; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

MS005282 (gene) of Bitter gourd (TR) v1 genome

Gene IDMS005282
OrganismMomordica charantia cv. TR (Bitter gourd (TR) v1)
Descriptionhistone H1-like
Genome locationscaffold83:568636..569520
RNA-Seq ExpressionMS005282
SyntenyMS005282
Gene Ontology termsGO:0006334 - nucleosome assembly (biological process)
GO:0000786 - nucleosome (cellular component)
GO:0005634 - nucleus (cellular component)
GO:0003677 - DNA binding (molecular function)
GO:0008168 - methyltransferase activity (molecular function)
InterPro domainsIPR005818 - Linker histone H1/H5, domain H15
IPR005819 - Linker histone H1/H5
IPR036388 - Winged helix-like DNA-binding domain superfamily
IPR036390 - Winged helix DNA-binding domain superfamily


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG6599320.1 Histone H1.2, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]1.3e-8683.77Show/hide
Query:  MASAADPIVPSDAPAADAAEVLTVANDAKPKKAASSKASKAKKPSGAKRPKSSPTHPPFFQMISEAIVSLKERTGSSQYAITKFSEEKHKQLPSNFRKLL
        M+SAADP+  SDAPA  AA    V ND+K KKAA+SKASKAKKPSGAKR +SSPTHPPFF+MISEAIVSLKERTGSSQYAITKFSEEKHKQLPSNFRKLL
Subjt:  MASAADPIVPSDAPAADAAEVLTVANDAKPKKAASSKASKAKKPSGAKRPKSSPTHPPFFQMISEAIVSLKERTGSSQYAITKFSEEKHKQLPSNFRKLL

Query:  LVHLKKLVAADKLVKVKNSYKLPSARSIQAKAAAPVAAKKPASSKLKAAASVKKKAAVVKPKAKTAVKPKPKAVVKPKTISKSKVVAKPKAAAAAAAKPK
        LVHLKKLVAADKLVKVKNSYKLPSARS    AAAPV AKKPASSKLKAA SV KKAAV KPKAKTAVKPKPKAV KPK  +KSKVVAKPK  A A AK K
Subjt:  LVHLKKLVAADKLVKVKNSYKLPSARSIQAKAAAPVAAKKPASSKLKAAASVKKKAAVVKPKAKTAVKPKPKAVVKPKTISKSKVVAKPKAAAAAAAKPK

Query:  AAAKV-KAAAKAKPAARPAKVAKTLTQTSPGKRAAPAAKAKKVAAKKPKTVKSPARKVQARKVKK
        AA KV K A K KPAA+PAKVAKTL++TSPGK+AAPAAKAKKVAAKKPKTVKSPARKVQARKVKK
Subjt:  AAAKV-KAAAKAKPAARPAKVAKTLTQTSPGKRAAPAAKAKKVAAKKPKTVKSPARKVQARKVKK

XP_022142941.1 histone H1-like [Momordica charantia]3.7e-11399.62Show/hide
Query:  MASAADPIVPSDAPAADAAEVLTVANDAKPKKAASSKASKAKKPSGAKRPKSSPTHPPFFQMISEAIVSLKERTGSSQYAITKFSEEKHKQLPSNFRKLL
        MASAADPIVPSDAPAADAAEVLTVANDAKPKKAASSKASKAKKPSGAKRPKSSPTHPPFFQMISEAIVSLKERTGSSQYAITKFSEEKHKQLPSNFRKLL
Subjt:  MASAADPIVPSDAPAADAAEVLTVANDAKPKKAASSKASKAKKPSGAKRPKSSPTHPPFFQMISEAIVSLKERTGSSQYAITKFSEEKHKQLPSNFRKLL

Query:  LVHLKKLVAADKLVKVKNSYKLPSARSIQAKAAAPVAAKKPASSKLKAAASVKKKAAVVKPKAKTAVKPKPKAVVKPKTISKSKVVAKPKAAAAAAAKPK
        LVHLKKLVAADKLVKVKNSYKLPSARSIQAKAAAPVAAKKPASSKLKAAASVKKKAAVVKPKAKTAVKPKPKAVVKPKTISKSKVVAKPK AAAAAAKPK
Subjt:  LVHLKKLVAADKLVKVKNSYKLPSARSIQAKAAAPVAAKKPASSKLKAAASVKKKAAVVKPKAKTAVKPKPKAVVKPKTISKSKVVAKPKAAAAAAAKPK

Query:  AAAKVKAAAKAKPAARPAKVAKTLTQTSPGKRAAPAAKAKKVAAKKPKTVKSPARKVQARKVKK
        AAAKVKAAAKAKPAARPAKVAKTLTQTSPGKRAAPAAKAKKVAAKKPKTVKSPARKVQARKVKK
Subjt:  AAAKVKAAAKAKPAARPAKVAKTLTQTSPGKRAAPAAKAKKVAAKKPKTVKSPARKVQARKVKK

XP_022946127.1 histone H1-like [Cucurbita moschata]3.0e-8683.4Show/hide
Query:  MASAADPIVPSDAPAADAAEVLTVANDAKPKKAASSKASKAKKPSGAKRPKSSPTHPPFFQMISEAIVSLKERTGSSQYAITKFSEEKHKQLPSNFRKLL
        M+SAADP+  SDAPA  AA    V ND+K KKAA+SKASKAKKPSGAKR +SSPTHPPFF+MISEAIVSLKERTGSSQYAITKFSEEKHK+LPSNFRKLL
Subjt:  MASAADPIVPSDAPAADAAEVLTVANDAKPKKAASSKASKAKKPSGAKRPKSSPTHPPFFQMISEAIVSLKERTGSSQYAITKFSEEKHKQLPSNFRKLL

Query:  LVHLKKLVAADKLVKVKNSYKLPSARSIQAKAAAPVAAKKPASSKLKAAASVKKKAAVVKPKAKTAVKPKPKAVVKPKTISKSKVVAKPKAAAAAAAKPK
        LVHLKKLVAADKLVKVKNSYKLPSARS    AAAPV AKKPASSKLKAA SV KKAAV KPKAKTAVKPKPKAV KPK+ +KSKVVAKPK  A A AK K
Subjt:  LVHLKKLVAADKLVKVKNSYKLPSARSIQAKAAAPVAAKKPASSKLKAAASVKKKAAVVKPKAKTAVKPKPKAVVKPKTISKSKVVAKPKAAAAAAAKPK

Query:  AAAKV-KAAAKAKPAARPAKVAKTLTQTSPGKRAAPAAKAKKVAAKKPKTVKSPARKVQARKVKK
        AA KV K A K KPAA+PAKVAKTL++TSPGK+AAPAAKAKKVAAKKPKTVKSPARKVQARKVKK
Subjt:  AAAKV-KAAAKAKPAARPAKVAKTLTQTSPGKRAAPAAKAKKVAAKKPKTVKSPARKVQARKVKK

XP_022999095.1 histone H1-like [Cucurbita maxima]1.6e-8482.26Show/hide
Query:  MASAADPIVPSDAPAADAAEVLTVANDAKPKKAASSKASKAKKPSGAKRPKSSPTHPPFFQMISEAIVSLKERTGSSQYAITKFSEEKHKQLPSNFRKLL
        M+SAADP+  SDAPA  A     V ND+K KKAA+SKASKAKKPSGAKR +SSPTHPPFF+MISEAIVSLKERTGSSQYAITKFSEEKHKQLPSNFRKLL
Subjt:  MASAADPIVPSDAPAADAAEVLTVANDAKPKKAASSKASKAKKPSGAKRPKSSPTHPPFFQMISEAIVSLKERTGSSQYAITKFSEEKHKQLPSNFRKLL

Query:  LVHLKKLVAADKLVKVKNSYKLPSARSIQAKAAAPVAAKKPASSKLKAAASVKKKAAVVKPKAKTAVKPKPKAVVKPKTISKSKVVAKPKAAAAAAAKPK
        LVHLKKLVAADKLVKVKNSYKLPSARS    AAAPV AKKPASSKLKAA SV KKAAV KPKAKTAVKPKPK V KPK  +KSKVV KPK  A A AK K
Subjt:  LVHLKKLVAADKLVKVKNSYKLPSARSIQAKAAAPVAAKKPASSKLKAAASVKKKAAVVKPKAKTAVKPKPKAVVKPKTISKSKVVAKPKAAAAAAAKPK

Query:  AAAKV-KAAAKAKPAARPAKVAKTLTQTSPGKRAAPAAKAKKVAAKKPKTVKSPARKVQARKVKK
        AA KV K A K KPAA+PAKVAKTL++ SPGK+AAPAAKAKKVAAKKPKTVKSPARKVQARKVKK
Subjt:  AAAKV-KAAAKAKPAARPAKVAKTLTQTSPGKRAAPAAKAKKVAAKKPKTVKSPARKVQARKVKK

XP_023521173.1 histone H1-like [Cucurbita pepo subsp. pepo]3.3e-8582.64Show/hide
Query:  MASAADPIVPSDAPAADAAEVLTVANDAKPKKAASSKASKAKKPSGAKRPKSSPTHPPFFQMISEAIVSLKERTGSSQYAITKFSEEKHKQLPSNFRKLL
        M+SAADP+  SDAPA  A       ND+K KKAA+SKASKAKKPSGAKR +SSPTHPPFF+MISEAIVSLKERTGSSQYAITKFSEEKHKQLPSNFRKLL
Subjt:  MASAADPIVPSDAPAADAAEVLTVANDAKPKKAASSKASKAKKPSGAKRPKSSPTHPPFFQMISEAIVSLKERTGSSQYAITKFSEEKHKQLPSNFRKLL

Query:  LVHLKKLVAADKLVKVKNSYKLPSARSIQAKAAAPVAAKKPASSKLKAAASVKKKAAVVKPKAKTAVKPKPKAVVKPKTISKSKVVAKPKAAAAAAAKPK
        LVHLKKLVAADKLVKVKNSYKLPSARS    AAAPV AKKPASSKLKAA SV KKAAV KPKAKTAVKPKPK V KPK  +KSKVVAKPK  A A AK K
Subjt:  LVHLKKLVAADKLVKVKNSYKLPSARSIQAKAAAPVAAKKPASSKLKAAASVKKKAAVVKPKAKTAVKPKPKAVVKPKTISKSKVVAKPKAAAAAAAKPK

Query:  AAAKV-KAAAKAKPAARPAKVAKTLTQTSPGKRAAPAAKAKKVAAKKPKTVKSPARKVQARKVKK
        AA KV K A K KPAA+PAKVAKTL++TSPGK+AAPAAKAKKVAAKKPKTVKSPARKVQARKVKK
Subjt:  AAAKV-KAAAKAKPAARPAKVAKTLTQTSPGKRAAPAAKAKKVAAKKPKTVKSPARKVQARKVKK

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A1S3C278 histone H1-like2.8e-8280.37Show/hide
Query:  MASAADPIVPSDAP-AADAAEVLTVANDAKPKKAASSKASKAKKPSGAKRPKSSPTHPPFFQMISEAIVSLKERTGSSQYAITKFSEEKHKQLPSNFRKL
        M+SAADP+V SDAP AADAA      ND+K KKAA+SKASKAKKPSGAK+ +SSPTHPPF QMISEAIVSLKERTGSSQYAITKF+EEKHKQLPSNFRKL
Subjt:  MASAADPIVPSDAP-AADAAEVLTVANDAKPKKAASSKASKAKKPSGAKRPKSSPTHPPFFQMISEAIVSLKERTGSSQYAITKFSEEKHKQLPSNFRKL

Query:  LLVHLKKLVAADKLVKVKNSYKLPSARSIQAK--AAAPVAAKKPASSKLKAAASVKKKAAVVKPKAKTAVKPKPKAVV--KPKTISKSKVVAKPKAAAAA
        LLVHLKKLVAADKLVKVKNSYKLPSARSIQAK  AAAPVA KKP SSKLKA AS+ KK AV KPKAKTA K KPKAV   KPKT++KSK VAKPK     
Subjt:  LLVHLKKLVAADKLVKVKNSYKLPSARSIQAK--AAAPVAAKKPASSKLKAAASVKKKAAVVKPKAKTAVKPKPKAVV--KPKTISKSKVVAKPKAAAAA

Query:  AAKPKAAAKV-KAAAKAKPAARPAKVAKTLTQTSPGKRAAPAAKAKKVAAKKPKTVKSPARKVQARKVKK
        AAK KAA KV K A K K  A+  KVAKTL++TSPGKRAAPAAKAKKVAAKKPKTVKSPARKVQARKVKK
Subjt:  AAKPKAAAKV-KAAAKAKPAARPAKVAKTLTQTSPGKRAAPAAKAKKVAAKKPKTVKSPARKVQARKVKK

A0A5D3D4H1 Histone H1-like3.3e-8380.74Show/hide
Query:  MASAADPIVPSDAP-AADAAEVLTVANDAKPKKAASSKASKAKKPSGAKRPKSSPTHPPFFQMISEAIVSLKERTGSSQYAITKFSEEKHKQLPSNFRKL
        M+SAADP+V SDAP AADAA      ND+K KKAA+SKASKAKKPSGAK+ +SSPTHPPF QMISEAIVSLKERTGSSQYAITKF+EEKHKQLPSNFRKL
Subjt:  MASAADPIVPSDAP-AADAAEVLTVANDAKPKKAASSKASKAKKPSGAKRPKSSPTHPPFFQMISEAIVSLKERTGSSQYAITKFSEEKHKQLPSNFRKL

Query:  LLVHLKKLVAADKLVKVKNSYKLPSARSIQAK--AAAPVAAKKPASSKLKAAASVKKKAAVVKPKAKTAVKPKPKAVV--KPKTISKSKVVAKPKAAAAA
        LLVHLKKLVAADKLVKVKNSYKLPSARSIQAK  AAAPVA KKP SSKLKA AS+ KK AV KPKAKTA KPKPKAV   KPKT++KSK VAKPK     
Subjt:  LLVHLKKLVAADKLVKVKNSYKLPSARSIQAK--AAAPVAAKKPASSKLKAAASVKKKAAVVKPKAKTAVKPKPKAVV--KPKTISKSKVVAKPKAAAAA

Query:  AAKPKAAAKV-KAAAKAKPAARPAKVAKTLTQTSPGKRAAPAAKAKKVAAKKPKTVKSPARKVQARKVKK
        AAK KAA KV K A K K  A+  KVAKTL++TSPGKRAAPAAKAKKVAAKKPKTVKSPARKVQARKVKK
Subjt:  AAKPKAAAKV-KAAAKAKPAARPAKVAKTLTQTSPGKRAAPAAKAKKVAAKKPKTVKSPARKVQARKVKK

A0A6J1CNP7 histone H1-like1.8e-11399.62Show/hide
Query:  MASAADPIVPSDAPAADAAEVLTVANDAKPKKAASSKASKAKKPSGAKRPKSSPTHPPFFQMISEAIVSLKERTGSSQYAITKFSEEKHKQLPSNFRKLL
        MASAADPIVPSDAPAADAAEVLTVANDAKPKKAASSKASKAKKPSGAKRPKSSPTHPPFFQMISEAIVSLKERTGSSQYAITKFSEEKHKQLPSNFRKLL
Subjt:  MASAADPIVPSDAPAADAAEVLTVANDAKPKKAASSKASKAKKPSGAKRPKSSPTHPPFFQMISEAIVSLKERTGSSQYAITKFSEEKHKQLPSNFRKLL

Query:  LVHLKKLVAADKLVKVKNSYKLPSARSIQAKAAAPVAAKKPASSKLKAAASVKKKAAVVKPKAKTAVKPKPKAVVKPKTISKSKVVAKPKAAAAAAAKPK
        LVHLKKLVAADKLVKVKNSYKLPSARSIQAKAAAPVAAKKPASSKLKAAASVKKKAAVVKPKAKTAVKPKPKAVVKPKTISKSKVVAKPK AAAAAAKPK
Subjt:  LVHLKKLVAADKLVKVKNSYKLPSARSIQAKAAAPVAAKKPASSKLKAAASVKKKAAVVKPKAKTAVKPKPKAVVKPKTISKSKVVAKPKAAAAAAAKPK

Query:  AAAKVKAAAKAKPAARPAKVAKTLTQTSPGKRAAPAAKAKKVAAKKPKTVKSPARKVQARKVKK
        AAAKVKAAAKAKPAARPAKVAKTLTQTSPGKRAAPAAKAKKVAAKKPKTVKSPARKVQARKVKK
Subjt:  AAAKVKAAAKAKPAARPAKVAKTLTQTSPGKRAAPAAKAKKVAAKKPKTVKSPARKVQARKVKK

A0A6J1G2W2 histone H1-like1.4e-8683.4Show/hide
Query:  MASAADPIVPSDAPAADAAEVLTVANDAKPKKAASSKASKAKKPSGAKRPKSSPTHPPFFQMISEAIVSLKERTGSSQYAITKFSEEKHKQLPSNFRKLL
        M+SAADP+  SDAPA  AA    V ND+K KKAA+SKASKAKKPSGAKR +SSPTHPPFF+MISEAIVSLKERTGSSQYAITKFSEEKHK+LPSNFRKLL
Subjt:  MASAADPIVPSDAPAADAAEVLTVANDAKPKKAASSKASKAKKPSGAKRPKSSPTHPPFFQMISEAIVSLKERTGSSQYAITKFSEEKHKQLPSNFRKLL

Query:  LVHLKKLVAADKLVKVKNSYKLPSARSIQAKAAAPVAAKKPASSKLKAAASVKKKAAVVKPKAKTAVKPKPKAVVKPKTISKSKVVAKPKAAAAAAAKPK
        LVHLKKLVAADKLVKVKNSYKLPSARS    AAAPV AKKPASSKLKAA SV KKAAV KPKAKTAVKPKPKAV KPK+ +KSKVVAKPK  A A AK K
Subjt:  LVHLKKLVAADKLVKVKNSYKLPSARSIQAKAAAPVAAKKPASSKLKAAASVKKKAAVVKPKAKTAVKPKPKAVVKPKTISKSKVVAKPKAAAAAAAKPK

Query:  AAAKV-KAAAKAKPAARPAKVAKTLTQTSPGKRAAPAAKAKKVAAKKPKTVKSPARKVQARKVKK
        AA KV K A K KPAA+PAKVAKTL++TSPGK+AAPAAKAKKVAAKKPKTVKSPARKVQARKVKK
Subjt:  AAAKV-KAAAKAKPAARPAKVAKTLTQTSPGKRAAPAAKAKKVAAKKPKTVKSPARKVQARKVKK

A0A6J1KEC3 histone H1-like7.9e-8582.26Show/hide
Query:  MASAADPIVPSDAPAADAAEVLTVANDAKPKKAASSKASKAKKPSGAKRPKSSPTHPPFFQMISEAIVSLKERTGSSQYAITKFSEEKHKQLPSNFRKLL
        M+SAADP+  SDAPA  A     V ND+K KKAA+SKASKAKKPSGAKR +SSPTHPPFF+MISEAIVSLKERTGSSQYAITKFSEEKHKQLPSNFRKLL
Subjt:  MASAADPIVPSDAPAADAAEVLTVANDAKPKKAASSKASKAKKPSGAKRPKSSPTHPPFFQMISEAIVSLKERTGSSQYAITKFSEEKHKQLPSNFRKLL

Query:  LVHLKKLVAADKLVKVKNSYKLPSARSIQAKAAAPVAAKKPASSKLKAAASVKKKAAVVKPKAKTAVKPKPKAVVKPKTISKSKVVAKPKAAAAAAAKPK
        LVHLKKLVAADKLVKVKNSYKLPSARS    AAAPV AKKPASSKLKAA SV KKAAV KPKAKTAVKPKPK V KPK  +KSKVV KPK  A A AK K
Subjt:  LVHLKKLVAADKLVKVKNSYKLPSARSIQAKAAAPVAAKKPASSKLKAAASVKKKAAVVKPKAKTAVKPKPKAVVKPKTISKSKVVAKPKAAAAAAAKPK

Query:  AAAKV-KAAAKAKPAARPAKVAKTLTQTSPGKRAAPAAKAKKVAAKKPKTVKSPARKVQARKVKK
        AA KV K A K KPAA+PAKVAKTL++ SPGK+AAPAAKAKKVAAKKPKTVKSPARKVQARKVKK
Subjt:  AAAKV-KAAAKAKPAARPAKVAKTLTQTSPGKRAAPAAKAKKVAAKKPKTVKSPARKVQARKVKK

SwissProt top hitse value%identityAlignment
P08283 Histone H19.8e-3247.65Show/hide
Query:  MASAADPIVPSDAPAADAAEVLTVANDAKPKK------AASSKASKAKKPSGAKRPKSSPTHPPFFQMISEAIVSLKERTGSSQYAITKFSEEKHKQLPS
        MA+    +     P     E  T+     P+K         +K +K  KP  A +P++  +HP + +MI +AIVSLKE+ GSSQYAI KF EEK KQLP+
Subjt:  MASAADPIVPSDAPAADAAEVLTVANDAKPKK------AASSKASKAKKPSGAKRPKSSPTHPPFFQMISEAIVSLKERTGSSQYAITKFSEEKHKQLPS

Query:  NFRKLLLVHLKKLVAADKLVKVKNSYKLPSARSIQAKAAAPVAAKKPASSKLKAAASVKKKAAVVKPKAKTAVKPKPKAVVKPKTISKSK-VVAKPKAAA
        NF+KLLL +LKK VA+ KL+KVK S+KL +            AAKKPA +K KA  + K K+     KAK A KPK KAVVKPK  SK+K V AKPK AA
Subjt:  NFRKLLLVHLKKLVAADKLVKVKNSYKLPSARSIQAKAAAPVAAKKPASSKLKAAASVKKKAAVVKPKAKTAVKPKPKAVVKPKTISKSK-VVAKPKAAA

Query:  A----AAAKPK-AAAKVKAAAKAKPAARPAKVAKTLTQTSPGKRAAPAAK--AKKVAAK--KPKTVKSPARKVQARK
        A     AAK K  AAK KA  K K   +PAKVAKT  +T+PGK+ A   K  AKKV  K  K K+VKSP +KV  ++
Subjt:  A----AAAKPK-AAAKVKAAAKAKPAARPAKVAKTLTQTSPGKRAAPAAK--AKKVAAK--KPKTVKSPARKVQARK

P23444 Histone H13.7e-3152.27Show/hide
Query:  ADPIVPSDAPAADAAEVLTVANDAKPKKAASSKASKAKKPSGAKRPKSSPTHPPFFQMISEAIVSLKERTGSSQYAITKFSEEKHK-QLPSNFRKLLLVH
        A P  P+DAPAA AA+    AN AK KKA             A + ++SPTH P+ +M+SEAI SLKERTGSS YAI KF E+KHK +LP NFRKLL V 
Subjt:  ADPIVPSDAPAADAAEVLTVANDAKPKKAASSKASKAKKPSGAKRPKSSPTHPPFFQMISEAIVSLKERTGSSQYAITKFSEEKHK-QLPSNFRKLLLVH

Query:  LKKLVAADKLVKVKNSYKLPSARSIQAKAAAPVAAKKPASSKLKAAASVKKKAAVVKPKAKTAVKPKPKAVVKPKTISKSKVVAKPKAAAAAAAKPKAAA
        LKKLVA  KL KVKNSYKL SA     K  A  A KKP +   K  A+ K KA     KAK A KPKP A  KPK + K K  AKPKA  AA AKPK   
Subjt:  LKKLVAADKLVKVKNSYKLPSARSIQAKAAAPVAAKKPASSKLKAAASVKKKAAVVKPKAKTAVKPKPKAVVKPKTISKSKVVAKPKAAAAAAAKPKAAA

Query:  KVKAAAKAKPAARP---AKVAKTLTQTSPGKRAAPAAKAKKVAAKKPKTVKSPARKVQARKVKK
           A AK KP A+    AK AKT  + +PGK+ APA KA    +KK  T   P RK  +RK KK
Subjt:  KVKAAAKAKPAARP---AKVAKTLTQTSPGKRAAPAAKAKKVAAKKPKTVKSPARKVQARKVKK

P26569 Histone H1.21.4e-3050.93Show/hide
Query:  DAPAAD----AAEVLTVANDAKPKKAASSKASKAK-KPSGAKRPKSSPTHPPFFQMISEAIVSLKERTGSSQYAITKFSEEKHKQLPSNFRKLLLVHLKK
        D+ AAD    + E    A   K KK  ++KA+K   K +   + K++ +HP + +MI +AIV+LKERTGSSQYAI KF EEKHK LP  FRKLLLV+LK+
Subjt:  DAPAAD----AAEVLTVANDAKPKKAASSKASKAK-KPSGAKRPKSSPTHPPFFQMISEAIVSLKERTGSSQYAITKFSEEKHKQLPSNFRKLLLVHLKK

Query:  LVAADKLVKVKNSYKLPSARSIQA-KAAAPVAAKKPASSKLKAAASVKKKAAVVKPKAKTAVKPKPKAVVKPKTISKSKVVAKPKAAAAAAAKPK-----
        LVA++KLVKVK S+K+PSARS    K AAPV  K    +K K     K  AAV   KAK A K   K     K ++K+KV AKPK A   AAKPK     
Subjt:  LVAADKLVKVKNSYKLPSARSIQA-KAAAPVAAKKPASSKLKAAASVKKKAAVVKPKAKTAVKPKPKAVVKPKTISKSKVVAKPKAAAAAAAKPK-----

Query:  AAAKVKA-AAKAKPAARPAKVAKTLTQTSPGKR-AAPAAK---AKKVAAKKPKTVKSPARKVQARKVKK
        A +K KA AAK K   RPAK ++T T+TSPGK+ AAPA K    KK  AK  K VKSPA++   RK KK
Subjt:  AAAKVKA-AAKAKPAARPAKVAKTLTQTSPGKR-AAPAAK---AKKVAAKKPKTVKSPARKVQARKVKK

P37218 Histone H13.4e-4052.25Show/hide
Query:  DPIVPSDAPAADAAEVLTVANDAKP--KKAASSKASKAKKPSGAKRPKSSPTHPPFFQMISEAIVSLKERTGSSQYAITKFSEEKHKQLPSNFRKLLLVH
        +P++ ++     AA   TV ++A P  K   + K +KAKKP+  ++  ++PTHPP+F+MI +AIV+LKERTGSSQ+AITKF EEK K LPSNF+KLLL  
Subjt:  DPIVPSDAPAADAAEVLTVANDAKP--KKAASSKASKAKKPSGAKRPKSSPTHPPFFQMISEAIVSLKERTGSSQYAITKFSEEKHKQLPSNFRKLLLVH

Query:  LKKLVAADKLVKVKNSYKLPSARSIQAKAAAPVAAKKPASSKLKAAASVKKKAAVVKPKAKTAVKPKPKAVVKP----------------KTISKSKVVA
        LKK VA++KLVKVKNSYKLPS  S  A AA P A KKPA++K K AA   K  A VKPKAK A K KP A  KP                K  +K+K VA
Subjt:  LKKLVAADKLVKVKNSYKLPSARSIQAKAAAPVAAKKPASSKLKAAASVKKKAAVVKPKAKTAVKPKPKAVVKP----------------KTISKSKVVA

Query:  KPKAAAAAAAKPKAAAKVKAA-AKAKPAARP--------AKVAKTLTQTSPGKRAAP-AAKAKKVAAKK--PKTVKSPARKVQARKVKK
        K K  AAAAAKPKAA K KAA AK K A +P        AKVAKT T+T+P ++AAP A  AKK   KK   K VKSPA+K   ++ +K
Subjt:  KPKAAAAAAAKPKAAAKVKAA-AKAKPAARP--------AKVAKTLTQTSPGKRAAP-AAKAKKVAAKK--PKTVKSPARKVQARKVKK

Q9M5W4 Histone H19.5e-3553.6Show/hide
Query:  SDAP-AADAAEVLTVANDAKPKKAASSKASKAKKP-SGAKRPKSSPT--HPPFFQMISEAIVSLKERTGSSQYAITKFSEEKHKQLPSNFRKLLLVHLKK
        +D P +A     +T     +  KAA+ K  K KK    AK+PKS  T  HP FF+MIS+AI +LKERTGSSQYAI KF E+KHKQLPSNFRKLLL HLKK
Subjt:  SDAP-AADAAEVLTVANDAKPKKAASSKASKAKKP-SGAKRPKSSPT--HPPFFQMISEAIVSLKERTGSSQYAITKFSEEKHKQLPSNFRKLLLVHLKK

Query:  LVAADKLVKVKNSYKLPSARSIQAKAAAPVAAKKPASSKLKAAASVKKKAAVVKPKAKTAVKPKPKAVVKPKTISKSKVVAKPKAAAAAAAKPKAAAKVK
        LVA+ KLVKVKNS+KLPSAR+    A AP  AKKP   K K AA  K      KPKAK  V  K KA    KT++K    AKPK  A  A KPK      
Subjt:  LVAADKLVKVKNSYKLPSARSIQAKAAAPVAAKKPASSKLKAAASVKKKAAVVKPKAKTAVKPKPKAVVKPKTISKSKVVAKPKAAAAAAAKPKAAAKVK

Query:  AAAKAKPAARPAKVAKTLTQTSPGKRAAPAAKAKKVAAKKPKTVKSPARK
               AA+PAKVAKT    SPGK+       K V  KK KTVKSPA K
Subjt:  AAAKAKPAARPAKVAKTLTQTSPGKRAAPAAKAKKVAAKKPKTVKSPARK

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G06760.1 winged-helix DNA-binding transcription factor family protein3.0e-2848.87Show/hide
Query:  SDAPAADAAEVLTVANDAKPKKAASSKASKAKKP-SGAKRPKSSPTHPPFFQMISEAIVSLKERTGSSQYAITKFSEEKHKQLPSNFRKLLLVHLKKLVA
        +DAP  DAA     A  AK +K  + K  K KK  + A + ++  +HP + +MI +AIV+LKERTGSSQYAI KF EEK K+LP  FRKLLL++LK+LVA
Subjt:  SDAPAADAAEVLTVANDAKPKKAASSKASKAKKP-SGAKRPKSSPTHPPFFQMISEAIVSLKERTGSSQYAITKFSEEKHKQLPSNFRKLLLVHLKKLVA

Query:  ADKLVKVKNSYKLPSARSIQAKAAAP-VAAKKPASSKLKAAASVKKKAAVVKPKAKTAVKPKPKAVVKPKTISKSKVVAKPKAAAAAAAKPKAAAKVKAA
        + KLVKVK S+KLPSA    AKA++P  AA+K A +K K A     KA   K K   A K K    VKPKT +  KV AK KA     A   A  +    
Subjt:  ADKLVKVKNSYKLPSARSIQAKAAAP-VAAKKPASSKLKAAASVKKKAAVVKPKAKTAVKPKPKAVVKPKTISKSKVVAKPKAAAAAAAKPKAAAKVKAA

Query:  AKAKPAARPAKVAKTLTQTSPGKRAAPAAK-------AKKVAAK---KPKTVKSPARKVQARKVKK
        AK K  ARPAK AKT   TSP K+A  A K        KK   K   KPKTVKSPA++  +R VKK
Subjt:  AKAKPAARPAKVAKTLTQTSPGKRAAPAAK-------AKKVAAK---KPKTVKSPARKVQARKVKK

AT2G18050.1 histone H1-31.5e-1141.67Show/hide
Query:  KASKAKKPSGAKRPKSSPTHPPFFQMISEAIVSLKERTGSSQYAITKFSEEKHKQ-LPSNFRKLLLVHLKKLVAADKLVKVKNSYKLPSARSIQAKAAAP
        K   AKKP   ++PK++ THPP+FQMI EA++ LKE+ GSS YAI K  EEKHK  LP +FRK L + LK  VA  KLVK++ SYKL     +  +    
Subjt:  KASKAKKPSGAKRPKSSPTHPPFFQMISEAIVSLKERTGSSQYAITKFSEEKHKQ-LPSNFRKLLLVHLKKLVAADKLVKVKNSYKLPSARSIQAKAAAP

Query:  VAAK------KPASSKLKAAASVKKKAAVVKPKAKTAVKPKPKAVVKPKTISKSKVVAKPKAAAAAAA
           K      K  + + +++++  KK   V  + K   K K K   +PK+I  S  V K KA  A+AA
Subjt:  VAAK------KPASSKLKAAASVKKKAAVVKPKAKTAVKPKPKAVVKPKTISKSKVVAKPKAAAAAAA

AT2G18050.2 histone H1-32.5e-0639.86Show/hide
Query:  MISEAIVSLKERTGSSQYAITKFSEEKHKQ-LPSNFRKLLLVHLKKLVAADKLVKVKNSYKLPSARSIQAKAAAPVAAK------KPASSKLKAAASVKK
        MI EA++ LKE+ GSS YAI K  EEKHK  LP +FRK L + LK  VA  KLVK++ SYKL     +  +       K      K  + + +++++  K
Subjt:  MISEAIVSLKERTGSSQYAITKFSEEKHKQ-LPSNFRKLLLVHLKKLVAADKLVKVKNSYKLPSARSIQAKAAAPVAAK------KPASSKLKAAASVKK

Query:  KAAVVKPKAKTAVKPKPKAVVKPKTISKSKVVAKPKAAAAAAA
        K   V  + K   K K K   +PK+I  S  V K KA  A+AA
Subjt:  KAAVVKPKAKTAVKPKPKAVVKPKTISKSKVVAKPKAAAAAAA

AT2G30620.1 winged-helix DNA-binding transcription factor family protein1.0e-3150.93Show/hide
Query:  DAPAAD----AAEVLTVANDAKPKKAASSKASKAK-KPSGAKRPKSSPTHPPFFQMISEAIVSLKERTGSSQYAITKFSEEKHKQLPSNFRKLLLVHLKK
        D+ AAD    + E    A   K KK  ++KA+K   K +   + K++ +HP + +MI +AIV+LKERTGSSQYAI KF EEKHK LP  FRKLLLV+LK+
Subjt:  DAPAAD----AAEVLTVANDAKPKKAASSKASKAK-KPSGAKRPKSSPTHPPFFQMISEAIVSLKERTGSSQYAITKFSEEKHKQLPSNFRKLLLVHLKK

Query:  LVAADKLVKVKNSYKLPSARSIQA-KAAAPVAAKKPASSKLKAAASVKKKAAVVKPKAKTAVKPKPKAVVKPKTISKSKVVAKPKAAAAAAAKPK-----
        LVA++KLVKVK S+K+PSARS    K AAPV  K    +K K     K  AAV   KAK A K   K     K ++K+KV AKPK A   AAKPK     
Subjt:  LVAADKLVKVKNSYKLPSARSIQA-KAAAPVAAKKPASSKLKAAASVKKKAAVVKPKAKTAVKPKPKAVVKPKTISKSKVVAKPKAAAAAAAKPK-----

Query:  AAAKVKA-AAKAKPAARPAKVAKTLTQTSPGKR-AAPAAK---AKKVAAKKPKTVKSPARKVQARKVKK
        A +K KA AAK K   RPAK ++T T+TSPGK+ AAPA K    KK  AK  K VKSPA++   RK KK
Subjt:  AAAKVKA-AAKAKPAARPAKVAKTLTQTSPGKR-AAPAAK---AKKVAAKKPKTVKSPARKVQARKVKK

AT2G30620.2 winged-helix DNA-binding transcription factor family protein7.2e-2248.08Show/hide
Query:  DAPAAD----AAEVLTVANDAKPKKAASSKASKAK-KPSGAKRPKSSPTHPPFFQMISEAIVSLKERTGSSQYAITKFSEEKHKQLPSNFRKLLLVHLKK
        D+ AAD    + E    A   K KK  ++KA+K   K +   + K++ +HP + +MI +AIV+LKERTGSSQYAI KF EEKHK LP  FRKLLLV+LK+
Subjt:  DAPAAD----AAEVLTVANDAKPKKAASSKASKAK-KPSGAKRPKSSPTHPPFFQMISEAIVSLKERTGSSQYAITKFSEEKHKQLPSNFRKLLLVHLKK

Query:  LVAADKLVKVKNSYKLPSARSIQAKAAAPVAAKKPASSKLKAAASVKKKAAVV-KPKA-KTAVKPKPKAVVKPKTISKSKVVAKPKAAAAAAAKPKAAAK
        LVA++KLVKVK S+K+PSARS    AA P           K AA VKKKA VV KPKA +T+ +  P      K  + +K VA  K A A + K K+ AK
Subjt:  LVAADKLVKVKNSYKLPSARSIQAKAAAPVAAKKPASSKLKAAASVKKKAAVV-KPKA-KTAVKPKPKAVVKPKTISKSKVVAKPKAAAAAAAKPKAAAK

Query:  VKAAAKAK
          +  KAK
Subjt:  VKAAAKAK


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGCTTCCGCTGCAGATCCGATCGTACCTTCCGACGCGCCGGCCGCCGACGCGGCGGAGGTTCTGACTGTGGCGAACGATGCGAAGCCTAAGAAGGCCGCGTCCTCGAA
AGCTTCCAAGGCTAAGAAACCATCGGGCGCGAAGAGGCCGAAATCTTCACCGACTCATCCTCCTTTCTTTCAGATGATTAGCGAGGCGATTGTATCGCTGAAGGAGAGGA
CAGGCTCGAGTCAGTACGCCATTACGAAGTTCAGTGAAGAGAAGCACAAACAGCTGCCGTCGAATTTCCGGAAGCTCTTGCTTGTTCATCTGAAGAAATTAGTCGCCGCT
GATAAACTTGTTAAGGTGAAGAACTCCTACAAGCTTCCTTCCGCTCGCTCGATTCAGGCGAAAGCCGCAGCGCCTGTCGCTGCCAAGAAGCCAGCTAGTTCAAAGTTGAA
GGCAGCTGCGAGTGTGAAGAAGAAGGCCGCCGTCGTCAAACCGAAGGCTAAAACTGCAGTGAAACCTAAGCCCAAGGCCGTGGTTAAGCCGAAGACGATCTCCAAATCCA
AGGTTGTTGCAAAGCCGAAGGCGGCGGCGGCGGCGGCGGCCAAGCCTAAGGCGGCAGCGAAAGTTAAAGCTGCTGCGAAGGCTAAGCCCGCTGCAAGGCCCGCGAAAGTG
GCGAAAACATTGACGCAAACATCACCGGGAAAGAGAGCTGCACCGGCAGCGAAGGCGAAGAAGGTAGCCGCGAAGAAGCCGAAGACTGTAAAGTCGCCGGCGAGGAAAGT
CCAGGCAAGGAAAGTCAAGAAA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGGCTTCCGCTGCAGATCCGATCGTACCTTCCGACGCGCCGGCCGCCGACGCGGCGGAGGTTCTGACTGTGGCGAACGATGCGAAGCCTAAGAAGGCCGCGTCCTCGAA
AGCTTCCAAGGCTAAGAAACCATCGGGCGCGAAGAGGCCGAAATCTTCACCGACTCATCCTCCTTTCTTTCAGATGATTAGCGAGGCGATTGTATCGCTGAAGGAGAGGA
CAGGCTCGAGTCAGTACGCCATTACGAAGTTCAGTGAAGAGAAGCACAAACAGCTGCCGTCGAATTTCCGGAAGCTCTTGCTTGTTCATCTGAAGAAATTAGTCGCCGCT
GATAAACTTGTTAAGGTGAAGAACTCCTACAAGCTTCCTTCCGCTCGCTCGATTCAGGCGAAAGCCGCAGCGCCTGTCGCTGCCAAGAAGCCAGCTAGTTCAAAGTTGAA
GGCAGCTGCGAGTGTGAAGAAGAAGGCCGCCGTCGTCAAACCGAAGGCTAAAACTGCAGTGAAACCTAAGCCCAAGGCCGTGGTTAAGCCGAAGACGATCTCCAAATCCA
AGGTTGTTGCAAAGCCGAAGGCGGCGGCGGCGGCGGCGGCCAAGCCTAAGGCGGCAGCGAAAGTTAAAGCTGCTGCGAAGGCTAAGCCCGCTGCAAGGCCCGCGAAAGTG
GCGAAAACATTGACGCAAACATCACCGGGAAAGAGAGCTGCACCGGCAGCGAAGGCGAAGAAGGTAGCCGCGAAGAAGCCGAAGACTGTAAAGTCGCCGGCGAGGAAAGT
CCAGGCAAGGAAAGTCAAGAAA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MASAADPIVPSDAPAADAAEVLTVANDAKPKKAASSKASKAKKPSGAKRPKSSPTHPPFFQMISEAIVSLKERTGSSQYAITKFSEEKHKQLPSNFRKLLLVHLKKLVAA
DKLVKVKNSYKLPSARSIQAKAAAPVAAKKPASSKLKAAASVKKKAAVVKPKAKTAVKPKPKAVVKPKTISKSKVVAKPKAAAAAAAKPKAAAKVKAAAKAKPAARPAKV
AKTLTQTSPGKRAAPAAKAKKVAAKKPKTVKSPARKVQARKVKK