; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

MS005289 (gene) of Bitter gourd (TR) v1 genome

Gene IDMS005289
OrganismMomordica charantia cv. TR (Bitter gourd (TR) v1)
DescriptionPSII 6.1 kDa protein
Genome locationscaffold83:605489..605800
RNA-Seq ExpressionMS005289
SyntenyMS005289
Gene Ontology termsGO:0042549 - photosystem II stabilization (biological process)
GO:0009523 - photosystem II (cellular component)
GO:0009535 - chloroplast thylakoid membrane (cellular component)
GO:0016021 - integral component of membrane (cellular component)
InterPro domainsIPR009806 - Photosystem II PsbW, class 2


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
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XP_022966002.1 photosystem II reaction center W protein, chloroplastic-like [Cucurbita maxima]2.6e-3376.92Show/hide
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XP_023521133.1 photosystem II reaction center W protein, chloroplastic-like [Cucurbita pepo subsp. pepo]3.4e-3376.92Show/hide
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XP_038890119.1 photosystem II reaction center W protein, chloroplastic-like [Benincasa hispida]8.5e-3784.62Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A1S3C2B0 PSII 6.1 kDa protein4.7e-3380.81Show/hide
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A0A1S4E257 PSII 6.1 kDa protein4.7e-3380.81Show/hide
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A0A6J1CNY5 PSII 6.1 kDa protein8.3e-4699.04Show/hide
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A0A6J1FBR0 PSII 6.1 kDa protein2.1e-3376.92Show/hide
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A0A6J1HLU7 PSII 6.1 kDa protein1.2e-3376.92Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
Q39194 Photosystem II reaction center W protein, chloroplastic1.9e-2358.56Show/hide
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Q41387 Photosystem II reaction center W protein, chloroplastic2.3e-2458.88Show/hide
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Q5ZBY9 Photosystem II reaction center W protein, chloroplastic4.1e-1853.19Show/hide
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
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mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
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Protein sequenceShow/hide protein sequence
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