; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

MS005393 (gene) of Bitter gourd (TR) v1 genome

Gene IDMS005393
OrganismMomordica charantia cv. TR (Bitter gourd (TR) v1)
Descriptionperoxisomal membrane protein 11C-like
Genome locationscaffold451:79489..80747
RNA-Seq ExpressionMS005393
SyntenyMS005393
Gene Ontology termsGO:0016559 - peroxisome fission (biological process)
GO:0044375 - regulation of peroxisome size (biological process)
GO:0005779 - integral component of peroxisomal membrane (cellular component)
GO:0042802 - identical protein binding (molecular function)
InterPro domainsIPR008733 - Peroxisomal biogenesis factor 11


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG7026023.1 Peroxisomal membrane protein 11C [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]1.9e-10886.7Show/hide
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XP_022999840.1 peroxisomal membrane protein 11C-like [Cucurbita maxima]6.4e-10987.12Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0K8W2 Uncharacterized protein1.1e-10988.41Show/hide
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A0A1S3CD65 LOW QUALITY PROTEIN: peroxisomal membrane protein 11C1.5e-10887.98Show/hide
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A0A6J1DPF4 peroxisomal membrane protein 11C-like4.9e-12399.13Show/hide
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A0A6J1HNQ2 peroxisomal membrane protein 11E-like4.0e-10987.12Show/hide
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A0A6J1KGQ4 peroxisomal membrane protein 11C-like3.1e-10987.12Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
O80845 Peroxisomal membrane protein 11D1.1e-10078.26Show/hide
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Q10SM7 Peroxisomal membrane protein 11-14.2e-9575.55Show/hide
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Q5VRJ8 Peroxisomal membrane protein 11-51.8e-9071.86Show/hide
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Q84JW1 Peroxisomal membrane protein 11E6.9e-9876.19Show/hide
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Q9LQ73 Peroxisomal membrane protein 11C1.7e-10180.09Show/hide
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AT1G01820.1 peroxin 11c1.2e-10280.09Show/hide
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AT2G45740.1 peroxin 11D8.1e-10278.26Show/hide
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        DQIVWLGR+GIYKNKER+E +GRISLFCW+G+S CT LVE+GE+GRLS++MKK+EK L++ +K      QDE YR  LKKSNERSLALIK++MD+VVA G
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        LLQLAP K+TPRVTGAFGF++S+ISCYQ++
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AT2G45740.3 peroxin 11D8.1e-10278.26Show/hide
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        M+TLD TR EL L+VLYLNKAEARDKICRAIQYGSKFLS G+PGTAQ VDK+TSLARKVFRLFKFVND HGLISP PKGTPLPL+LLGKSKNALLSTFLF
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        LDQIVWLGR+GIYKNKER+E +GRISLFCWLG+S CT  VE+GE+GRLS++MKK+EK+L+           DE YR  L+KSN+R+LALIK+SMD++VA+
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        GLLQLAPK ++PRVTGAFGF +SLISCYQ++
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
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AAAGGTCCCTGGCCCTGATTAAAGCATCCATGGATTTAGTGGTTGCTGTTGGACTACTTCAGTTGGCACCAAAGAAAGTTACGCCACGTGTCACAGGCGCTTTTGGATTC
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