; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

MS005424 (gene) of Bitter gourd (TR) v1 genome

Gene IDMS005424
OrganismMomordica charantia cv. TR (Bitter gourd (TR) v1)
Descriptionras-related protein RABH1b
Genome locationscaffold641:94776..100053
RNA-Seq ExpressionMS005424
SyntenyMS005424
Gene Ontology termsGO:0006886 - intracellular protein transport (biological process)
GO:0006890 - retrograde vesicle-mediated transport, Golgi to endoplasmic reticulum (biological process)
GO:0006891 - intra-Golgi vesicle-mediated transport (biological process)
GO:0042147 - retrograde transport, endosome to Golgi (biological process)
GO:0005794 - Golgi apparatus (cellular component)
GO:0005829 - cytosol (cellular component)
GO:0003924 - GTPase activity (molecular function)
GO:0005525 - GTP binding (molecular function)
InterPro domainsIPR001806 - Small GTPase
IPR005225 - Small GTP-binding protein domain
IPR027417 - P-loop containing nucleoside triphosphate hydrolase


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG7036170.1 Ras-related protein RABH1b, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]4.6e-10698.56Show/hide
Query:  MAPVSALAKYKLVFLGDQSVGKTSIITRFMYDKFDNTYQATIGIDFLSKTMYLEDRTVRLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSSVAVIVYDVASRQTFLNT
        MAP SALAKYKLVFLGDQSVGKTSIITRFMYDKFDNTYQATIGIDFLSKTMYLEDRTVRLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSSVAVIVYDVASRQTF+NT
Subjt:  MAPVSALAKYKLVFLGDQSVGKTSIITRFMYDKFDNTYQATIGIDFLSKTMYLEDRTVRLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSSVAVIVYDVASRQTFLNT

Query:  SKWIEEVRTERGSDVIIVLVGNKTDLVEKRQVSIEEGEAKARELNVMFIETSAKAGFNIKALFRKIAAALPGMETLSSTKQEDMVDVNLKSSGSGAAQSQ
        SKWIEEVRTERGSDVIIVLVGNKTDLVEKRQVS+EEGEAKARELNVMFIETSAKAGFNIKALFRKIAAALPGMETLSSTKQEDMVDVNLKSSGSGAAQSQ
Subjt:  SKWIEEVRTERGSDVIIVLVGNKTDLVEKRQVSIEEGEAKARELNVMFIETSAKAGFNIKALFRKIAAALPGMETLSSTKQEDMVDVNLKSSGSGAAQSQ

Query:  PQSGGCAC
        PQSGGCAC
Subjt:  PQSGGCAC

XP_022159735.1 ras-related protein RABH1b [Momordica charantia]5.4e-107100Show/hide
Query:  MAPVSALAKYKLVFLGDQSVGKTSIITRFMYDKFDNTYQATIGIDFLSKTMYLEDRTVRLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSSVAVIVYDVASRQTFLNT
        MAPVSALAKYKLVFLGDQSVGKTSIITRFMYDKFDNTYQATIGIDFLSKTMYLEDRTVRLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSSVAVIVYDVASRQTFLNT
Subjt:  MAPVSALAKYKLVFLGDQSVGKTSIITRFMYDKFDNTYQATIGIDFLSKTMYLEDRTVRLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSSVAVIVYDVASRQTFLNT

Query:  SKWIEEVRTERGSDVIIVLVGNKTDLVEKRQVSIEEGEAKARELNVMFIETSAKAGFNIKALFRKIAAALPGMETLSSTKQEDMVDVNLKSSGSGAAQSQ
        SKWIEEVRTERGSDVIIVLVGNKTDLVEKRQVSIEEGEAKARELNVMFIETSAKAGFNIKALFRKIAAALPGMETLSSTKQEDMVDVNLKSSGSGAAQSQ
Subjt:  SKWIEEVRTERGSDVIIVLVGNKTDLVEKRQVSIEEGEAKARELNVMFIETSAKAGFNIKALFRKIAAALPGMETLSSTKQEDMVDVNLKSSGSGAAQSQ

Query:  PQSGGCAC
        PQSGGCAC
Subjt:  PQSGGCAC

XP_022958673.1 ras-related protein RABH1b [Cucurbita moschata]4.6e-10698.56Show/hide
Query:  MAPVSALAKYKLVFLGDQSVGKTSIITRFMYDKFDNTYQATIGIDFLSKTMYLEDRTVRLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSSVAVIVYDVASRQTFLNT
        MAP SALAKYKLVFLGDQSVGKTSIITRFMYDKFDNTYQATIGIDFLSKTMYLEDRTVRLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSSVAVIVYDVASRQTF+NT
Subjt:  MAPVSALAKYKLVFLGDQSVGKTSIITRFMYDKFDNTYQATIGIDFLSKTMYLEDRTVRLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSSVAVIVYDVASRQTFLNT

Query:  SKWIEEVRTERGSDVIIVLVGNKTDLVEKRQVSIEEGEAKARELNVMFIETSAKAGFNIKALFRKIAAALPGMETLSSTKQEDMVDVNLKSSGSGAAQSQ
        SKWIEEVRTERGSDVIIVLVGNKTDLVEKRQVS+EEGEAKARELNVMFIETSAKAGFNIKALFRKIAAALPGMETLSSTKQEDMVDVNLKSSGSGAAQSQ
Subjt:  SKWIEEVRTERGSDVIIVLVGNKTDLVEKRQVSIEEGEAKARELNVMFIETSAKAGFNIKALFRKIAAALPGMETLSSTKQEDMVDVNLKSSGSGAAQSQ

Query:  PQSGGCAC
        PQSGGCAC
Subjt:  PQSGGCAC

XP_022996115.1 ras-related protein RABH1b [Cucurbita maxima]1.0e-10598.08Show/hide
Query:  MAPVSALAKYKLVFLGDQSVGKTSIITRFMYDKFDNTYQATIGIDFLSKTMYLEDRTVRLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSSVAVIVYDVASRQTFLNT
        MAP SALAKYKLVFLGDQSVGKTSIITRFMYDKFDNTYQATIGIDFLSKTMYLEDRTVRLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSSVAVIVYDVASRQTF+NT
Subjt:  MAPVSALAKYKLVFLGDQSVGKTSIITRFMYDKFDNTYQATIGIDFLSKTMYLEDRTVRLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSSVAVIVYDVASRQTFLNT

Query:  SKWIEEVRTERGSDVIIVLVGNKTDLVEKRQVSIEEGEAKARELNVMFIETSAKAGFNIKALFRKIAAALPGMETLSSTKQEDMVDVNLKSSGSGAAQSQ
        SKWIEEVRTERGSDVIIVLVGNKTDLVEKRQVS+EEGEAKARELNVMFIETSAKAGFNIKALFRKIAAALPGMETLSSTKQEDMVDVNLKS+GSGAAQSQ
Subjt:  SKWIEEVRTERGSDVIIVLVGNKTDLVEKRQVSIEEGEAKARELNVMFIETSAKAGFNIKALFRKIAAALPGMETLSSTKQEDMVDVNLKSSGSGAAQSQ

Query:  PQSGGCAC
        PQSGGCAC
Subjt:  PQSGGCAC

XP_038889006.1 ras-related protein RABH1b [Benincasa hispida]3.5e-10699.04Show/hide
Query:  MAPVSALAKYKLVFLGDQSVGKTSIITRFMYDKFDNTYQATIGIDFLSKTMYLEDRTVRLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSSVAVIVYDVASRQTFLNT
        MAP SALAKYKLVFLGDQSVGKTSIITRFMYDKFDNTYQATIGIDFLSKTMYLEDRTVRLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSSVAVIVYDVASRQTFLNT
Subjt:  MAPVSALAKYKLVFLGDQSVGKTSIITRFMYDKFDNTYQATIGIDFLSKTMYLEDRTVRLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSSVAVIVYDVASRQTFLNT

Query:  SKWIEEVRTERGSDVIIVLVGNKTDLVEKRQVSIEEGEAKARELNVMFIETSAKAGFNIKALFRKIAAALPGMETLSSTKQEDMVDVNLKSSGSGAAQSQ
        SKWIEEVRTERGSDVIIVLVGNKTDLVEKRQVSIEEGEAKARELNVMFIETSAKAGFNIKALFRKIAAALPGMETLSSTKQEDMVDVNLKS+GSGAAQSQ
Subjt:  SKWIEEVRTERGSDVIIVLVGNKTDLVEKRQVSIEEGEAKARELNVMFIETSAKAGFNIKALFRKIAAALPGMETLSSTKQEDMVDVNLKSSGSGAAQSQ

Query:  PQSGGCAC
        PQSGGCAC
Subjt:  PQSGGCAC

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0LI95 Uncharacterized protein8.4e-10698.56Show/hide
Query:  MAPVSALAKYKLVFLGDQSVGKTSIITRFMYDKFDNTYQATIGIDFLSKTMYLEDRTVRLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSSVAVIVYDVASRQTFLNT
        MAP SALAKYKLVFLGDQSVGKTSIITRFMYDKFDNTYQATIGIDFLSKTMYLEDRTVRLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSSVAVIVYDVASRQTFLNT
Subjt:  MAPVSALAKYKLVFLGDQSVGKTSIITRFMYDKFDNTYQATIGIDFLSKTMYLEDRTVRLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSSVAVIVYDVASRQTFLNT

Query:  SKWIEEVRTERGSDVIIVLVGNKTDLVEKRQVSIEEGEAKARELNVMFIETSAKAGFNIKALFRKIAAALPGMETLSSTKQEDMVDVNLKSSGSGAAQSQ
        SKWIEEVRTERGSDVIIVLVGNKTDLVEKRQVSIEEGEAKARELNVMFIETSAKAGFNIKALFRKIAAALPGMETLSSTKQEDMVDVNLKS+GSGAAQSQ
Subjt:  SKWIEEVRTERGSDVIIVLVGNKTDLVEKRQVSIEEGEAKARELNVMFIETSAKAGFNIKALFRKIAAALPGMETLSSTKQEDMVDVNLKSSGSGAAQSQ

Query:  PQSGGCAC
        PQS GCAC
Subjt:  PQSGGCAC

A0A5A7TB19 Ras-related protein RABH1b-like isoform X18.4e-10698.56Show/hide
Query:  MAPVSALAKYKLVFLGDQSVGKTSIITRFMYDKFDNTYQATIGIDFLSKTMYLEDRTVRLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSSVAVIVYDVASRQTFLNT
        MAP SALAKYKLVFLGDQSVGKTSIITRFMYDKFDNTYQATIGIDFLSKTMYLEDRTVRLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSSVAVIVYDVASRQTFLNT
Subjt:  MAPVSALAKYKLVFLGDQSVGKTSIITRFMYDKFDNTYQATIGIDFLSKTMYLEDRTVRLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSSVAVIVYDVASRQTFLNT

Query:  SKWIEEVRTERGSDVIIVLVGNKTDLVEKRQVSIEEGEAKARELNVMFIETSAKAGFNIKALFRKIAAALPGMETLSSTKQEDMVDVNLKSSGSGAAQSQ
        SKWIEEVRTERGSDVIIVLVGNKTDLVEKRQVSIEEGEAKARELNVMFIETSAKAGFNIKALFRKIAAALPGMETLSSTKQEDMVDVNLKS+GSGAAQSQ
Subjt:  SKWIEEVRTERGSDVIIVLVGNKTDLVEKRQVSIEEGEAKARELNVMFIETSAKAGFNIKALFRKIAAALPGMETLSSTKQEDMVDVNLKSSGSGAAQSQ

Query:  PQSGGCAC
        PQS GCAC
Subjt:  PQSGGCAC

A0A6J1DZL5 ras-related protein RABH1b2.6e-107100Show/hide
Query:  MAPVSALAKYKLVFLGDQSVGKTSIITRFMYDKFDNTYQATIGIDFLSKTMYLEDRTVRLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSSVAVIVYDVASRQTFLNT
        MAPVSALAKYKLVFLGDQSVGKTSIITRFMYDKFDNTYQATIGIDFLSKTMYLEDRTVRLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSSVAVIVYDVASRQTFLNT
Subjt:  MAPVSALAKYKLVFLGDQSVGKTSIITRFMYDKFDNTYQATIGIDFLSKTMYLEDRTVRLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSSVAVIVYDVASRQTFLNT

Query:  SKWIEEVRTERGSDVIIVLVGNKTDLVEKRQVSIEEGEAKARELNVMFIETSAKAGFNIKALFRKIAAALPGMETLSSTKQEDMVDVNLKSSGSGAAQSQ
        SKWIEEVRTERGSDVIIVLVGNKTDLVEKRQVSIEEGEAKARELNVMFIETSAKAGFNIKALFRKIAAALPGMETLSSTKQEDMVDVNLKSSGSGAAQSQ
Subjt:  SKWIEEVRTERGSDVIIVLVGNKTDLVEKRQVSIEEGEAKARELNVMFIETSAKAGFNIKALFRKIAAALPGMETLSSTKQEDMVDVNLKSSGSGAAQSQ

Query:  PQSGGCAC
        PQSGGCAC
Subjt:  PQSGGCAC

A0A6J1H3Q8 ras-related protein RABH1b2.2e-10698.56Show/hide
Query:  MAPVSALAKYKLVFLGDQSVGKTSIITRFMYDKFDNTYQATIGIDFLSKTMYLEDRTVRLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSSVAVIVYDVASRQTFLNT
        MAP SALAKYKLVFLGDQSVGKTSIITRFMYDKFDNTYQATIGIDFLSKTMYLEDRTVRLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSSVAVIVYDVASRQTF+NT
Subjt:  MAPVSALAKYKLVFLGDQSVGKTSIITRFMYDKFDNTYQATIGIDFLSKTMYLEDRTVRLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSSVAVIVYDVASRQTFLNT

Query:  SKWIEEVRTERGSDVIIVLVGNKTDLVEKRQVSIEEGEAKARELNVMFIETSAKAGFNIKALFRKIAAALPGMETLSSTKQEDMVDVNLKSSGSGAAQSQ
        SKWIEEVRTERGSDVIIVLVGNKTDLVEKRQVS+EEGEAKARELNVMFIETSAKAGFNIKALFRKIAAALPGMETLSSTKQEDMVDVNLKSSGSGAAQSQ
Subjt:  SKWIEEVRTERGSDVIIVLVGNKTDLVEKRQVSIEEGEAKARELNVMFIETSAKAGFNIKALFRKIAAALPGMETLSSTKQEDMVDVNLKSSGSGAAQSQ

Query:  PQSGGCAC
        PQSGGCAC
Subjt:  PQSGGCAC

A0A6J1K5U1 ras-related protein RABH1b4.9e-10698.08Show/hide
Query:  MAPVSALAKYKLVFLGDQSVGKTSIITRFMYDKFDNTYQATIGIDFLSKTMYLEDRTVRLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSSVAVIVYDVASRQTFLNT
        MAP SALAKYKLVFLGDQSVGKTSIITRFMYDKFDNTYQATIGIDFLSKTMYLEDRTVRLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSSVAVIVYDVASRQTF+NT
Subjt:  MAPVSALAKYKLVFLGDQSVGKTSIITRFMYDKFDNTYQATIGIDFLSKTMYLEDRTVRLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSSVAVIVYDVASRQTFLNT

Query:  SKWIEEVRTERGSDVIIVLVGNKTDLVEKRQVSIEEGEAKARELNVMFIETSAKAGFNIKALFRKIAAALPGMETLSSTKQEDMVDVNLKSSGSGAAQSQ
        SKWIEEVRTERGSDVIIVLVGNKTDLVEKRQVS+EEGEAKARELNVMFIETSAKAGFNIKALFRKIAAALPGMETLSSTKQEDMVDVNLKS+GSGAAQSQ
Subjt:  SKWIEEVRTERGSDVIIVLVGNKTDLVEKRQVSIEEGEAKARELNVMFIETSAKAGFNIKALFRKIAAALPGMETLSSTKQEDMVDVNLKSSGSGAAQSQ

Query:  PQSGGCAC
        PQSGGCAC
Subjt:  PQSGGCAC

SwissProt top hitse value%identityAlignment
O80501 Ras-related protein RABH1b4.9e-10393.27Show/hide
Query:  MAPVSALAKYKLVFLGDQSVGKTSIITRFMYDKFDNTYQATIGIDFLSKTMYLEDRTVRLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSSVAVIVYDVASRQTFLNT
        MAPVSALAKYKLVFLGDQSVGKTSIITRFMYDKFDNTYQATIGIDFLSKTMYLEDRTVRLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSSVAVIVYDVASRQ+FLNT
Subjt:  MAPVSALAKYKLVFLGDQSVGKTSIITRFMYDKFDNTYQATIGIDFLSKTMYLEDRTVRLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSSVAVIVYDVASRQTFLNT

Query:  SKWIEEVRTERGSDVIIVLVGNKTDLVEKRQVSIEEGEAKARELNVMFIETSAKAGFNIKALFRKIAAALPGMETLSSTKQEDMVDVNLKSSGSGAAQSQ
        +KWI+EVRTERGSDVI+VLVGNKTDLV+KRQVSIEE EAKARELNVMFIETSAKAGFNIKALFRKIAAALPGMETLSSTKQEDMVDVNLKSS + A+ +Q
Subjt:  SKWIEEVRTERGSDVIIVLVGNKTDLVEKRQVSIEEGEAKARELNVMFIETSAKAGFNIKALFRKIAAALPGMETLSSTKQEDMVDVNLKSSGSGAAQSQ

Query:  PQSGGCAC
         QSGGC+C
Subjt:  PQSGGCAC

P20340 Ras-related protein Rab-6A1.8e-8175.37Show/hide
Query:  LAKYKLVFLGDQSVGKTSIITRFMYDKFDNTYQATIGIDFLSKTMYLEDRTVRLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSSVAVIVYDVASRQTFLNTSKWIEE
        L K+KLVFLG+QSVGKTS+ITRFMYD FDNTYQATIGIDFLSKTMYLEDRTVRLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDS+VAV+VYD+ +  +F  T+KWI++
Subjt:  LAKYKLVFLGDQSVGKTSIITRFMYDKFDNTYQATIGIDFLSKTMYLEDRTVRLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSSVAVIVYDVASRQTFLNTSKWIEE

Query:  VRTERGSDVIIVLVGNKTDLVEKRQVSIEEGEAKARELNVMFIETSAKAGFNIKALFRKIAAALPGMETLSSTKQEDMVDVNLKSSGSGAAQSQPQS-GG
        VRTERGSDVII+LVGNKTDL +KRQVSIEEGE KA+ELNVMFIETSAKAG+N+K LFR++AAALPGME+     +EDM+D+ L+       Q QP S GG
Subjt:  VRTERGSDVIIVLVGNKTDLVEKRQVSIEEGEAKARELNVMFIETSAKAGFNIKALFRKIAAALPGMETLSSTKQEDMVDVNLKSSGSGAAQSQPQS-GG

Query:  CAC
        C+C
Subjt:  CAC

Q9LFT9 Ras-related protein RABH1e1.2e-9689.42Show/hide
Query:  MAPVSALAKYKLVFLGDQSVGKTSIITRFMYDKFDNTYQATIGIDFLSKTMYLEDRTVRLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSSVAVIVYDVASRQTFLNT
        MA VS LAKYKLVFLGDQSVGKTSIITRFMYDKFD TYQATIGIDFLSKTMYLEDRTVRLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSSVAVIVYDVA+RQ+FLNT
Subjt:  MAPVSALAKYKLVFLGDQSVGKTSIITRFMYDKFDNTYQATIGIDFLSKTMYLEDRTVRLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSSVAVIVYDVASRQTFLNT

Query:  SKWIEEVRTERGSDVIIVLVGNKTDLVEKRQVSIEEGEAKARELNVMFIETSAKAGFNIKALFRKIAAALPGMETLSSTKQEDMVDVNLKSSGSGAAQSQ
        SKWIE+VRTERGSDVIIVLVGNKTDLV+KRQVSIEEG+ KAR+  V+FIETSAKAGFNIK LFRKIAAALPGMETLSSTKQEDMVDVNLK+S S +AQ +
Subjt:  SKWIEEVRTERGSDVIIVLVGNKTDLVEKRQVSIEEGEAKARELNVMFIETSAKAGFNIKALFRKIAAALPGMETLSSTKQEDMVDVNLKSSGSGAAQSQ

Query:  PQSGGCAC
         Q GGCAC
Subjt:  PQSGGCAC

Q9SID8 Ras-related protein RABH1d2.5e-9184.62Show/hide
Query:  MAPVSALAKYKLVFLGDQSVGKTSIITRFMYDKFDNTYQATIGIDFLSKTMYLEDRTVRLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSSVAVIVYDVASRQTFLNT
        MA VS LAKYKLVFLGDQSVGKTSIITRFMYDKFD TYQATIGIDFLSKTMYLEDRTVRLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSSVAV+VYDVA+R +FLNT
Subjt:  MAPVSALAKYKLVFLGDQSVGKTSIITRFMYDKFDNTYQATIGIDFLSKTMYLEDRTVRLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSSVAVIVYDVASRQTFLNT

Query:  SKWIEEVRTERGSDVIIVLVGNKTDLVEKRQVSIEEGEAKARELNVMFIETSAKAGFNIKALFRKIAAALPGMETLSSTKQEDMVDVNLKSSGSGAAQSQ
        SKWIEEVR ER  DVIIVLVGNKTDLVEKRQVSIEEG++K RE  VMFIETSAKAGFNIK LFRKIAAALPGME+ S+TK EDMVDVNLK + S ++Q  
Subjt:  SKWIEEVRTERGSDVIIVLVGNKTDLVEKRQVSIEEGEAKARELNVMFIETSAKAGFNIKALFRKIAAALPGMETLSSTKQEDMVDVNLKSSGSGAAQSQ

Query:  PQSGGCAC
         Q G C+C
Subjt:  PQSGGCAC

Q9SMR4 Ras-related protein RABH1c2.3e-8478.6Show/hide
Query:  MAPVSALAKYKLVFLGDQSVGKTSIITRFMYDKFDNTYQATIGIDFLSKTMYLEDRTVRLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSSVAVIVYDVASRQTFLNT
        MA VS LAK+KLVFLGDQSVGKTSIITRFMYDKFD TYQ TIGIDFLSKTMYLEDRTVRLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSSVA++VYDV++RQTFLNT
Subjt:  MAPVSALAKYKLVFLGDQSVGKTSIITRFMYDKFDNTYQATIGIDFLSKTMYLEDRTVRLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSSVAVIVYDVASRQTFLNT

Query:  SKWIEEVRTERG-SDVIIVLVGNKTDLVEKRQVSIEEGEAKARELNVMFIETSAKAGFNIKALFRKIAAALPGMETLS-STKQEDMVDVNLKSSGSGAAQ
        SKWIE+V  ERG S+VIIVLVGNKTDLVEKRQVSI EGE K +E  VMFIETSAK  FNIKALFRKIAAALPG+++ S +TK +DMVDVNLK++ S ++Q
Subjt:  SKWIEEVRTERG-SDVIIVLVGNKTDLVEKRQVSIEEGEAKARELNVMFIETSAKAGFNIKALFRKIAAALPGMETLS-STKQEDMVDVNLKSSGSGAAQ

Query:  SQPQ-----SGGCAC
         + Q      GGC+C
Subjt:  SQPQ-----SGGCAC

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT2G22290.1 RAB GTPase homolog H1D1.8e-9284.62Show/hide
Query:  MAPVSALAKYKLVFLGDQSVGKTSIITRFMYDKFDNTYQATIGIDFLSKTMYLEDRTVRLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSSVAVIVYDVASRQTFLNT
        MA VS LAKYKLVFLGDQSVGKTSIITRFMYDKFD TYQATIGIDFLSKTMYLEDRTVRLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSSVAV+VYDVA+R +FLNT
Subjt:  MAPVSALAKYKLVFLGDQSVGKTSIITRFMYDKFDNTYQATIGIDFLSKTMYLEDRTVRLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSSVAVIVYDVASRQTFLNT

Query:  SKWIEEVRTERGSDVIIVLVGNKTDLVEKRQVSIEEGEAKARELNVMFIETSAKAGFNIKALFRKIAAALPGMETLSSTKQEDMVDVNLKSSGSGAAQSQ
        SKWIEEVR ER  DVIIVLVGNKTDLVEKRQVSIEEG++K RE  VMFIETSAKAGFNIK LFRKIAAALPGME+ S+TK EDMVDVNLK + S ++Q  
Subjt:  SKWIEEVRTERGSDVIIVLVGNKTDLVEKRQVSIEEGEAKARELNVMFIETSAKAGFNIKALFRKIAAALPGMETLSSTKQEDMVDVNLKSSGSGAAQSQ

Query:  PQSGGCAC
         Q G C+C
Subjt:  PQSGGCAC

AT2G44610.1 Ras-related small GTP-binding family protein3.5e-10493.27Show/hide
Query:  MAPVSALAKYKLVFLGDQSVGKTSIITRFMYDKFDNTYQATIGIDFLSKTMYLEDRTVRLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSSVAVIVYDVASRQTFLNT
        MAPVSALAKYKLVFLGDQSVGKTSIITRFMYDKFDNTYQATIGIDFLSKTMYLEDRTVRLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSSVAVIVYDVASRQ+FLNT
Subjt:  MAPVSALAKYKLVFLGDQSVGKTSIITRFMYDKFDNTYQATIGIDFLSKTMYLEDRTVRLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSSVAVIVYDVASRQTFLNT

Query:  SKWIEEVRTERGSDVIIVLVGNKTDLVEKRQVSIEEGEAKARELNVMFIETSAKAGFNIKALFRKIAAALPGMETLSSTKQEDMVDVNLKSSGSGAAQSQ
        +KWI+EVRTERGSDVI+VLVGNKTDLV+KRQVSIEE EAKARELNVMFIETSAKAGFNIKALFRKIAAALPGMETLSSTKQEDMVDVNLKSS + A+ +Q
Subjt:  SKWIEEVRTERGSDVIIVLVGNKTDLVEKRQVSIEEGEAKARELNVMFIETSAKAGFNIKALFRKIAAALPGMETLSSTKQEDMVDVNLKSSGSGAAQSQ

Query:  PQSGGCAC
         QSGGC+C
Subjt:  PQSGGCAC

AT4G39890.1 RAB GTPase homolog H1C1.6e-8578.6Show/hide
Query:  MAPVSALAKYKLVFLGDQSVGKTSIITRFMYDKFDNTYQATIGIDFLSKTMYLEDRTVRLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSSVAVIVYDVASRQTFLNT
        MA VS LAK+KLVFLGDQSVGKTSIITRFMYDKFD TYQ TIGIDFLSKTMYLEDRTVRLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSSVA++VYDV++RQTFLNT
Subjt:  MAPVSALAKYKLVFLGDQSVGKTSIITRFMYDKFDNTYQATIGIDFLSKTMYLEDRTVRLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSSVAVIVYDVASRQTFLNT

Query:  SKWIEEVRTERG-SDVIIVLVGNKTDLVEKRQVSIEEGEAKARELNVMFIETSAKAGFNIKALFRKIAAALPGMETLS-STKQEDMVDVNLKSSGSGAAQ
        SKWIE+V  ERG S+VIIVLVGNKTDLVEKRQVSI EGE K +E  VMFIETSAK  FNIKALFRKIAAALPG+++ S +TK +DMVDVNLK++ S ++Q
Subjt:  SKWIEEVRTERG-SDVIIVLVGNKTDLVEKRQVSIEEGEAKARELNVMFIETSAKAGFNIKALFRKIAAALPGMETLS-STKQEDMVDVNLKSSGSGAAQ

Query:  SQPQ-----SGGCAC
         + Q      GGC+C
Subjt:  SQPQ-----SGGCAC

AT5G10260.1 RAB GTPase homolog H1E8.3e-9889.42Show/hide
Query:  MAPVSALAKYKLVFLGDQSVGKTSIITRFMYDKFDNTYQATIGIDFLSKTMYLEDRTVRLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSSVAVIVYDVASRQTFLNT
        MA VS LAKYKLVFLGDQSVGKTSIITRFMYDKFD TYQATIGIDFLSKTMYLEDRTVRLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSSVAVIVYDVA+RQ+FLNT
Subjt:  MAPVSALAKYKLVFLGDQSVGKTSIITRFMYDKFDNTYQATIGIDFLSKTMYLEDRTVRLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSSVAVIVYDVASRQTFLNT

Query:  SKWIEEVRTERGSDVIIVLVGNKTDLVEKRQVSIEEGEAKARELNVMFIETSAKAGFNIKALFRKIAAALPGMETLSSTKQEDMVDVNLKSSGSGAAQSQ
        SKWIE+VRTERGSDVIIVLVGNKTDLV+KRQVSIEEG+ KAR+  V+FIETSAKAGFNIK LFRKIAAALPGMETLSSTKQEDMVDVNLK+S S +AQ +
Subjt:  SKWIEEVRTERGSDVIIVLVGNKTDLVEKRQVSIEEGEAKARELNVMFIETSAKAGFNIKALFRKIAAALPGMETLSSTKQEDMVDVNLKSSGSGAAQSQ

Query:  PQSGGCAC
         Q GGCAC
Subjt:  PQSGGCAC

AT5G64990.1 RAB GTPase homolog H1A9.5e-7875.88Show/hide
Query:  YKLVFLGDQSVGKTSIITRFMYDKFDNTYQATIGIDFLSKTMYLEDRTVRLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSSVAVIVYDVASRQTFLNTSKWIEEVRT
        YKLVFLGDQ VGKTSIIT FMY KFD +YQATIGIDFLSKT   EDRT RLQLWDTAGQERF+SL+PSYIRDSSVAVIVYDVAS+Q+F+NTSKWIEEVR 
Subjt:  YKLVFLGDQSVGKTSIITRFMYDKFDNTYQATIGIDFLSKTMYLEDRTVRLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSSVAVIVYDVASRQTFLNTSKWIEEVRT

Query:  ERGSDVIIVLVGNKTDLVEKRQVSIEEGEAKARELNVMFIETSAKAGFNIKALFRKIAAALPGMETLSSTKQEDMVDVNLKSSGSGAAQSQPQSGGCAC
        ERGS VIIVLVGNKTDLV KRQVSIEEGE KARE   +F+ETSAKAGFNIK LF KI +AL G E +S TKQED+VDVNLK     +  +  Q   C+C
Subjt:  ERGSDVIIVLVGNKTDLVEKRQVSIEEGEAKARELNVMFIETSAKAGFNIKALFRKIAAALPGMETLSSTKQEDMVDVNLKSSGSGAAQSQPQSGGCAC


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGCACCAGTGTCAGCTCTCGCGAAGTATAAGCTGGTCTTTCTCGGAGACCAGTCTGTTGGGAAAACCAGCATCATCACACGCTTCATGTACGACAAATTCGACAATAC
GTATCAGGCTACGATCGGTATTGATTTTCTCTCAAAGACTATGTATCTTGAAGATCGCACTGTCCGACTACAGTTGTGGGACACTGCTGGACAGGAAAGATTCAGAAGTC
TAATACCCAGCTATATCAGGGACTCATCCGTCGCTGTCATTGTTTATGATGTTGCAAGCCGGCAGACTTTTCTAAACACTTCAAAATGGATTGAGGAGGTGCGCACTGAG
AGGGGAAGTGATGTCATTATAGTGCTTGTTGGAAACAAAACCGACCTCGTGGAGAAGAGGCAAGTCTCTATAGAGGAAGGAGAAGCCAAAGCCCGTGAACTAAATGTCAT
GTTTATCGAAACAAGTGCAAAAGCTGGATTCAATATTAAGGCACTTTTTAGGAAAATTGCTGCAGCGTTGCCGGGAATGGAAACTCTCTCTTCAACAAAACAAGAAGACA
TGGTTGATGTTAACCTGAAGTCCTCCGGCAGTGGCGCTGCACAGTCCCAGCCGCAGTCCGGTGGATGCGCCTGC
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGGCACCAGTGTCAGCTCTCGCGAAGTATAAGCTGGTCTTTCTCGGAGACCAGTCTGTTGGGAAAACCAGCATCATCACACGCTTCATGTACGACAAATTCGACAATAC
GTATCAGGCTACGATCGGTATTGATTTTCTCTCAAAGACTATGTATCTTGAAGATCGCACTGTCCGACTACAGTTGTGGGACACTGCTGGACAGGAAAGATTCAGAAGTC
TAATACCCAGCTATATCAGGGACTCATCCGTCGCTGTCATTGTTTATGATGTTGCAAGCCGGCAGACTTTTCTAAACACTTCAAAATGGATTGAGGAGGTGCGCACTGAG
AGGGGAAGTGATGTCATTATAGTGCTTGTTGGAAACAAAACCGACCTCGTGGAGAAGAGGCAAGTCTCTATAGAGGAAGGAGAAGCCAAAGCCCGTGAACTAAATGTCAT
GTTTATCGAAACAAGTGCAAAAGCTGGATTCAATATTAAGGCACTTTTTAGGAAAATTGCTGCAGCGTTGCCGGGAATGGAAACTCTCTCTTCAACAAAACAAGAAGACA
TGGTTGATGTTAACCTGAAGTCCTCCGGCAGTGGCGCTGCACAGTCCCAGCCGCAGTCCGGTGGATGCGCCTGC
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MAPVSALAKYKLVFLGDQSVGKTSIITRFMYDKFDNTYQATIGIDFLSKTMYLEDRTVRLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSSVAVIVYDVASRQTFLNTSKWIEEVRTE
RGSDVIIVLVGNKTDLVEKRQVSIEEGEAKARELNVMFIETSAKAGFNIKALFRKIAAALPGMETLSSTKQEDMVDVNLKSSGSGAAQSQPQSGGCAC