; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

MS005584 (gene) of Bitter gourd (TR) v1 genome

Gene IDMS005584
OrganismMomordica charantia cv. TR (Bitter gourd (TR) v1)
DescriptionUnknown protein
Genome locationscaffold254:102716..107644
RNA-Seq ExpressionMS005584
SyntenyMS005584
Gene Ontology termsNA
InterPro domainsIPR027902 - Protein of unknown function DUF4487


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG7028781.1 hypothetical protein SDJN02_09962, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]0.0e+0087.01Show/hide
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A0A6J1CZS0 uncharacterized protein LOC111016053 isoform X20.0e+0099.68Show/hide
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Query:  PQNAALSYDLESGKQVNEEGFMLEFKIFLEKEMALLTVTTSGDQLALLMKEGLMLKDVLNKILKSCEKGIECKSMDTDEGPSSRKRKLPEGISKGMDLLK
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        NGLKVMRQGLSLLEGSHVDSRELHNKLFSHFFGLEDEIARLGNQGGGD
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A0A6J1GBD2 uncharacterized protein LOC1114526030.0e+0087.32Show/hide
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        K LM+TVENF LEQLNLMNESVSEIQRI+EFG EILKAVQM+IDAMIKFCEVHSQALD EFS E+ D TSSA NH INVHK IIEKLCELGTIAAKGGGG
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        N LLNLLR+SFDLSDD KLLITTKL  LLD LVQEDVYASVLLLQVPFLY SGKTTELKWQPLFSSL+HALKTFMVAVSSS AW+ELQSFLL+NLLHPHF
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        LSEKIK+IAIQ M+HDYL+FIG+FDETSML  SS VIGLPVFSAS TIQS+KLSTSDIDVRTLKFLLALLR YK+SGV +VKGFCRKLISETL IISCMK
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Query:  PQNAALSYDLESGKQVNEEGFMLEFKIFLEKEMALLTVTTSGDQLALLMKEGLMLKDVLNKILKSCEKGIECKSMDTDEGPSSRKRKLPEGISKGMDLLK
        PQNAALSYDLESGK VNEEGFMLEFKIFLEKEMALLTVT S +QLALLMKEGL+LKD  N +LKSC KGIECKSM+ DEGPSSRKRKLPEGISKGM+LLK
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Query:  NGLKVMRQGLSLLEGSHVDSRELHNKLFSHFFGLEDEIARLGNQGG
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A0A6J1IF25 uncharacterized protein LOC111473635 isoform X10.0e+0085.84Show/hide
Query:  IFWEDFTCLDVTQCLLNRTILLVAIKRLEKDTAGSLAQFLRLGVKASIWCGKHLKMTLMSIQESQEEEHSNLFFQVLLLDALKFSAASFSALARYPLFED
        +FWEDFTCLDVTQCLLNRTILLVA+KR+EKD A  L QFL L VKAS+WC KHLKMTLMSIQESQEEEHSNLFFQ LLLDA+KFSAA FSALARYPL ED
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Query:  KMLMSTVENFTLEQLNLMNESVSEIQRIQEFGSEILKAVQMIIDAMIKFCEVHSQALDGEFSDENSDKTSSAANHAINVHKCIIEKLCELGTIAAKGGGG
        K LM+ VENF LEQLNLMNE VSEIQRI+EFG +ILKAVQM+IDAMIKFCEVHSQAL   FS E+ D TSSA NH INVHK IIEKLCELGTIAAKGGGG
Subjt:  KMLMSTVENFTLEQLNLMNESVSEIQRIQEFGSEILKAVQMIIDAMIKFCEVHSQALDGEFSDENSDKTSSAANHAINVHKCIIEKLCELGTIAAKGGGG

Query:  LVTILNVSWKGVFTLLQHGNMVLLSKVNIAGTILILVSLVIEPLKCAAATWSSVTKEAVSAAEARRIFLPVKFFLINAVKISCLCPCQAYLVHKEIILCV
        LVTILNVSWKGVFTLLQ GN VL SKVNIAG IL LVSLV+EPLKCA+ATWSSVT EAVSA+EARRIFLPVKFFLINAVKISCL PCQAYLVHKEIILCV
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Query:  LTIFTYKFSLSSEKLLETVAEAITELLEPTCLDLVKCIVNSTDLKQDLKLEIMGLLFTTERCSFPDGDPSACFRIDPMNGMFSINCEGMNNGKTLLLGRI
        LTI TYK SLS+EKLL TVAEAITELLE TCLDLVKCI+N+TDLKQDLKL IM LLFT+ERCS PDGDPS CFRIDPMN +F+ NCE M + KTLLLGRI
Subjt:  LTIFTYKFSLSSEKLLETVAEAITELLEPTCLDLVKCIVNSTDLKQDLKLEIMGLLFTTERCSFPDGDPSACFRIDPMNGMFSINCEGMNNGKTLLLGRI

Query:  NLLLNLLRYSFDLSDDAKLLITTKLSWLLDNLVQEDVYASVLLLQVPFLYLSGKTTELKWQPLFSSLLHALKTFMVAVSSSYAWVELQSFLLENLLHPHF
        N LLNLLR+SFDLSDD KLLITTKL  LLD LVQEDVYASVLLLQVPFLY SGKTTELKWQPLFSSL+HALKTFMVAVSSS AW+ELQSFLL+NL HPHF
Subjt:  NLLLNLLRYSFDLSDDAKLLITTKLSWLLDNLVQEDVYASVLLLQVPFLYLSGKTTELKWQPLFSSLLHALKTFMVAVSSSYAWVELQSFLLENLLHPHF

Query:  LCWDIVMELWCFMLRYADNGLVNGVISNLLSVMKSLASSEPVLVYSSALRKMARSINMMLTYGAHSKLNEICEAIFIQDKSRLSTVILVALILEGFPLNL
        LCWDIVMELWCFMLRYAD+GLVNGVISN  SVMK LASSE VLV+SSALRKMAR I M+LTYGAHSKLNEICE+IFIQDKSR STVI  ALILEGFPLNL
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Query:  LSEKIKHIAIQGMVHDYLSFIGNFDETSMLTSSSGVIGLPVFSASATIQSMKLSTSDIDVRTLKFLLALLRGYKISGVGEVKGFCRKLISETLGIISCMK
        LS KIK+IAIQ M+HDYL+FIG+FDETSML  SS VIGLPVFSAS TIQS+KLSTSDIDVRTLKFLLAL+R YK+SGV +VKGFCRKLISETLGIISCMK
Subjt:  LSEKIKHIAIQGMVHDYLSFIGNFDETSMLTSSSGVIGLPVFSASATIQSMKLSTSDIDVRTLKFLLALLRGYKISGVGEVKGFCRKLISETLGIISCMK

Query:  HLYASNEMEEVILELEKLFISGPTASDPLLYECKSGLAPFLAGLAHIKMTETDDNAKSCAVWELYHMLFKERHWALIHLGLTAFGYFAARTSCDELWRFV
        HLYA NEMEEVILELEKLFISGPTASD LLYECKSGL PFLAGLAHIKMTET+DNAKSCAVWELYHMLFKERHWA IHLGLTAFGY+AARTSCDELWRFV
Subjt:  HLYASNEMEEVILELEKLFISGPTASDPLLYECKSGLAPFLAGLAHIKMTETDDNAKSCAVWELYHMLFKERHWALIHLGLTAFGYFAARTSCDELWRFV

Query:  PQNAALSYDLESGKQVNEEGFMLEFKIFLEKEMALLTVTTSGDQLALLMKEGLMLKDVLNKILKSCEKGIECKSMDTDEGPSSRKRKLPEGISKGMDLLK
        PQNAALSYDLESGK VNEEGFMLEFKIFLEKEMALLTVT S +QL LLMKEGL+LKD  N +LKS  KGIECKSM+ DEGPSSRKRKLPEGISKGM+LLK
Subjt:  PQNAALSYDLESGKQVNEEGFMLEFKIFLEKEMALLTVTTSGDQLALLMKEGLMLKDVLNKILKSCEKGIECKSMDTDEGPSSRKRKLPEGISKGMDLLK

Query:  NGLKVMRQGLSLLEGSHVDSRELHNKLFSHFFGLEDEIARLGNQGG
        NGLK MRQGLSLLE +HVDSRELHNKL SHF GLEDEI RL +QGG
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G04650.1 unknown protein4.5e-21544.58Show/hide
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           TV  F  EQLNL  E +   ++++ F SEI KAVQ++ID+ ++ C+ +SQ ++ E S+  +         +  +A  + +++    ++ L ELG +A
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        A+ GG LV ILN SWKGV TLLQ     L+SKV++   IL L+SL+ + L+ AA  WS   KE +SA EARR+FLPVKF+LINAVK+  L P QA +V K
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        L+L+GFPLN L ++IK+ A + +  D+ +FI  FDE    +S   ++G PVF+ SA ++ +K+S S+ID +TL F++AL++ Y+ S     K    +++S
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        ETL IIS  + LY   EM+ VI EL+KLF S        L + K  LA FL+GL+  +M+ET    KS AVWELYHML ++RHWAL+H  +TAFGYF AR
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        TSC++LWRFVP++AAL++D+ SGK+   E FM E K+FLEKE ALL++T S ++L LL KEG  +K  + K+L    +G   +SM+ ++ P ++KRKLPE
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Query:  GISKGMDLLKNGLKVMRQGLSLLEGSHVDSRELHNKLFSHFFGLEDEIARL
        GI +GM+LL+NG+K + +GL+ L     +S E    L + F  LED ++ L
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Sequences Show/hide sequences
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SLIFWEDFTCLDVTQCLLNRTILLVAIKRLEKDTAGSLAQFLRLGVKASIWCGKHLKMTLMSIQESQEEEHSNLFFQVLLLDALKFSAASFSALARYPLFEDKMLMSTVE
NFTLEQLNLMNESVSEIQRIQEFGSEILKAVQMIIDAMIKFCEVHSQALDGEFSDENSDKTSSAANHAINVHKCIIEKLCELGTIAAKGGGGLVTILNVSWKGVFTLLQH
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