; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

MS005615 (gene) of Bitter gourd (TR) v1 genome

Gene IDMS005615
OrganismMomordica charantia cv. TR (Bitter gourd (TR) v1)
Descriptioncytochrome b5-like
Genome locationscaffold254:297581..300232
RNA-Seq ExpressionMS005615
SyntenyMS005615
Gene Ontology termsGO:0042761 - very long-chain fatty acid biosynthetic process (biological process)
GO:0043447 - alkane biosynthetic process (biological process)
GO:0016021 - integral component of membrane (cellular component)
GO:0020037 - heme binding (molecular function)
GO:0046872 - metal ion binding (molecular function)
InterPro domainsIPR001199 - Cytochrome b5-like heme/steroid binding domain
IPR018506 - Cytochrome b5, heme-binding site
IPR036400 - Cytochrome b5-like heme/steroid binding domain superfamily


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
XP_004133998.1 cytochrome b5 [Cucumis sativus]1.3e-6997.76Show/hide
Query:  MGSGEKVFTLKEVAEHNNHRDCWLIISGKVYDVTKFLEDHPGGDDVLLSATGKDATDDFEDVGHSDNAREMMDQYYVGEIDGSTIPKKVTYTPPKQPHYN
        MGSGEKVFTLKEVAEHNNH+DCWLIISGKVYDVTKFLEDHPGGDDVLLSATGKDATDDFEDVGHSDNAREMMDQYYVGEID STIPKKV YTPPKQPHYN
Subjt:  MGSGEKVFTLKEVAEHNNHRDCWLIISGKVYDVTKFLEDHPGGDDVLLSATGKDATDDFEDVGHSDNAREMMDQYYVGEIDGSTIPKKVTYTPPKQPHYN

Query:  QDKTSEFIIKLLQFLVPLAILGLAVAIRFYTKQA
        QDKTSEFIIKLLQFLVPLAILGLAVAIRFYTKQA
Subjt:  QDKTSEFIIKLLQFLVPLAILGLAVAIRFYTKQA

XP_008438367.1 PREDICTED: cytochrome b5 [Cucumis melo]1.3e-6997.76Show/hide
Query:  MGSGEKVFTLKEVAEHNNHRDCWLIISGKVYDVTKFLEDHPGGDDVLLSATGKDATDDFEDVGHSDNAREMMDQYYVGEIDGSTIPKKVTYTPPKQPHYN
        MGSGEKVFTLKEVAEHNNH+DCWLIISGKVYDVTKFLEDHPGGDDVLLSATGKDATDDFEDVGHSDNAREMMDQYYVGEID STIPKKV YTPPKQPHYN
Subjt:  MGSGEKVFTLKEVAEHNNHRDCWLIISGKVYDVTKFLEDHPGGDDVLLSATGKDATDDFEDVGHSDNAREMMDQYYVGEIDGSTIPKKVTYTPPKQPHYN

Query:  QDKTSEFIIKLLQFLVPLAILGLAVAIRFYTKQA
        QDKTSEFIIKLLQFLVPLAILGLAVAIRFYTKQA
Subjt:  QDKTSEFIIKLLQFLVPLAILGLAVAIRFYTKQA

XP_022147043.1 cytochrome b5-like [Momordica charantia]3.1e-71100Show/hide
Query:  MGSGEKVFTLKEVAEHNNHRDCWLIISGKVYDVTKFLEDHPGGDDVLLSATGKDATDDFEDVGHSDNAREMMDQYYVGEIDGSTIPKKVTYTPPKQPHYN
        MGSGEKVFTLKEVAEHNNHRDCWLIISGKVYDVTKFLEDHPGGDDVLLSATGKDATDDFEDVGHSDNAREMMDQYYVGEIDGSTIPKKVTYTPPKQPHYN
Subjt:  MGSGEKVFTLKEVAEHNNHRDCWLIISGKVYDVTKFLEDHPGGDDVLLSATGKDATDDFEDVGHSDNAREMMDQYYVGEIDGSTIPKKVTYTPPKQPHYN

Query:  QDKTSEFIIKLLQFLVPLAILGLAVAIRFYTKQA
        QDKTSEFIIKLLQFLVPLAILGLAVAIRFYTKQA
Subjt:  QDKTSEFIIKLLQFLVPLAILGLAVAIRFYTKQA

XP_022936377.1 cytochrome b5-like [Cucurbita moschata]9.9e-7097.01Show/hide
Query:  MGSGEKVFTLKEVAEHNNHRDCWLIISGKVYDVTKFLEDHPGGDDVLLSATGKDATDDFEDVGHSDNAREMMDQYYVGEIDGSTIPKKVTYTPPKQPHYN
        MGSGEKVFTLKEVAEHNNH+DCWLIISGKVYDVTKFL+DHPGGDDVLLSATGKDATDDFEDVGHSDNAREMMDQYYVGEIDGSTIPKKV YTPPKQPHYN
Subjt:  MGSGEKVFTLKEVAEHNNHRDCWLIISGKVYDVTKFLEDHPGGDDVLLSATGKDATDDFEDVGHSDNAREMMDQYYVGEIDGSTIPKKVTYTPPKQPHYN

Query:  QDKTSEFIIKLLQFLVPLAILGLAVAIRFYTKQA
        QDKTSEFIIKLLQFLVPLAILGLAVA+RFYTKQA
Subjt:  QDKTSEFIIKLLQFLVPLAILGLAVAIRFYTKQA

XP_023521594.1 cytochrome b5-like [Cucurbita pepo subsp. pepo]1.3e-6996.27Show/hide
Query:  MGSGEKVFTLKEVAEHNNHRDCWLIISGKVYDVTKFLEDHPGGDDVLLSATGKDATDDFEDVGHSDNAREMMDQYYVGEIDGSTIPKKVTYTPPKQPHYN
        MGSGEKVFTLKEVAEHNNH+DCWLIISGKVYDVTKFL+DHPGGDDVLLSATGKDATDDFEDVGHSDNAREMMDQYYVGEIDGST+PKKV YTPPKQPHYN
Subjt:  MGSGEKVFTLKEVAEHNNHRDCWLIISGKVYDVTKFLEDHPGGDDVLLSATGKDATDDFEDVGHSDNAREMMDQYYVGEIDGSTIPKKVTYTPPKQPHYN

Query:  QDKTSEFIIKLLQFLVPLAILGLAVAIRFYTKQA
        QDKTSEFIIKLLQFLVPLAILGLAVA+RFYTKQA
Subjt:  QDKTSEFIIKLLQFLVPLAILGLAVAIRFYTKQA

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0L7Y9 Cytochrome b5 heme-binding domain-containing protein6.2e-7097.76Show/hide
Query:  MGSGEKVFTLKEVAEHNNHRDCWLIISGKVYDVTKFLEDHPGGDDVLLSATGKDATDDFEDVGHSDNAREMMDQYYVGEIDGSTIPKKVTYTPPKQPHYN
        MGSGEKVFTLKEVAEHNNH+DCWLIISGKVYDVTKFLEDHPGGDDVLLSATGKDATDDFEDVGHSDNAREMMDQYYVGEID STIPKKV YTPPKQPHYN
Subjt:  MGSGEKVFTLKEVAEHNNHRDCWLIISGKVYDVTKFLEDHPGGDDVLLSATGKDATDDFEDVGHSDNAREMMDQYYVGEIDGSTIPKKVTYTPPKQPHYN

Query:  QDKTSEFIIKLLQFLVPLAILGLAVAIRFYTKQA
        QDKTSEFIIKLLQFLVPLAILGLAVAIRFYTKQA
Subjt:  QDKTSEFIIKLLQFLVPLAILGLAVAIRFYTKQA

A0A5D3D383 Cytochrome b56.2e-7097.76Show/hide
Query:  MGSGEKVFTLKEVAEHNNHRDCWLIISGKVYDVTKFLEDHPGGDDVLLSATGKDATDDFEDVGHSDNAREMMDQYYVGEIDGSTIPKKVTYTPPKQPHYN
        MGSGEKVFTLKEVAEHNNH+DCWLIISGKVYDVTKFLEDHPGGDDVLLSATGKDATDDFEDVGHSDNAREMMDQYYVGEID STIPKKV YTPPKQPHYN
Subjt:  MGSGEKVFTLKEVAEHNNHRDCWLIISGKVYDVTKFLEDHPGGDDVLLSATGKDATDDFEDVGHSDNAREMMDQYYVGEIDGSTIPKKVTYTPPKQPHYN

Query:  QDKTSEFIIKLLQFLVPLAILGLAVAIRFYTKQA
        QDKTSEFIIKLLQFLVPLAILGLAVAIRFYTKQA
Subjt:  QDKTSEFIIKLLQFLVPLAILGLAVAIRFYTKQA

A0A6J1D069 cytochrome b5-like1.5e-71100Show/hide
Query:  MGSGEKVFTLKEVAEHNNHRDCWLIISGKVYDVTKFLEDHPGGDDVLLSATGKDATDDFEDVGHSDNAREMMDQYYVGEIDGSTIPKKVTYTPPKQPHYN
        MGSGEKVFTLKEVAEHNNHRDCWLIISGKVYDVTKFLEDHPGGDDVLLSATGKDATDDFEDVGHSDNAREMMDQYYVGEIDGSTIPKKVTYTPPKQPHYN
Subjt:  MGSGEKVFTLKEVAEHNNHRDCWLIISGKVYDVTKFLEDHPGGDDVLLSATGKDATDDFEDVGHSDNAREMMDQYYVGEIDGSTIPKKVTYTPPKQPHYN

Query:  QDKTSEFIIKLLQFLVPLAILGLAVAIRFYTKQA
        QDKTSEFIIKLLQFLVPLAILGLAVAIRFYTKQA
Subjt:  QDKTSEFIIKLLQFLVPLAILGLAVAIRFYTKQA

A0A6J1F8A2 cytochrome b5-like4.8e-7097.01Show/hide
Query:  MGSGEKVFTLKEVAEHNNHRDCWLIISGKVYDVTKFLEDHPGGDDVLLSATGKDATDDFEDVGHSDNAREMMDQYYVGEIDGSTIPKKVTYTPPKQPHYN
        MGSGEKVFTLKEVAEHNNH+DCWLIISGKVYDVTKFL+DHPGGDDVLLSATGKDATDDFEDVGHSDNAREMMDQYYVGEIDGSTIPKKV YTPPKQPHYN
Subjt:  MGSGEKVFTLKEVAEHNNHRDCWLIISGKVYDVTKFLEDHPGGDDVLLSATGKDATDDFEDVGHSDNAREMMDQYYVGEIDGSTIPKKVTYTPPKQPHYN

Query:  QDKTSEFIIKLLQFLVPLAILGLAVAIRFYTKQA
        QDKTSEFIIKLLQFLVPLAILGLAVA+RFYTKQA
Subjt:  QDKTSEFIIKLLQFLVPLAILGLAVAIRFYTKQA

A0A6J1IHM0 cytochrome b5-like4.8e-7097.01Show/hide
Query:  MGSGEKVFTLKEVAEHNNHRDCWLIISGKVYDVTKFLEDHPGGDDVLLSATGKDATDDFEDVGHSDNAREMMDQYYVGEIDGSTIPKKVTYTPPKQPHYN
        MGSGEKVFTLKEVAEHNNH+DCWLIISGKVYDVTKFL+DHPGGDDVLLSATGKDATDDFEDVGHSDNAREMMDQYYVGEIDGSTIPKKV YTPPKQPHYN
Subjt:  MGSGEKVFTLKEVAEHNNHRDCWLIISGKVYDVTKFLEDHPGGDDVLLSATGKDATDDFEDVGHSDNAREMMDQYYVGEIDGSTIPKKVTYTPPKQPHYN

Query:  QDKTSEFIIKLLQFLVPLAILGLAVAIRFYTKQA
        QDKTSEFIIKLLQFLVPLAILGLAVA+RFYTKQA
Subjt:  QDKTSEFIIKLLQFLVPLAILGLAVAIRFYTKQA

SwissProt top hitse value%identityAlignment
O04354 Cytochrome b52.4e-5576.74Show/hide
Query:  KVFTLKEVAEHNNHRDCWLIISGKVYDVTKFLEDHPGGDDVLLSATGKDATDDFEDVGHSDNAREMMDQYYVGEIDGSTIPKKVTYTPPKQPHYNQDKTS
        K+FTL EVA+HNN +DCWLII+GKVYDVTKFLEDHPGGDDVLLSATGKDATDDFED+GHS +A+ M+D+YYVG+ID S+IP +V YTPPKQP YN DKT 
Subjt:  KVFTLKEVAEHNNHRDCWLIISGKVYDVTKFLEDHPGGDDVLLSATGKDATDDFEDVGHSDNAREMMDQYYVGEIDGSTIPKKVTYTPPKQPHYNQDKTS

Query:  EFIIKLLQFLVPLAILGLAVAIRFYTKQA
        EF+IKLLQFLVPL IL  A+ IRFYTK +
Subjt:  EFIIKLLQFLVPLAILGLAVAIRFYTKQA

O48845 Cytochrome b5 isoform B3.9e-6183.33Show/hide
Query:  MGSGEKVFTLKEVAEHNNHRDCWLIISGKVYDVTKFLEDHPGGDDVLLSATGKDATDDFEDVGHSDNAREMMDQYYVGEIDGSTIPKKVTYTPPKQPHYN
        MG   K+FTL EV+EHN   DCW++I+GKVY+VTKFLEDHPGGDDVLLS+TGKDATDDFEDVGHS++AREMM+QYYVGEID +TIPKKV YTPPKQPHYN
Subjt:  MGSGEKVFTLKEVAEHNNHRDCWLIISGKVYDVTKFLEDHPGGDDVLLSATGKDATDDFEDVGHSDNAREMMDQYYVGEIDGSTIPKKVTYTPPKQPHYN

Query:  QDKTSEFIIKLLQFLVPLAILGLAVAIRFYTK
        QDKTSEFIIKLLQFLVPLAILGLAV IR YTK
Subjt:  QDKTSEFIIKLLQFLVPLAILGLAVAIRFYTK

P49098 Cytochrome b53.7e-5977.61Show/hide
Query:  MGSGEKVFTLKEVAEHNNHRDCWLIISGKVYDVTKFLEDHPGGDDVLLSATGKDATDDFEDVGHSDNAREMMDQYYVGEIDGSTIPKKVTYTPPKQPHYN
        MG   KVFTL EV++HNN +DCWL+ISGKVYDVTKFL+DHPGGD+VLLSATGKDATDDFEDVGHS +AR M+D+YYVG+ID +TIP K  YTPP QPHYN
Subjt:  MGSGEKVFTLKEVAEHNNHRDCWLIISGKVYDVTKFLEDHPGGDDVLLSATGKDATDDFEDVGHSDNAREMMDQYYVGEIDGSTIPKKVTYTPPKQPHYN

Query:  QDKTSEFIIKLLQFLVPLAILGLAVAIRFYTKQA
        QDKTSEF++KLLQFLVPL ILG+A  IRFYTKQ+
Subjt:  QDKTSEFIIKLLQFLVPLAILGLAVAIRFYTKQA

P49099 Cytochrome b5, seed isoform1.8e-5877.61Show/hide
Query:  MGSGEKVFTLKEVAEHNNHRDCWLIISGKVYDVTKFLEDHPGGDDVLLSATGKDATDDFEDVGHSDNAREMMDQYYVGEIDGSTIPKKVTYTPPKQPHYN
        MG   KVFTL EV+ HNN +DCWLIISGKVY+VTKFLEDHPGG +VLLSATGKDATDDFED+GHS +AR M+D+YYVG+ID STIP KV YTPPKQPHYN
Subjt:  MGSGEKVFTLKEVAEHNNHRDCWLIISGKVYDVTKFLEDHPGGDDVLLSATGKDATDDFEDVGHSDNAREMMDQYYVGEIDGSTIPKKVTYTPPKQPHYN

Query:  QDKTSEFIIKLLQFLVPLAILGLAVAIRFYTKQA
        QDKT+EFI+KLLQFLVPL ILG+A  + FYTKQ+
Subjt:  QDKTSEFIIKLLQFLVPLAILGLAVAIRFYTKQA

P49100 Cytochrome b52.9e-5680.47Show/hide
Query:  EKVFTLKEVAEHNNHRDCWLIISGKVYDVTKFLEDHPGGDDVLLSATGKDATDDFEDVGHSDNAREMMDQYYVGEIDGSTIPKKVTYTPPKQPHYNQDKT
        +KV+TL+EVA+HN+  DCWLII GKVY+V+KFLEDHPGGDDVLLS+TGKDATDDFEDVGHS  AR MMD+YYVG+ID STIP +  Y PPKQPHYNQDKT
Subjt:  EKVFTLKEVAEHNNHRDCWLIISGKVYDVTKFLEDHPGGDDVLLSATGKDATDDFEDVGHSDNAREMMDQYYVGEIDGSTIPKKVTYTPPKQPHYNQDKT

Query:  SEFIIKLLQFLVPLAILGLAVAIRFYTK
         EFIIK+LQFLVPLAILGLAVAIR YTK
Subjt:  SEFIIKLLQFLVPLAILGLAVAIRFYTK

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G26340.1 cytochrome B5 isoform A1.3e-3044.88Show/hide
Query:  KVFTLKEVAEHNNHRDCWLIISGKVYDVTKFLEDHPGGDDVLLSATGKDATDDFEDVGHSDNAREMMDQYYVGEIDGSTIPKKVTYTPPKQPHYNQDKTS
        K+++++E A HN   DCW++I GKVYDV+ ++++HPGGDDVLL+  GKDATDDFED GHS +ARE+M++Y++GE+D S++P+      P+   Y +D+  
Subjt:  KVFTLKEVAEHNNHRDCWLIISGKVYDVTKFLEDHPGGDDVLLSATGKDATDDFEDVGHSDNAREMMDQYYVGEIDGSTIPKKVTYTPPKQPHYNQDKTS

Query:  EFIIKLLQ-----FLVPLAILGLAVAI
        + + KL       ++VP++I+ ++VA+
Subjt:  EFIIKLLQ-----FLVPLAILGLAVAI

AT2G32720.1 cytochrome B5 isoform B2.8e-6283.33Show/hide
Query:  MGSGEKVFTLKEVAEHNNHRDCWLIISGKVYDVTKFLEDHPGGDDVLLSATGKDATDDFEDVGHSDNAREMMDQYYVGEIDGSTIPKKVTYTPPKQPHYN
        MG   K+FTL EV+EHN   DCW++I+GKVY+VTKFLEDHPGGDDVLLS+TGKDATDDFEDVGHS++AREMM+QYYVGEID +TIPKKV YTPPKQPHYN
Subjt:  MGSGEKVFTLKEVAEHNNHRDCWLIISGKVYDVTKFLEDHPGGDDVLLSATGKDATDDFEDVGHSDNAREMMDQYYVGEIDGSTIPKKVTYTPPKQPHYN

Query:  QDKTSEFIIKLLQFLVPLAILGLAVAIRFYTK
        QDKTSEFIIKLLQFLVPLAILGLAV IR YTK
Subjt:  QDKTSEFIIKLLQFLVPLAILGLAVAIRFYTK

AT2G46650.1 cytochrome B5 isoform C2.5e-3147.29Show/hide
Query:  VFTLKEVAEHNNHRDCWLIISGKVYDVTKFLEDHPGGDDVLLSATGKDATDDFEDVGHSDNAREMMDQYYVGEIDGSTIPKKVTYTPPKQPHYNQDKTS-
        + +  +VA+H    DCW++I GKVYD++ F+++HPGGD+VLL+ TGKDA+ DFEDV HS +A+E+M +Y +G++D ST+P    Y PP +      +T+ 
Subjt:  VFTLKEVAEHNNHRDCWLIISGKVYDVTKFLEDHPGGDDVLLSATGKDATDDFEDVGHSDNAREMMDQYYVGEIDGSTIPKKVTYTPPKQPHYNQDKTS-

Query:  -EFIIKLLQFLVPLAILGLAVAIRFYTKQ
         E   KLL +L+PL ILG+A A+RFY  +
Subjt:  -EFIIKLLQFLVPLAILGLAVAIRFYTKQ

AT5G48810.1 cytochrome B5 isoform D3.0e-4864.18Show/hide
Query:  MGSGEKVFTLKEVAEHNNHRDCWLIISGKVYDVTKFLEDHPGGDDVLLSATGKDATDDFEDVGHSDNAREMMDQYYVGEIDGSTIPKKVTYTPPKQPH--
        MG   KVFTL EV++H++ +DCW++I GKVYDVTKFL+DHPGGD+V+L++TGKDATDDFEDVGHS  A+ M+D+YYVG+ID +T+P K  + PP      
Subjt:  MGSGEKVFTLKEVAEHNNHRDCWLIISGKVYDVTKFLEDHPGGDDVLLSATGKDATDDFEDVGHSDNAREMMDQYYVGEIDGSTIPKKVTYTPPKQPH--

Query:  YNQDKTSEFIIKLLQFLVPLAILGLAVAIRFYTK
          QDK+S+F+IKLLQFLVPL ILGLA  IR+YTK
Subjt:  YNQDKTSEFIIKLLQFLVPLAILGLAVAIRFYTK

AT5G53560.1 cytochrome B5 isoform E2.0e-5268.42Show/hide
Query:  MGSGEKVFTLKEVAEHNNHRDCWLIISGKVYDVTKFLEDHPGGDDVLLSATGKDATDDFEDVGHSDNAREMMDQYYVGEIDGSTIPKKVTYTPPKQPHYN
        M S  KV + +EV++HN  +DCWLIISGKVYDVT F++DHPGGD+VLLS+TGKDAT+DFEDVGHSD AR+MMD+Y++GEID S++P   TY  P+QP YN
Subjt:  MGSGEKVFTLKEVAEHNNHRDCWLIISGKVYDVTKFLEDHPGGDDVLLSATGKDATDDFEDVGHSDNAREMMDQYYVGEIDGSTIPKKVTYTPPKQPHYN

Query:  QDKTSEFIIKLLQFLVPLAILGLAVAIRFYTKQ
        QDKT EFIIK+LQFLVP+ ILGLA+ +R YTK+
Subjt:  QDKTSEFIIKLLQFLVPLAILGLAVAIRFYTKQ


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGGTAGCGGGGAAAAGGTTTTCACCTTGAAGGAAGTCGCCGAGCACAACAACCACAGGGATTGTTGGCTCATCATCAGTGGCAAGGTATATGATGTGACCAAATTCTT
AGAAGACCATCCTGGTGGTGATGACGTTTTGTTATCAGCTACAGGAAAAGATGCGACCGACGATTTTGAAGACGTGGGGCATAGTGACAATGCAAGAGAAATGATGGATC
AATACTATGTCGGGGAGATTGATGGTTCAACAATTCCCAAGAAGGTCACATACACACCTCCAAAACAGCCTCACTACAATCAGGACAAGACATCTGAGTTCATCATCAAG
CTCCTCCAGTTCCTCGTTCCGCTTGCCATTTTGGGATTGGCAGTTGCCATTCGGTTCTACACCAAACAAGCT
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGGGTAGCGGGGAAAAGGTTTTCACCTTGAAGGAAGTCGCCGAGCACAACAACCACAGGGATTGTTGGCTCATCATCAGTGGCAAGGTATATGATGTGACCAAATTCTT
AGAAGACCATCCTGGTGGTGATGACGTTTTGTTATCAGCTACAGGAAAAGATGCGACCGACGATTTTGAAGACGTGGGGCATAGTGACAATGCAAGAGAAATGATGGATC
AATACTATGTCGGGGAGATTGATGGTTCAACAATTCCCAAGAAGGTCACATACACACCTCCAAAACAGCCTCACTACAATCAGGACAAGACATCTGAGTTCATCATCAAG
CTCCTCCAGTTCCTCGTTCCGCTTGCCATTTTGGGATTGGCAGTTGCCATTCGGTTCTACACCAAACAAGCT
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MGSGEKVFTLKEVAEHNNHRDCWLIISGKVYDVTKFLEDHPGGDDVLLSATGKDATDDFEDVGHSDNAREMMDQYYVGEIDGSTIPKKVTYTPPKQPHYNQDKTSEFIIK
LLQFLVPLAILGLAVAIRFYTKQA