; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

MS005730 (gene) of Bitter gourd (TR) v1 genome

Gene IDMS005730
OrganismMomordica charantia cv. TR (Bitter gourd (TR) v1)
DescriptionPentatricopeptide repeat-containing protein
Genome locationscaffold254:1151688..1153301
RNA-Seq ExpressionMS005730
SyntenyMS005730
Gene Ontology termsGO:0016556 - mRNA modification (biological process)
GO:1900865 - chloroplast RNA modification (biological process)
GO:0009507 - chloroplast (cellular component)
GO:0005515 - protein binding (molecular function)
InterPro domainsIPR002885 - Pentatricopeptide repeat
IPR011990 - Tetratricopeptide-like helical domain superfamily


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
XP_004133915.1 pentatricopeptide repeat-containing protein At2g45350, chloroplastic [Cucumis sativus]3.4e-27886.22Show/hide
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XP_022146972.1 pentatricopeptide repeat-containing protein At2g45350, chloroplastic [Momordica charantia]0.0e+0099.07Show/hide
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XP_022974095.1 pentatricopeptide repeat-containing protein At2g45350, chloroplastic [Cucurbita maxima]8.0e-28087.9Show/hide
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XP_023540140.1 pentatricopeptide repeat-containing protein At2g45350, chloroplastic isoform X1 [Cucurbita pepo subsp. pepo]6.8e-27987.9Show/hide
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XP_038877671.1 pentatricopeptide repeat-containing protein At2g45350, chloroplastic [Benincasa hispida]1.8e-28489.39Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0L4E1 Uncharacterized protein1.6e-27886.22Show/hide
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A0A1S3AWC2 pentatricopeptide repeat-containing protein At2g45350, chloroplastic2.1e-27886.41Show/hide
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A0A5A7TZK8 Pentatricopeptide repeat-containing protein2.1e-27886.41Show/hide
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A0A6J1D128 pentatricopeptide repeat-containing protein At2g45350, chloroplastic0.0e+0099.07Show/hide
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A0A6J1ID28 pentatricopeptide repeat-containing protein At2g45350, chloroplastic3.9e-28087.9Show/hide
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        QDSVSYNSMIDGYVK G+VD ARELFDSMPL++KNLISWNSMIGGFAQT+DGVE ALELFEKMPERDLVSWNT+IGGFAKCGR+EFAH LF++MP+RDVI
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        SWSN+IDGYAKLG+IEVARNLFDEMPEKDVVA NAMMAGY QNGY T+AL+IFY MQ Q NLSP++TTL IA SAVSQLG +EKA S+HSYL+ENGFSLM
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        GKVGV LIDMYSKCGSI NAMSIF GI+EKGIDHWNAMISGMARNGLGE AF+ML+EMQ+LSV PDDITFIGVLNACAHAGLVKEG ICF LMRKVHKLE
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        PKLQHYGCMVDILGKAGLIE ALKFIEEMPIEPNDIIWRTLLSACQNHENF IGE IA+HLMR+D CNSSSYVLLSNIY  LGLWSAASKVRTMMKKR L
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        TK+PG SWIEL+GVVHEFLVHDKSHP VTEIY VLDG
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
O22137 Pentatricopeptide repeat-containing protein At2g45350, chloroplastic1.4e-20564.62Show/hide
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        DPFLWNAVIKS+SHG DP +AL+L C+MLENG  VDKFS SL+LKAC+R+  V+ G QIHG L K  + S+LFL NCLI +YL+CG +  +RQ+FDRMP+
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        +DSVSYNSMIDGYVK G++ SARELFD MP+E KNLISWNSMI G+AQT DGV+ A +LF  MPE+DL+SWN++I G+ K GRIE A  LF+ MPRRDV+
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        +W+ +IDGYAKLG +  A+ LFD+MP +DVVA N+MMAGYVQN Y  +AL+IF  M+ +S+L PD TTLVI L A++QLGR+ KA  +H Y++E  F L 
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Query:  GKVGVALIDMYSKCGSINNAMSIFEGIEEKGIDHWNAMISGMARNGLGESAFDMLVEMQKLSVKPDDITFIGVLNACAHAGLVKEGMICFVLMRKVHKLE
        GK+GVALIDMYSKCGSI +AM +FEGIE K IDHWNAMI G+A +GLGESAFDML+++++LS+KPDDITF+GVLNAC+H+GLVKEG++CF LMR+ HK+E
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Query:  PKLQHYGCMVDILGKAGLIEGALKFIEEMPIEPNDIIWRTLLSACQNHENFAIGESIARHLMRLDFCNSSSYVLLSNIYAGLGLWSAASKVRTMMKKRNL
        P+LQHYGCMVDIL ++G IE A   IEEMP+EPND+IWRT L+AC +H+ F  GE +A+HL+     N SSYVLLSN+YA  G+W    +VRTMMK+R +
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         K+PG SWIEL+G VHEF V
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O82380 Pentatricopeptide repeat-containing protein At2g29760, chloroplastic6.5e-11538.78Show/hide
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        F WN +I++Y+ G DP+ ++  F  M+    C  +K++F  ++KA A V  +  G+ +HG+ +K  +GS++F+ N LI  Y  CGD++ A +VF  +  +
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        D VS+NSMI+G+V+ G  D A ELF  M  ED       ++   S        E G +    + E     +L   N ++  + KCG IE A  LF+ M  
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Query:  RDVISWSNLIDGYAKLGNIEVARNLFDEMPEKDVVACNAMMAGYVQNGYCTKALKIFYMMQSQSNLSPDKTTLVIALSAVSQLGRIEKAASIHSYLIENG
        +D ++W+ ++DGYA   + E AR + + MP+KD+VA NA+++ Y QNG   +AL +F+ +Q Q N+  ++ TLV  LSA +Q+G +E    IHSY+ ++G
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Query:  FSLMGKVGVALIDMYSKCGSINNAMSIFEGIEEKGIDHWNAMISGMARNGLGESAFDMLVEMQKLSVKPDDITFIGVLNACAHAGLVKEGMICFVLMRKV
          +   V  ALI MYSKCG +  +  +F  +E++ +  W+AMI G+A +G G  A DM  +MQ+ +VKP+ +TF  V  AC+H GLV E    F  M   
Subjt:  FSLMGKVGVALIDMYSKCGSINNAMSIFEGIEEKGIDHWNAMISGMARNGLGESAFDMLVEMQKLSVKPDDITFIGVLNACAHAGLVKEGMICFVLMRKV

Query:  HKLEPKLQHYGCMVDILGKAGLIEGALKFIEEMPIEPNDIIWRTLLSACQNHENFAIGESIARHLMRLDFCNSSSYVLLSNIYAGLGLWSAASKVRTMMK
        + + P+ +HY C+VD+LG++G +E A+KFIE MPI P+  +W  LL AC+ H N  + E     L+ L+  N  ++VLLSNIYA LG W   S++R  M+
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Query:  KRNLTKVPGRSWIELEGVVHEFLVHDKSHPHVTEIYSVL
           L K PG S IE++G++HEFL  D +HP   ++Y  L
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Q9LN01 Pentatricopeptide repeat-containing protein At1g08070, chloroplastic5.5e-11438.67Show/hide
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        +WN + + ++  +DP+ AL L+  M+  G   + ++F  +LK+CA+    ++G+QIHG ++KL    +L++   LI+MY++ G +E A +VFD+ P +D 
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Query:  VSYNSMIDGYVKSGMVDSARELFDSMPLEDKNLISWNSMIGGFAQTEDGVEFALELFEKMPER----DLVSWNTVIGGFAKCGRIEFAHSLFNQMPRRDV
        VSY ++I GY   G +++A++LFD +P++D  ++SWN+MI G+A+T +  E ALELF+ M +     D  +  TV+   A+ G IE    +   +     
Subjt:  VSYNSMIDGYVKSGMVDSARELFDSMPLEDKNLISWNSMIGGFAQTEDGVEFALELFEKMPER----DLVSWNTVIGGFAKCGRIEFAHSLFNQMPRRDV

Query:  IS----WSNLIDGYAKLGNIEVARNLFDEMPEKDVVACNAMMAGYVQNGYCTKALKIFYMMQSQSNLSPDKTTLVIALSAVSQLGRIEKAASIHSYLIE-
         S     + LID Y+K G +E A  LF+ +P KDV++ N ++ GY       +AL +F  M  +S  +P+  T++  L A + LG I+    IH Y+ + 
Subjt:  IS----WSNLIDGYAKLGNIEVARNLFDEMPEKDVVACNAMMAGYVQNGYCTKALKIFYMMQSQSNLSPDKTTLVIALSAVSQLGRIEKAASIHSYLIE-

Query:  -NGFSLMGKVGVALIDMYSKCGSINNAMSIFEGIEEKGIDHWNAMISGMARNGLGESAFDMLVEMQKLSVKPDDITFIGVLNACAHAGLVKEGMICFVLM
          G +    +  +LIDMY+KCG I  A  +F  I  K +  WNAMI G A +G  +++FD+   M+K+ ++PDDITF+G+L+AC+H+G++  G   F  M
Subjt:  -NGFSLMGKVGVALIDMYSKCGSINNAMSIFEGIEEKGIDHWNAMISGMARNGLGESAFDMLVEMQKLSVKPDDITFIGVLNACAHAGLVKEGMICFVLM

Query:  RKVHKLEPKLQHYGCMVDILGKAGLIEGALKFIEEMPIEPNDIIWRTLLSACQNHENFAIGESIARHLMRLDFCNSSSYVLLSNIYAGLGLWSAASKVRT
         + +K+ PKL+HYGCM+D+LG +GL + A + I  M +EP+ +IW +LL AC+ H N  +GES A +L++++  N  SYVLLSNIYA  G W+  +K R 
Subjt:  RKVHKLEPKLQHYGCMVDILGKAGLIEGALKFIEEMPIEPNDIIWRTLLSACQNHENFAIGESIARHLMRLDFCNSSSYVLLSNIYAGLGLWSAASKVRT

Query:  MMKKRNLTKVPGRSWIELEGVVHEFLVHDKSHPHVTEIYSVLD
        ++  + + KVPG S IE++ VVHEF++ DK HP   EIY +L+
Subjt:  MMKKRNLTKVPGRSWIELEGVVHEFLVHDKSHPHVTEIYSVLD

Q9SJZ3 Pentatricopeptide repeat-containing protein At2g22410, mitochondrial1.1e-10638.24Show/hide
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        F WN  I+ +S   +P  + +L+  ML +G C    D F++ ++ K CA + L   G  I G ++KL +     + N  I M+  CGD+E AR+VFD  P
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Query:  RQDSVSYNSMIDGYVKSGMVDSARELFDSMPLEDK--------NLISWNSMIGGFAQTEDGVEFALELFEKMPERDLVSWNTVIGGFAKCGRIEFAHSLF
         +D VS+N +I+GY K G  + A  ++  M  E           L+S  SM+G   + ++  E+  E   +M    +   N ++  F+KCG I  A  +F
Subjt:  RQDSVSYNSMIDGYVKSGMVDSARELFDSMPLEDK--------NLISWNSMIGGFAQTEDGVEFALELFEKMPERDLVSWNTVIGGFAKCGRIEFAHSLF

Query:  NQMPRRDVISWSNLIDGYAKLGNIEVARNLFDEMPEKDVVACNAMMAGYVQNGYCTKALKIFYMMQSQSNLSPDKTTLVIALSAVSQLGRIEKAASIHSY
        + + +R ++SW+ +I GYA+ G ++V+R LFD+M EKDVV  NAM+ G VQ      AL +F  MQ+ SN  PD+ T++  LSA SQLG ++    IH Y
Subjt:  NQMPRRDVISWSNLIDGYAKLGNIEVARNLFDEMPEKDVVACNAMMAGYVQNGYCTKALKIFYMMQSQSNLSPDKTTLVIALSAVSQLGRIEKAASIHSY

Query:  LIENGFSLMGKVGVALIDMYSKCGSINNAMSIFEGIEEKGIDHWNAMISGMARNGLGESAFDMLVEMQKLSVKPDDITFIGVLNACAHAGLVKEGMICFV
        + +   SL   +G +L+DMY+KCG+I+ A+S+F GI+ +    + A+I G+A +G   +A     EM    + PD+ITFIG+L+AC H G+++ G   F 
Subjt:  LIENGFSLMGKVGVALIDMYSKCGSINNAMSIFEGIEEKGIDHWNAMISGMARNGLGESAFDMLVEMQKLSVKPDDITFIGVLNACAHAGLVKEGMICFV

Query:  LMRKVHKLEPKLQHYGCMVDILGKAGLIEGALKFIEEMPIEPNDIIWRTLLSACQNHENFAIGESIARHLMRLDFCNSSSYVLLSNIYAGLGLWSAASKV
         M+    L P+L+HY  MVD+LG+AGL+E A + +E MP+E +  +W  LL  C+ H N  +GE  A+ L+ LD  +S  YVLL  +Y    +W  A + 
Subjt:  LMRKVHKLEPKLQHYGCMVDILGKAGLIEGALKFIEEMPIEPNDIIWRTLLSACQNHENFAIGESIARHLMRLDFCNSSSYVLLSNIYAGLGLWSAASKV

Query:  RTMMKKRNLTKVPGRSWIELEGVVHEFLVHDKSHPHVTEIYSVL
        R MM +R + K+PG S IE+ G+V EF+V DKS P   +IY  L
Subjt:  RTMMKKRNLTKVPGRSWIELEGVVHEFLVHDKSHPHVTEIYSVL

Q9SY02 Pentatricopeptide repeat-containing protein At4g027502.2e-10737.79Show/hide
Query:  WNAVIKSYSHGNDPIRALVLFCMMLENGFCVDKFSFSLILKACARVCLVEQGKQIHG---------------------------LLMKLEIGSNLFLLNC
        WN +IK Y    +  +A  LF +M E   C    S++ +L   A+   V+  + +                             +L K      L   NC
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Query:  LITMYLRCGDIEFARQVFDRMPRQDSVSYNSMIDGYVKSGMVDSARELFDSMPLEDKNLISWNSMIGGFAQTEDGVEFALELFEKMPERDLVSWNTVIGG
        L+  +++   I  ARQ FD M  +D VS+N++I GY +SG +D AR+LFD  P++D  + +W +M+ G+ Q    VE A ELF+KMPER+ VSWN ++ G
Subjt:  LITMYLRCGDIEFARQVFDRMPRQDSVSYNSMIDGYVKSGMVDSARELFDSMPLEDKNLISWNSMIGGFAQTEDGVEFALELFEKMPERDLVSWNTVIGG

Query:  FAKCGRIEFAHSLFNQMPRRDVISWSNLIDGYAKLGNIEVARNLFDEMPEKDVVACNAMMAGYVQNGYCTKALKIFYMMQSQSNLSPDKTTLVIALSAVS
        + +  R+E A  LF+ MP R+V +W+ +I GYA+ G I  A+NLFD+MP++D V+  AM+AGY Q+G+  +AL++F  M+ +     ++++   ALS  +
Subjt:  FAKCGRIEFAHSLFNQMPRRDVISWSNLIDGYAKLGNIEVARNLFDEMPEKDVVACNAMMAGYVQNGYCTKALKIFYMMQSQSNLSPDKTTLVIALSAVS

Query:  QLGRIEKAASIHSYLIENGFSLMGKVGVALIDMYSKCGSINNAMSIFEGIEEKGIDHWNAMISGMARNGLGESAFDMLVEMQKLSVKPDDITFIGVLNAC
         +  +E    +H  L++ G+     VG AL+ MY KCGSI  A  +F+ +  K I  WN MI+G +R+G GE A      M++  +KPDD T + VL+AC
Subjt:  QLGRIEKAASIHSYLIENGFSLMGKVGVALIDMYSKCGSINNAMSIFEGIEEKGIDHWNAMISGMARNGLGESAFDMLVEMQKLSVKPDDITFIGVLNAC

Query:  AHAGLVKEGMICFVLMRKVHKLEPKLQHYGCMVDILGKAGLIEGALKFIEEMPIEPNDIIWRTLLSACQNHENFAIGESIARHLMRLDFCNSSSYVLLSN
        +H GLV +G   F  M + + + P  QHY CMVD+LG+AGL+E A   ++ MP EP+  IW TLL A + H N  + E+ A  +  ++  NS  YVLLSN
Subjt:  AHAGLVKEGMICFVLMRKVHKLEPKLQHYGCMVDILGKAGLIEGALKFIEEMPIEPNDIIWRTLLSACQNHENFAIGESIARHLMRLDFCNSSSYVLLSN

Query:  IYAGLGLWSAASKVRTMMKKRNLTKVPGRSWIELEGVVHEFLVHDKSHPHVTEIYSVLDGL
        +YA  G W    K+R  M+ + + KVPG SWIE++   H F V D+ HP   EI++ L+ L
Subjt:  IYAGLGLWSAASKVRTMMKKRNLTKVPGRSWIELEGVVHEFLVHDKSHPHVTEIYSVLDGL

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G08070.1 Tetratricopeptide repeat (TPR)-like superfamily protein3.9e-11538.67Show/hide
Query:  LWNAVIKSYSHGNDPIRALVLFCMMLENGFCVDKFSFSLILKACARVCLVEQGKQIHGLLMKLEIGSNLFLLNCLITMYLRCGDIEFARQVFDRMPRQDS
        +WN + + ++  +DP+ AL L+  M+  G   + ++F  +LK+CA+    ++G+QIHG ++KL    +L++   LI+MY++ G +E A +VFD+ P +D 
Subjt:  LWNAVIKSYSHGNDPIRALVLFCMMLENGFCVDKFSFSLILKACARVCLVEQGKQIHGLLMKLEIGSNLFLLNCLITMYLRCGDIEFARQVFDRMPRQDS

Query:  VSYNSMIDGYVKSGMVDSARELFDSMPLEDKNLISWNSMIGGFAQTEDGVEFALELFEKMPER----DLVSWNTVIGGFAKCGRIEFAHSLFNQMPRRDV
        VSY ++I GY   G +++A++LFD +P++D  ++SWN+MI G+A+T +  E ALELF+ M +     D  +  TV+   A+ G IE    +   +     
Subjt:  VSYNSMIDGYVKSGMVDSARELFDSMPLEDKNLISWNSMIGGFAQTEDGVEFALELFEKMPER----DLVSWNTVIGGFAKCGRIEFAHSLFNQMPRRDV

Query:  IS----WSNLIDGYAKLGNIEVARNLFDEMPEKDVVACNAMMAGYVQNGYCTKALKIFYMMQSQSNLSPDKTTLVIALSAVSQLGRIEKAASIHSYLIE-
         S     + LID Y+K G +E A  LF+ +P KDV++ N ++ GY       +AL +F  M  +S  +P+  T++  L A + LG I+    IH Y+ + 
Subjt:  IS----WSNLIDGYAKLGNIEVARNLFDEMPEKDVVACNAMMAGYVQNGYCTKALKIFYMMQSQSNLSPDKTTLVIALSAVSQLGRIEKAASIHSYLIE-

Query:  -NGFSLMGKVGVALIDMYSKCGSINNAMSIFEGIEEKGIDHWNAMISGMARNGLGESAFDMLVEMQKLSVKPDDITFIGVLNACAHAGLVKEGMICFVLM
          G +    +  +LIDMY+KCG I  A  +F  I  K +  WNAMI G A +G  +++FD+   M+K+ ++PDDITF+G+L+AC+H+G++  G   F  M
Subjt:  -NGFSLMGKVGVALIDMYSKCGSINNAMSIFEGIEEKGIDHWNAMISGMARNGLGESAFDMLVEMQKLSVKPDDITFIGVLNACAHAGLVKEGMICFVLM

Query:  RKVHKLEPKLQHYGCMVDILGKAGLIEGALKFIEEMPIEPNDIIWRTLLSACQNHENFAIGESIARHLMRLDFCNSSSYVLLSNIYAGLGLWSAASKVRT
         + +K+ PKL+HYGCM+D+LG +GL + A + I  M +EP+ +IW +LL AC+ H N  +GES A +L++++  N  SYVLLSNIYA  G W+  +K R 
Subjt:  RKVHKLEPKLQHYGCMVDILGKAGLIEGALKFIEEMPIEPNDIIWRTLLSACQNHENFAIGESIARHLMRLDFCNSSSYVLLSNIYAGLGLWSAASKVRT

Query:  MMKKRNLTKVPGRSWIELEGVVHEFLVHDKSHPHVTEIYSVLD
        ++  + + KVPG S IE++ VVHEF++ DK HP   EIY +L+
Subjt:  MMKKRNLTKVPGRSWIELEGVVHEFLVHDKSHPHVTEIYSVLD

AT2G22410.1 SLOW GROWTH 17.9e-10838.24Show/hide
Query:  FLWNAVIKSYSHGNDPIRALVLFCMMLENGFC---VDKFSFSLILKACARVCLVEQGKQIHGLLMKLEIGSNLFLLNCLITMYLRCGDIEFARQVFDRMP
        F WN  I+ +S   +P  + +L+  ML +G C    D F++ ++ K CA + L   G  I G ++KL +     + N  I M+  CGD+E AR+VFD  P
Subjt:  FLWNAVIKSYSHGNDPIRALVLFCMMLENGFC---VDKFSFSLILKACARVCLVEQGKQIHGLLMKLEIGSNLFLLNCLITMYLRCGDIEFARQVFDRMP

Query:  RQDSVSYNSMIDGYVKSGMVDSARELFDSMPLEDK--------NLISWNSMIGGFAQTEDGVEFALELFEKMPERDLVSWNTVIGGFAKCGRIEFAHSLF
         +D VS+N +I+GY K G  + A  ++  M  E           L+S  SM+G   + ++  E+  E   +M    +   N ++  F+KCG I  A  +F
Subjt:  RQDSVSYNSMIDGYVKSGMVDSARELFDSMPLEDK--------NLISWNSMIGGFAQTEDGVEFALELFEKMPERDLVSWNTVIGGFAKCGRIEFAHSLF

Query:  NQMPRRDVISWSNLIDGYAKLGNIEVARNLFDEMPEKDVVACNAMMAGYVQNGYCTKALKIFYMMQSQSNLSPDKTTLVIALSAVSQLGRIEKAASIHSY
        + + +R ++SW+ +I GYA+ G ++V+R LFD+M EKDVV  NAM+ G VQ      AL +F  MQ+ SN  PD+ T++  LSA SQLG ++    IH Y
Subjt:  NQMPRRDVISWSNLIDGYAKLGNIEVARNLFDEMPEKDVVACNAMMAGYVQNGYCTKALKIFYMMQSQSNLSPDKTTLVIALSAVSQLGRIEKAASIHSY

Query:  LIENGFSLMGKVGVALIDMYSKCGSINNAMSIFEGIEEKGIDHWNAMISGMARNGLGESAFDMLVEMQKLSVKPDDITFIGVLNACAHAGLVKEGMICFV
        + +   SL   +G +L+DMY+KCG+I+ A+S+F GI+ +    + A+I G+A +G   +A     EM    + PD+ITFIG+L+AC H G+++ G   F 
Subjt:  LIENGFSLMGKVGVALIDMYSKCGSINNAMSIFEGIEEKGIDHWNAMISGMARNGLGESAFDMLVEMQKLSVKPDDITFIGVLNACAHAGLVKEGMICFV

Query:  LMRKVHKLEPKLQHYGCMVDILGKAGLIEGALKFIEEMPIEPNDIIWRTLLSACQNHENFAIGESIARHLMRLDFCNSSSYVLLSNIYAGLGLWSAASKV
         M+    L P+L+HY  MVD+LG+AGL+E A + +E MP+E +  +W  LL  C+ H N  +GE  A+ L+ LD  +S  YVLL  +Y    +W  A + 
Subjt:  LMRKVHKLEPKLQHYGCMVDILGKAGLIEGALKFIEEMPIEPNDIIWRTLLSACQNHENFAIGESIARHLMRLDFCNSSSYVLLSNIYAGLGLWSAASKV

Query:  RTMMKKRNLTKVPGRSWIELEGVVHEFLVHDKSHPHVTEIYSVL
        R MM +R + K+PG S IE+ G+V EF+V DKS P   +IY  L
Subjt:  RTMMKKRNLTKVPGRSWIELEGVVHEFLVHDKSHPHVTEIYSVL

AT2G29760.1 Tetratricopeptide repeat (TPR)-like superfamily protein4.6e-11638.78Show/hide
Query:  FLWNAVIKSYSHGNDPIRALVLFCMMLENGFCV-DKFSFSLILKACARVCLVEQGKQIHGLLMKLEIGSNLFLLNCLITMYLRCGDIEFARQVFDRMPRQ
        F WN +I++Y+ G DP+ ++  F  M+    C  +K++F  ++KA A V  +  G+ +HG+ +K  +GS++F+ N LI  Y  CGD++ A +VF  +  +
Subjt:  FLWNAVIKSYSHGNDPIRALVLFCMMLENGFCV-DKFSFSLILKACARVCLVEQGKQIHGLLMKLEIGSNLFLLNCLITMYLRCGDIEFARQVFDRMPRQ

Query:  DSVSYNSMIDGYVKSGMVDSARELFDSMPLED-----KNLISWNSMIGGFAQTEDGVEFALELFEKMPERDLVSWNTVIGGFAKCGRIEFAHSLFNQMPR
        D VS+NSMI+G+V+ G  D A ELF  M  ED       ++   S        E G +    + E     +L   N ++  + KCG IE A  LF+ M  
Subjt:  DSVSYNSMIDGYVKSGMVDSARELFDSMPLED-----KNLISWNSMIGGFAQTEDGVEFALELFEKMPERDLVSWNTVIGGFAKCGRIEFAHSLFNQMPR

Query:  RDVISWSNLIDGYAKLGNIEVARNLFDEMPEKDVVACNAMMAGYVQNGYCTKALKIFYMMQSQSNLSPDKTTLVIALSAVSQLGRIEKAASIHSYLIENG
        +D ++W+ ++DGYA   + E AR + + MP+KD+VA NA+++ Y QNG   +AL +F+ +Q Q N+  ++ TLV  LSA +Q+G +E    IHSY+ ++G
Subjt:  RDVISWSNLIDGYAKLGNIEVARNLFDEMPEKDVVACNAMMAGYVQNGYCTKALKIFYMMQSQSNLSPDKTTLVIALSAVSQLGRIEKAASIHSYLIENG

Query:  FSLMGKVGVALIDMYSKCGSINNAMSIFEGIEEKGIDHWNAMISGMARNGLGESAFDMLVEMQKLSVKPDDITFIGVLNACAHAGLVKEGMICFVLMRKV
          +   V  ALI MYSKCG +  +  +F  +E++ +  W+AMI G+A +G G  A DM  +MQ+ +VKP+ +TF  V  AC+H GLV E    F  M   
Subjt:  FSLMGKVGVALIDMYSKCGSINNAMSIFEGIEEKGIDHWNAMISGMARNGLGESAFDMLVEMQKLSVKPDDITFIGVLNACAHAGLVKEGMICFVLMRKV

Query:  HKLEPKLQHYGCMVDILGKAGLIEGALKFIEEMPIEPNDIIWRTLLSACQNHENFAIGESIARHLMRLDFCNSSSYVLLSNIYAGLGLWSAASKVRTMMK
        + + P+ +HY C+VD+LG++G +E A+KFIE MPI P+  +W  LL AC+ H N  + E     L+ L+  N  ++VLLSNIYA LG W   S++R  M+
Subjt:  HKLEPKLQHYGCMVDILGKAGLIEGALKFIEEMPIEPNDIIWRTLLSACQNHENFAIGESIARHLMRLDFCNSSSYVLLSNIYAGLGLWSAASKVRTMMK

Query:  KRNLTKVPGRSWIELEGVVHEFLVHDKSHPHVTEIYSVL
           L K PG S IE++G++HEFL  D +HP   ++Y  L
Subjt:  KRNLTKVPGRSWIELEGVVHEFLVHDKSHPHVTEIYSVL

AT2G45350.1 Pentatricopeptide repeat (PPR) superfamily protein9.7e-20764.62Show/hide
Query:  DPFLWNAVIKSYSHGNDPIRALVLFCMMLENGFCVDKFSFSLILKACARVCLVEQGKQIHGLLMKLEIGSNLFLLNCLITMYLRCGDIEFARQVFDRMPR
        DPFLWNAVIKS+SHG DP +AL+L C+MLENG  VDKFS SL+LKAC+R+  V+ G QIHG L K  + S+LFL NCLI +YL+CG +  +RQ+FDRMP+
Subjt:  DPFLWNAVIKSYSHGNDPIRALVLFCMMLENGFCVDKFSFSLILKACARVCLVEQGKQIHGLLMKLEIGSNLFLLNCLITMYLRCGDIEFARQVFDRMPR

Query:  QDSVSYNSMIDGYVKSGMVDSARELFDSMPLEDKNLISWNSMIGGFAQTEDGVEFALELFEKMPERDLVSWNTVIGGFAKCGRIEFAHSLFNQMPRRDVI
        +DSVSYNSMIDGYVK G++ SARELFD MP+E KNLISWNSMI G+AQT DGV+ A +LF  MPE+DL+SWN++I G+ K GRIE A  LF+ MPRRDV+
Subjt:  QDSVSYNSMIDGYVKSGMVDSARELFDSMPLEDKNLISWNSMIGGFAQTEDGVEFALELFEKMPERDLVSWNTVIGGFAKCGRIEFAHSLFNQMPRRDVI

Query:  SWSNLIDGYAKLGNIEVARNLFDEMPEKDVVACNAMMAGYVQNGYCTKALKIFYMMQSQSNLSPDKTTLVIALSAVSQLGRIEKAASIHSYLIENGFSLM
        +W+ +IDGYAKLG +  A+ LFD+MP +DVVA N+MMAGYVQN Y  +AL+IF  M+ +S+L PD TTLVI L A++QLGR+ KA  +H Y++E  F L 
Subjt:  SWSNLIDGYAKLGNIEVARNLFDEMPEKDVVACNAMMAGYVQNGYCTKALKIFYMMQSQSNLSPDKTTLVIALSAVSQLGRIEKAASIHSYLIENGFSLM

Query:  GKVGVALIDMYSKCGSINNAMSIFEGIEEKGIDHWNAMISGMARNGLGESAFDMLVEMQKLSVKPDDITFIGVLNACAHAGLVKEGMICFVLMRKVHKLE
        GK+GVALIDMYSKCGSI +AM +FEGIE K IDHWNAMI G+A +GLGESAFDML+++++LS+KPDDITF+GVLNAC+H+GLVKEG++CF LMR+ HK+E
Subjt:  GKVGVALIDMYSKCGSINNAMSIFEGIEEKGIDHWNAMISGMARNGLGESAFDMLVEMQKLSVKPDDITFIGVLNACAHAGLVKEGMICFVLMRKVHKLE

Query:  PKLQHYGCMVDILGKAGLIEGALKFIEEMPIEPNDIIWRTLLSACQNHENFAIGESIARHLMRLDFCNSSSYVLLSNIYAGLGLWSAASKVRTMMKKRNL
        P+LQHYGCMVDIL ++G IE A   IEEMP+EPND+IWRT L+AC +H+ F  GE +A+HL+     N SSYVLLSN+YA  G+W    +VRTMMK+R +
Subjt:  PKLQHYGCMVDILGKAGLIEGALKFIEEMPIEPNDIIWRTLLSACQNHENFAIGESIARHLMRLDFCNSSSYVLLSNIYAGLGLWSAASKVRTMMKKRNL

Query:  TKVPGRSWIELEGVVHEFLV
         K+PG SWIEL+G VHEF V
Subjt:  TKVPGRSWIELEGVVHEFLV

AT4G02750.1 Tetratricopeptide repeat (TPR)-like superfamily protein1.6e-10837.79Show/hide
Query:  WNAVIKSYSHGNDPIRALVLFCMMLENGFCVDKFSFSLILKACARVCLVEQGKQIHG---------------------------LLMKLEIGSNLFLLNC
        WN +IK Y    +  +A  LF +M E   C    S++ +L   A+   V+  + +                             +L K      L   NC
Subjt:  WNAVIKSYSHGNDPIRALVLFCMMLENGFCVDKFSFSLILKACARVCLVEQGKQIHG---------------------------LLMKLEIGSNLFLLNC

Query:  LITMYLRCGDIEFARQVFDRMPRQDSVSYNSMIDGYVKSGMVDSARELFDSMPLEDKNLISWNSMIGGFAQTEDGVEFALELFEKMPERDLVSWNTVIGG
        L+  +++   I  ARQ FD M  +D VS+N++I GY +SG +D AR+LFD  P++D  + +W +M+ G+ Q    VE A ELF+KMPER+ VSWN ++ G
Subjt:  LITMYLRCGDIEFARQVFDRMPRQDSVSYNSMIDGYVKSGMVDSARELFDSMPLEDKNLISWNSMIGGFAQTEDGVEFALELFEKMPERDLVSWNTVIGG

Query:  FAKCGRIEFAHSLFNQMPRRDVISWSNLIDGYAKLGNIEVARNLFDEMPEKDVVACNAMMAGYVQNGYCTKALKIFYMMQSQSNLSPDKTTLVIALSAVS
        + +  R+E A  LF+ MP R+V +W+ +I GYA+ G I  A+NLFD+MP++D V+  AM+AGY Q+G+  +AL++F  M+ +     ++++   ALS  +
Subjt:  FAKCGRIEFAHSLFNQMPRRDVISWSNLIDGYAKLGNIEVARNLFDEMPEKDVVACNAMMAGYVQNGYCTKALKIFYMMQSQSNLSPDKTTLVIALSAVS

Query:  QLGRIEKAASIHSYLIENGFSLMGKVGVALIDMYSKCGSINNAMSIFEGIEEKGIDHWNAMISGMARNGLGESAFDMLVEMQKLSVKPDDITFIGVLNAC
         +  +E    +H  L++ G+     VG AL+ MY KCGSI  A  +F+ +  K I  WN MI+G +R+G GE A      M++  +KPDD T + VL+AC
Subjt:  QLGRIEKAASIHSYLIENGFSLMGKVGVALIDMYSKCGSINNAMSIFEGIEEKGIDHWNAMISGMARNGLGESAFDMLVEMQKLSVKPDDITFIGVLNAC

Query:  AHAGLVKEGMICFVLMRKVHKLEPKLQHYGCMVDILGKAGLIEGALKFIEEMPIEPNDIIWRTLLSACQNHENFAIGESIARHLMRLDFCNSSSYVLLSN
        +H GLV +G   F  M + + + P  QHY CMVD+LG+AGL+E A   ++ MP EP+  IW TLL A + H N  + E+ A  +  ++  NS  YVLLSN
Subjt:  AHAGLVKEGMICFVLMRKVHKLEPKLQHYGCMVDILGKAGLIEGALKFIEEMPIEPNDIIWRTLLSACQNHENFAIGESIARHLMRLDFCNSSSYVLLSN

Query:  IYAGLGLWSAASKVRTMMKKRNLTKVPGRSWIELEGVVHEFLVHDKSHPHVTEIYSVLDGL
        +YA  G W    K+R  M+ + + KVPG SWIE++   H F V D+ HP   EI++ L+ L
Subjt:  IYAGLGLWSAASKVRTMMKKRNLTKVPGRSWIELEGVVHEFLVHDKSHPHVTEIYSVLDGL


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
GACCCGTTTCTCTGGAATGCTGTGATCAAATCGTATTCGCACGGGAATGACCCCATTCGAGCTCTGGTATTATTCTGTATGATGCTTGAAAATGGATTTTGTGTCGATAA
GTTCTCGTTTTCTTTGATTCTTAAAGCCTGTGCTCGAGTGTGTTTGGTGGAGCAAGGGAAGCAGATTCATGGGTTGTTGATGAAGTTAGAAATTGGGTCGAATTTGTTTC
TGCTTAATTGTTTGATTACTATGTATTTACGATGCGGGGATATTGAGTTTGCACGGCAAGTGTTCGACAGAATGCCGAGGCAGGACTCTGTTTCGTATAATTCGATGATT
GATGGTTATGTTAAGTCTGGGATGGTCGATTCGGCTCGTGAATTGTTCGATTCTATGCCATTGGAGGATAAGAATTTGATCTCTTGGAACTCGATGATTGGTGGGTTTGC
TCAAACAGAAGACGGTGTGGAGTTTGCATTGGAACTGTTTGAGAAAATGCCTGAGAGAGATTTGGTTTCTTGGAACACGGTAATTGGTGGTTTTGCTAAATGTGGGCGCA
TAGAATTTGCTCATAGCTTGTTCAATCAAATGCCGAGAAGGGATGTAATCAGTTGGTCTAATTTGATTGATGGTTATGCCAAACTGGGTAATATCGAGGTTGCGAGGAAC
CTGTTTGATGAAATGCCTGAGAAAGATGTGGTTGCTTGTAATGCAATGATGGCTGGCTATGTGCAAAATGGTTATTGCACAAAAGCTTTAAAAATATTTTATATGATGCA
AAGCCAAAGCAACTTATCTCCTGATAAAACGACGTTGGTGATCGCGTTGTCTGCTGTTTCTCAGTTAGGACGCATTGAGAAGGCTGCGAGTATACATAGTTATTTGATTG
AAAATGGCTTTTCTTTGATGGGTAAGGTTGGTGTTGCTCTCATTGACATGTATTCTAAATGCGGTAGTATCAATAATGCCATGTCAATATTCGAAGGCATCGAAGAAAAG
GGTATCGACCATTGGAATGCCATGATTAGTGGAATGGCAAGAAATGGTCTGGGTGAGTCGGCTTTTGATATGCTCGTGGAGATGCAGAAGCTTTCAGTGAAACCAGACGA
TATCACTTTCATAGGTGTGTTGAATGCATGTGCGCATGCCGGGTTGGTGAAAGAAGGGATGATTTGTTTCGTGTTGATGAGAAAAGTTCATAAGTTAGAGCCAAAGCTAC
AGCATTATGGATGCATGGTGGACATCCTTGGCAAAGCAGGGCTTATAGAAGGAGCATTGAAATTCATTGAAGAAATGCCCATTGAGCCCAATGATATCATATGGAGGACT
TTGCTTAGCGCTTGCCAAAACCATGAGAACTTTGCCATTGGAGAATCCATTGCTAGACATCTTATGAGGTTGGATTTTTGTAACTCGAGTTCTTATGTTCTTCTTTCGAA
TATCTACGCCGGTCTCGGCCTGTGGAGTGCAGCGAGCAAGGTACGAACAATGATGAAGAAGAGGAATTTAACGAAAGTTCCTGGGCGCAGTTGGATTGAACTTGAGGGAG
TTGTTCATGAGTTCTTGGTGCATGATAAATCCCATCCACATGTTACTGAAATATATTCTGTGTTGGATGGTTTA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
GACCCGTTTCTCTGGAATGCTGTGATCAAATCGTATTCGCACGGGAATGACCCCATTCGAGCTCTGGTATTATTCTGTATGATGCTTGAAAATGGATTTTGTGTCGATAA
GTTCTCGTTTTCTTTGATTCTTAAAGCCTGTGCTCGAGTGTGTTTGGTGGAGCAAGGGAAGCAGATTCATGGGTTGTTGATGAAGTTAGAAATTGGGTCGAATTTGTTTC
TGCTTAATTGTTTGATTACTATGTATTTACGATGCGGGGATATTGAGTTTGCACGGCAAGTGTTCGACAGAATGCCGAGGCAGGACTCTGTTTCGTATAATTCGATGATT
GATGGTTATGTTAAGTCTGGGATGGTCGATTCGGCTCGTGAATTGTTCGATTCTATGCCATTGGAGGATAAGAATTTGATCTCTTGGAACTCGATGATTGGTGGGTTTGC
TCAAACAGAAGACGGTGTGGAGTTTGCATTGGAACTGTTTGAGAAAATGCCTGAGAGAGATTTGGTTTCTTGGAACACGGTAATTGGTGGTTTTGCTAAATGTGGGCGCA
TAGAATTTGCTCATAGCTTGTTCAATCAAATGCCGAGAAGGGATGTAATCAGTTGGTCTAATTTGATTGATGGTTATGCCAAACTGGGTAATATCGAGGTTGCGAGGAAC
CTGTTTGATGAAATGCCTGAGAAAGATGTGGTTGCTTGTAATGCAATGATGGCTGGCTATGTGCAAAATGGTTATTGCACAAAAGCTTTAAAAATATTTTATATGATGCA
AAGCCAAAGCAACTTATCTCCTGATAAAACGACGTTGGTGATCGCGTTGTCTGCTGTTTCTCAGTTAGGACGCATTGAGAAGGCTGCGAGTATACATAGTTATTTGATTG
AAAATGGCTTTTCTTTGATGGGTAAGGTTGGTGTTGCTCTCATTGACATGTATTCTAAATGCGGTAGTATCAATAATGCCATGTCAATATTCGAAGGCATCGAAGAAAAG
GGTATCGACCATTGGAATGCCATGATTAGTGGAATGGCAAGAAATGGTCTGGGTGAGTCGGCTTTTGATATGCTCGTGGAGATGCAGAAGCTTTCAGTGAAACCAGACGA
TATCACTTTCATAGGTGTGTTGAATGCATGTGCGCATGCCGGGTTGGTGAAAGAAGGGATGATTTGTTTCGTGTTGATGAGAAAAGTTCATAAGTTAGAGCCAAAGCTAC
AGCATTATGGATGCATGGTGGACATCCTTGGCAAAGCAGGGCTTATAGAAGGAGCATTGAAATTCATTGAAGAAATGCCCATTGAGCCCAATGATATCATATGGAGGACT
TTGCTTAGCGCTTGCCAAAACCATGAGAACTTTGCCATTGGAGAATCCATTGCTAGACATCTTATGAGGTTGGATTTTTGTAACTCGAGTTCTTATGTTCTTCTTTCGAA
TATCTACGCCGGTCTCGGCCTGTGGAGTGCAGCGAGCAAGGTACGAACAATGATGAAGAAGAGGAATTTAACGAAAGTTCCTGGGCGCAGTTGGATTGAACTTGAGGGAG
TTGTTCATGAGTTCTTGGTGCATGATAAATCCCATCCACATGTTACTGAAATATATTCTGTGTTGGATGGTTTA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
DPFLWNAVIKSYSHGNDPIRALVLFCMMLENGFCVDKFSFSLILKACARVCLVEQGKQIHGLLMKLEIGSNLFLLNCLITMYLRCGDIEFARQVFDRMPRQDSVSYNSMI
DGYVKSGMVDSARELFDSMPLEDKNLISWNSMIGGFAQTEDGVEFALELFEKMPERDLVSWNTVIGGFAKCGRIEFAHSLFNQMPRRDVISWSNLIDGYAKLGNIEVARN
LFDEMPEKDVVACNAMMAGYVQNGYCTKALKIFYMMQSQSNLSPDKTTLVIALSAVSQLGRIEKAASIHSYLIENGFSLMGKVGVALIDMYSKCGSINNAMSIFEGIEEK
GIDHWNAMISGMARNGLGESAFDMLVEMQKLSVKPDDITFIGVLNACAHAGLVKEGMICFVLMRKVHKLEPKLQHYGCMVDILGKAGLIEGALKFIEEMPIEPNDIIWRT
LLSACQNHENFAIGESIARHLMRLDFCNSSSYVLLSNIYAGLGLWSAASKVRTMMKKRNLTKVPGRSWIELEGVVHEFLVHDKSHPHVTEIYSVLDGL