CuGenDBv2

Gene ID	MS006269
Organism	Momordica charantia cv. TR (Bitter gourd (TR) v1)
Description	ATP synthase subunit beta, chloroplastic
Genome location	scaffold96:1748457..1748768
RNA-Seq Expression	MS006269
Synteny	MS006269
Gene Ontology terms	GO:0015986 - ATP synthesis coupled proton transport (biological process) GO:0009535 - chloroplast thylakoid membrane (cellular component) GO:0045261 - proton-transporting ATP synthase complex, catalytic core F(1) (cellular component) GO:0005524 - ATP binding (molecular function) GO:0046933 - proton-transporting ATP synthase activity, rotational mechanism (molecular function) GO:0046961 - proton-transporting ATPase activity, rotational mechanism (molecular function)
InterPro domains	IPR004100 - ATPase, F1/V1/A1 complex, alpha/beta subunit, N-terminal domain IPR027417 - P-loop containing nucleoside triphosphate hydrolase IPR036121 - ATPase, F1/V1/A1 complex, alpha/beta subunit, N-terminal domain superfamily

Homology

Show/hide homology

GenBank top hits

e value

%identity

Alignment

AAY44151.1 ATP synthase beta subunit, partial [Dendrosicyos socotranus]

1.6e-46

91.35

Show/hide

Query:  MPNIYNALVVKGQDTAGQEINVTCEVQQLLGNNRVRSVAMSATDGLMRGMNVIDTKGPLNVPVGGTTLDRIFNVLGVPIDNLGPVDTRTTSPIHRSAPAF
        MPNIYNAL+VKGQDTAGQEINVTCEVQQLLGNNRVR+VAMSATDGLMRGM V+DT+ PL+VPVGGTTL RIFNVLG PIDNLGPVDTRTTSPIHRSAPAF
Subjt:  MPNIYNALVVKGQDTAGQEINVTCEVQQLLGNNRVRSVAMSATDGLMRGMNVIDTKGPLNVPVGGTTLDRIFNVLGVPIDNLGPVDTRTTSPIHRSAPAF

Query:  IQLD
        IQLD
Subjt:  IQLD

AAY44153.1 ATP synthase beta subunit, partial [Gurania tubulosa]

1.6e-46

91.35

Show/hide

Query:  MPNIYNALVVKGQDTAGQEINVTCEVQQLLGNNRVRSVAMSATDGLMRGMNVIDTKGPLNVPVGGTTLDRIFNVLGVPIDNLGPVDTRTTSPIHRSAPAF
        MPNIYNAL+VKGQDTAGQEINVTCEVQQLLGNNRVR+VAMSATDGLMRGM V+DT+ PL+VPVGGTTL RIFNVLG PIDNLGPVDTRTTSPIHRSAPAF
Subjt:  MPNIYNALVVKGQDTAGQEINVTCEVQQLLGNNRVRSVAMSATDGLMRGMNVIDTKGPLNVPVGGTTLDRIFNVLGVPIDNLGPVDTRTTSPIHRSAPAF

Query:  IQLD
        IQLD
Subjt:  IQLD

YP_009456068.1 ATP synthase CF1 beta subunit [Momordica charantia]

1.7e-48

96.15

Show/hide

Query:  MPNIYNALVVKGQDTAGQEINVTCEVQQLLGNNRVRSVAMSATDGLMRGMNVIDTKGPLNVPVGGTTLDRIFNVLGVPIDNLGPVDTRTTSPIHRSAPAF
        MPNIYNALVVKGQDTAGQEINVTCEVQQLLGNNRVR+VAMSATDGLMRGM+VIDTKGPLNVPVGGTTL RIFNVLG PIDNLGPVDTRTTSPIHRSAPAF
Subjt:  MPNIYNALVVKGQDTAGQEINVTCEVQQLLGNNRVRSVAMSATDGLMRGMNVIDTKGPLNVPVGGTTLDRIFNVLGVPIDNLGPVDTRTTSPIHRSAPAF

Query:  IQLD
        IQLD
Subjt:  IQLD

YP_009752082.1 CF1 subunit beta [Dendrosicyos socotranus]

1.6e-46

91.35

Show/hide

Query:  MPNIYNALVVKGQDTAGQEINVTCEVQQLLGNNRVRSVAMSATDGLMRGMNVIDTKGPLNVPVGGTTLDRIFNVLGVPIDNLGPVDTRTTSPIHRSAPAF
        MPNIYNAL+VKGQDTAGQEINVTCEVQQLLGNNRVR+VAMSATDGLMRGM V+DT+ PL+VPVGGTTL RIFNVLG PIDNLGPVDTRTTSPIHRSAPAF
Subjt:  MPNIYNALVVKGQDTAGQEINVTCEVQQLLGNNRVRSVAMSATDGLMRGMNVIDTKGPLNVPVGGTTLDRIFNVLGVPIDNLGPVDTRTTSPIHRSAPAF

Query:  IQLD
        IQLD
Subjt:  IQLD

YP_009752927.1 CF1 subunit beta [Momordica sessilifolia]

3.5e-46

92.31

Show/hide

Query:  MPNIYNALVVKGQDTAGQEINVTCEVQQLLGNNRVRSVAMSATDGLMRGMNVIDTKGPLNVPVGGTTLDRIFNVLGVPIDNLGPVDTRTTSPIHRSAPAF
        MPNIYNALVVKGQD AGQEINVTCEVQQLLGNNRVR+VAMSATDGLMRGM VIDT+GPL+VPVGG TL RIFNVLG PIDNLGPVDTRTTSPIHRSAPAF
Subjt:  MPNIYNALVVKGQDTAGQEINVTCEVQQLLGNNRVRSVAMSATDGLMRGMNVIDTKGPLNVPVGGTTLDRIFNVLGVPIDNLGPVDTRTTSPIHRSAPAF

Query:  IQLD
        IQLD
Subjt:  IQLD

TrEMBL top hits

e value

%identity

Alignment

A0A2I6BZY4 ATP synthase subunit beta, chloroplastic

8.0e-49

96.15

Show/hide

Query:  MPNIYNALVVKGQDTAGQEINVTCEVQQLLGNNRVRSVAMSATDGLMRGMNVIDTKGPLNVPVGGTTLDRIFNVLGVPIDNLGPVDTRTTSPIHRSAPAF
        MPNIYNALVVKGQDTAGQEINVTCEVQQLLGNNRVR+VAMSATDGLMRGM+VIDTKGPLNVPVGGTTL RIFNVLG PIDNLGPVDTRTTSPIHRSAPAF
Subjt:  MPNIYNALVVKGQDTAGQEINVTCEVQQLLGNNRVRSVAMSATDGLMRGMNVIDTKGPLNVPVGGTTLDRIFNVLGVPIDNLGPVDTRTTSPIHRSAPAF

Query:  IQLD
        IQLD
Subjt:  IQLD

A0A6H0ET20 ATP synthase subunit beta, chloroplastic

7.5e-47

91.35

Show/hide

Query:  MPNIYNALVVKGQDTAGQEINVTCEVQQLLGNNRVRSVAMSATDGLMRGMNVIDTKGPLNVPVGGTTLDRIFNVLGVPIDNLGPVDTRTTSPIHRSAPAF
        MPNIYNAL+VKGQDTAGQEINVTCEVQQLLGNNRVR+VAMSATDGLMRGM V+DT+ PL+VPVGGTTL RIFNVLG PIDNLGPVDTRTTSPIHRSAPAF
Subjt:  MPNIYNALVVKGQDTAGQEINVTCEVQQLLGNNRVRSVAMSATDGLMRGMNVIDTKGPLNVPVGGTTLDRIFNVLGVPIDNLGPVDTRTTSPIHRSAPAF

Query:  IQLD
        IQLD
Subjt:  IQLD

A0A6H0EV22 ATP synthase subunit beta, chloroplastic

7.5e-47

91.35

Show/hide

Query:  MPNIYNALVVKGQDTAGQEINVTCEVQQLLGNNRVRSVAMSATDGLMRGMNVIDTKGPLNVPVGGTTLDRIFNVLGVPIDNLGPVDTRTTSPIHRSAPAF
        MPNIYNAL+VKGQDTAGQEINVTCEVQQLLGNNRVR+VAMSATDGLMRGM V+DT+ PL+VPVGGTTL RIFNVLG PIDNLGPVDTRTTSPIHRSAPAF
Subjt:  MPNIYNALVVKGQDTAGQEINVTCEVQQLLGNNRVRSVAMSATDGLMRGMNVIDTKGPLNVPVGGTTLDRIFNVLGVPIDNLGPVDTRTTSPIHRSAPAF

Query:  IQLD
        IQLD
Subjt:  IQLD

Q29S91 ATP synthase subunit beta (Fragment)

7.5e-47

91.35

Show/hide

Query:  MPNIYNALVVKGQDTAGQEINVTCEVQQLLGNNRVRSVAMSATDGLMRGMNVIDTKGPLNVPVGGTTLDRIFNVLGVPIDNLGPVDTRTTSPIHRSAPAF
        MPNIYNAL+VKGQDTAGQEINVTCEVQQLLGNNRVR+VAMSATDGLMRGM V+DT+ PL+VPVGGTTL RIFNVLG PIDNLGPVDTRTTSPIHRSAPAF
Subjt:  MPNIYNALVVKGQDTAGQEINVTCEVQQLLGNNRVRSVAMSATDGLMRGMNVIDTKGPLNVPVGGTTLDRIFNVLGVPIDNLGPVDTRTTSPIHRSAPAF

Query:  IQLD
        IQLD
Subjt:  IQLD

Q29S93 ATP synthase subunit beta (Fragment)

7.5e-47

91.35

Show/hide

Query:  MPNIYNALVVKGQDTAGQEINVTCEVQQLLGNNRVRSVAMSATDGLMRGMNVIDTKGPLNVPVGGTTLDRIFNVLGVPIDNLGPVDTRTTSPIHRSAPAF
        MPNIYNAL+VKGQDTAGQEINVTCEVQQLLGNNRVR+VAMSATDGLMRGM V+DT+ PL+VPVGGTTL RIFNVLG PIDNLGPVDTRTTSPIHRSAPAF
Subjt:  MPNIYNALVVKGQDTAGQEINVTCEVQQLLGNNRVRSVAMSATDGLMRGMNVIDTKGPLNVPVGGTTLDRIFNVLGVPIDNLGPVDTRTTSPIHRSAPAF

Query:  IQLD
        IQLD
Subjt:  IQLD

SwissProt top hits

e value

%identity

Alignment

O98766 ATP synthase subunit beta, chloroplastic

3.2e-47

88.46

Show/hide

Query:  MPNIYNALVVKGQDTAGQEINVTCEVQQLLGNNRVRSVAMSATDGLMRGMNVIDTKGPLNVPVGGTTLDRIFNVLGVPIDNLGPVDTRTTSPIHRSAPAF
        MPNIYNALVVKG+DT GQ+INVTCEVQQLLGNNRVR+VAMSATDGLMRGM VIDT  PL+VPVGG TL RIFNVLG P+DNLGPVDTRTTSPIHRSAPAF
Subjt:  MPNIYNALVVKGQDTAGQEINVTCEVQQLLGNNRVRSVAMSATDGLMRGMNVIDTKGPLNVPVGGTTLDRIFNVLGVPIDNLGPVDTRTTSPIHRSAPAF

Query:  IQLD
        IQLD
Subjt:  IQLD

Q09FV4 ATP synthase subunit beta, chloroplastic

1.1e-47

89.42

Show/hide

Query:  MPNIYNALVVKGQDTAGQEINVTCEVQQLLGNNRVRSVAMSATDGLMRGMNVIDTKGPLNVPVGGTTLDRIFNVLGVPIDNLGPVDTRTTSPIHRSAPAF
        MPNIYNALVVKGQDT GQ+INVTCEVQQLLGNNRVR+VAMSATDGLMRGM VIDT  PL+VPVGG TL RIFNVLG P+DNLGPVDTRTTSPIHRSAPAF
Subjt:  MPNIYNALVVKGQDTAGQEINVTCEVQQLLGNNRVRSVAMSATDGLMRGMNVIDTKGPLNVPVGGTTLDRIFNVLGVPIDNLGPVDTRTTSPIHRSAPAF

Query:  IQLD
        IQLD
Subjt:  IQLD

Q09X10 ATP synthase subunit beta, chloroplastic

2.5e-47

89.42

Show/hide

Query:  MPNIYNALVVKGQDTAGQEINVTCEVQQLLGNNRVRSVAMSATDGLMRGMNVIDTKGPLNVPVGGTTLDRIFNVLGVPIDNLGPVDTRTTSPIHRSAPAF
        MPNIYNALVVKG+DT GQ+INVTCEVQQLLGNNRVR+VAMSATDGLMRGM VIDT  PL+VPVGG TL RIFNVLG PIDNLGPVDTRTTSPIHRSAPAF
Subjt:  MPNIYNALVVKGQDTAGQEINVTCEVQQLLGNNRVRSVAMSATDGLMRGMNVIDTKGPLNVPVGGTTLDRIFNVLGVPIDNLGPVDTRTTSPIHRSAPAF

Query:  IQLD
        IQLD
Subjt:  IQLD

Q6QBP2 ATP synthase subunit beta, chloroplastic

1.1e-47

89.42

Show/hide

Query:  MPNIYNALVVKGQDTAGQEINVTCEVQQLLGNNRVRSVAMSATDGLMRGMNVIDTKGPLNVPVGGTTLDRIFNVLGVPIDNLGPVDTRTTSPIHRSAPAF
        MPNIYNALVVKG+DTAGQ+INVTCEVQQLLGNNRVR+VAMSATDGLMRGM VIDT  PL+VPVGG TL RIFNVLG P+DNLGPVDTRTTSPIHRSAPAF
Subjt:  MPNIYNALVVKGQDTAGQEINVTCEVQQLLGNNRVRSVAMSATDGLMRGMNVIDTKGPLNVPVGGTTLDRIFNVLGVPIDNLGPVDTRTTSPIHRSAPAF

Query:  IQLD
        IQLD
Subjt:  IQLD

Q7HDI4 ATP synthase subunit beta, chloroplastic

3.2e-47

88.46

Show/hide

Query:  MPNIYNALVVKGQDTAGQEINVTCEVQQLLGNNRVRSVAMSATDGLMRGMNVIDTKGPLNVPVGGTTLDRIFNVLGVPIDNLGPVDTRTTSPIHRSAPAF
        MPNIYNALVVKG+DT GQ+INVTCEVQQLLGNNRVR+VAMSATDGLMRGM VIDT  PL+VPVGG TL RIFNVLG P+DNLGPVDTRTTSPIHRSAPAF
Subjt:  MPNIYNALVVKGQDTAGQEINVTCEVQQLLGNNRVRSVAMSATDGLMRGMNVIDTKGPLNVPVGGTTLDRIFNVLGVPIDNLGPVDTRTTSPIHRSAPAF

Query:  IQLD
        IQLD
Subjt:  IQLD

Arabidopsis top hits

e value

%identity

Alignment

AT5G08670.1 ATP synthase alpha/beta family protein

5.5e-18

45.63

Show/hide

Query:  MPNIYNALVVKGQDTAGQEINVTCEVQQLLGNNRVRSVAMSATDGLMRGMNVIDTKGPLNVPVGGTTLDRIFNVLGVPIDNLGPVDTRTTSPIHRSAPAF
        +P I  +L V+   T      +  EV   LG N VR++AM  T+GL+RG  V++T  P+ VPVG  TL RI NVLG PID  G + T    PIHR APA 
Subjt:  MPNIYNALVVKGQDTAGQEINVTCEVQQLLGNNRVRSVAMSATDGLMRGMNVIDTKGPLNVPVGGTTLDRIFNVLGVPIDNLGPVDTRTTSPIHRSAPAF

Query:  IQL
        + L
Subjt:  IQL

AT5G08680.1 ATP synthase alpha/beta family protein

5.5e-18

45.63

Show/hide

Query:  MPNIYNALVVKGQDTAGQEINVTCEVQQLLGNNRVRSVAMSATDGLMRGMNVIDTKGPLNVPVGGTTLDRIFNVLGVPIDNLGPVDTRTTSPIHRSAPAF
        +P I  +L V+   T      +  EV   LG N VR++AM  T+GL+RG  V++T  P+ VPVG  TL RI NVLG PID  G + T    PIHR APA 
Subjt:  MPNIYNALVVKGQDTAGQEINVTCEVQQLLGNNRVRSVAMSATDGLMRGMNVIDTKGPLNVPVGGTTLDRIFNVLGVPIDNLGPVDTRTTSPIHRSAPAF

Query:  IQL
        + L
Subjt:  IQL

AT5G08690.1 ATP synthase alpha/beta family protein

5.5e-18

45.63

Show/hide

Query:  MPNIYNALVVKGQDTAGQEINVTCEVQQLLGNNRVRSVAMSATDGLMRGMNVIDTKGPLNVPVGGTTLDRIFNVLGVPIDNLGPVDTRTTSPIHRSAPAF
        +P I  +L V+   T      +  EV   LG N VR++AM  T+GL+RG  V++T  P+ VPVG  TL RI NVLG PID  G + T    PIHR APA 
Subjt:  MPNIYNALVVKGQDTAGQEINVTCEVQQLLGNNRVRSVAMSATDGLMRGMNVIDTKGPLNVPVGGTTLDRIFNVLGVPIDNLGPVDTRTTSPIHRSAPAF

Query:  IQL
        + L
Subjt:  IQL

ATCG00480.1 ATP synthase subunit beta

4.8e-46

83.65

Show/hide

Query:  MPNIYNALVVKGQDTAGQEINVTCEVQQLLGNNRVRSVAMSATDGLMRGMNVIDTKGPLNVPVGGTTLDRIFNVLGVPIDNLGPVDTRTTSPIHRSAPAF
        MPNIYNALVVKG+DT GQEINVTCEVQQLLGNNRVR+VAMSAT+GL RGM+V+D   PL+VPVGG TL RIFNVLG P+DNLGPVDTRTTSPIH+SAPAF
Subjt:  MPNIYNALVVKGQDTAGQEINVTCEVQQLLGNNRVRSVAMSATDGLMRGMNVIDTKGPLNVPVGGTTLDRIFNVLGVPIDNLGPVDTRTTSPIHRSAPAF

Query:  IQLD
        I+LD
Subjt:  IQLD

Sequences

Show/hide sequences

CDS sequence

Show/hide CDS sequence

ATGCCTAATATTTACAACGCTTTGGTAGTTAAGGGTCAAGATACTGCCGGTCAAGAAATTAATGTGACTTGTGAAGTACAGCAATTATTAGGAAATAATCGAGTTAGATC
TGTAGCTATGAGTGCTACAGATGGTCTAATGAGAGGAATGAACGTGATTGACACGAAAGGTCCTCTAAATGTTCCAGTCGGCGGAACGACTCTCGACCGAATTTTCAATG
TGCTTGGAGTGCCTATTGATAATTTGGGTCCTGTAGATACTCGCACAACATCTCCTATTCATAGATCCGCCCCTGCTTTTATACAGTTAGAT

mRNA sequence

Show/hide mRNA sequence

Protein sequence

Show/hide protein sequence

MPNIYNALVVKGQDTAGQEINVTCEVQQLLGNNRVRSVAMSATDGLMRGMNVIDTKGPLNVPVGGTTLDRIFNVLGVPIDNLGPVDTRTTSPIHRSAPAFIQLD

MS006269 (gene) of Bitter gourd (TR) v1 genome