; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

MS006273 (gene) of Bitter gourd (TR) v1 genome

Gene IDMS006273
OrganismMomordica charantia cv. TR (Bitter gourd (TR) v1)
DescriptionGDT1 family protein
Genome locationscaffold96:1807992..1811595
RNA-Seq ExpressionMS006273
SyntenyMS006273
Gene Ontology termsGO:0032468 - Golgi calcium ion homeostasis (biological process)
GO:0032472 - Golgi calcium ion transport (biological process)
GO:0070588 - calcium ion transmembrane transport (biological process)
GO:0071421 - manganese ion transmembrane transport (biological process)
GO:0005794 - Golgi apparatus (cellular component)
GO:0009535 - chloroplast thylakoid membrane (cellular component)
GO:0016021 - integral component of membrane (cellular component)
GO:0005384 - manganese ion transmembrane transporter activity (molecular function)
GO:0015085 - calcium ion transmembrane transporter activity (molecular function)
InterPro domainsIPR001727 - Gdt1 family


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
XP_004143960.2 GDT1-like protein 1, chloroplastic isoform X1 [Cucumis sativus]4.1e-11883.21Show/hide
Query:  LYSFSSRCSASTRRERHWHKPEVVSKYHDRQELCHRNYSSCDLSAKSATVIDNCSSSGKSLAKYNSAREIHENTDNLMSSSTISSSFLKFVLLSGFFIFQ
        L+ FSS C  +T +  +W K EVVSKY+D QE CH +YSS ++S +S T++DNC +  K LAKY+SA  IHENTDN  SSS  SSSFLKF+LLSGFFI Q
Subjt:  LYSFSSRCSASTRRERHWHKPEVVSKYHDRQELCHRNYSSCDLSAKSATVIDNCSSSGKSLAKYNSAREIHENTDNLMSSSTISSSFLKFVLLSGFFIFQ

Query:  DSQQALAGSDIATGLQSVPLLGDLGDISTGFASAFLLIFFSELGDKTFFIAALLAARNSAAIVFTGTFGALAAMTIISVVLGRTFHYVDEILPFRLGDSD
        DSQ ALAGSD+ATGLQSVPLLGDLGDISTGFASAFLLIFFSELGDKTFFIAALLAARNSAA VFTGTFGAL AMTIISVVLGRTFHYVDEILPFRLGDSD
Subjt:  DSQQALAGSDIATGLQSVPLLGDLGDISTGFASAFLLIFFSELGDKTFFIAALLAARNSAAIVFTGTFGALAAMTIISVVLGRTFHYVDEILPFRLGDSD

Query:  LPVDDIAAVCLLVYFGVSTLLDASSSDGLKAEDEQKEAEIAVSKFSGNGAGILAAASTVVSTFVLVFVAEWGDKSFFSTI
        LPVDDIAAVCLLVYFGV+TLLDASSSDGLKAEDEQKEAE+AVSKFSGNGAGILAAASTVVSTF LVFVAEWGDKSFFSTI
Subjt:  LPVDDIAAVCLLVYFGVSTLLDASSSDGLKAEDEQKEAEIAVSKFSGNGAGILAAASTVVSTFVLVFVAEWGDKSFFSTI

XP_022146056.1 protein PAM71, chloroplastic isoform X1 [Momordica charantia]8.8e-14599.64Show/hide
Query:  LYSFSSRCSASTRRERHWHKPEVVSKYHDRQELCHRNYSSCDLSAKSATVIDNCSSSGKSLAKYNSAREIHENTDNLMSSSTISSSFLKFVLLSGFFIFQ
        L+SFSSRCSASTRRERHWHKPEVVSKYHDRQELCHRNYSSCDLSAKSATVIDNCSSSGKSLAKYNSAREIHENTDNLMSSSTISSSFLKFVLLSGFFIFQ
Subjt:  LYSFSSRCSASTRRERHWHKPEVVSKYHDRQELCHRNYSSCDLSAKSATVIDNCSSSGKSLAKYNSAREIHENTDNLMSSSTISSSFLKFVLLSGFFIFQ

Query:  DSQQALAGSDIATGLQSVPLLGDLGDISTGFASAFLLIFFSELGDKTFFIAALLAARNSAAIVFTGTFGALAAMTIISVVLGRTFHYVDEILPFRLGDSD
        DSQQALAGSDIATGLQSVPLLGDLGDISTGFASAFLLIFFSELGDKTFFIAALLAARNSAAIVFTGTFGALAAMTIISVVLGRTFHYVDEILPFRLGDSD
Subjt:  DSQQALAGSDIATGLQSVPLLGDLGDISTGFASAFLLIFFSELGDKTFFIAALLAARNSAAIVFTGTFGALAAMTIISVVLGRTFHYVDEILPFRLGDSD

Query:  LPVDDIAAVCLLVYFGVSTLLDASSSDGLKAEDEQKEAEIAVSKFSGNGAGILAAASTVVSTFVLVFVAEWGDKSFFSTI
        LPVDDIAAVCLLVYFGVSTLLDASSSDGLKAEDEQKEAEIAVSKFSGNGAGILAAASTVVSTFVLVFVAEWGDKSFFSTI
Subjt:  LPVDDIAAVCLLVYFGVSTLLDASSSDGLKAEDEQKEAEIAVSKFSGNGAGILAAASTVVSTFVLVFVAEWGDKSFFSTI

XP_022146057.1 GDT1-like protein 1, chloroplastic isoform X2 [Momordica charantia]8.8e-14599.64Show/hide
Query:  LYSFSSRCSASTRRERHWHKPEVVSKYHDRQELCHRNYSSCDLSAKSATVIDNCSSSGKSLAKYNSAREIHENTDNLMSSSTISSSFLKFVLLSGFFIFQ
        L+SFSSRCSASTRRERHWHKPEVVSKYHDRQELCHRNYSSCDLSAKSATVIDNCSSSGKSLAKYNSAREIHENTDNLMSSSTISSSFLKFVLLSGFFIFQ
Subjt:  LYSFSSRCSASTRRERHWHKPEVVSKYHDRQELCHRNYSSCDLSAKSATVIDNCSSSGKSLAKYNSAREIHENTDNLMSSSTISSSFLKFVLLSGFFIFQ

Query:  DSQQALAGSDIATGLQSVPLLGDLGDISTGFASAFLLIFFSELGDKTFFIAALLAARNSAAIVFTGTFGALAAMTIISVVLGRTFHYVDEILPFRLGDSD
        DSQQALAGSDIATGLQSVPLLGDLGDISTGFASAFLLIFFSELGDKTFFIAALLAARNSAAIVFTGTFGALAAMTIISVVLGRTFHYVDEILPFRLGDSD
Subjt:  DSQQALAGSDIATGLQSVPLLGDLGDISTGFASAFLLIFFSELGDKTFFIAALLAARNSAAIVFTGTFGALAAMTIISVVLGRTFHYVDEILPFRLGDSD

Query:  LPVDDIAAVCLLVYFGVSTLLDASSSDGLKAEDEQKEAEIAVSKFSGNGAGILAAASTVVSTFVLVFVAEWGDKSFFSTI
        LPVDDIAAVCLLVYFGVSTLLDASSSDGLKAEDEQKEAEIAVSKFSGNGAGILAAASTVVSTFVLVFVAEWGDKSFFSTI
Subjt:  LPVDDIAAVCLLVYFGVSTLLDASSSDGLKAEDEQKEAEIAVSKFSGNGAGILAAASTVVSTFVLVFVAEWGDKSFFSTI

XP_022146058.1 protein PAM71, chloroplastic isoform X3 [Momordica charantia]8.8e-14599.64Show/hide
Query:  LYSFSSRCSASTRRERHWHKPEVVSKYHDRQELCHRNYSSCDLSAKSATVIDNCSSSGKSLAKYNSAREIHENTDNLMSSSTISSSFLKFVLLSGFFIFQ
        L+SFSSRCSASTRRERHWHKPEVVSKYHDRQELCHRNYSSCDLSAKSATVIDNCSSSGKSLAKYNSAREIHENTDNLMSSSTISSSFLKFVLLSGFFIFQ
Subjt:  LYSFSSRCSASTRRERHWHKPEVVSKYHDRQELCHRNYSSCDLSAKSATVIDNCSSSGKSLAKYNSAREIHENTDNLMSSSTISSSFLKFVLLSGFFIFQ

Query:  DSQQALAGSDIATGLQSVPLLGDLGDISTGFASAFLLIFFSELGDKTFFIAALLAARNSAAIVFTGTFGALAAMTIISVVLGRTFHYVDEILPFRLGDSD
        DSQQALAGSDIATGLQSVPLLGDLGDISTGFASAFLLIFFSELGDKTFFIAALLAARNSAAIVFTGTFGALAAMTIISVVLGRTFHYVDEILPFRLGDSD
Subjt:  DSQQALAGSDIATGLQSVPLLGDLGDISTGFASAFLLIFFSELGDKTFFIAALLAARNSAAIVFTGTFGALAAMTIISVVLGRTFHYVDEILPFRLGDSD

Query:  LPVDDIAAVCLLVYFGVSTLLDASSSDGLKAEDEQKEAEIAVSKFSGNGAGILAAASTVVSTFVLVFVAEWGDKSFFSTI
        LPVDDIAAVCLLVYFGVSTLLDASSSDGLKAEDEQKEAEIAVSKFSGNGAGILAAASTVVSTFVLVFVAEWGDKSFFSTI
Subjt:  LPVDDIAAVCLLVYFGVSTLLDASSSDGLKAEDEQKEAEIAVSKFSGNGAGILAAASTVVSTFVLVFVAEWGDKSFFSTI

XP_038875218.1 GDT1-like protein 1, chloroplastic [Benincasa hispida]8.2e-11984.29Show/hide
Query:  LYSFSSRCSASTRRERHWHKPEVVSKYHDRQELCHRNYSSCDLSAKSATVIDNCSSSGKSLAKYNSAREIHENTDNLMSSSTISSSFLKFVLLSGFFIFQ
        L  FSS   A+TR+  +W + EVVSKY+DRQELCH +YSS +LS KS TV+DNC +  +SLAKY+SA  IHENTD+  SS+ +SSSFLKF+LLSGFFI Q
Subjt:  LYSFSSRCSASTRRERHWHKPEVVSKYHDRQELCHRNYSSCDLSAKSATVIDNCSSSGKSLAKYNSAREIHENTDNLMSSSTISSSFLKFVLLSGFFIFQ

Query:  DSQQALAGSDIATGLQSVPLLGDLGDISTGFASAFLLIFFSELGDKTFFIAALLAARNSAAIVFTGTFGALAAMTIISVVLGRTFHYVDEILPFRLGDSD
        DSQQALAGSD+ATGLQSVP LGDLGDISTGFASAFLLIFFSELGDKTFFIAALLAARNSAA VFTGTFGALAAMTIISVVLGRTFHYVDEILPFRLGDSD
Subjt:  DSQQALAGSDIATGLQSVPLLGDLGDISTGFASAFLLIFFSELGDKTFFIAALLAARNSAAIVFTGTFGALAAMTIISVVLGRTFHYVDEILPFRLGDSD

Query:  LPVDDIAAVCLLVYFGVSTLLDASSSDGLKAEDEQKEAEIAVSKFSGNGAGILAAASTVVSTFVLVFVAEWGDKSFFSTI
        LPVDDIAAVCLLVYFGV+TL+DASSSDGLKAEDEQKEAE+AVSKFSGNGAGILAAASTVVSTF LVFVAEWGDKSFFSTI
Subjt:  LPVDDIAAVCLLVYFGVSTLLDASSSDGLKAEDEQKEAEIAVSKFSGNGAGILAAASTVVSTFVLVFVAEWGDKSFFSTI

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0KNT2 GDT1 family protein2.0e-11883.21Show/hide
Query:  LYSFSSRCSASTRRERHWHKPEVVSKYHDRQELCHRNYSSCDLSAKSATVIDNCSSSGKSLAKYNSAREIHENTDNLMSSSTISSSFLKFVLLSGFFIFQ
        L+ FSS C  +T +  +W K EVVSKY+D QE CH +YSS ++S +S T++DNC +  K LAKY+SA  IHENTDN  SSS  SSSFLKF+LLSGFFI Q
Subjt:  LYSFSSRCSASTRRERHWHKPEVVSKYHDRQELCHRNYSSCDLSAKSATVIDNCSSSGKSLAKYNSAREIHENTDNLMSSSTISSSFLKFVLLSGFFIFQ

Query:  DSQQALAGSDIATGLQSVPLLGDLGDISTGFASAFLLIFFSELGDKTFFIAALLAARNSAAIVFTGTFGALAAMTIISVVLGRTFHYVDEILPFRLGDSD
        DSQ ALAGSD+ATGLQSVPLLGDLGDISTGFASAFLLIFFSELGDKTFFIAALLAARNSAA VFTGTFGAL AMTIISVVLGRTFHYVDEILPFRLGDSD
Subjt:  DSQQALAGSDIATGLQSVPLLGDLGDISTGFASAFLLIFFSELGDKTFFIAALLAARNSAAIVFTGTFGALAAMTIISVVLGRTFHYVDEILPFRLGDSD

Query:  LPVDDIAAVCLLVYFGVSTLLDASSSDGLKAEDEQKEAEIAVSKFSGNGAGILAAASTVVSTFVLVFVAEWGDKSFFSTI
        LPVDDIAAVCLLVYFGV+TLLDASSSDGLKAEDEQKEAE+AVSKFSGNGAGILAAASTVVSTF LVFVAEWGDKSFFSTI
Subjt:  LPVDDIAAVCLLVYFGVSTLLDASSSDGLKAEDEQKEAEIAVSKFSGNGAGILAAASTVVSTFVLVFVAEWGDKSFFSTI

A0A5A7THF5 GDT1 family protein6.4e-11783.27Show/hide
Query:  LYSFSSRCSASTRRERHWHKPEVVSKYHDRQELCHRNYSSCDLSAKSATVIDNCSSSGKSLAKYNSAREIHENTDNLMSSSTISSSFLKFVLLSGFFIFQ
        L+ FSS C  +T ++  W K EVVSKY+D QELCH +YSS +LS KS T++DNC +  K LAKY+SA  I+ENTDN  SSS  SSSFLK +LLSGFFI Q
Subjt:  LYSFSSRCSASTRRERHWHKPEVVSKYHDRQELCHRNYSSCDLSAKSATVIDNCSSSGKSLAKYNSAREIHENTDNLMSSSTISSSFLKFVLLSGFFIFQ

Query:  DSQQALAGS-DIATGLQSVPLLGDLGDISTGFASAFLLIFFSELGDKTFFIAALLAARNSAAIVFTGTFGALAAMTIISVVLGRTFHYVDEILPFRLGDS
        DSQ ALAGS D+ATGLQSVPLLGDLGDISTGFASAFLLIFFSELGDKTFFIAALLAARNSAA VFTGTFGALAAMTIISV LGRTFHYVDEILPFRLGDS
Subjt:  DSQQALAGS-DIATGLQSVPLLGDLGDISTGFASAFLLIFFSELGDKTFFIAALLAARNSAAIVFTGTFGALAAMTIISVVLGRTFHYVDEILPFRLGDS

Query:  DLPVDDIAAVCLLVYFGVSTLLDASSSDGLKAEDEQKEAEIAVSKFSGNGAGILAAASTVVSTFVLVFVAEWGDKSFFSTI
        DLPVDDIAAVCLLVYFGV+TLLDASSSDGLKAEDEQKEAE+AVSKFSGNGAGILAAASTVVSTF LVFVAEWGDKSFFSTI
Subjt:  DLPVDDIAAVCLLVYFGVSTLLDASSSDGLKAEDEQKEAEIAVSKFSGNGAGILAAASTVVSTFVLVFVAEWGDKSFFSTI

A0A6J1CXK0 GDT1 family protein4.2e-14599.64Show/hide
Query:  LYSFSSRCSASTRRERHWHKPEVVSKYHDRQELCHRNYSSCDLSAKSATVIDNCSSSGKSLAKYNSAREIHENTDNLMSSSTISSSFLKFVLLSGFFIFQ
        L+SFSSRCSASTRRERHWHKPEVVSKYHDRQELCHRNYSSCDLSAKSATVIDNCSSSGKSLAKYNSAREIHENTDNLMSSSTISSSFLKFVLLSGFFIFQ
Subjt:  LYSFSSRCSASTRRERHWHKPEVVSKYHDRQELCHRNYSSCDLSAKSATVIDNCSSSGKSLAKYNSAREIHENTDNLMSSSTISSSFLKFVLLSGFFIFQ

Query:  DSQQALAGSDIATGLQSVPLLGDLGDISTGFASAFLLIFFSELGDKTFFIAALLAARNSAAIVFTGTFGALAAMTIISVVLGRTFHYVDEILPFRLGDSD
        DSQQALAGSDIATGLQSVPLLGDLGDISTGFASAFLLIFFSELGDKTFFIAALLAARNSAAIVFTGTFGALAAMTIISVVLGRTFHYVDEILPFRLGDSD
Subjt:  DSQQALAGSDIATGLQSVPLLGDLGDISTGFASAFLLIFFSELGDKTFFIAALLAARNSAAIVFTGTFGALAAMTIISVVLGRTFHYVDEILPFRLGDSD

Query:  LPVDDIAAVCLLVYFGVSTLLDASSSDGLKAEDEQKEAEIAVSKFSGNGAGILAAASTVVSTFVLVFVAEWGDKSFFSTI
        LPVDDIAAVCLLVYFGVSTLLDASSSDGLKAEDEQKEAEIAVSKFSGNGAGILAAASTVVSTFVLVFVAEWGDKSFFSTI
Subjt:  LPVDDIAAVCLLVYFGVSTLLDASSSDGLKAEDEQKEAEIAVSKFSGNGAGILAAASTVVSTFVLVFVAEWGDKSFFSTI

A0A6J1CY82 protein PAM71, chloroplastic isoform X14.2e-14599.64Show/hide
Query:  LYSFSSRCSASTRRERHWHKPEVVSKYHDRQELCHRNYSSCDLSAKSATVIDNCSSSGKSLAKYNSAREIHENTDNLMSSSTISSSFLKFVLLSGFFIFQ
        L+SFSSRCSASTRRERHWHKPEVVSKYHDRQELCHRNYSSCDLSAKSATVIDNCSSSGKSLAKYNSAREIHENTDNLMSSSTISSSFLKFVLLSGFFIFQ
Subjt:  LYSFSSRCSASTRRERHWHKPEVVSKYHDRQELCHRNYSSCDLSAKSATVIDNCSSSGKSLAKYNSAREIHENTDNLMSSSTISSSFLKFVLLSGFFIFQ

Query:  DSQQALAGSDIATGLQSVPLLGDLGDISTGFASAFLLIFFSELGDKTFFIAALLAARNSAAIVFTGTFGALAAMTIISVVLGRTFHYVDEILPFRLGDSD
        DSQQALAGSDIATGLQSVPLLGDLGDISTGFASAFLLIFFSELGDKTFFIAALLAARNSAAIVFTGTFGALAAMTIISVVLGRTFHYVDEILPFRLGDSD
Subjt:  DSQQALAGSDIATGLQSVPLLGDLGDISTGFASAFLLIFFSELGDKTFFIAALLAARNSAAIVFTGTFGALAAMTIISVVLGRTFHYVDEILPFRLGDSD

Query:  LPVDDIAAVCLLVYFGVSTLLDASSSDGLKAEDEQKEAEIAVSKFSGNGAGILAAASTVVSTFVLVFVAEWGDKSFFSTI
        LPVDDIAAVCLLVYFGVSTLLDASSSDGLKAEDEQKEAEIAVSKFSGNGAGILAAASTVVSTFVLVFVAEWGDKSFFSTI
Subjt:  LPVDDIAAVCLLVYFGVSTLLDASSSDGLKAEDEQKEAEIAVSKFSGNGAGILAAASTVVSTFVLVFVAEWGDKSFFSTI

A0A6J1CYI6 GDT1 family protein4.2e-14599.64Show/hide
Query:  LYSFSSRCSASTRRERHWHKPEVVSKYHDRQELCHRNYSSCDLSAKSATVIDNCSSSGKSLAKYNSAREIHENTDNLMSSSTISSSFLKFVLLSGFFIFQ
        L+SFSSRCSASTRRERHWHKPEVVSKYHDRQELCHRNYSSCDLSAKSATVIDNCSSSGKSLAKYNSAREIHENTDNLMSSSTISSSFLKFVLLSGFFIFQ
Subjt:  LYSFSSRCSASTRRERHWHKPEVVSKYHDRQELCHRNYSSCDLSAKSATVIDNCSSSGKSLAKYNSAREIHENTDNLMSSSTISSSFLKFVLLSGFFIFQ

Query:  DSQQALAGSDIATGLQSVPLLGDLGDISTGFASAFLLIFFSELGDKTFFIAALLAARNSAAIVFTGTFGALAAMTIISVVLGRTFHYVDEILPFRLGDSD
        DSQQALAGSDIATGLQSVPLLGDLGDISTGFASAFLLIFFSELGDKTFFIAALLAARNSAAIVFTGTFGALAAMTIISVVLGRTFHYVDEILPFRLGDSD
Subjt:  DSQQALAGSDIATGLQSVPLLGDLGDISTGFASAFLLIFFSELGDKTFFIAALLAARNSAAIVFTGTFGALAAMTIISVVLGRTFHYVDEILPFRLGDSD

Query:  LPVDDIAAVCLLVYFGVSTLLDASSSDGLKAEDEQKEAEIAVSKFSGNGAGILAAASTVVSTFVLVFVAEWGDKSFFSTI
        LPVDDIAAVCLLVYFGVSTLLDASSSDGLKAEDEQKEAEIAVSKFSGNGAGILAAASTVVSTFVLVFVAEWGDKSFFSTI
Subjt:  LPVDDIAAVCLLVYFGVSTLLDASSSDGLKAEDEQKEAEIAVSKFSGNGAGILAAASTVVSTFVLVFVAEWGDKSFFSTI

SwissProt top hitse value%identityAlignment
B8AAM2 GDT1-like protein 1, chloroplastic1.2e-6771.57Show/hide
Query:  SSSFLKFVLLSGFFIFQDSQQALAGSDIATGLQSVPLLGDLGDISTGFASAFLLIFFSELGDKTFFIAALLAARNSAAIVFTGTFGALAAMTIISVVLGR
        SS  L     +G  + Q SQQALAG++   G+Q V  +GDLGDISTGFASAFLLIFFSELGD+TFFIAALLAARNS AI+F GTFGALA MTIISVVLGR
Subjt:  SSSFLKFVLLSGFFIFQDSQQALAGSDIATGLQSVPLLGDLGDISTGFASAFLLIFFSELGDKTFFIAALLAARNSAAIVFTGTFGALAAMTIISVVLGR

Query:  TFHYVDEILPFRLGDSDLPVDDIAAVCLLVYFGVSTLLDASSSDGLKAEDEQKEAEIAVSKFSGNGAGILAAASTVVSTFVLVFVAEWGDKSFFSTI
         FHYVD I+PF  G +D PVDD  A CLLVY+GV+TLLDA+S D  K  +EQ+EAE+AVSKF GNGAGI++AAST+ STFVLVF+AEWGDKSFFSTI
Subjt:  TFHYVDEILPFRLGDSDLPVDDIAAVCLLVYFGVSTLLDASSSDGLKAEDEQKEAEIAVSKFSGNGAGILAAASTVVSTFVLVFVAEWGDKSFFSTI

Q2R2Z4 GDT1-like protein 2, chloroplastic3.8e-1835.61Show/hide
Query:  TISSSFLKFVLLSGFFIFQDSQQALAGSDIATGLQSVPLLGDLGDISTGFASAFLLIFFSELGDKTFFIAALLAARNSAAIVFTGTFGALAAMTIISVVL
        +I++  L   L S F +F   Q +   + +A                +GF +AF LIF SE+GDKTFFIAALLA +   A+V  G+  AL+ MTI+SV++
Subjt:  TISSSFLKFVLLSGFFIFQDSQQALAGSDIATGLQSVPLLGDLGDISTGFASAFLLIFFSELGDKTFFIAALLAARNSAAIVFTGTFGALAAMTIISVVL

Query:  GRTFHYVDEILPFRLGDSDLPVDDIAAVCLLVYFGVSTLLDA-----SSSDGLKAEDEQKEAEIAVSKFSGNGAGILAAASTVV-STFVLVFVAEWGDKS
        GR F  V    P +   + LP+ + AA+ LL +FG  ++ DA     +++  L+   E  E   A        A  L +   V+  +F LVF AEWGD+S
Subjt:  GRTFHYVDEILPFRLGDSDLPVDDIAAVCLLVYFGVSTLLDA-----SSSDGLKAEDEQKEAEIAVSKFSGNGAGILAAASTVV-STFVLVFVAEWGDKS

Query:  FFSTI
          +TI
Subjt:  FFSTI

Q5NAY7 GDT1-like protein 1, chloroplastic1.5e-6771.07Show/hide
Query:  SSSFLKFVLLSGFFIFQDSQQALAGSDIATGLQSVPLLGDLGDISTGFASAFLLIFFSELGDKTFFIAALLAARNSAAIVFTGTFGALAAMTIISVVLGR
        SS  L     +G  + Q SQQALAG++   G+Q V  +GDLGDISTGFASAFLLIFFSELGD+TFFIAALLAARNS AI+F GTFGALA MTIISVVLGR
Subjt:  SSSFLKFVLLSGFFIFQDSQQALAGSDIATGLQSVPLLGDLGDISTGFASAFLLIFFSELGDKTFFIAALLAARNSAAIVFTGTFGALAAMTIISVVLGR

Query:  TFHYVDEILPFRLGDSDLPVDDIAAVCLLVYFGVSTLLDASSSDGLKAEDEQKEAEIAVSKFSGNGAGILAAASTVVSTFVLVFVAEWGDKSFFSTI
         FHYVD I+PF  G +D PVDD  A CLLVY+G++TLLDA+S D  K  +EQ+EAE+AVSKF GNGAGI++AAST+ STFVLVF+AEWGDKSFFSTI
Subjt:  TFHYVDEILPFRLGDSDLPVDDIAAVCLLVYFGVSTLLDASSSDGLKAEDEQKEAEIAVSKFSGNGAGILAAASTVVSTFVLVFVAEWGDKSFFSTI

Q94AX5 Protein PAM71, chloroplastic1.3e-6969.55Show/hide
Query:  AREIHENTDNLMSSSTISS-----SFLKFVLLSGFFIFQDSQQALAGSDIATGLQS-VPLLGDLGDISTGFASAFLLIFFSELGDKTFFIAALLAARNSA
        + E   N D L+ SS   S       L F+ +SG      +  A A S I    QS V   GDLGDIS+GFASAFLLIFFSELGDKTFFIAALLAARNSA
Subjt:  AREIHENTDNLMSSSTISS-----SFLKFVLLSGFFIFQDSQQALAGSDIATGLQS-VPLLGDLGDISTGFASAFLLIFFSELGDKTFFIAALLAARNSA

Query:  AIVFTGTFGALAAMTIISVVLGRTFHYVDEILPFRLGDSDLPVDDIAAVCLLVYFGVSTLLDASSSDGLKAEDEQKEAEIAVSKFSGNGAGILAAASTVV
        A VF GTFGAL  MTIISVVLGRTFHYVDE+LPFR G +DLP+DDIAAVCLLVYFGVSTLLDA S +G KA++EQKEAE+AVS+ SGNGAGI+AAA+T++
Subjt:  AIVFTGTFGALAAMTIISVVLGRTFHYVDEILPFRLGDSDLPVDDIAAVCLLVYFGVSTLLDASSSDGLKAEDEQKEAEIAVSKFSGNGAGILAAASTVV

Query:  STFVLVFVAEWGDKSFFSTI
        STF LVFVAEWGDKSFFSTI
Subjt:  STFVLVFVAEWGDKSFFSTI

Q9T0H9 Protein PAM71-homolog, chloroplastic7.2e-1732.52Show/hide
Query:  SSSGKSLAKYNSAREIHENTDNLMSSSTISSSFLK------------FVLLSGFFIFQDSQQALAGSDIATGLQSVPLLGDLGDISTGFASAFLLIFFSE
        S +G     Y+   E    + +L  S   SS  LK             VLLS   +F           + T ++  P         +GF +AF LIF SE
Subjt:  SSSGKSLAKYNSAREIHENTDNLMSSSTISSSFLK------------FVLLSGFFIFQDSQQALAGSDIATGLQSVPLLGDLGDISTGFASAFLLIFFSE

Query:  LGDKTFFIAALLAARNSAAIVFTGTFGALAAMTIISVVLGRTFHYVDEILPFRLGDSDLPVDDIAAVCLLVYFGVSTLLDASSSDGLKAEDEQKEAEIAV
        +GDKTFFIAALLA +    +V  G+ GAL+ MTI+SVV+G+ F  V    P +   + LP+ + AA+ LL++FG+ ++ DA     ++A++ + E  I +
Subjt:  LGDKTFFIAALLAARNSAAIVFTGTFGALAAMTIISVVLGRTFHYVDEILPFRLGDSDLPVDDIAAVCLLVYFGVSTLLDASSSDGLKAEDEQKEAEIAV

Query:  SKFSGNGAGILAAASTVVS--------TFVLVFVAEWGDKSFFSTI
         ++S     +   AS  ++        +F LVF AEWGD+S  +T+
Subjt:  SKFSGNGAGILAAASTVVS--------TFVLVFVAEWGDKSFFSTI

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G64150.1 Uncharacterized protein family (UPF0016)8.9e-7169.55Show/hide
Query:  AREIHENTDNLMSSSTISS-----SFLKFVLLSGFFIFQDSQQALAGSDIATGLQS-VPLLGDLGDISTGFASAFLLIFFSELGDKTFFIAALLAARNSA
        + E   N D L+ SS   S       L F+ +SG      +  A A S I    QS V   GDLGDIS+GFASAFLLIFFSELGDKTFFIAALLAARNSA
Subjt:  AREIHENTDNLMSSSTISS-----SFLKFVLLSGFFIFQDSQQALAGSDIATGLQS-VPLLGDLGDISTGFASAFLLIFFSELGDKTFFIAALLAARNSA

Query:  AIVFTGTFGALAAMTIISVVLGRTFHYVDEILPFRLGDSDLPVDDIAAVCLLVYFGVSTLLDASSSDGLKAEDEQKEAEIAVSKFSGNGAGILAAASTVV
        A VF GTFGAL  MTIISVVLGRTFHYVDE+LPFR G +DLP+DDIAAVCLLVYFGVSTLLDA S +G KA++EQKEAE+AVS+ SGNGAGI+AAA+T++
Subjt:  AIVFTGTFGALAAMTIISVVLGRTFHYVDEILPFRLGDSDLPVDDIAAVCLLVYFGVSTLLDASSSDGLKAEDEQKEAEIAVSKFSGNGAGILAAASTVV

Query:  STFVLVFVAEWGDKSFFSTI
        STF LVFVAEWGDKSFFSTI
Subjt:  STFVLVFVAEWGDKSFFSTI

AT4G13590.1 Uncharacterized protein family (UPF0016)5.1e-1832.52Show/hide
Query:  SSSGKSLAKYNSAREIHENTDNLMSSSTISSSFLK------------FVLLSGFFIFQDSQQALAGSDIATGLQSVPLLGDLGDISTGFASAFLLIFFSE
        S +G     Y+   E    + +L  S   SS  LK             VLLS   +F           + T ++  P         +GF +AF LIF SE
Subjt:  SSSGKSLAKYNSAREIHENTDNLMSSSTISSSFLK------------FVLLSGFFIFQDSQQALAGSDIATGLQSVPLLGDLGDISTGFASAFLLIFFSE

Query:  LGDKTFFIAALLAARNSAAIVFTGTFGALAAMTIISVVLGRTFHYVDEILPFRLGDSDLPVDDIAAVCLLVYFGVSTLLDASSSDGLKAEDEQKEAEIAV
        +GDKTFFIAALLA +    +V  G+ GAL+ MTI+SVV+G+ F  V    P +   + LP+ + AA+ LL++FG+ ++ DA     ++A++ + E  I +
Subjt:  LGDKTFFIAALLAARNSAAIVFTGTFGALAAMTIISVVLGRTFHYVDEILPFRLGDSDLPVDDIAAVCLLVYFGVSTLLDASSSDGLKAEDEQKEAEIAV

Query:  SKFSGNGAGILAAASTVVS--------TFVLVFVAEWGDKSFFSTI
         ++S     +   AS  ++        +F LVF AEWGD+S  +T+
Subjt:  SKFSGNGAGILAAASTVVS--------TFVLVFVAEWGDKSFFSTI

AT4G13590.2 Uncharacterized protein family (UPF0016)5.1e-1832.52Show/hide
Query:  SSSGKSLAKYNSAREIHENTDNLMSSSTISSSFLK------------FVLLSGFFIFQDSQQALAGSDIATGLQSVPLLGDLGDISTGFASAFLLIFFSE
        S +G     Y+   E    + +L  S   SS  LK             VLLS   +F           + T ++  P         +GF +AF LIF SE
Subjt:  SSSGKSLAKYNSAREIHENTDNLMSSSTISSSFLK------------FVLLSGFFIFQDSQQALAGSDIATGLQSVPLLGDLGDISTGFASAFLLIFFSE

Query:  LGDKTFFIAALLAARNSAAIVFTGTFGALAAMTIISVVLGRTFHYVDEILPFRLGDSDLPVDDIAAVCLLVYFGVSTLLDASSSDGLKAEDEQKEAEIAV
        +GDKTFFIAALLA +    +V  G+ GAL+ MTI+SVV+G+ F  V    P +   + LP+ + AA+ LL++FG+ ++ DA     ++A++ + E  I +
Subjt:  LGDKTFFIAALLAARNSAAIVFTGTFGALAAMTIISVVLGRTFHYVDEILPFRLGDSDLPVDDIAAVCLLVYFGVSTLLDASSSDGLKAEDEQKEAEIAV

Query:  SKFSGNGAGILAAASTVVS--------TFVLVFVAEWGDKSFFSTI
         ++S     +   AS  ++        +F LVF AEWGD+S  +T+
Subjt:  SKFSGNGAGILAAASTVVS--------TFVLVFVAEWGDKSFFSTI

AT5G36290.1 Uncharacterized protein family (UPF0016)1.0e-1033.77Show/hide
Query:  SAFLLIFFSELGDKTFFIAALLAARNSAAIVFTGTFGALAAMTIISVVLGRTFHYVDEILPFRLGDSDLPVDDIAAVCLLVYFGVSTLLDASSSDGLKAE
        S+F +I  +E+GD+TF IAAL+A R+  A V +G   AL  MTI+S  LGR       I+P  +        + AA  L  +FG+  L  A  S   K+ 
Subjt:  SAFLLIFFSELGDKTFFIAALLAARNSAAIVFTGTFGALAAMTIISVVLGRTFHYVDEILPFRLGDSDLPVDDIAAVCLLVYFGVSTLLDASSSDGLKAE

Query:  DEQKEAEIAVSKFSGNGAGILA------AASTVVSTFVLVFVAEWGDKSFFSTI
         +++  E+     SG G                + +F+L F+AEWGD+S  +TI
Subjt:  DEQKEAEIAVSKFSGNGAGILA------AASTVVSTFVLVFVAEWGDKSFFSTI

AT5G36290.2 Uncharacterized protein family (UPF0016)1.0e-1033.77Show/hide
Query:  SAFLLIFFSELGDKTFFIAALLAARNSAAIVFTGTFGALAAMTIISVVLGRTFHYVDEILPFRLGDSDLPVDDIAAVCLLVYFGVSTLLDASSSDGLKAE
        S+F +I  +E+GD+TF IAAL+A R+  A V +G   AL  MTI+S  LGR       I+P  +        + AA  L  +FG+  L  A  S   K+ 
Subjt:  SAFLLIFFSELGDKTFFIAALLAARNSAAIVFTGTFGALAAMTIISVVLGRTFHYVDEILPFRLGDSDLPVDDIAAVCLLVYFGVSTLLDASSSDGLKAE

Query:  DEQKEAEIAVSKFSGNGAGILA------AASTVVSTFVLVFVAEWGDKSFFSTI
         +++  E+     SG G                + +F+L F+AEWGD+S  +TI
Subjt:  DEQKEAEIAVSKFSGNGAGILA------AASTVVSTFVLVFVAEWGDKSFFSTI


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
TTATATAGTTTTTCAAGTCGGTGCTCGGCAAGCACTCGCAGAGAGCGGCATTGGCACAAACCGGAAGTGGTTTCGAAATATCATGATCGCCAAGAACTTTGTCATCGTAA
CTACAGTAGCTGTGACTTATCTGCAAAATCAGCAACTGTTATAGATAATTGTTCTTCATCTGGGAAATCACTAGCAAAGTATAACTCAGCAAGGGAAATTCATGAGAATA
CAGATAACCTAATGTCTAGCAGTACAATCAGTAGTTCATTTCTGAAATTTGTGCTCCTGTCTGGGTTCTTCATATTTCAAGACTCTCAGCAGGCATTAGCCGGTTCAGAT
ATTGCTACTGGGTTGCAGTCAGTCCCTCTTCTTGGAGACCTTGGTGATATTAGCACAGGTTTTGCTTCAGCATTTTTACTTATCTTTTTCTCAGAACTAGGGGACAAGAC
CTTTTTCATTGCAGCTCTTCTAGCAGCTAGGAACTCTGCTGCTATTGTTTTTACTGGAACTTTTGGTGCACTTGCGGCAATGACCATCATATCTGTTGTTCTGGGACGAA
CTTTTCACTACGTTGATGAGATTCTTCCATTCAGGCTTGGTGACAGTGATTTGCCAGTTGATGATATTGCAGCTGTCTGTCTTTTGGTGTATTTTGGGGTTTCAACATTG
CTTGATGCCAGTTCAAGCGATGGACTAAAGGCAGAAGATGAGCAGAAGGAGGCAGAGATAGCTGTCTCAAAATTCTCAGGAAATGGTGCTGGGATATTGGCTGCTGCCAG
TACTGTCGTCAGCACCTTTGTTTTAGTGTTTGTGGCAGAGTGGGGCGACAAGTCATTTTTCTCTACAATT
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
TTATATAGTTTTTCAAGTCGGTGCTCGGCAAGCACTCGCAGAGAGCGGCATTGGCACAAACCGGAAGTGGTTTCGAAATATCATGATCGCCAAGAACTTTGTCATCGTAA
CTACAGTAGCTGTGACTTATCTGCAAAATCAGCAACTGTTATAGATAATTGTTCTTCATCTGGGAAATCACTAGCAAAGTATAACTCAGCAAGGGAAATTCATGAGAATA
CAGATAACCTAATGTCTAGCAGTACAATCAGTAGTTCATTTCTGAAATTTGTGCTCCTGTCTGGGTTCTTCATATTTCAAGACTCTCAGCAGGCATTAGCCGGTTCAGAT
ATTGCTACTGGGTTGCAGTCAGTCCCTCTTCTTGGAGACCTTGGTGATATTAGCACAGGTTTTGCTTCAGCATTTTTACTTATCTTTTTCTCAGAACTAGGGGACAAGAC
CTTTTTCATTGCAGCTCTTCTAGCAGCTAGGAACTCTGCTGCTATTGTTTTTACTGGAACTTTTGGTGCACTTGCGGCAATGACCATCATATCTGTTGTTCTGGGACGAA
CTTTTCACTACGTTGATGAGATTCTTCCATTCAGGCTTGGTGACAGTGATTTGCCAGTTGATGATATTGCAGCTGTCTGTCTTTTGGTGTATTTTGGGGTTTCAACATTG
CTTGATGCCAGTTCAAGCGATGGACTAAAGGCAGAAGATGAGCAGAAGGAGGCAGAGATAGCTGTCTCAAAATTCTCAGGAAATGGTGCTGGGATATTGGCTGCTGCCAG
TACTGTCGTCAGCACCTTTGTTTTAGTGTTTGTGGCAGAGTGGGGCGACAAGTCATTTTTCTCTACAATT
Protein sequenceShow/hide protein sequence
LYSFSSRCSASTRRERHWHKPEVVSKYHDRQELCHRNYSSCDLSAKSATVIDNCSSSGKSLAKYNSAREIHENTDNLMSSSTISSSFLKFVLLSGFFIFQDSQQALAGSD
IATGLQSVPLLGDLGDISTGFASAFLLIFFSELGDKTFFIAALLAARNSAAIVFTGTFGALAAMTIISVVLGRTFHYVDEILPFRLGDSDLPVDDIAAVCLLVYFGVSTL
LDASSSDGLKAEDEQKEAEIAVSKFSGNGAGILAAASTVVSTFVLVFVAEWGDKSFFSTI