; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

MS006372 (gene) of Bitter gourd (TR) v1 genome

Gene IDMS006372
OrganismMomordica charantia cv. TR (Bitter gourd (TR) v1)
DescriptionGDSL esterase/lipase
Genome locationscaffold327:179954..182828
RNA-Seq ExpressionMS006372
SyntenyMS006372
Gene Ontology termsGO:0016788 - hydrolase activity, acting on ester bonds (molecular function)
InterPro domainsIPR001087 - GDSL lipase/esterase
IPR035669 - GDSL lipase/esterase-like, plant
IPR036514 - SGNH hydrolase superfamily


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG6589280.1 GDSL esterase/lipase, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]5.2e-16585.54Show/hide
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A0A0A0KGK8 Uncharacterized protein2.9e-16183.64Show/hide
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A0A6J1JJ45 GDSL esterase/lipase At2g42990-like1.6e-16485.54Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
Q67ZI9 GDSL esterase/lipase At2g429906.9e-12862.65Show/hide
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        AFHPT++TNQI+ +   + L  +F
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Q8VY93 GDSL esterase/lipase At4g267901.9e-12260.49Show/hide
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        FHPT+KTN I+ N +L+  L  F+
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Q9C653 GDSL esterase/lipase At1g585251.1e-7743.12Show/hide
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        I +W ++ +FK+Y +K++ + G EKA +++  + +LV   +ND    Y     R   +    Y +FL + A +F+ EL+ LGARKI      P+GC+PL+
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Query:  RATNVMGNF---GCVEKYNAVALEFNRKLEGFVGALNRQLPGLTMLFANPFPIFYQIISQPYLYGFEVAGKACCATGTFEMSYLCNQENPFTCMDANKYV
        R   V G F   GC E  N +A +FN +L   + +L+++L G+ +L+ N +   + +I  P  YGF+VA K CC  G   +SYLCN  NPFTC +++ Y+
Subjt:  RATNVMGNF---GCVEKYNAVALEFNRKLEGFVGALNRQLPGLTMLFANPFPIFYQIISQPYLYGFEVAGKACCATGTFEMSYLCNQENPFTCMDANKYV

Query:  FWDAFHPTQKTNQIIVNDLL
        FWD++HP+++  Q+IV++LL
Subjt:  FWDAFHPTQKTNQIIVNDLL

Q9FHW9 GDSL esterase/lipase At5g421706.5e-7844.16Show/hide
Query:  VPAIIVFGDSSVDSGNNNVVKTVLKSNFRPYGRDFVGGQATGRFSNGRVPPDFISEAFGLKSTIPAYLDPGYTIADFATGVCFASAGTGFDNSTSDVLNV
        +P II FGDS VDSGNNN ++T LK NF PYG+DF G  ATGRFS+GRVP D ++E  G+  TIPAYL+P     D   GV FAS G+G+D  T+ ++ V
Subjt:  VPAIIVFGDSSVDSGNNNVVKTVLKSNFRPYGRDFVGGQATGRFSNGRVPPDFISEAFGLKSTIPAYLDPGYTIADFATGVCFASAGTGFDNSTSDVLNV

Query:  IPLWREVEFFKDYQNKLRAYMGNEKANEVIREALYLVSLGTNDFLENYYTIPRRRLQFTIQQYEDFLLELAGNFIGELYGLGARKISFTGLPPMGCLPLE
        + L  +++ F++Y+NKL+  +G EKAN +++ +LYLV   +ND    Y     R +++    Y D+L + A  F+  LYGLGAR+I      P+GC+P  
Subjt:  IPLWREVEFFKDYQNKLRAYMGNEKANEVIREALYLVSLGTNDFLENYYTIPRRRLQFTIQQYEDFLLELAGNFIGELYGLGARKISFTGLPPMGCLPLE

Query:  RATNVMGNFGCVEKYNAVALEFNRKLEGFVGALNRQLPGLTMLFANPFPIFYQIISQPYLYGFEVAGKACCATGTFEMSYLCNQENPFTCMDANKYVFWD
        R         C EK N VA  FN K+   + AL ++LP   ++  +       +I  P  YGFEV+ + CC TG  E+ +LCN+ NPFTC +++ Y+FWD
Subjt:  RATNVMGNFGCVEKYNAVALEFNRKLEGFVGALNRQLPGLTMLFANPFPIFYQIISQPYLYGFEVAGKACCATGTFEMSYLCNQENPFTCMDANKYVFWD

Query:  AFHPTQKTNQIIVNDLL
        ++HPT+K  QIIV+ LL
Subjt:  AFHPTQKTNQIIVNDLL

Q9SJB4 GDSL esterase/lipase At2g045706.2e-12159.88Show/hide
Query:  VPAIIVFGDSSVDSGNNNVVKTVLKSNFRPYGRDFVGGQATGRFSNGRVPPDFISEAFGLKSTIPAYLDPGYTIADFATGVCFASAGTGFDNSTSDVLNV
        +PAIIVFGDSSVD+GNNN + TV +SNF PYGRDFVGG+ TGRF NG++  DF+SEA GLK  IPAYLDP Y I+DFATGV FASA TG+DN+TSDVL+V
Subjt:  VPAIIVFGDSSVDSGNNNVVKTVLKSNFRPYGRDFVGGQATGRFSNGRVPPDFISEAFGLKSTIPAYLDPGYTIADFATGVCFASAGTGFDNSTSDVLNV

Query:  IPLWREVEFFKDYQNKLRAYMGNEKANEVIREALYLVSLGTNDFLENYYTIPRRRLQFTIQQYEDFLLELAGNFIGELYGLGARKISFTGLPPMGCLPLE
        +PLW+++E++K+YQ KL+AY G ++  E I  +LYL+S+GTNDFLENY+  P R  Q+++  Y+DFL  +A  F+ +L+GLGARKIS  GLPPMGC+PLE
Subjt:  IPLWREVEFFKDYQNKLRAYMGNEKANEVIREALYLVSLGTNDFLENYYTIPRRRLQFTIQQYEDFLLELAGNFIGELYGLGARKISFTGLPPMGCLPLE

Query:  RATNVMGNFGCVEKYNAVALEFNRKLEGFVGALNRQLPGLTMLFANPFPIFYQIISQPYLYGFEVAGKACCATGTFEMSYLCNQENPFTCMDANKYVFWD
        RATN+     CV +YN +A++FN KL+  V  L+++LPG  ++F+NP+  F +II  P  +GFEV G ACCATG FEM Y C + NPFTC +A+KYVFWD
Subjt:  RATNVMGNFGCVEKYNAVALEFNRKLEGFVGALNRQLPGLTMLFANPFPIFYQIISQPYLYGFEVAGKACCATGTFEMSYLCNQENPFTCMDANKYVFWD

Query:  AFHPTQKTNQIIVNDLLRILLPMF
        +FHPTQKTN I+ N L+    P F
Subjt:  AFHPTQKTNQIIVNDLLRILLPMF

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT2G04570.1 GDSL-like Lipase/Acylhydrolase superfamily protein4.4e-12259.88Show/hide
Query:  VPAIIVFGDSSVDSGNNNVVKTVLKSNFRPYGRDFVGGQATGRFSNGRVPPDFISEAFGLKSTIPAYLDPGYTIADFATGVCFASAGTGFDNSTSDVLNV
        +PAIIVFGDSSVD+GNNN + TV +SNF PYGRDFVGG+ TGRF NG++  DF+SEA GLK  IPAYLDP Y I+DFATGV FASA TG+DN+TSDVL+V
Subjt:  VPAIIVFGDSSVDSGNNNVVKTVLKSNFRPYGRDFVGGQATGRFSNGRVPPDFISEAFGLKSTIPAYLDPGYTIADFATGVCFASAGTGFDNSTSDVLNV

Query:  IPLWREVEFFKDYQNKLRAYMGNEKANEVIREALYLVSLGTNDFLENYYTIPRRRLQFTIQQYEDFLLELAGNFIGELYGLGARKISFTGLPPMGCLPLE
        +PLW+++E++K+YQ KL+AY G ++  E I  +LYL+S+GTNDFLENY+  P R  Q+++  Y+DFL  +A  F+ +L+GLGARKIS  GLPPMGC+PLE
Subjt:  IPLWREVEFFKDYQNKLRAYMGNEKANEVIREALYLVSLGTNDFLENYYTIPRRRLQFTIQQYEDFLLELAGNFIGELYGLGARKISFTGLPPMGCLPLE

Query:  RATNVMGNFGCVEKYNAVALEFNRKLEGFVGALNRQLPGLTMLFANPFPIFYQIISQPYLYGFEVAGKACCATGTFEMSYLCNQENPFTCMDANKYVFWD
        RATN+     CV +YN +A++FN KL+  V  L+++LPG  ++F+NP+  F +II  P  +GFEV G ACCATG FEM Y C + NPFTC +A+KYVFWD
Subjt:  RATNVMGNFGCVEKYNAVALEFNRKLEGFVGALNRQLPGLTMLFANPFPIFYQIISQPYLYGFEVAGKACCATGTFEMSYLCNQENPFTCMDANKYVFWD

Query:  AFHPTQKTNQIIVNDLLRILLPMF
        +FHPTQKTN I+ N L+    P F
Subjt:  AFHPTQKTNQIIVNDLLRILLPMF

AT2G42990.1 GDSL-like Lipase/Acylhydrolase superfamily protein4.9e-12962.65Show/hide
Query:  VPAIIVFGDSSVDSGNNNVVKTVLKSNFRPYGRDFVGGQATGRFSNGRVPPDFISEAFGLKSTIPAYLDPGYTIADFATGVCFASAGTGFDNSTSDVLNV
        +PAIIVFGDSSVDSGNNN + T+ ++NF PYGRDF GG+ATGRF NGR+  DF SEA+GLK T+PAYLDP Y I+DFATGVCFASAGTG+DNST+DVL V
Subjt:  VPAIIVFGDSSVDSGNNNVVKTVLKSNFRPYGRDFVGGQATGRFSNGRVPPDFISEAFGLKSTIPAYLDPGYTIADFATGVCFASAGTGFDNSTSDVLNV

Query:  IPLWREVEFFKDYQNKLRAYMGNEKANEVIREALYLVSLGTNDFLENYYTIPRRRLQFTIQQYEDFLLELAGNFIGELYGLGARKISFTGLPPMGCLPLE
        IPLW+EVE+FK+YQ+ L AY+G+ +A ++IRE+LY+VS+GTNDFLENYYT+P RR QF+I QY+DFL+E+A  F+ ++Y LGARK+SFTG+ PMGCLPLE
Subjt:  IPLWREVEFFKDYQNKLRAYMGNEKANEVIREALYLVSLGTNDFLENYYTIPRRRLQFTIQQYEDFLLELAGNFIGELYGLGARKISFTGLPPMGCLPLE

Query:  RATNVMGNFGCVEKYNAVALEFNRKLEGFVGALNRQLPGLTMLFANPFPIFYQIISQPYLYGFEVAGKACCATGTFEMSYLCNQENPFTCMDANKYVFWD
        R TN+   F C   YN +A++FN +L   V  LNR+L G+ + FANP+ I + I+++P LYG E++  ACC TG FEM +LC Q+NP TC DANK+VFWD
Subjt:  RATNVMGNFGCVEKYNAVALEFNRKLEGFVGALNRQLPGLTMLFANPFPIFYQIISQPYLYGFEVAGKACCATGTFEMSYLCNQENPFTCMDANKYVFWD

Query:  AFHPTQKTNQIIVNDLLRILLPMF
        AFHPT++TNQI+ +   + L  +F
Subjt:  AFHPTQKTNQIIVNDLLRILLPMF

AT4G26790.1 GDSL-like Lipase/Acylhydrolase superfamily protein1.4e-12360.49Show/hide
Query:  PAIIVFGDSSVDSGNNNVVKTVLKSNFRPYGRDFVGGQATGRFSNGRVPPDFISEAFGLKSTIPAYLDPGYTIADFATGVCFASAGTGFDNSTSDVLNVI
        PA+IVFGDS+VDSGNNN + TVLKSNF+PYGRD+  G+ATGRFSNGR+ PDFISE  GLK+ +PAYLDP Y IADFATGVCFASAGTG DN+TS VL+V+
Subjt:  PAIIVFGDSSVDSGNNNVVKTVLKSNFRPYGRDFVGGQATGRFSNGRVPPDFISEAFGLKSTIPAYLDPGYTIADFATGVCFASAGTGFDNSTSDVLNVI

Query:  PLWREVEFFKDYQNKLRAYMGNEKANEVIREALYLVSLGTNDFLENYYTIPRRRLQFTIQQYEDFLLELAGNFIGELYGLGARKISFTGLPPMGCLPLER
        PLW+EVE++K+YQ +LR+Y+G EKANE+I E+LYL+S+GTNDFLENYY +PR+  ++++ +Y+ FL+ +A +F+ ++Y LGARK+S +GL P GCLPLER
Subjt:  PLWREVEFFKDYQNKLRAYMGNEKANEVIREALYLVSLGTNDFLENYYTIPRRRLQFTIQQYEDFLLELAGNFIGELYGLGARKISFTGLPPMGCLPLER

Query:  ATNVMGNFGCVEKYNAVALEFNRKLEGFVGALNRQLPGLTMLFANPFPIFYQIISQPYLYGFEVAGKACCATGTFEMSYLCNQENPFTCMDANKYVFWDA
         T +     C+E+YN VA +FN K+E  V  LNR L G+ ++F+NP+ +  +II  P  +GFE    ACC TG +EMSYLC++ NPFTC DA+KYVFWD+
Subjt:  ATNVMGNFGCVEKYNAVALEFNRKLEGFVGALNRQLPGLTMLFANPFPIFYQIISQPYLYGFEVAGKACCATGTFEMSYLCNQENPFTCMDANKYVFWDA

Query:  FHPTQKTNQIIVNDLLRILLPMFR
        FHPT+KTN I+ N +L+  L  F+
Subjt:  FHPTQKTNQIIVNDLLRILLPMFR

AT4G26790.2 GDSL-like Lipase/Acylhydrolase superfamily protein1.4e-12360.49Show/hide
Query:  PAIIVFGDSSVDSGNNNVVKTVLKSNFRPYGRDFVGGQATGRFSNGRVPPDFISEAFGLKSTIPAYLDPGYTIADFATGVCFASAGTGFDNSTSDVLNVI
        PA+IVFGDS+VDSGNNN + TVLKSNF+PYGRD+  G+ATGRFSNGR+ PDFISE  GLK+ +PAYLDP Y IADFATGVCFASAGTG DN+TS VL+V+
Subjt:  PAIIVFGDSSVDSGNNNVVKTVLKSNFRPYGRDFVGGQATGRFSNGRVPPDFISEAFGLKSTIPAYLDPGYTIADFATGVCFASAGTGFDNSTSDVLNVI

Query:  PLWREVEFFKDYQNKLRAYMGNEKANEVIREALYLVSLGTNDFLENYYTIPRRRLQFTIQQYEDFLLELAGNFIGELYGLGARKISFTGLPPMGCLPLER
        PLW+EVE++K+YQ +LR+Y+G EKANE+I E+LYL+S+GTNDFLENYY +PR+  ++++ +Y+ FL+ +A +F+ ++Y LGARK+S +GL P GCLPLER
Subjt:  PLWREVEFFKDYQNKLRAYMGNEKANEVIREALYLVSLGTNDFLENYYTIPRRRLQFTIQQYEDFLLELAGNFIGELYGLGARKISFTGLPPMGCLPLER

Query:  ATNVMGNFGCVEKYNAVALEFNRKLEGFVGALNRQLPGLTMLFANPFPIFYQIISQPYLYGFEVAGKACCATGTFEMSYLCNQENPFTCMDANKYVFWDA
         T +     C+E+YN VA +FN K+E  V  LNR L G+ ++F+NP+ +  +II  P  +GFE    ACC TG +EMSYLC++ NPFTC DA+KYVFWD+
Subjt:  ATNVMGNFGCVEKYNAVALEFNRKLEGFVGALNRQLPGLTMLFANPFPIFYQIISQPYLYGFEVAGKACCATGTFEMSYLCNQENPFTCMDANKYVFWDA

Query:  FHPTQKTNQIIVNDLLRILLPMFR
        FHPT+KTN I+ N +L+  L  F+
Subjt:  FHPTQKTNQIIVNDLLRILLPMFR

AT5G42170.1 SGNH hydrolase-type esterase superfamily protein4.6e-7944.16Show/hide
Query:  VPAIIVFGDSSVDSGNNNVVKTVLKSNFRPYGRDFVGGQATGRFSNGRVPPDFISEAFGLKSTIPAYLDPGYTIADFATGVCFASAGTGFDNSTSDVLNV
        +P II FGDS VDSGNNN ++T LK NF PYG+DF G  ATGRFS+GRVP D ++E  G+  TIPAYL+P     D   GV FAS G+G+D  T+ ++ V
Subjt:  VPAIIVFGDSSVDSGNNNVVKTVLKSNFRPYGRDFVGGQATGRFSNGRVPPDFISEAFGLKSTIPAYLDPGYTIADFATGVCFASAGTGFDNSTSDVLNV

Query:  IPLWREVEFFKDYQNKLRAYMGNEKANEVIREALYLVSLGTNDFLENYYTIPRRRLQFTIQQYEDFLLELAGNFIGELYGLGARKISFTGLPPMGCLPLE
        + L  +++ F++Y+NKL+  +G EKAN +++ +LYLV   +ND    Y     R +++    Y D+L + A  F+  LYGLGAR+I      P+GC+P  
Subjt:  IPLWREVEFFKDYQNKLRAYMGNEKANEVIREALYLVSLGTNDFLENYYTIPRRRLQFTIQQYEDFLLELAGNFIGELYGLGARKISFTGLPPMGCLPLE

Query:  RATNVMGNFGCVEKYNAVALEFNRKLEGFVGALNRQLPGLTMLFANPFPIFYQIISQPYLYGFEVAGKACCATGTFEMSYLCNQENPFTCMDANKYVFWD
        R         C EK N VA  FN K+   + AL ++LP   ++  +       +I  P  YGFEV+ + CC TG  E+ +LCN+ NPFTC +++ Y+FWD
Subjt:  RATNVMGNFGCVEKYNAVALEFNRKLEGFVGALNRQLPGLTMLFANPFPIFYQIISQPYLYGFEVAGKACCATGTFEMSYLCNQENPFTCMDANKYVFWD

Query:  AFHPTQKTNQIIVNDLL
        ++HPT+K  QIIV+ LL
Subjt:  AFHPTQKTNQIIVNDLL


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
GTTCCGGCCATTATTGTGTTTGGAGACTCCTCTGTGGATTCCGGCAATAACAATGTGGTTAAGACGGTGTTGAAAAGCAATTTCAGGCCTTATGGCCGGGACTTCGTCGG
TGGTCAGGCCACCGGAAGGTTCTCCAACGGCCGCGTTCCGCCGGACTTTATTTCTGAAGCTTTTGGTCTAAAATCAACCATACCGGCTTACTTGGACCCCGGTTATACCA
TTGCCGACTTCGCCACCGGAGTTTGCTTCGCCTCTGCCGGAACTGGCTTCGACAACTCCACTTCCGATGTTTTAAATGTGATACCTCTATGGAGGGAAGTGGAGTTTTTC
AAGGACTATCAAAACAAGCTAAGAGCCTATATGGGCAATGAGAAAGCAAATGAAGTGATAAGAGAAGCTCTATATTTGGTAAGTTTAGGAACAAACGACTTCTTGGAAAA
TTACTACACAATTCCTCGGCGGAGACTCCAATTTACGATCCAACAGTACGAGGATTTCCTGCTCGAACTGGCCGGGAACTTCATCGGAGAACTTTACGGGCTCGGCGCGA
GAAAAATATCGTTTACCGGGCTTCCTCCGATGGGGTGTTTGCCGCTGGAGAGAGCAACCAATGTCATGGGAAATTTTGGGTGCGTAGAGAAATACAACGCTGTGGCTTTG
GAATTCAATAGGAAGTTGGAGGGATTCGTGGGGGCATTGAATAGGCAGCTCCCAGGCCTTACAATGCTCTTTGCAAATCCTTTTCCCATTTTTTATCAGATCATCAGCCA
GCCTTACTTATACGGATTTGAAGTGGCTGGAAAGGCATGCTGTGCAACTGGGACATTTGAGATGAGCTATCTGTGCAACCAAGAAAACCCATTTACTTGCATGGACGCAA
ACAAATATGTGTTTTGGGATGCCTTTCATCCCACTCAGAAGACCAACCAAATTATTGTCAATGATTTGCTTAGAATTCTTCTTCCTATGTTTCGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
GTTCCGGCCATTATTGTGTTTGGAGACTCCTCTGTGGATTCCGGCAATAACAATGTGGTTAAGACGGTGTTGAAAAGCAATTTCAGGCCTTATGGCCGGGACTTCGTCGG
TGGTCAGGCCACCGGAAGGTTCTCCAACGGCCGCGTTCCGCCGGACTTTATTTCTGAAGCTTTTGGTCTAAAATCAACCATACCGGCTTACTTGGACCCCGGTTATACCA
TTGCCGACTTCGCCACCGGAGTTTGCTTCGCCTCTGCCGGAACTGGCTTCGACAACTCCACTTCCGATGTTTTAAATGTGATACCTCTATGGAGGGAAGTGGAGTTTTTC
AAGGACTATCAAAACAAGCTAAGAGCCTATATGGGCAATGAGAAAGCAAATGAAGTGATAAGAGAAGCTCTATATTTGGTAAGTTTAGGAACAAACGACTTCTTGGAAAA
TTACTACACAATTCCTCGGCGGAGACTCCAATTTACGATCCAACAGTACGAGGATTTCCTGCTCGAACTGGCCGGGAACTTCATCGGAGAACTTTACGGGCTCGGCGCGA
GAAAAATATCGTTTACCGGGCTTCCTCCGATGGGGTGTTTGCCGCTGGAGAGAGCAACCAATGTCATGGGAAATTTTGGGTGCGTAGAGAAATACAACGCTGTGGCTTTG
GAATTCAATAGGAAGTTGGAGGGATTCGTGGGGGCATTGAATAGGCAGCTCCCAGGCCTTACAATGCTCTTTGCAAATCCTTTTCCCATTTTTTATCAGATCATCAGCCA
GCCTTACTTATACGGATTTGAAGTGGCTGGAAAGGCATGCTGTGCAACTGGGACATTTGAGATGAGCTATCTGTGCAACCAAGAAAACCCATTTACTTGCATGGACGCAA
ACAAATATGTGTTTTGGGATGCCTTTCATCCCACTCAGAAGACCAACCAAATTATTGTCAATGATTTGCTTAGAATTCTTCTTCCTATGTTTCGA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
VPAIIVFGDSSVDSGNNNVVKTVLKSNFRPYGRDFVGGQATGRFSNGRVPPDFISEAFGLKSTIPAYLDPGYTIADFATGVCFASAGTGFDNSTSDVLNVIPLWREVEFF
KDYQNKLRAYMGNEKANEVIREALYLVSLGTNDFLENYYTIPRRRLQFTIQQYEDFLLELAGNFIGELYGLGARKISFTGLPPMGCLPLERATNVMGNFGCVEKYNAVAL
EFNRKLEGFVGALNRQLPGLTMLFANPFPIFYQIISQPYLYGFEVAGKACCATGTFEMSYLCNQENPFTCMDANKYVFWDAFHPTQKTNQIIVNDLLRILLPMFR