| GenBank top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| KAG7011405.1 Serine/arginine-rich splicing factor SC35 [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma] | 3.6e-122 | 89.16 | Show/hide |
Query: MSHFGRSGPPDITDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVERLDGTVVDGREITVQFAKYGPNAER
MSHFGRSGPPDI DTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVERLDG VVDGREITVQFAKYGPNAER
Subjt: MSHFGRSGPPDITDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVERLDGTVVDGREITVQFAKYGPNAER
Query: IHKGKISEAFTKPRYRSRSRSPRRRYRDDNRDRDYRRRSRSRSRSRSLDRSDRDRRGRERERERDYRRRSRSISPRRPSPDYSKGRGRGRYDDERRSRSR
IHKGK+SE+F K RYRSRSRSPRRR+RDD+RDRDYRRRSRSRSRSRSLDR D DRRGRERERERDYRRRSRSISPRRPSPDYSKGRGRGRY DERRSRSR
Subjt: IHKGKISEAFTKPRYRSRSRSPRRRYRDDNRDRDYRRRSRSRSRSRSLDRSDRDRRGRERERERDYRRRSRSISPRRPSPDYSKGRGRGRYDDERRSRSR
Query: SCSR--------SRSRGQSRSVDSASPGRRSASPRRSLSPQRSPSPRGESPVRNGDGGRSPTPRSVSPRGQPADSRSPSPQNSDVD
S SR SR RG+ RSVDSASPGR+S SP RS SPQRSPSPRGESP RNGDGGRSPT RSVSPRGQPADSRSPS NSDVD
Subjt: SCSR--------SRSRGQSRSVDSASPGRRSASPRRSLSPQRSPSPRGESPVRNGDGGRSPTPRSVSPRGQPADSRSPSPQNSDVD
|
|
| XP_008455209.1 PREDICTED: serine/arginine-rich splicing factor SC35 [Cucumis melo] | 6.5e-124 | 91.52 | Show/hide |
Query: MSHFGRSGPPDITDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVERLDGTVVDGREITVQFAKYGPNAER
MSHFGRSGPPDITDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVERLDGT+VDGREITVQFAKYGPNAER
Subjt: MSHFGRSGPPDITDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVERLDGTVVDGREITVQFAKYGPNAER
Query: IHKGKISEAFTKPRYRSRSRSPRRRYRDDNRDRDYRRRSRSRSRSRSLDRSDRDRRGRERERERDYRRRSRSISPRRPSPDYSKGRGRGRYDDERRSRSR
IHKGKISEAF K RYRSRSRSPRRRYRDD RDRDYRRRSRSRSRSRSLDRSDRDRRGRERERERD+RRRSRSISPRRPSPDYSKGRGRGRYDDER RSR
Subjt: IHKGKISEAFTKPRYRSRSRSPRRRYRDDNRDRDYRRRSRSRSRSRSLDRSDRDRRGRERERERDYRRRSRSISPRRPSPDYSKGRGRGRYDDERRSRSR
Query: SCSRSRSRGQSRSVDSASPG------RRSASPRRSLSPQRSPSPRGESPVRNGD-GGRSPTPRSVSPRGQPADSRSPSPQNSD
S SRSRSRG+SRSVDS SPG RRS SPRRSLSP+RSPSPR ESP RNG+ GGRSPT RSVSPRG+PADSRSPSPQNSD
Subjt: SCSRSRSRGQSRSVDSASPG------RRSASPRRSLSPQRSPSPRGESPVRNGD-GGRSPTPRSVSPRGQPADSRSPSPQNSD
|
|
| XP_022141921.1 serine/arginine-rich splicing factor SC35 [Momordica charantia] | 6.4e-140 | 99.28 | Show/hide |
Query: MSHFGRSGPPDITDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVERLDGTVVDGREITVQFAKYGPNAER
MSHFGRSGPPDITDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVERLDGTVVDGREITVQFAKYGPNAER
Subjt: MSHFGRSGPPDITDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVERLDGTVVDGREITVQFAKYGPNAER
Query: IHKGKISEAFTKPRYRSRSRSPRRRYRDDNRDRDYRRRSRSRSRSRSLDRSDRDRRGRERERERDYRRRSRSISPRRPSPDYSKGRGRGRYDDERRSRSR
IHKGKISEAFTKPRYRSRSRSPRRRYRDDNRDRDYRRRSRSRSRSRSLDRSDRDRRGRERERERDYRRRSRSISPRRPSPDYSKGRGRGRYDDERRSRSR
Subjt: IHKGKISEAFTKPRYRSRSRSPRRRYRDDNRDRDYRRRSRSRSRSRSLDRSDRDRRGRERERERDYRRRSRSISPRRPSPDYSKGRGRGRYDDERRSRSR
Query: SCSRSRSRGQSRSVDSASPGRRSASPRRSLSPQRSPSPRGESPVRNGDGGRSPTPRSVSPRGQPADSRSPSPQNSDVD
SCSRS+SRGQSRSVDSASPGRRSASPRRSLSPQRSPSPRGESPVRNGDGGR+PTPRSVSPRGQPADSRSPSPQNSDVD
Subjt: SCSRSRSRGQSRSVDSASPGRRSASPRRSLSPQRSPSPRGESPVRNGDGGRSPTPRSVSPRGQPADSRSPSPQNSDVD
|
|
| XP_022927926.1 serine/arginine-rich splicing factor SC35-like [Cucurbita moschata] | 3.6e-122 | 87.16 | Show/hide |
Query: MSHFGRSGPPDITDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVERLDGTVVDGREITVQFAKYGPNAER
MSHFGRSGPPDITDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAV+RLDGTVVDGREITVQFAKYGPNAE+
Subjt: MSHFGRSGPPDITDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVERLDGTVVDGREITVQFAKYGPNAER
Query: IHKGKISEAFTKPRYRSRSRSPRRRYRDDNRDRDYRRRSRSRSRSRSLDRSDRDRRGRERERERDYRRRSRSISPRRPSPDYSKGRGRGRYDDERRSRSR
I KGKISE F K R+RSRSRSPRRRYRDD RDRDYRR RSRSRSRSLDRSDRDRRGRERERERDYRRRSRSISPRRPSPDYSKGRGRGRY DERR+RSR
Subjt: IHKGKISEAFTKPRYRSRSRSPRRRYRDDNRDRDYRRRSRSRSRSRSLDRSDRDRRGRERERERDYRRRSRSISPRRPSPDYSKGRGRGRYDDERRSRSR
Query: SCSRSRSRGQSRSVDSASPGRRSASPR------------------RSLSPQRSPSPRGESPVRNGDGGRSPTPRSVSPRGQPADSRSPSPQNSDVD
S SRSRG+SRSV+SASPGRRS SPR RSLSP+RSPSPRGESP RNGDGGRSPTPRSVSPRGQPADSRSPSPQNSDVD
Subjt: SCSRSRSRGQSRSVDSASPGRRSASPR------------------RSLSPQRSPSPRGESPVRNGDGGRSPTPRSVSPRGQPADSRSPSPQNSDVD
|
|
| XP_038888048.1 serine/arginine-rich splicing factor SC35 [Benincasa hispida] | 1.5e-125 | 90.88 | Show/hide |
Query: MSHFGRSGPPDITDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVERLDGTVVDGREITVQFAKYGPNAER
MSHFGRSGPPDITDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVERLDGT+VDGREITVQFAKYGPNAER
Subjt: MSHFGRSGPPDITDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVERLDGTVVDGREITVQFAKYGPNAER
Query: IHKGKISEAFTKPRYRSRSRSPRRRYRDDNRDRDYRRRSRSRSRSRSLDRSDRDRRGRERERERDYRRRSRSISPRRPSPDYSKGRGRGRYDDERRSRSR
IHKGKISEAF K RY+SRSRSPRRRYRDD RDRDYRRRSRSRSRSRS DRSDRDRRGRE+ERER+YRRRSRSISPRRPSPDYSKGRGRGRYDDERRSRSR
Subjt: IHKGKISEAFTKPRYRSRSRSPRRRYRDDNRDRDYRRRSRSRSRSRSLDRSDRDRRGRERERERDYRRRSRSISPRRPSPDYSKGRGRGRYDDERRSRSR
Query: SCSRSRSRGQSRSVDSASPG------RRSASPRRSLSPQRSPSPRGESPVRNGD-GGRSPTPRSVSPRGQPADSRSPSPQNSDVD
S SRSRSRG+SRSVDS SPG RRS SPRRSLSP+RSPSPRG SP RNG+ GGRSPT RSVSPRG+P DSRSPSPQNSDVD
Subjt: SCSRSRSRGQSRSVDSASPG------RRSASPRRSLSPQRSPSPRGESPVRNGD-GGRSPTPRSVSPRGQPADSRSPSPQNSDVD
|
|
| TrEMBL top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| A0A0A0K7C0 RRM domain-containing protein | 1.7e-122 | 90.11 | Show/hide |
Query: MSHFGRSGPPDITDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVERLDGTVVDGREITVQFAKYGPNAER
MSHFGRSGPPDITDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVERLDGT+VDGREITVQFAKYGPNAER
Subjt: MSHFGRSGPPDITDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVERLDGTVVDGREITVQFAKYGPNAER
Query: IHKGKISEAFTKPRYRSRSRSPRRRYRDDNRDRDYRRRSRSRSRSRSLDRSDRDRRGRERERERDYRRRSRSISPRRPSPDYSKGRGRGRYDDERRSRSR
IHKGKISEAF K RYRSRSRSPRRR+RDD RD+DYRRRSRSRSRSRSLD++DRDRRGRERERERD+RRRSRSISPRRPSPDYSKGRGRGRYDDER RSR
Subjt: IHKGKISEAFTKPRYRSRSRSPRRRYRDDNRDRDYRRRSRSRSRSRSLDRSDRDRRGRERERERDYRRRSRSISPRRPSPDYSKGRGRGRYDDERRSRSR
Query: SCSRSRSRGQSRSVDSASPG------RRSASPRRSLSPQRSPSPRGESPVRNGDG-GRSPTPRSVSPRGQPADSRSPSPQNSD
S SRSRSRG+SRSVDS SPG RRS SPRRSLSP+RSPSPR ESP RNG+G GRSPT RSVSPRG+PADSRSPSPQNSD
Subjt: SCSRSRSRGQSRSVDSASPG------RRSASPRRSLSPQRSPSPRGESPVRNGDG-GRSPTPRSVSPRGQPADSRSPSPQNSD
|
|
| A0A1S3C0I4 serine/arginine-rich splicing factor SC35 | 3.1e-124 | 91.52 | Show/hide |
Query: MSHFGRSGPPDITDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVERLDGTVVDGREITVQFAKYGPNAER
MSHFGRSGPPDITDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVERLDGT+VDGREITVQFAKYGPNAER
Subjt: MSHFGRSGPPDITDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVERLDGTVVDGREITVQFAKYGPNAER
Query: IHKGKISEAFTKPRYRSRSRSPRRRYRDDNRDRDYRRRSRSRSRSRSLDRSDRDRRGRERERERDYRRRSRSISPRRPSPDYSKGRGRGRYDDERRSRSR
IHKGKISEAF K RYRSRSRSPRRRYRDD RDRDYRRRSRSRSRSRSLDRSDRDRRGRERERERD+RRRSRSISPRRPSPDYSKGRGRGRYDDER RSR
Subjt: IHKGKISEAFTKPRYRSRSRSPRRRYRDDNRDRDYRRRSRSRSRSRSLDRSDRDRRGRERERERDYRRRSRSISPRRPSPDYSKGRGRGRYDDERRSRSR
Query: SCSRSRSRGQSRSVDSASPG------RRSASPRRSLSPQRSPSPRGESPVRNGD-GGRSPTPRSVSPRGQPADSRSPSPQNSD
S SRSRSRG+SRSVDS SPG RRS SPRRSLSP+RSPSPR ESP RNG+ GGRSPT RSVSPRG+PADSRSPSPQNSD
Subjt: SCSRSRSRGQSRSVDSASPG------RRSASPRRSLSPQRSPSPRGESPVRNGD-GGRSPTPRSVSPRGQPADSRSPSPQNSD
|
|
| A0A6J1CKN2 serine/arginine-rich splicing factor SC35 | 3.1e-140 | 99.28 | Show/hide |
Query: MSHFGRSGPPDITDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVERLDGTVVDGREITVQFAKYGPNAER
MSHFGRSGPPDITDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVERLDGTVVDGREITVQFAKYGPNAER
Subjt: MSHFGRSGPPDITDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVERLDGTVVDGREITVQFAKYGPNAER
Query: IHKGKISEAFTKPRYRSRSRSPRRRYRDDNRDRDYRRRSRSRSRSRSLDRSDRDRRGRERERERDYRRRSRSISPRRPSPDYSKGRGRGRYDDERRSRSR
IHKGKISEAFTKPRYRSRSRSPRRRYRDDNRDRDYRRRSRSRSRSRSLDRSDRDRRGRERERERDYRRRSRSISPRRPSPDYSKGRGRGRYDDERRSRSR
Subjt: IHKGKISEAFTKPRYRSRSRSPRRRYRDDNRDRDYRRRSRSRSRSRSLDRSDRDRRGRERERERDYRRRSRSISPRRPSPDYSKGRGRGRYDDERRSRSR
Query: SCSRSRSRGQSRSVDSASPGRRSASPRRSLSPQRSPSPRGESPVRNGDGGRSPTPRSVSPRGQPADSRSPSPQNSDVD
SCSRS+SRGQSRSVDSASPGRRSASPRRSLSPQRSPSPRGESPVRNGDGGR+PTPRSVSPRGQPADSRSPSPQNSDVD
Subjt: SCSRSRSRGQSRSVDSASPGRRSASPRRSLSPQRSPSPRGESPVRNGDGGRSPTPRSVSPRGQPADSRSPSPQNSDVD
|
|
| A0A6J1EIV3 serine/arginine-rich splicing factor SC35-like | 1.7e-122 | 87.16 | Show/hide |
Query: MSHFGRSGPPDITDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVERLDGTVVDGREITVQFAKYGPNAER
MSHFGRSGPPDITDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAV+RLDGTVVDGREITVQFAKYGPNAE+
Subjt: MSHFGRSGPPDITDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVERLDGTVVDGREITVQFAKYGPNAER
Query: IHKGKISEAFTKPRYRSRSRSPRRRYRDDNRDRDYRRRSRSRSRSRSLDRSDRDRRGRERERERDYRRRSRSISPRRPSPDYSKGRGRGRYDDERRSRSR
I KGKISE F K R+RSRSRSPRRRYRDD RDRDYRR RSRSRSRSLDRSDRDRRGRERERERDYRRRSRSISPRRPSPDYSKGRGRGRY DERR+RSR
Subjt: IHKGKISEAFTKPRYRSRSRSPRRRYRDDNRDRDYRRRSRSRSRSRSLDRSDRDRRGRERERERDYRRRSRSISPRRPSPDYSKGRGRGRYDDERRSRSR
Query: SCSRSRSRGQSRSVDSASPGRRSASPR------------------RSLSPQRSPSPRGESPVRNGDGGRSPTPRSVSPRGQPADSRSPSPQNSDVD
S SRSRG+SRSV+SASPGRRS SPR RSLSP+RSPSPRGESP RNGDGGRSPTPRSVSPRGQPADSRSPSPQNSDVD
Subjt: SCSRSRSRGQSRSVDSASPGRRSASPR------------------RSLSPQRSPSPRGESPVRNGDGGRSPTPRSVSPRGQPADSRSPSPQNSDVD
|
|
| A0A6J1HFC7 serine/arginine-rich splicing factor SC35-like isoform X2 | 2.2e-122 | 89.16 | Show/hide |
Query: MSHFGRSGPPDITDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVERLDGTVVDGREITVQFAKYGPNAER
MSHFGRSGPPDI DTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVERLDG VVDGREITVQFAKYGPNAER
Subjt: MSHFGRSGPPDITDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVERLDGTVVDGREITVQFAKYGPNAER
Query: IHKGKISEAFTKPRYRSRSRSPRRRYRDDNRDRDYRRRSRSRSRSRSLDRSDRDRRGRERERERDYRRRSRSISPRRPSPDYSKGRGRGRYDDERRSRSR
IHKGK+SE+F K RYRSRSRSPRRR+RDD+RDRDYRRRSRSRSRSRSLDR D DRRGRERERERDYRRRSRSISPRRPSPDYSKGRGRGRY DERRSRSR
Subjt: IHKGKISEAFTKPRYRSRSRSPRRRYRDDNRDRDYRRRSRSRSRSRSLDRSDRDRRGRERERERDYRRRSRSISPRRPSPDYSKGRGRGRYDDERRSRSR
Query: SCSRSRS--------RGQSRSVDSASPGRRSASPRRSLSPQRSPSPRGESPVRNGDGGRSPTPRSVSPRGQPADSRSPSPQNSDVD
S SRSRS RG+ RSVDSASPGR+S SP RS SP RSPSPRGESP RNGDGGRSPT RSVSPRGQPADSRSPS NSDVD
Subjt: SCSRSRS--------RGQSRSVDSASPGRRSASPRRSLSPQRSPSPRGESPVRNGDGGRSPTPRSVSPRGQPADSRSPSPQNSDVD
|
|
| SwissProt top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| P30352 Serine/arginine-rich splicing factor 2 | 5.3e-28 | 46.03 | Show/hide |
Query: FGRSGPPDITDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVERLDGTVVDGREITVQFAKYG--PNAERI
+GR PPD+ SL V N+T+RT+ D L +F KYG+V D++IPRDR T +SRGFAFVR+ +A+ A++ +DG V+DGRE+ VQ A+YG P++
Subjt: FGRSGPPDITDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVERLDGTVVDGREITVQFAKYG--PNAERI
Query: HKGKISEAFTKPRYRSRSRSPRRRYRDDNRDRDYRRRSRSRSRSRSLDRSDRDRRGRERERERDYRRRSRSISPRRPSPDYSKGRGRGRYDDERRSRSRS
+G + Y RSRSPRR RRRSRSRSRSRS RS R R R + R R R RSRS SK R R + S SRS
Subjt: HKGKISEAFTKPRYRSRSRSPRRRYRDDNRDRDYRRRSRSRSRSRSLDRSDRDRRGRERERERDYRRRSRSISPRRPSPDYSKGRGRGRYDDERRSRSRS
Query: CSRSRSRGQSRSVDSASPGRRSASPRRSLSPQRSPSPRG
SRSRSR +SRS S R S S RS SP +SP G
Subjt: CSRSRSRGQSRSVDSASPGRRSASPRRSLSPQRSPSPRG
|
|
| Q01130 Serine/arginine-rich splicing factor 2 | 9.0e-28 | 46.03 | Show/hide |
Query: FGRSGPPDITDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVERLDGTVVDGREITVQFAKYG--PNAERI
+GR PPD+ SL V N+T+RT+ D L +F KYG+V D++IPRDR T +SRGFAFVR+ +A+ A++ +DG V+DGRE+ VQ A+YG P++
Subjt: FGRSGPPDITDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVERLDGTVVDGREITVQFAKYG--PNAERI
Query: HKGKISEAFTKPRYRSRSRSPRRRYRDDNRDRDYRRRSRSRSRSRSLDRSDRDRRGRERERERDYRRRSRSISPRRPSPDYSKGRGRGRYDDERRSRSRS
+G + Y RSRSPRR RRRSRSRSRSRS RS R R R + R R R RSRS SK R R + S SRS
Subjt: HKGKISEAFTKPRYRSRSRSPRRRYRDDNRDRDYRRRSRSRSRSRSLDRSDRDRRGRERERERDYRRRSRSISPRRPSPDYSKGRGRGRYDDERRSRSRS
Query: CSRSRSRGQSRSVDSASPGRRSASPRRSLSPQRSPSPRG
SRSRSR +SRS S R S S RS SP +SP G
Subjt: CSRSRSRGQSRSVDSASPGRRSASPRRSLSPQRSPSPRG
|
|
| Q06A98 Serine/arginine-rich splicing factor 2 | 3.1e-28 | 46.44 | Show/hide |
Query: FGRSGPPDITDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVERLDGTVVDGREITVQFAKYG--PNAERI
+GR PPD+ SL V N+T+RT+ D L +F KYG+V D++IPRDR T +SRGFAFVR+ +A+ A++ +DG V+DGRE+ VQ A+YG P++
Subjt: FGRSGPPDITDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVERLDGTVVDGREITVQFAKYG--PNAERI
Query: HKGKISEAFTKPRYRSRSRSPRRRYRDDNRDRDYRRRSRSRSRSRSLDRSDRDRRGRERERERDYRRRSRSISPRRPSPDYSKGRGRGRYDDERRSRSRS
+G + Y RSRSPRR RRRSRSRSRSRS RS R R R + R R R RSRS SK R R + S SRS
Subjt: HKGKISEAFTKPRYRSRSRSPRRRYRDDNRDRDYRRRSRSRSRSRSLDRSDRDRRGRERERERDYRRRSRSISPRRPSPDYSKGRGRGRYDDERRSRSRS
Query: CSRSRSRGQSRSVDSASPGRRSASPRRSLSPQRSPSPRG
SRSRSR +SRS AS R S S RS SP +SP G
Subjt: CSRSRSRGQSRSVDSASPGRRSASPRRSLSPQRSPSPRG
|
|
| Q3MHR5 Serine/arginine-rich splicing factor 2 | 9.0e-28 | 46.03 | Show/hide |
Query: FGRSGPPDITDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVERLDGTVVDGREITVQFAKYG--PNAERI
+GR PPD+ SL V N+T+RT+ D L +F KYG+V D++IPRDR T +SRGFAFVR+ +A+ A++ +DG V+DGRE+ VQ A+YG P++
Subjt: FGRSGPPDITDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVERLDGTVVDGREITVQFAKYG--PNAERI
Query: HKGKISEAFTKPRYRSRSRSPRRRYRDDNRDRDYRRRSRSRSRSRSLDRSDRDRRGRERERERDYRRRSRSISPRRPSPDYSKGRGRGRYDDERRSRSRS
+G + Y RSRSPRR RRRSRSRSRSRS RS R R R + R R R RSRS SK R R + S SRS
Subjt: HKGKISEAFTKPRYRSRSRSPRRRYRDDNRDRDYRRRSRSRSRSRSLDRSDRDRRGRERERERDYRRRSRSISPRRPSPDYSKGRGRGRYDDERRSRSRS
Query: CSRSRSRGQSRSVDSASPGRRSASPRRSLSPQRSPSPRG
SRSRSR +SRS S R S S RS SP +SP G
Subjt: CSRSRSRGQSRSVDSASPGRRSASPRRSLSPQRSPSPRG
|
|
| Q9FMG4 Serine/arginine-rich splicing factor SC35 | 9.9e-67 | 60.38 | Show/hide |
Query: MSHFGRSGPPDITDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVERLDGTVVDGREITVQFAKYGPNAER
MSHFGRSGPPDI+DTYSLLVLNITFRTTADDLYPLF KYGKVVD+FIPRDRRTGDSRGFAFVRYKY DEA KAVERLDG VVDGREITVQFAKYGPNAE+
Subjt: MSHFGRSGPPDITDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVERLDGTVVDGREITVQFAKYGPNAER
Query: IHKGKISEAFTK---------------------PRYRS--RSRSPRRRYRDDNRDRDYRRRSRSRSRSRSLDRSDRDRRGRERERERDYRRRSRSISPRR
I KG++ E K PR RS RSRSPRRR RDD R++DYR+RSRSRS DRR R E++RD+RRR+RS R
Subjt: IHKGKISEAFTK---------------------PRYRS--RSRSPRRRYRDDNRDRDYRRRSRSRSRSRSLDRSDRDRRGRERERERDYRRRSRSISPRR
Query: PSPDYSKGRGRGRYDDERRSRSRSCSRSRSR--GQSRSVDSASPGR----------RSASPRRSLSPQRSP-----SPRGESPVRNGDGGRSPTPRSVSP
SPD K R RGRYD+E RS SRS S S +R +S S SP R RS SPRRSLSP RSP SP E RSP+P S +P
Subjt: PSPDYSKGRGRGRYDDERRSRSRSCSRSRSR--GQSRSVDSASPGR----------RSASPRRSLSPQRSP-----SPRGESPVRNGDGGRSPTPRSVSP
Query: -RGQPADSRSPSP
R A SRS SP
Subjt: -RGQPADSRSPSP
|
|
| Arabidopsis top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| AT1G55310.1 SC35-like splicing factor 33 | 1.3e-13 | 38.41 | Show/hide |
Query: SLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVERLDGTVVDGREITVQFAKYGPNAERIHKGKISEAFTKPRYR
SLLV N+ +DL F ++G V DI++PRD TGD RGF FV++ +A A +DG ++ GRE+TV FA+ R
Subjt: SLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVERLDGTVVDGREITVQFAKYGPNAERIHKGKISEAFTKPRYR
Query: SRSRSPRRRYRDDNRDRDYRRRSRSRSRSRSLDRSDRDRRGRERERERDY------RRRSRSISPRR------------PSPDYSKGRGRGRYDDERRSR
+ R R R R RD RRR+ R SRS RS RRGR R R DY R RSISPR P+ D S+GR + RS
Subjt: SRSRSPRRRYRDDNRDRDYRRRSRSRSRSRSLDRSDRDRRGRERERERDY------RRRSRSISPRR------------PSPDYSKGRGRGRYDDERRSR
Query: SRSCSRSRSRGQSRSVDSASPGRRSASPRRSL--SPQRSPSPRGESPVRNGDGGRSPTPRSVSPR-GQPADSRSPS
S S RS SR RS + RS SPRRS+ SP+RS SPR + RS RS SP GQ + RSPS
Subjt: SRSCSRSRSRGQSRSVDSASPGRRSASPRRSL--SPQRSPSPRGESPVRNGDGGRSPTPRSVSPR-GQPADSRSPS
|
|
| AT1G55310.3 SC35-like splicing factor 33 | 3.2e-12 | 37.37 | Show/hide |
Query: SLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTG------------DSRGFAFVRYKYADEAQKAVERLDGTVVDGREITVQFAKYGPNAERIHKG
SLLV N+ +DL F ++G V DI++PRD TG D RGF FV++ +A A +DG ++ GRE+TV FA+
Subjt: SLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTG------------DSRGFAFVRYKYADEAQKAVERLDGTVVDGREITVQFAKYGPNAERIHKG
Query: KISEAFTKP-RYRSRSRSPRRRYRDDNRDRDYRRRSRSRSRSRSLDRSDRDRRGRERERERDY------RRRSRSISPRR------------PSPDYSKG
E KP R+R R R+RD RRR+ R SRS RS RRGR R R DY R RSISPR P+ D S+G
Subjt: KISEAFTKP-RYRSRSRSPRRRYRDDNRDRDYRRRSRSRSRSRSLDRSDRDRRGRERERERDY------RRRSRSISPRR------------PSPDYSKG
Query: RGRGRYDDERRSRSRSCSRSRSRGQSRSVDSASPGRRSASPRRSL--SPQRSPSPRGESPVRNGDGGRSPTPRSVSPR-GQPADSRSPS
R + RS S S RS SR RS + RS SPRRS+ SP+RS SPR + RS RS SP GQ + RSPS
Subjt: RGRGRYDDERRSRSRSCSRSRSRGQSRSVDSASPGRRSASPRRSL--SPQRSPSPRGESPVRNGDGGRSPTPRSVSPR-GQPADSRSPS
|
|
| AT3G13570.1 SC35-like splicing factor 30A | 2.9e-13 | 38.03 | Show/hide |
Query: FGRSGPPDITDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVERLDGTVVDGREITVQFAKYGPNAERIHK
FG S D+ SLLV N+ +DL F ++G V DI++PRD TGD RGF F+++ +A +A ++DG ++ GRE+TV FA+
Subjt: FGRSGPPDITDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVERLDGTVVDGREITVQFAKYGPNAERIHK
Query: GKISEAFTKP-RYRSRSRSPRRRYRDDNRDRDYRRRSRSRSRSRSLDRSDRDRRG-RERERERDY------RRRSRSISPRRPSPDYSKGRGRGRYDDER
E KP R+R R R NR +D RRRS R RS RRG R R R R Y R +SRS+SP+ D R
Subjt: GKISEAFTKP-RYRSRSRSPRRRYRDDNRDRDYRRRSRSRSRSRSLDRSDRDRRG-RERERERDY------RRRSRSISPRRPSPDYSKGRGRGRYDDER
Query: RSRSRSCSRSRSRGQSRSVDSASPGR---RSASPRRSLSPQRSPS-----PRGESPVRNGDGGRSPTPRSVSPRGQPADSRSPS
+ RS SRS SR V S SPGR S SPRRS+SP+++ S R +SPV RSPTP PRG RSPS
Subjt: RSRSRSCSRSRSRGQSRSVDSASPGR---RSASPRRSLSPQRSPS-----PRGESPVRNGDGGRSPTPRSVSPRGQPADSRSPS
|
|
| AT5G64200.1 ortholog of human splicing factor SC35 | 7.0e-68 | 60.38 | Show/hide |
Query: MSHFGRSGPPDITDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVERLDGTVVDGREITVQFAKYGPNAER
MSHFGRSGPPDI+DTYSLLVLNITFRTTADDLYPLF KYGKVVD+FIPRDRRTGDSRGFAFVRYKY DEA KAVERLDG VVDGREITVQFAKYGPNAE+
Subjt: MSHFGRSGPPDITDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVERLDGTVVDGREITVQFAKYGPNAER
Query: IHKGKISEAFTK---------------------PRYRS--RSRSPRRRYRDDNRDRDYRRRSRSRSRSRSLDRSDRDRRGRERERERDYRRRSRSISPRR
I KG++ E K PR RS RSRSPRRR RDD R++DYR+RSRSRS DRR R E++RD+RRR+RS R
Subjt: IHKGKISEAFTK---------------------PRYRS--RSRSPRRRYRDDNRDRDYRRRSRSRSRSRSLDRSDRDRRGRERERERDYRRRSRSISPRR
Query: PSPDYSKGRGRGRYDDERRSRSRSCSRSRSR--GQSRSVDSASPGR----------RSASPRRSLSPQRSP-----SPRGESPVRNGDGGRSPTPRSVSP
SPD K R RGRYD+E RS SRS S S +R +S S SP R RS SPRRSLSP RSP SP E RSP+P S +P
Subjt: PSPDYSKGRGRGRYDDERRSRSRSCSRSRSR--GQSRSVDSASPGR----------RSASPRRSLSPQRSP-----SPRGESPVRNGDGGRSPTPRSVSP
Query: -RGQPADSRSPSP
R A SRS SP
Subjt: -RGQPADSRSPSP
|
|
| AT5G64200.2 ortholog of human splicing factor SC35 | 7.0e-68 | 60.38 | Show/hide |
Query: MSHFGRSGPPDITDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVERLDGTVVDGREITVQFAKYGPNAER
MSHFGRSGPPDI+DTYSLLVLNITFRTTADDLYPLF KYGKVVD+FIPRDRRTGDSRGFAFVRYKY DEA KAVERLDG VVDGREITVQFAKYGPNAE+
Subjt: MSHFGRSGPPDITDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVERLDGTVVDGREITVQFAKYGPNAER
Query: IHKGKISEAFTK---------------------PRYRS--RSRSPRRRYRDDNRDRDYRRRSRSRSRSRSLDRSDRDRRGRERERERDYRRRSRSISPRR
I KG++ E K PR RS RSRSPRRR RDD R++DYR+RSRSRS DRR R E++RD+RRR+RS R
Subjt: IHKGKISEAFTK---------------------PRYRS--RSRSPRRRYRDDNRDRDYRRRSRSRSRSRSLDRSDRDRRGRERERERDYRRRSRSISPRR
Query: PSPDYSKGRGRGRYDDERRSRSRSCSRSRSR--GQSRSVDSASPGR----------RSASPRRSLSPQRSP-----SPRGESPVRNGDGGRSPTPRSVSP
SPD K R RGRYD+E RS SRS S S +R +S S SP R RS SPRRSLSP RSP SP E RSP+P S +P
Subjt: PSPDYSKGRGRGRYDDERRSRSRSCSRSRSR--GQSRSVDSASPGR----------RSASPRRSLSPQRSP-----SPRGESPVRNGDGGRSPTPRSVSP
Query: -RGQPADSRSPSP
R A SRS SP
Subjt: -RGQPADSRSPSP
|
|
