; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

MS006622 (gene) of Bitter gourd (TR) v1 genome

Gene IDMS006622
OrganismMomordica charantia cv. TR (Bitter gourd (TR) v1)
Descriptioneukaryotic initiation factor 4A-III
Genome locationscaffold482:190572..196346
RNA-Seq ExpressionMS006622
SyntenyMS006622
Gene Ontology termsGO:0006413 - translational initiation (biological process)
GO:0005730 - nucleolus (cellular component)
GO:0071013 - catalytic step 2 spliceosome (cellular component)
GO:0003724 - RNA helicase activity (molecular function)
GO:0003729 - mRNA binding (molecular function)
GO:0003743 - translation initiation factor activity (molecular function)
GO:0005524 - ATP binding (molecular function)
GO:0016787 - hydrolase activity (molecular function)
InterPro domainsIPR001650 - Helicase, C-terminal
IPR011545 - DEAD/DEAH box helicase domain
IPR014001 - Helicase superfamily 1/2, ATP-binding domain
IPR014014 - RNA helicase, DEAD-box type, Q motif
IPR027417 - P-loop containing nucleoside triphosphate hydrolase


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
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A0A0A0L9P0 Uncharacterized protein2.7e-22597.8Show/hide
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A0A6J1DI60 eukaryotic initiation factor 4A-34.5e-22899.51Show/hide
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A0A6J1GB02 eukaryotic initiation factor 4A-3-like1.6e-22598.05Show/hide
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A0A6J1J605 eukaryotic initiation factor 4A-36.0e-22597.32Show/hide
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A0A6J1K814 eukaryotic initiation factor 4A-3-like1.6e-22598.05Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
P41380 Eukaryotic initiation factor 4A-32.8e-20391.52Show/hide
Query:  EDKLEFETTEGVEPISSFDQMGIKDDLLRGIYAYGFEKPSAIQQRAVRPIIEGRDVIAQAQSGTGKTSMIALTVCQMVDTSSREVQALILSPTRELATQT
        ED+L FET++GVEPI+SF +MGIKDDLLRG+Y YGFEKPSAIQQRAV PII GRDVIAQAQSGTGKTSMIALTVCQ+VDT S EVQALILSPTRELA QT
Subjt:  EDKLEFETTEGVEPISSFDQMGIKDDLLRGIYAYGFEKPSAIQQRAVRPIIEGRDVIAQAQSGTGKTSMIALTVCQMVDTSSREVQALILSPTRELATQT

Query:  EKVILAIGDYINIQAHACIGGKSVGEDIRKLEFGVQIVSGTPGRVCDMIKRRTLRTRAIKLLVLDESDEMLSRGFKDQIYDVYRYLPPELQVVLISATLP
        EKVILAIGDYIN+QAHACIGGKSVGEDIRKLE GVQ+VSGTPGRVCDMIKRRTLRTR IKLL+LDESDEMLSRGFKDQIYDVYRYLPPELQVVLISATLP
Subjt:  EKVILAIGDYINIQAHACIGGKSVGEDIRKLEFGVQIVSGTPGRVCDMIKRRTLRTRAIKLLVLDESDEMLSRGFKDQIYDVYRYLPPELQVVLISATLP

Query:  HEILEMTNKFMTDPVRILVKRDELTLEGIKQFFVAVEREEWKFDTLCDLYDTLTITQAVIFCNTKRKVEWLTEKMRSNNFTVSHMHGDMPQRERDAIMGE
        +EILE+T+KFMTDPVRILVKRDELTLEGIKQFFVAVE+EEWKFDTLCDLYDTLTITQAVIFCNTKRKV+WLT KMR NNFTVS MHGDMPQ+ERDAIM E
Subjt:  HEILEMTNKFMTDPVRILVKRDELTLEGIKQFFVAVEREEWKFDTLCDLYDTLTITQAVIFCNTKRKVEWLTEKMRSNNFTVSHMHGDMPQRERDAIMGE

Query:  FRSGTTRVLITTDVWARGLDVQQASL-INYDLPNNRELYIHRIGRSGRFGRKGVAINFVKSDDIKILRDIEQYYSTQIDEMPMNVADLI
        FR GTTRVLITTDVWARGLDVQQ SL INYDLPNNRELYIHRIGRSGRFGRKGVAINFVKSDDIKILRDIEQYYSTQIDEMPMNVADLI
Subjt:  FRSGTTRVLITTDVWARGLDVQQASL-INYDLPNNRELYIHRIGRSGRFGRKGVAINFVKSDDIKILRDIEQYYSTQIDEMPMNVADLI

Q10I26 Eukaryotic initiation factor 4A-III homolog B2.6e-20187.78Show/hide
Query:  AAATTSVVPPNRRRSINAPEDK-LEFETTEGVEPISSFDQMGIKDDLLRGIYAYGFEKPSAIQQRAVRPIIEGRDVIAQAQSGTGKTSMIALTVCQMVDT
        AAATTS      RR   A +D+ L FET+ GVE ISSFDQMGI++DLLRGIYAYGFEKPSAIQQRAV PII GRDVIAQAQSGTGKTSMI+L+VCQ+VDT
Subjt:  AAATTSVVPPNRRRSINAPEDK-LEFETTEGVEPISSFDQMGIKDDLLRGIYAYGFEKPSAIQQRAVRPIIEGRDVIAQAQSGTGKTSMIALTVCQMVDT

Query:  SSREVQALILSPTRELATQTEKVILAIGDYINIQAHACIGGKSVGEDIRKLEFGVQIVSGTPGRVCDMIKRRTLRTRAIKLLVLDESDEMLSRGFKDQIY
        + REVQALILSPTRELA QTE+V+LAIGDYINIQ HACIGGKS+GEDIRKLE GV +VSGTPGRVCDMIKRRTLRTRAIKLL+LDE+DEML RGFKDQIY
Subjt:  SSREVQALILSPTRELATQTEKVILAIGDYINIQAHACIGGKSVGEDIRKLEFGVQIVSGTPGRVCDMIKRRTLRTRAIKLLVLDESDEMLSRGFKDQIY

Query:  DVYRYLPPELQVVLISATLPHEILEMTNKFMTDPVRILVKRDELTLEGIKQFFVAVEREEWKFDTLCDLYDTLTITQAVIFCNTKRKVEWLTEKMRSNNF
        DVYRYLPPELQV LISATLPHEILEMT+KFMTDPVRILVKRDELTLEGIKQFFVAVE+EEWKFDTLCDLYDTLTITQAVIFCNTKRKV+WLTE+MRSNNF
Subjt:  DVYRYLPPELQVVLISATLPHEILEMTNKFMTDPVRILVKRDELTLEGIKQFFVAVEREEWKFDTLCDLYDTLTITQAVIFCNTKRKVEWLTEKMRSNNF

Query:  TVSHMHGDMPQRERDAIMGEFRSGTTRVLITTDVWARGLDVQQASL-INYDLPNNRELYIHRIGRSGRFGRKGVAINFVKSDDIKILRDIEQYYSTQIDE
        TVS MHGDMPQ+ERDAIMGEFRSG TRVLITTDVWARGLDVQQ SL INYDLPNNRELYIHRIGRSGRFGRKGVAINFVK +DI+ILRDIEQYYSTQIDE
Subjt:  TVSHMHGDMPQRERDAIMGEFRSGTTRVLITTDVWARGLDVQQASL-INYDLPNNRELYIHRIGRSGRFGRKGVAINFVKSDDIKILRDIEQYYSTQIDE

Query:  MPMNVADLI
        MPMNVADLI
Subjt:  MPMNVADLI

Q2NL22 Eukaryotic initiation factor 4A-III2.1e-18277.37Show/hide
Query:  MAAAATTSVVPPNRRRSINAPE-DKLEFETTEGVEPISSFDQMGIKDDLLRGIYAYGFEKPSAIQQRAVRPIIEGRDVIAQAQSGTGKTSMIALTVCQMV
        MAA AT +     R+R +   +  K+EFET+E V+   +FD MG+++DLLRGIYAYGFEKPSAIQQRA++ II+GRDVIAQ+QSGTGKT+  +++V Q +
Subjt:  MAAAATTSVVPPNRRRSINAPE-DKLEFETTEGVEPISSFDQMGIKDDLLRGIYAYGFEKPSAIQQRAVRPIIEGRDVIAQAQSGTGKTSMIALTVCQMV

Query:  DTSSREVQALILSPTRELATQTEKVILAIGDYINIQAHACIGGKSVGEDIRKLEFGVQIVSGTPGRVCDMIKRRTLRTRAIKLLVLDESDEMLSRGFKDQ
        D   RE QALIL+PTRELA Q +K +LA+GDY+N+Q HACIGG +VGEDIRKL++G  +V+GTPGRV DMI+RR+LRTRAIK+LVLDE+DEML++GFK+Q
Subjt:  DTSSREVQALILSPTRELATQTEKVILAIGDYINIQAHACIGGKSVGEDIRKLEFGVQIVSGTPGRVCDMIKRRTLRTRAIKLLVLDESDEMLSRGFKDQ

Query:  IYDVYRYLPPELQVVLISATLPHEILEMTNKFMTDPVRILVKRDELTLEGIKQFFVAVEREEWKFDTLCDLYDTLTITQAVIFCNTKRKVEWLTEKMRSN
        IYDVYRYLPP  QVVLISATLPHEILEMTNKFMTDP+RILVKRDELTLEGIKQFFVAVEREEWKFDTLCDLYDTLTITQAVIFCNTKRKV+WLTEKMR  
Subjt:  IYDVYRYLPPELQVVLISATLPHEILEMTNKFMTDPVRILVKRDELTLEGIKQFFVAVEREEWKFDTLCDLYDTLTITQAVIFCNTKRKVEWLTEKMRSN

Query:  NFTVSHMHGDMPQRERDAIMGEFRSGTTRVLITTDVWARGLDVQQASL-INYDLPNNRELYIHRIGRSGRFGRKGVAINFVKSDDIKILRDIEQYYSTQI
        NFTVS MHGDMPQ+ER++IM EFRSG +RVLI+TDVWARGLDV Q SL INYDLPNNRELYIHRIGRSGR+GRKGVAINFVK+DDI+ILRDIEQYYSTQI
Subjt:  NFTVSHMHGDMPQRERDAIMGEFRSGTTRVLITTDVWARGLDVQQASL-INYDLPNNRELYIHRIGRSGRFGRKGVAINFVKSDDIKILRDIEQYYSTQI

Query:  DEMPMNVADLI
        DEMPMNVADLI
Subjt:  DEMPMNVADLI

Q5VNM3 Eukaryotic initiation factor 4A-III homolog A2.6e-20187.78Show/hide
Query:  AAATTSVVPPNRRRSINAPEDK-LEFETTEGVEPISSFDQMGIKDDLLRGIYAYGFEKPSAIQQRAVRPIIEGRDVIAQAQSGTGKTSMIALTVCQMVDT
        AAATTS      RR   A +D+ L FET+ GVE ISSFDQMGI+DDLLRGIYAYGFEKPSAIQQRAV PII GRDVIAQAQSGTGKTSMI+L+VCQ+VDT
Subjt:  AAATTSVVPPNRRRSINAPEDK-LEFETTEGVEPISSFDQMGIKDDLLRGIYAYGFEKPSAIQQRAVRPIIEGRDVIAQAQSGTGKTSMIALTVCQMVDT

Query:  SSREVQALILSPTRELATQTEKVILAIGDYINIQAHACIGGKSVGEDIRKLEFGVQIVSGTPGRVCDMIKRRTLRTRAIKLLVLDESDEMLSRGFKDQIY
        + REVQALILSPTRELA QTE+V+LAIGD+INIQ HACIGGKS+GEDIRKLE GV +VSGTPGRVCDMIKRRTLRTRAIKLL+LDE+DEML RGFKDQIY
Subjt:  SSREVQALILSPTRELATQTEKVILAIGDYINIQAHACIGGKSVGEDIRKLEFGVQIVSGTPGRVCDMIKRRTLRTRAIKLLVLDESDEMLSRGFKDQIY

Query:  DVYRYLPPELQVVLISATLPHEILEMTNKFMTDPVRILVKRDELTLEGIKQFFVAVEREEWKFDTLCDLYDTLTITQAVIFCNTKRKVEWLTEKMRSNNF
        DVYRYLPPELQV LISATLPHEILEMT+KFMTDPVRILVKRDELTLEGIKQFFVAVE+EEWKFDTLCDLYDTLTITQAVIFCNTKRKV+WLTE+MRSNNF
Subjt:  DVYRYLPPELQVVLISATLPHEILEMTNKFMTDPVRILVKRDELTLEGIKQFFVAVEREEWKFDTLCDLYDTLTITQAVIFCNTKRKVEWLTEKMRSNNF

Query:  TVSHMHGDMPQRERDAIMGEFRSGTTRVLITTDVWARGLDVQQASL-INYDLPNNRELYIHRIGRSGRFGRKGVAINFVKSDDIKILRDIEQYYSTQIDE
        TVS MHGDMPQ+ERDAIMGEFRSG TRVLITTDVWARGLDVQQ SL INYDLPNNRELYIHRIGRSGRFGRKGVAINFVK +DI+ILRDIEQYYSTQIDE
Subjt:  TVSHMHGDMPQRERDAIMGEFRSGTTRVLITTDVWARGLDVQQASL-INYDLPNNRELYIHRIGRSGRFGRKGVAINFVKSDDIKILRDIEQYYSTQIDE

Query:  MPMNVADLI
        MPMNVADLI
Subjt:  MPMNVADLI

Q94A52 Eukaryotic initiation factor 4A-III homolog2.3e-19788.17Show/hide
Query:  EDKLEFETTEGVEPISSFDQMGIKDDLLRGIYAYGFEKPSAIQQRAVRPIIEGRDVIAQAQSGTGKTSMIALTVCQMVDTSSREVQALILSPTRELATQT
        +DKL FETT+G+EPI+SF+ MGIK+D+LRG+Y YGFEKPSAIQQRAV PI++GRDVIAQAQSGTGKTSMIAL+VCQ+VDTSSREVQALILSPTRELATQT
Subjt:  EDKLEFETTEGVEPISSFDQMGIKDDLLRGIYAYGFEKPSAIQQRAVRPIIEGRDVIAQAQSGTGKTSMIALTVCQMVDTSSREVQALILSPTRELATQT

Query:  EKVILAIGDYINIQAHACIGGKSVGEDIRKLEFGVQIVSGTPGRVCDMIKRRTLRTRAIKLLVLDESDEMLSRGFKDQIYDVYRYLPPELQVVLISATLP
        EK I AIG + NIQAHACIGG SVGEDIRKLE GV +VSGTPGRVCDMIKRR+LRTRAIKLL+LDESDEMLSRGFKDQIYDVYRYLPP+LQV L+SATLP
Subjt:  EKVILAIGDYINIQAHACIGGKSVGEDIRKLEFGVQIVSGTPGRVCDMIKRRTLRTRAIKLLVLDESDEMLSRGFKDQIYDVYRYLPPELQVVLISATLP

Query:  HEILEMTNKFMTDPVRILVKRDELTLEGIKQFFVAVEREEWKFDTLCDLYDTLTITQAVIFCNTKRKVEWLTEKMRSNNFTVSHMHGDMPQRERDAIMGE
        HEILEMT+KFMT+PV+ILVKRDELTLEGIKQFFVAVE+EEWKFDTLCDLYDTLTITQAVIFCNTKRKV++L+EKMRS+NFTVS MHGDMPQ+ERDAIM E
Subjt:  HEILEMTNKFMTDPVRILVKRDELTLEGIKQFFVAVEREEWKFDTLCDLYDTLTITQAVIFCNTKRKVEWLTEKMRSNNFTVSHMHGDMPQRERDAIMGE

Query:  FRSGTTRVLITTDVWARGLDVQQASL-INYDLPNNRELYIHRIGRSGRFGRKGVAINFVKSDDIKILRDIEQYYSTQIDEMPMNVADLI
        FRSG +RVLITTDVWARG+DVQQ SL INYDLPNNRELYIHRIGRSGRFGRKGVAINFVKSDDIKILRDIEQYYSTQIDEMPMNVADLI
Subjt:  FRSGTTRVLITTDVWARGLDVQQASL-INYDLPNNRELYIHRIGRSGRFGRKGVAINFVKSDDIKILRDIEQYYSTQIDEMPMNVADLI

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G51380.1 DEA(D/H)-box RNA helicase family protein6.5e-16373.01Show/hide
Query:  EDKLEFETTEGVEPISSFDQMGIKDDLLRGIYAYGFEKPSAIQQRAVRPIIEGRDVIAQAQSGTGKTSMIALTVCQMVDTSSREVQALILSPTRELATQT
        E+ L FETT+G++PI SFD MG+ D +LRG+Y YG++KPS IQQRA+ PI++GRDVIAQAQSGTGKTSMIA++VCQ+V+ SSR+VQ L+LSP+RELA+QT
Subjt:  EDKLEFETTEGVEPISSFDQMGIKDDLLRGIYAYGFEKPSAIQQRAVRPIIEGRDVIAQAQSGTGKTSMIALTVCQMVDTSSREVQALILSPTRELATQT

Query:  EKVILAIGDYINIQAHACIGGKSVGEDIRKLEFGVQIVSGTPGRVCDMIKRRTLRTRAIKLLVLDESDEMLSRGFKDQIYDVYRYLPPELQVVLISATLP
        EK I AIG + NIQAHACIGGKS+GEDI+KLE GV  VSGTPGRV DMIKR +L+T+A+KLLVLDESDEMLS+G KDQIYDVYR LP ++QV LISATLP
Subjt:  EKVILAIGDYINIQAHACIGGKSVGEDIRKLEFGVQIVSGTPGRVCDMIKRRTLRTRAIKLLVLDESDEMLSRGFKDQIYDVYRYLPPELQVVLISATLP

Query:  HEILEMTNKFMTDPVRILVKRDELTLEGIKQFFVAVEREEWKFDTLCDLYDTLTITQAVIFCNTKRKVEWLTEKMRSNNFTVSHMHGDMPQRERDAIMGE
         EILEMT KFMTDPVRILVK DELTLEGIKQ++V V++EEWKFDTLCDLY  LTI QA+IFCNT++KV+WLTEKMRS+NF VS MHGD  Q+ERD IM +
Subjt:  HEILEMTNKFMTDPVRILVKRDELTLEGIKQFFVAVEREEWKFDTLCDLYDTLTITQAVIFCNTKRKVEWLTEKMRSNNFTVSHMHGDMPQRERDAIMGE

Query:  FRSGTTRVLITTDVWARGLDVQQAS-LINYDLPNNRELYIHRIGRSGRFGRKGVAINFVKSDDIKILRDIEQYYSTQIDEMPMNVADLI
        FRS  +RVLI +DVWARG+DVQ  S +INYD+PNN ELYIHRIGR+GRFGR+GVAINFVKS D+K L+DIE++Y T+I EMP   ADL+
Subjt:  FRSGTTRVLITTDVWARGLDVQQAS-LINYDLPNNRELYIHRIGRSGRFGRKGVAINFVKSDDIKILRDIEQYYSTQIDEMPMNVADLI

AT1G54270.1 eif4a-26.5e-13965.15Show/hide
Query:  SFDQMGIKDDLLRGIYAYGFEKPSAIQQRAVRPIIEGRDVIAQAQSGTGKTSMIALTVCQMVDTSSREVQALILSPTRELATQTEKVILAIGDYINIQAH
        SFD MG++++LLRGIYAYGFEKPSAIQQR + P  +G DVI QAQSGTGKT+     V Q +D +  + QAL+L+PTRELA Q EKV+ A+GDY  ++ H
Subjt:  SFDQMGIKDDLLRGIYAYGFEKPSAIQQRAVRPIIEGRDVIAQAQSGTGKTSMIALTVCQMVDTSSREVQALILSPTRELATQTEKVILAIGDYINIQAH

Query:  ACIGGKSVGEDIRKLEFGVQIVSGTPGRVCDMIKRRTLRTRAIKLLVLDESDEMLSRGFKDQIYDVYRYLPPELQVVLISATLPHEILEMTNKFMTDPVR
        AC+GG SV ED R L+ GV +V GTPGRV DM++R++LR   IK+ VLDE+DEMLSRGFKDQIYD+++ LPP++QV + SAT+P E LE+T KFM+ PVR
Subjt:  ACIGGKSVGEDIRKLEFGVQIVSGTPGRVCDMIKRRTLRTRAIKLLVLDESDEMLSRGFKDQIYDVYRYLPPELQVVLISATLPHEILEMTNKFMTDPVR

Query:  ILVKRDELTLEGIKQFFVAVEREEWKFDTLCDLYDTLTITQAVIFCNTKRKVEWLTEKMRSNNFTVSHMHGDMPQRERDAIMGEFRSGTTRVLITTDVWA
        ILVKRDELTLEGIKQF+V VE+E+WK +TLCDLY+TL ITQ+VIF NT+RKV+WLT+KMRS + TVS  HGDM Q  RD IM EFRSG++RVLITTD+ A
Subjt:  ILVKRDELTLEGIKQFFVAVEREEWKFDTLCDLYDTLTITQAVIFCNTKRKVEWLTEKMRSNNFTVSHMHGDMPQRERDAIMGEFRSGTTRVLITTDVWA

Query:  RGLDVQQASL-INYDLPNNRELYIHRIGRSGRFGRKGVAINFVKSDDIKILRDIEQYYSTQIDEMPMNVADLI
        RG+DVQQ SL IN+DLP   E Y+HRIGRSGRFGRKGVAINFV  DD ++L DI+++Y+  ++E+P NVADL+
Subjt:  RGLDVQQASL-INYDLPNNRELYIHRIGRSGRFGRKGVAINFVKSDDIKILRDIEQYYSTQIDEMPMNVADLI

AT3G13920.1 eukaryotic translation initiation factor 4A12.0e-14065.95Show/hide
Query:  SFDQMGIKDDLLRGIYAYGFEKPSAIQQRAVRPIIEGRDVIAQAQSGTGKTSMIALTVCQMVDTSSREVQALILSPTRELATQTEKVILAIGDYINIQAH
        SFD MG++++LLRGIYAYGFEKPSAIQQR + P  +G DVI QAQSGTGKT+     V Q +D S  + QAL+L+PTRELA Q EKV+ A+GDY+ ++ H
Subjt:  SFDQMGIKDDLLRGIYAYGFEKPSAIQQRAVRPIIEGRDVIAQAQSGTGKTSMIALTVCQMVDTSSREVQALILSPTRELATQTEKVILAIGDYINIQAH

Query:  ACIGGKSVGEDIRKLEFGVQIVSGTPGRVCDMIKRRTLRTRAIKLLVLDESDEMLSRGFKDQIYDVYRYLPPELQVVLISATLPHEILEMTNKFMTDPVR
        AC+GG SV ED R L+ GV +V GTPGRV DM+KR++LR   IK+ VLDE+DEMLSRGFKDQIYD+++ LPP++QV + SAT+P E LE+T KFM+ PVR
Subjt:  ACIGGKSVGEDIRKLEFGVQIVSGTPGRVCDMIKRRTLRTRAIKLLVLDESDEMLSRGFKDQIYDVYRYLPPELQVVLISATLPHEILEMTNKFMTDPVR

Query:  ILVKRDELTLEGIKQFFVAVEREEWKFDTLCDLYDTLTITQAVIFCNTKRKVEWLTEKMRSNNFTVSHMHGDMPQRERDAIMGEFRSGTTRVLITTDVWA
        ILVKRDELTLEGIKQF+V VE+EEWK +TLCDLY+TL ITQ+VIF NT+RKV+WLT+KMRS + TVS  HGDM Q  RD IM EFRSG++RVLITTD+ A
Subjt:  ILVKRDELTLEGIKQFFVAVEREEWKFDTLCDLYDTLTITQAVIFCNTKRKVEWLTEKMRSNNFTVSHMHGDMPQRERDAIMGEFRSGTTRVLITTDVWA

Query:  RGLDVQQASL-INYDLPNNRELYIHRIGRSGRFGRKGVAINFVKSDDIKILRDIEQYYSTQIDEMPMNVADLI
        RG+DVQQ SL IN+DLP   E Y+HRIGRSGRFGRKGVAINFV  DD ++L DI+++Y+  ++E+P NVADL+
Subjt:  RGLDVQQASL-INYDLPNNRELYIHRIGRSGRFGRKGVAINFVKSDDIKILRDIEQYYSTQIDEMPMNVADLI

AT3G13920.3 eukaryotic translation initiation factor 4A12.0e-14065.95Show/hide
Query:  SFDQMGIKDDLLRGIYAYGFEKPSAIQQRAVRPIIEGRDVIAQAQSGTGKTSMIALTVCQMVDTSSREVQALILSPTRELATQTEKVILAIGDYINIQAH
        SFD MG++++LLRGIYAYGFEKPSAIQQR + P  +G DVI QAQSGTGKT+     V Q +D S  + QAL+L+PTRELA Q EKV+ A+GDY+ ++ H
Subjt:  SFDQMGIKDDLLRGIYAYGFEKPSAIQQRAVRPIIEGRDVIAQAQSGTGKTSMIALTVCQMVDTSSREVQALILSPTRELATQTEKVILAIGDYINIQAH

Query:  ACIGGKSVGEDIRKLEFGVQIVSGTPGRVCDMIKRRTLRTRAIKLLVLDESDEMLSRGFKDQIYDVYRYLPPELQVVLISATLPHEILEMTNKFMTDPVR
        AC+GG SV ED R L+ GV +V GTPGRV DM+KR++LR   IK+ VLDE+DEMLSRGFKDQIYD+++ LPP++QV + SAT+P E LE+T KFM+ PVR
Subjt:  ACIGGKSVGEDIRKLEFGVQIVSGTPGRVCDMIKRRTLRTRAIKLLVLDESDEMLSRGFKDQIYDVYRYLPPELQVVLISATLPHEILEMTNKFMTDPVR

Query:  ILVKRDELTLEGIKQFFVAVEREEWKFDTLCDLYDTLTITQAVIFCNTKRKVEWLTEKMRSNNFTVSHMHGDMPQRERDAIMGEFRSGTTRVLITTDVWA
        ILVKRDELTLEGIKQF+V VE+EEWK +TLCDLY+TL ITQ+VIF NT+RKV+WLT+KMRS + TVS  HGDM Q  RD IM EFRSG++RVLITTD+ A
Subjt:  ILVKRDELTLEGIKQFFVAVEREEWKFDTLCDLYDTLTITQAVIFCNTKRKVEWLTEKMRSNNFTVSHMHGDMPQRERDAIMGEFRSGTTRVLITTDVWA

Query:  RGLDVQQASL-INYDLPNNRELYIHRIGRSGRFGRKGVAINFVKSDDIKILRDIEQYYSTQIDEMPMNVADLI
        RG+DVQQ SL IN+DLP   E Y+HRIGRSGRFGRKGVAINFV  DD ++L DI+++Y+  ++E+P NVADL+
Subjt:  RGLDVQQASL-INYDLPNNRELYIHRIGRSGRFGRKGVAINFVKSDDIKILRDIEQYYSTQIDEMPMNVADLI

AT3G19760.1 eukaryotic initiation factor 4A-III1.6e-19888.17Show/hide
Query:  EDKLEFETTEGVEPISSFDQMGIKDDLLRGIYAYGFEKPSAIQQRAVRPIIEGRDVIAQAQSGTGKTSMIALTVCQMVDTSSREVQALILSPTRELATQT
        +DKL FETT+G+EPI+SF+ MGIK+D+LRG+Y YGFEKPSAIQQRAV PI++GRDVIAQAQSGTGKTSMIAL+VCQ+VDTSSREVQALILSPTRELATQT
Subjt:  EDKLEFETTEGVEPISSFDQMGIKDDLLRGIYAYGFEKPSAIQQRAVRPIIEGRDVIAQAQSGTGKTSMIALTVCQMVDTSSREVQALILSPTRELATQT

Query:  EKVILAIGDYINIQAHACIGGKSVGEDIRKLEFGVQIVSGTPGRVCDMIKRRTLRTRAIKLLVLDESDEMLSRGFKDQIYDVYRYLPPELQVVLISATLP
        EK I AIG + NIQAHACIGG SVGEDIRKLE GV +VSGTPGRVCDMIKRR+LRTRAIKLL+LDESDEMLSRGFKDQIYDVYRYLPP+LQV L+SATLP
Subjt:  EKVILAIGDYINIQAHACIGGKSVGEDIRKLEFGVQIVSGTPGRVCDMIKRRTLRTRAIKLLVLDESDEMLSRGFKDQIYDVYRYLPPELQVVLISATLP

Query:  HEILEMTNKFMTDPVRILVKRDELTLEGIKQFFVAVEREEWKFDTLCDLYDTLTITQAVIFCNTKRKVEWLTEKMRSNNFTVSHMHGDMPQRERDAIMGE
        HEILEMT+KFMT+PV+ILVKRDELTLEGIKQFFVAVE+EEWKFDTLCDLYDTLTITQAVIFCNTKRKV++L+EKMRS+NFTVS MHGDMPQ+ERDAIM E
Subjt:  HEILEMTNKFMTDPVRILVKRDELTLEGIKQFFVAVEREEWKFDTLCDLYDTLTITQAVIFCNTKRKVEWLTEKMRSNNFTVSHMHGDMPQRERDAIMGE

Query:  FRSGTTRVLITTDVWARGLDVQQASL-INYDLPNNRELYIHRIGRSGRFGRKGVAINFVKSDDIKILRDIEQYYSTQIDEMPMNVADLI
        FRSG +RVLITTDVWARG+DVQQ SL INYDLPNNRELYIHRIGRSGRFGRKGVAINFVKSDDIKILRDIEQYYSTQIDEMPMNVADLI
Subjt:  FRSGTTRVLITTDVWARGLDVQQASL-INYDLPNNRELYIHRIGRSGRFGRKGVAINFVKSDDIKILRDIEQYYSTQIDEMPMNVADLI


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGCGGCCGCAGCTACGACAAGCGTTGTGCCGCCTAATCGACGGCGATCAATTAATGCGCCGGAAGACAAGTTGGAATTCGAGACGACGGAGGGGGTTGAGCCGATCTC
GAGTTTCGATCAGATGGGCATTAAGGACGATCTTCTCCGTGGAATATATGCATACGGGTTCGAGAAGCCCTCGGCCATTCAGCAGAGAGCCGTGAGACCGATTATCGAGG
GGCGAGATGTCATTGCTCAGGCCCAGTCTGGAACAGGCAAGACGTCCATGATTGCCCTTACCGTTTGCCAAATGGTTGATACATCGAGTAGAGAGGTACAGGCCTTGATC
TTGTCCCCTACGAGAGAATTGGCAACTCAGACAGAGAAAGTAATATTGGCCATTGGCGACTACATTAATATACAAGCACACGCTTGCATTGGCGGCAAAAGTGTAGGTGA
AGATATCAGGAAGCTCGAGTTTGGAGTTCAGATTGTATCAGGAACTCCTGGAAGAGTCTGTGACATGATCAAGAGAAGGACATTGCGTACCAGAGCCATTAAGTTGTTAG
TTCTGGATGAGTCTGACGAGATGTTGAGCAGAGGGTTTAAAGACCAGATTTATGATGTGTATAGATATCTCCCACCAGAACTTCAGGTTGTCTTGATTTCTGCTACCCTT
CCTCATGAAATCCTGGAGATGACAAACAAGTTCATGACGGATCCTGTGAGAATCCTTGTCAAGCGTGATGAGTTAACTTTGGAGGGTATTAAGCAATTCTTCGTTGCAGT
TGAAAGGGAAGAGTGGAAGTTTGATACCTTATGTGATCTTTATGACACCTTGACTATCACTCAAGCTGTAATTTTCTGTAACACTAAGCGGAAGGTTGAATGGTTAACTG
AGAAGATGCGTAGTAATAACTTCACAGTTTCACATATGCATGGGGACATGCCTCAGAGGGAAAGAGATGCAATCATGGGGGAGTTCCGATCAGGAACTACTCGTGTCCTA
ATCACCACTGATGTTTGGGCACGAGGGCTTGATGTTCAGCAGGCAAGTTTGATAAACTACGACCTTCCAAACAATCGAGAACTTTACATTCACAGGATAGGAAGATCTGG
TCGGTTTGGGCGCAAGGGTGTTGCCATTAACTTTGTGAAAAGCGATGACATAAAGATCCTGAGAGATATTGAGCAGTATTACAGTACCCAGATTGATGAGATGCCCATGA
ACGTTGCTGATTTGATT
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGGCGGCCGCAGCTACGACAAGCGTTGTGCCGCCTAATCGACGGCGATCAATTAATGCGCCGGAAGACAAGTTGGAATTCGAGACGACGGAGGGGGTTGAGCCGATCTC
GAGTTTCGATCAGATGGGCATTAAGGACGATCTTCTCCGTGGAATATATGCATACGGGTTCGAGAAGCCCTCGGCCATTCAGCAGAGAGCCGTGAGACCGATTATCGAGG
GGCGAGATGTCATTGCTCAGGCCCAGTCTGGAACAGGCAAGACGTCCATGATTGCCCTTACCGTTTGCCAAATGGTTGATACATCGAGTAGAGAGGTACAGGCCTTGATC
TTGTCCCCTACGAGAGAATTGGCAACTCAGACAGAGAAAGTAATATTGGCCATTGGCGACTACATTAATATACAAGCACACGCTTGCATTGGCGGCAAAAGTGTAGGTGA
AGATATCAGGAAGCTCGAGTTTGGAGTTCAGATTGTATCAGGAACTCCTGGAAGAGTCTGTGACATGATCAAGAGAAGGACATTGCGTACCAGAGCCATTAAGTTGTTAG
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TGAAAGGGAAGAGTGGAAGTTTGATACCTTATGTGATCTTTATGACACCTTGACTATCACTCAAGCTGTAATTTTCTGTAACACTAAGCGGAAGGTTGAATGGTTAACTG
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TCGGTTTGGGCGCAAGGGTGTTGCCATTAACTTTGTGAAAAGCGATGACATAAAGATCCTGAGAGATATTGAGCAGTATTACAGTACCCAGATTGATGAGATGCCCATGA
ACGTTGCTGATTTGATT
Protein sequenceShow/hide protein sequence
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