; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

MS007291 (gene) of Bitter gourd (TR) v1 genome

Gene IDMS007291
OrganismMomordica charantia cv. TR (Bitter gourd (TR) v1)
DescriptionDNA double-strand break repair Rad50 ATPase
Genome locationscaffold25:2060438..2061995
RNA-Seq ExpressionMS007291
SyntenyMS007291
Gene Ontology termsNA
InterPro domainsNA


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
XP_022150735.1 uncharacterized protein LOC111018794 [Momordica charantia]2.9e-90100Show/hide
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XP_022938309.1 uncharacterized protein LOC111444445 [Cucurbita moschata]8.9e-7180.11Show/hide
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XP_023537979.1 uncharacterized protein LOC111798860 [Cucurbita pepo subsp. pepo]3.0e-7179.78Show/hide
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XP_038887975.1 uncharacterized protein LOC120077932 isoform X1 [Benincasa hispida]1.2e-7281.03Show/hide
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XP_038887977.1 uncharacterized protein LOC120077932 isoform X2 [Benincasa hispida]1.2e-7281.03Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A1S3C033 uncharacterized protein LOC103495347 isoform X19.6e-7179.31Show/hide
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        EEATVP +KLDAN+YAL MGI+K M+KK++IMQEKIISGLSLKSSSGELETYC+MWSL+PYIDD I+  AWKLV
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A0A1S3C0U3 uncharacterized protein LOC103495347 isoform X39.6e-7179.31Show/hide
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A0A1S4E157 uncharacterized protein LOC103495347 isoform X29.6e-7179.31Show/hide
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A0A6J1D9B8 uncharacterized protein LOC1110187941.4e-90100Show/hide
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A0A6J1FDP7 uncharacterized protein LOC1114444454.3e-7180.11Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT3G49645.1 unknown protein3.2e-4251.72Show/hide
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        L+RP I  SSKLIE++I+ N T  LKSY EAGCIN HD  QST+ LHT   GL DHL KA++L+ ELE L + A +A+E+     + S+   + V  DEE
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          TV   +  +  EYA  + +I  M+K++Y+MQ+KI+  LSLKSSSGELETY +MWSLRP+++DEI+ RAWK +
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
GAGCTTCTTCGACGACCTGCTATAAATAGATCATCAAAATTGATTGAGGATGTCATAGAAACTAACAATACGGAGAATCTTAAATCATACTTTGAAGCTGGATGCATCAA
CACTCATGATGGTGTCCAAAGTACAAAAAAGTTGCATACATGCCGGATTGGACTGGATGATCATTTGAAAAAAGCAAGGAGCTTAATTGATGAACTCGAACACCTACTCA
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mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
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DANEYALFMGIIKFMVKKDYIMQEKIISGLSLKSSSGELETYCVMWSLRPYIDDEIIRRAWKLV