; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

MS007641 (gene) of Bitter gourd (TR) v1 genome

Gene IDMS007641
OrganismMomordica charantia cv. TR (Bitter gourd (TR) v1)
DescriptionAAI domain-containing protein
Genome locationscaffold13:114733..115829
RNA-Seq ExpressionMS007641
SyntenyMS007641
Gene Ontology termsNA
InterPro domainsIPR016140 - Bifunctional inhibitor/plant lipid transfer protein/seed storage helical domain
IPR036312 - Bifunctional inhibitor/plant lipid transfer protein/seed storage helical domain superfamily


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG6574972.1 hypothetical protein SDJN03_25611, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]5.9e-6471.64Show/hide
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        G   E +SSL+S+C+AS+TLPPLQS+KIPGI+EPDSP +++TP P   ++ PPS +VS   P  PADE PPSPSSATAKG    +DCIGLFL GS LFL+
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KAG7013541.1 hypothetical protein SDJN02_23707, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]1.9e-6272.4Show/hide
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        G   E +SSL+S+C+AS+TLPPLQS+KIPGI+EPDSP +++TP P   ++ PPS +VS   P  PADE PPSPSSATAKG    +DCIGLFL
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XP_022138533.1 uncharacterized protein LOC111009674 [Momordica charantia]3.9e-10099.5Show/hide
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XP_022959376.1 uncharacterized protein LOC111460365 [Cucurbita moschata]9.1e-6572.14Show/hide
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        SLIA LT SM++VAM   SP TGCTTRELLLLSPCLPFISAPPNNLSD+VPS+CC+AFSSAY S GGICLCYFLR+PQILGFPLN++KLIALSS+CPLS 
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        G   E +SSL+S+C+AS+TLPPLQS+KIPGI+EPDSP +++TP P   ++ PPS +VSP     PADE PPSPSSATAKG    +DCIGLFL GS LFL+
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XP_038874252.1 non-specific lipid transfer protein GPI-anchored 25 [Benincasa hispida]6.7e-6872.81Show/hide
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        MAAII +V         L+AFLT SM+VVAMS   P TGC TRELLLLSPCLPFISAPPNNLSDTVPSACC+AFSSAY S GGICLCYFLREPQILGFPL
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        N +KLIALSS CPL   SG+  E  SSL+SICAAS+TLPPL S++IP I+EPDSP D++ PAP  GL  PPSA VSPSAPADEPPPS SSAT K     K
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        DCIGLF  GS LFLIHI
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0K7D4 AAI domain-containing protein2.9e-5673.37Show/hide
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        M+VVAM   SP TGCTTRELLLLSPCLPFISAPPNNLSDTVPS CCDAFSSAY + GGICLCYFLREPQILGFPLN +K +ALSS CPL   +G+  E +
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        SSL+S+CAASQTLPPLQS++IP I+EPDSP D++   P  GL  PP+AIVSPSAPA++P P PSSATA+
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A0A1S3BHM9 uncharacterized protein LOC1034896795.9e-6272.54Show/hide
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        M+VVAM   SP  GCTTRELLLLSPCLPFISAPPNNLSDTVPS CCDAFSSAY + GGICLCYFLREPQILGFPLN +KLIALSS CP    +G+  E +
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        SSL+S+CAASQTLPPLQS++IP I+EPDSP D++T     GL  PP+AIVSPSAPAD+P P PSSATA+     K+CIGLF  GS LFLIHIL
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A0A5D3D2B0 Non-specific lipid transfer protein GPI-anchored 2-like5.9e-6272.54Show/hide
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        M+VVAM   SP  GCTTRELLLLSPCLPFISAPPNNLSDTVPS CCDAFSSAY + GGICLCYFLREPQILGFPLN +KLIALSS CP    +G+  E +
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        SSL+S+CAASQTLPPLQS++IP I+EPDSP D++T     GL  PP+AIVSPSAPAD+P P PSSATA+     K+CIGLF  GS LFLIHIL
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A0A6J1CD91 uncharacterized protein LOC1110096741.9e-10099.5Show/hide
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        G
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A0A6J1H4P5 uncharacterized protein LOC1114603654.4e-6572.14Show/hide
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        G   E +SSL+S+C+AS+TLPPLQS+KIPGI+EPDSP +++TP P   ++ PPS +VSP     PADE PPSPSSATAKG    +DCIGLFL GS LFL+
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
F4JIG1 Non-specific lipid transfer protein GPI-anchored 253.7e-2140.12Show/hide
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        V+ +  A S+  PV  C T EL++ SPCLP++S+PPNN+S+T    CC  F+S+  S+ G CLCY LR+P ILGFPL+ S+LI+LS +C        +  
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        S  S+C+ S++  LPPLQS +              P S D     +P + L  P +A ++P  P   PPP P
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT4G14805.1 Bifunctional inhibitor/lipid-transfer protein/seed storage 2S albumin superfamily protein2.7e-2240.12Show/hide
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        V+ +  A S+  PV  C T EL++ SPCLP++S+PPNN+S+T    CC  F+S+  S+ G CLCY LR+P ILGFPL+ S+LI+LS +C        +  
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Query:  SLNSICAASQT--LPPLQSAKIPG--------IEEPDSPDDDDTPAPGTGLSPPPSAIVSPSAPADEPPPSP
        S  S+C+ S++  LPPLQS +              P S D     +P + L  P +A ++P  P   PPP P
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGCGGCGATAATTGGCGTCGTGAACGCGGCTATGCCGCTCTTTCTTTCGTTGATCGCGTTTCTCACGGTGTCGATGTCGGTGGTTGCGATGTCGGCACGGTCTCCGGT
GACGGGATGCACCACCAGAGAGCTGCTCTTGCTCTCACCATGCTTGCCGTTCATCTCTGCTCCGCCAAACAATCTTTCGGACACGGTTCCCTCCGCCTGCTGCGACGCAT
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CTTTGTCCTCTCAGTGGAGTGCTTTCCGAGAATCATAGTTCTCTGAACTCGATCTGCGCTGCTTCACAGACTCTGCCTCCCCTTCAAAGCGCGAAGATTCCAGGAATCGA
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mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
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Protein sequenceShow/hide protein sequence
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LCPLSGVLSENHSSLNSICAASQTLPPLQSAKIPGIEEPDSPDDDDTPAPGTGLSPPPSAIVSPSAPADEPPPSPSSATAKGLPAIKDCIGLFLPGSLLFLIHILFH