; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

MS007750 (gene) of Bitter gourd (TR) v1 genome

Gene IDMS007750
OrganismMomordica charantia cv. TR (Bitter gourd (TR) v1)
Descriptioncysteine-rich repeat secretory protein 3-like
Genome locationscaffold13:1005762..1006958
RNA-Seq ExpressionMS007750
SyntenyMS007750
Gene Ontology termsGO:0010497 - plasmodesmata-mediated intercellular transport (biological process)
GO:0046739 - transport of virus in multicellular host (biological process)
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GO:0016021 - integral component of membrane (cellular component)
InterPro domainsIPR002902 - Gnk2-homologous domain
IPR038408 - Gnk2-homologous domain superfamily


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG6593812.1 Plasmodesmata-located protein 2, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]1.1e-14890.97Show/hide
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A0A1S3CD12 cysteine-rich repeat secretory protein 3-like6.7e-14989.9Show/hide
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A0A5A7SL80 Cysteine-rich repeat secretory protein 3-like6.7e-14989.9Show/hide
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A0A6J1KG34 cysteine-rich repeat secretory protein 3-like2.0e-14890.91Show/hide
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O22784 Plasmodesmata-located protein 31.3e-11266.67Show/hide
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Q0WPN8 Plasmodesmata-located protein 71.8e-2932.39Show/hide
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Q6NKQ9 Plasmodesmata-located protein 82.4e-2630.66Show/hide
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Q6NM73 Plasmodesmata-located protein 26.1e-11574.64Show/hide
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        LYE  GF+QISG EMLFKTCG  NIAG+GFEERRDT   V++NGVVSGHGFY T Y+S+YVLGQCEGD+GD+DC  CVK+A+++AQVECGSSISGQ+YLH
Subjt:  LYEFPGFAQISGFEMLFKTCGATNIAGSGFEERRDTGLSVLENGVVSGHGFYTTNYQSLYVLGQCEGDLGDSDCGECVKHAVQRAQVECGSSISGQLYLH

Query:  KCFISYSYYPNGVPRRSSSPSSSSSISSS------PSGMGQNTGKTVAVILGGAAGVGFLVICLLFIRGL-KKKHD
        KCFI+YSYYPNGVPRRSSS SSSSS SSS      PS     TGKTVA+I+GGAAGVGFLVICLLF + L +KKHD
Subjt:  KCFISYSYYPNGVPRRSSSPSSSSSISSS------PSGMGQNTGKTVAVILGGAAGVGFLVICLLFIRGL-KKKHD

Q8GXV7 Plasmodesmata-located protein 11.5e-6847.49Show/hide
Query:  FFLFFLVSLSSLVQSGPDYTTLIYKGCAKQGFSDPNGVYSQALAALFGSLVSQSAKGSRFFKTTAGTAQ-SAITGLFQCRGDLTSSDCYNCVSKLPELAD
        FF+F+       +    DY  LI+KGCA Q   DP GV+SQ L  LF SLVSQS++ S F   T+GT   +A+ G+FQCRGDL ++ CY+CVSK+P+L  
Subjt:  FFLFFLVSLSSLVQSGPDYTTLIYKGCAKQGFSDPNGVYSQALAALFGSLVSQSAKGSRFFKTTAGTAQ-SAITGLFQCRGDLTSSDCYNCVSKLPELAD

Query:  SLC------GKTIAARVQLSGCYLLYEFPGFAQISGFEMLFKTCGATNIAGSGFEERRDTGLSVLENGVVSGH--------GFYTTNYQSLYVLGQCEGD
         LC      G  +AARV L+GCY+ YE  GF Q SG EMLF+ CG  +    GF  +R+T   + ENGV +G         GFY   Y+S+YVLGQCEG 
Subjt:  SLC------GKTIAARVQLSGCYLLYEFPGFAQISGFEMLFKTCGATNIAGSGFEERRDTGLSVLENGVVSGH--------GFYTTNYQSLYVLGQCEGD

Query:  LGDSDCGECVKHAVQRAQVECGSSISGQLYLHKCFISYSYYPNGVPRRSSSPSSSSSISSSPSGMGQNTGKTVAVILGGAAGVGFLVICLLFIRGLKKK
        LG+SDCGECVK   ++A+ ECG S SGQ+YL KCF+SYSYY +GVP  +  P S            Q+T +T+A+ +GG   +GF+++CLL +R   KK
Subjt:  LGDSDCGECVKHAVQRAQVECGSSISGQLYLHKCFISYSYYPNGVPRRSSSPSSSSSISSSPSGMGQNTGKTVAVILGGAAGVGFLVICLLFIRGLKKK

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G04520.1 plasmodesmata-located protein 24.3e-11674.64Show/hide
Query:  DYTTLIYKGCAKQGFSDPNGVYSQALAALFGSLVSQSAKGSRFFKTTAGTAQSAITGLFQCRGDLTSSDCYNCVSKLPELADSLCGKTIAARVQLSGCYL
        +YTTLIYKGCA+Q FSDP+G+YSQAL+A+FGSLVSQS K +RF+KTT GT+ + ITGLFQCRGDL++ DCYNCVS+LP L+D LCGKTIA+RVQLSGCYL
Subjt:  DYTTLIYKGCAKQGFSDPNGVYSQALAALFGSLVSQSAKGSRFFKTTAGTAQSAITGLFQCRGDLTSSDCYNCVSKLPELADSLCGKTIAARVQLSGCYL

Query:  LYEFPGFAQISGFEMLFKTCGATNIAGSGFEERRDTGLSVLENGVVSGHGFYTTNYQSLYVLGQCEGDLGDSDCGECVKHAVQRAQVECGSSISGQLYLH
        LYE  GF+QISG EMLFKTCG  NIAG+GFEERRDT   V++NGVVSGHGFY T Y+S+YVLGQCEGD+GD+DC  CVK+A+++AQVECGSSISGQ+YLH
Subjt:  LYEFPGFAQISGFEMLFKTCGATNIAGSGFEERRDTGLSVLENGVVSGHGFYTTNYQSLYVLGQCEGDLGDSDCGECVKHAVQRAQVECGSSISGQLYLH

Query:  KCFISYSYYPNGVPRRSSSPSSSSSISSS------PSGMGQNTGKTVAVILGGAAGVGFLVICLLFIRGL-KKKHD
        KCFI+YSYYPNGVPRRSSS SSSSS SSS      PS     TGKTVA+I+GGAAGVGFLVICLLF + L +KKHD
Subjt:  KCFISYSYYPNGVPRRSSSPSSSSSISSS------PSGMGQNTGKTVAVILGGAAGVGFLVICLLFIRGL-KKKHD

AT2G33330.1 plasmodesmata-located protein 39.1e-11466.67Show/hide
Query:  MGFHSKPSFFFLFFLV-----SLSSLVQSGPDYTTLIYKGCAKQGFSDPNGVYSQALAALFGSLVSQSAKGSRFFKTTAG-TAQSAITGLFQCRGDLTSS
        MGF+S      L+ ++      L     S P+YT LIYKGCA+Q  SDP+G+YSQAL+A++G LV+QS K +RF+KTT G T+Q+++TGLFQCRGDL+++
Subjt:  MGFHSKPSFFFLFFLV-----SLSSLVQSGPDYTTLIYKGCAKQGFSDPNGVYSQALAALFGSLVSQSAKGSRFFKTTAG-TAQSAITGLFQCRGDLTSS

Query:  DCYNCVSKLPELADSLCGKTIAARVQLSGCYLLYEFPGFAQISGFEMLFKTCGATNIAGSGFEERRDTGLSVLENGVVSGHGFYTTNYQSLYVLGQCEGD
        DCYNCVS+LP L+  LCGKTIAARVQLSGCYLLYE  GFAQISG E+LFKTCG  N+AG+GFE+RRDT   V++NGVV GHGFY T Y+S+YVLGQCEGD
Subjt:  DCYNCVSKLPELADSLCGKTIAARVQLSGCYLLYEFPGFAQISGFEMLFKTCGATNIAGSGFEERRDTGLSVLENGVVSGHGFYTTNYQSLYVLGQCEGD

Query:  LGDSDCGECVKHAVQRAQVECGSSISGQLYLHKCFISYSYYPNGVPRRSSS-PSSSSSISSSPSGMGQNTGKTVAVILGGAAGVGFLVICLLFIRGL-KK
        +GDSDC  C+K+A+QRAQVECGSSISGQ+YLHKCF+ YS+YPNGVP+RSS  PSS SS SSS S     TGKTVA+I+GG AGVGFLVICLLF++ L KK
Subjt:  LGDSDCGECVKHAVQRAQVECGSSISGQLYLHKCFISYSYYPNGVPRRSSS-PSSSSSISSSPSGMGQNTGKTVAVILGGAAGVGFLVICLLFIRGL-KK

Query:  KHD
        K+D
Subjt:  KHD

AT5G37660.1 plasmodesmata-located protein 71.3e-3032.39Show/hide
Query:  SFFFLFFLVSLSSLVQSGPDYTTLIYKGCAKQGFSDPNGVYSQALAALFGSLVSQSAKGSRFFKTTAGTAQS-AITGLFQCRGDLTSSDCYNCVSKLPEL
        S FF     +  SL  +     T ++ GC++Q FS P   Y   L +L  SLV+ +   S    T  G++ S    GLFQCRGDL+  DC  CV++    
Subjt:  SFFFLFFLVSLSSLVQSGPDYTTLIYKGCAKQGFSDPNGVYSQALAALFGSLVSQSAKGSRFFKTTAGTAQS-AITGLFQCRGDLTSSDCYNCVSKLPEL

Query:  ADSLCGKTIAARVQLSGCYLLYEFPGFAQISGFEMLFKTCGATNIAGSGFEERRDTGLSVLENGVVSGHGFYTTNYQSLYVLGQCEGDLGDSDCGECVKH
           LC  T    +QL+GCY+ Y+   F       ++ K CG++    +    RRD  L+ L NG   G  F       +  +GQC GDL  S+C +C+  
Subjt:  ADSLCGKTIAARVQLSGCYLLYEFPGFAQISGFEMLFKTCGATNIAGSGFEERRDTGLSVLENGVVSGHGFYTTNYQSLYVLGQCEGDLGDSDCGECVKH

Query:  AVQRAQVECGSSISGQLYLHKCFISYSYYPNGVPRRSSSPSSSSSISSSPSGMGQNTGKTVAVILGGAAGVGFLVICLLFIRGL
        A+ R + +CG+++ G ++L KC+  YS   +G    + S +  ++             KT A+I+G  A V  L+I LLF+RG+
Subjt:  AVQRAQVECGSSISGQLYLHKCFISYSYYPNGVPRRSSSPSSSSSISSSPSGMGQNTGKTVAVILGGAAGVGFLVICLLFIRGL

AT5G37660.2 plasmodesmata-located protein 71.3e-3032.39Show/hide
Query:  SFFFLFFLVSLSSLVQSGPDYTTLIYKGCAKQGFSDPNGVYSQALAALFGSLVSQSAKGSRFFKTTAGTAQS-AITGLFQCRGDLTSSDCYNCVSKLPEL
        S FF     +  SL  +     T ++ GC++Q FS P   Y   L +L  SLV+ +   S    T  G++ S    GLFQCRGDL+  DC  CV++    
Subjt:  SFFFLFFLVSLSSLVQSGPDYTTLIYKGCAKQGFSDPNGVYSQALAALFGSLVSQSAKGSRFFKTTAGTAQS-AITGLFQCRGDLTSSDCYNCVSKLPEL

Query:  ADSLCGKTIAARVQLSGCYLLYEFPGFAQISGFEMLFKTCGATNIAGSGFEERRDTGLSVLENGVVSGHGFYTTNYQSLYVLGQCEGDLGDSDCGECVKH
           LC  T    +QL+GCY+ Y+   F       ++ K CG++    +    RRD  L+ L NG   G  F       +  +GQC GDL  S+C +C+  
Subjt:  ADSLCGKTIAARVQLSGCYLLYEFPGFAQISGFEMLFKTCGATNIAGSGFEERRDTGLSVLENGVVSGHGFYTTNYQSLYVLGQCEGDLGDSDCGECVKH

Query:  AVQRAQVECGSSISGQLYLHKCFISYSYYPNGVPRRSSSPSSSSSISSSPSGMGQNTGKTVAVILGGAAGVGFLVICLLFIRGL
        A+ R + +CG+++ G ++L KC+  YS   +G    + S +  ++             KT A+I+G  A V  L+I LLF+RG+
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AT5G43980.1 plasmodesmata-located protein 11.0e-6947.49Show/hide
Query:  FFLFFLVSLSSLVQSGPDYTTLIYKGCAKQGFSDPNGVYSQALAALFGSLVSQSAKGSRFFKTTAGTAQ-SAITGLFQCRGDLTSSDCYNCVSKLPELAD
        FF+F+       +    DY  LI+KGCA Q   DP GV+SQ L  LF SLVSQS++ S F   T+GT   +A+ G+FQCRGDL ++ CY+CVSK+P+L  
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Query:  SLC------GKTIAARVQLSGCYLLYEFPGFAQISGFEMLFKTCGATNIAGSGFEERRDTGLSVLENGVVSGH--------GFYTTNYQSLYVLGQCEGD
         LC      G  +AARV L+GCY+ YE  GF Q SG EMLF+ CG  +    GF  +R+T   + ENGV +G         GFY   Y+S+YVLGQCEG 
Subjt:  SLC------GKTIAARVQLSGCYLLYEFPGFAQISGFEMLFKTCGATNIAGSGFEERRDTGLSVLENGVVSGH--------GFYTTNYQSLYVLGQCEGD

Query:  LGDSDCGECVKHAVQRAQVECGSSISGQLYLHKCFISYSYYPNGVPRRSSSPSSSSSISSSPSGMGQNTGKTVAVILGGAAGVGFLVICLLFIRGLKKK
        LG+SDCGECVK   ++A+ ECG S SGQ+YL KCF+SYSYY +GVP  +  P S            Q+T +T+A+ +GG   +GF+++CLL +R   KK
Subjt:  LGDSDCGECVKHAVQRAQVECGSSISGQLYLHKCFISYSYYPNGVPRRSSSPSSSSSISSSPSGMGQNTGKTVAVILGGAAGVGFLVICLLFIRGLKKK


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGGTTTTCACTCCAAACCCTCATTCTTCTTCTTATTCTTCCTCGTTTCCCTCTCTTCTTTGGTCCAATCTGGCCCCGATTACACCACATTGATCTACAAGGGCTGCGC
CAAGCAAGGATTCTCAGATCCGAACGGCGTTTACTCCCAAGCCCTCGCCGCCCTCTTCGGCTCTCTCGTTTCCCAATCCGCCAAAGGCTCCAGGTTCTTCAAAACCACCG
CCGGCACCGCCCAATCCGCCATCACCGGACTCTTCCAGTGCCGTGGGGACCTCACCAGCTCCGATTGCTACAACTGCGTCAGCAAACTCCCCGAATTGGCCGATAGTCTC
TGCGGCAAAACCATCGCCGCCAGAGTCCAGCTCTCCGGCTGCTATTTGCTCTACGAGTTTCCTGGGTTTGCCCAGATTTCAGGGTTCGAAATGCTGTTCAAAACTTGTGG
GGCAACGAATATTGCCGGAAGTGGGTTTGAGGAGAGGAGGGACACGGGGCTATCCGTGTTGGAGAATGGAGTGGTGAGTGGCCATGGATTCTACACCACTAACTATCAAT
CTCTGTATGTTTTGGGGCAATGCGAGGGAGATTTGGGGGATTCTGATTGTGGTGAGTGTGTGAAGCATGCTGTTCAGAGAGCTCAGGTTGAATGTGGGAGCTCAATTTCA
GGGCAACTTTATTTGCACAAATGCTTCATCAGTTACAGTTACTACCCAAATGGGGTTCCGAGGAGATCTTCCTCTCCTTCATCTTCCTCATCAATTTCCTCATCTCCATC
AGGAATGGGGCAAAACACAGGGAAAACAGTGGCCGTGATATTAGGAGGGGCAGCAGGAGTGGGATTTCTGGTCATCTGCTTGCTTTTCATCAGAGGTTTGAAGAAGAAAC
ATGACGGTATGCAT
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGGGTTTTCACTCCAAACCCTCATTCTTCTTCTTATTCTTCCTCGTTTCCCTCTCTTCTTTGGTCCAATCTGGCCCCGATTACACCACATTGATCTACAAGGGCTGCGC
CAAGCAAGGATTCTCAGATCCGAACGGCGTTTACTCCCAAGCCCTCGCCGCCCTCTTCGGCTCTCTCGTTTCCCAATCCGCCAAAGGCTCCAGGTTCTTCAAAACCACCG
CCGGCACCGCCCAATCCGCCATCACCGGACTCTTCCAGTGCCGTGGGGACCTCACCAGCTCCGATTGCTACAACTGCGTCAGCAAACTCCCCGAATTGGCCGATAGTCTC
TGCGGCAAAACCATCGCCGCCAGAGTCCAGCTCTCCGGCTGCTATTTGCTCTACGAGTTTCCTGGGTTTGCCCAGATTTCAGGGTTCGAAATGCTGTTCAAAACTTGTGG
GGCAACGAATATTGCCGGAAGTGGGTTTGAGGAGAGGAGGGACACGGGGCTATCCGTGTTGGAGAATGGAGTGGTGAGTGGCCATGGATTCTACACCACTAACTATCAAT
CTCTGTATGTTTTGGGGCAATGCGAGGGAGATTTGGGGGATTCTGATTGTGGTGAGTGTGTGAAGCATGCTGTTCAGAGAGCTCAGGTTGAATGTGGGAGCTCAATTTCA
GGGCAACTTTATTTGCACAAATGCTTCATCAGTTACAGTTACTACCCAAATGGGGTTCCGAGGAGATCTTCCTCTCCTTCATCTTCCTCATCAATTTCCTCATCTCCATC
AGGAATGGGGCAAAACACAGGGAAAACAGTGGCCGTGATATTAGGAGGGGCAGCAGGAGTGGGATTTCTGGTCATCTGCTTGCTTTTCATCAGAGGTTTGAAGAAGAAAC
ATGACGGTATGCAT
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MGFHSKPSFFFLFFLVSLSSLVQSGPDYTTLIYKGCAKQGFSDPNGVYSQALAALFGSLVSQSAKGSRFFKTTAGTAQSAITGLFQCRGDLTSSDCYNCVSKLPELADSL
CGKTIAARVQLSGCYLLYEFPGFAQISGFEMLFKTCGATNIAGSGFEERRDTGLSVLENGVVSGHGFYTTNYQSLYVLGQCEGDLGDSDCGECVKHAVQRAQVECGSSIS
GQLYLHKCFISYSYYPNGVPRRSSSPSSSSSISSSPSGMGQNTGKTVAVILGGAAGVGFLVICLLFIRGLKKKHDGMH