CuGenDBv2

Gene ID	MS008367
Organism	Momordica charantia cv. TR (Bitter gourd (TR) v1)
Description	t-SNARE coiled-coil homology domain-containing protein
Genome location	scaffold4:879878..883643
RNA-Seq Expression	MS008367
Synteny	MS008367
Gene Ontology terms	GO:0015031 - protein transport (biological process) GO:0030173 - integral component of Golgi membrane (cellular component)
InterPro domains	IPR000727 - Target SNARE coiled-coil homology domain IPR039897 - BET1-like protein

Homology

Show/hide homology

GenBank top hits

e value

%identity

Alignment

XP_008466185.1 PREDICTED: bet1-like protein At1g29060 [Cucumis melo]

1.2e-59

90.44

Show/hide

Query:  MAANSSRGGSSFYNANAAPYRSREGLSTRPAAASDEIQLQIDPMQGDLDDEIVGLHSQVKRLRTIAQDIGTEAKYQSDFLNQLQMTMIKAQAGVKNNVRR
        MA++S RGGSSFYN +AAP+RSREGLSTRPAAASDEIQLQIDPMQGDLDDEIVGLHSQVKRLR IAQDIGTEAK Q DFL+QLQMT+IKAQAGVKNNVRR
Subjt:  MAANSSRGGSSFYNANAAPYRSREGLSTRPAAASDEIQLQIDPMQGDLDDEIVGLHSQVKRLRTIAQDIGTEAKYQSDFLNQLQMTMIKAQAGVKNNVRR

Query:  LNKKIIQNGSNHVVQVVVFALICFFIVYMWSKMSRK
        LNKKIIQNGSNHV+QVVVFALICFFIVYMW+KMSRK
Subjt:  LNKKIIQNGSNHVVQVVVFALICFFIVYMWSKMSRK

XP_022159293.1 bet1-like protein At1g29060 [Momordica charantia]

2.0e-65

98.53

Show/hide

Query:  MAANSSRGGSSFYNANAAPYRSREGLSTRPAAASDEIQLQIDPMQGDLDDEIVGLHSQVKRLRTIAQDIGTEAKYQSDFLNQLQMTMIKAQAGVKNNVRR
        MAANSSRGGSSFYNANAAPYRSREGLSTRPAAASDEIQLQIDPMQGDLDDEIVGLHSQVKRLRTIAQDIGTEAKYQSDFLNQLQMTMIKAQAGVKNNVRR
Subjt:  MAANSSRGGSSFYNANAAPYRSREGLSTRPAAASDEIQLQIDPMQGDLDDEIVGLHSQVKRLRTIAQDIGTEAKYQSDFLNQLQMTMIKAQAGVKNNVRR

Query:  LNKKIIQNGSNHVVQVVVFALICFFIVYMWSKMSRK
        LNKKIIQNGSNHVVQVVVF LICFF+VYMWSKMSRK
Subjt:  LNKKIIQNGSNHVVQVVVFALICFFIVYMWSKMSRK

XP_022940948.1 bet1-like protein At1g29060 [Cucurbita moschata]

2.1e-59

90.44

Show/hide

Query:  MAANSSRGGSSFYNANAAPYRSREGLSTRPAAASDEIQLQIDPMQGDLDDEIVGLHSQVKRLRTIAQDIGTEAKYQSDFLNQLQMTMIKAQAGVKNNVRR
        MA+NS RGGSSFYN +AAPYRSREGLSTRPAAASDEIQLQIDPMQGDLDD+IVGLH QVKRLR IAQ+IGTEAK Q DFL+QLQMT+IKAQAGVKNNVRR
Subjt:  MAANSSRGGSSFYNANAAPYRSREGLSTRPAAASDEIQLQIDPMQGDLDDEIVGLHSQVKRLRTIAQDIGTEAKYQSDFLNQLQMTMIKAQAGVKNNVRR

Query:  LNKKIIQNGSNHVVQVVVFALICFFIVYMWSKMSRK
        LNKKIIQNGSNHVVQVVVFALICFFIVYMWSK+SRK
Subjt:  LNKKIIQNGSNHVVQVVVFALICFFIVYMWSKMSRK

XP_022980898.1 bet1-like protein At1g29060 [Cucurbita maxima]

4.7e-59

89.71

Show/hide

Query:  MAANSSRGGSSFYNANAAPYRSREGLSTRPAAASDEIQLQIDPMQGDLDDEIVGLHSQVKRLRTIAQDIGTEAKYQSDFLNQLQMTMIKAQAGVKNNVRR
        MA+NS RGGSSFYN +AAPYRSREGLSTRP+AASDEIQLQIDPMQGDLDD+IVGLH QVKRLR IAQ+IGTEAK Q DFL+QLQMT+IKAQAGVKNNVRR
Subjt:  MAANSSRGGSSFYNANAAPYRSREGLSTRPAAASDEIQLQIDPMQGDLDDEIVGLHSQVKRLRTIAQDIGTEAKYQSDFLNQLQMTMIKAQAGVKNNVRR

Query:  LNKKIIQNGSNHVVQVVVFALICFFIVYMWSKMSRK
        LNKKIIQNGSNHVVQVVVFALICFFIVYMWSK+SRK
Subjt:  LNKKIIQNGSNHVVQVVVFALICFFIVYMWSKMSRK

XP_038896659.1 bet1-like protein At1g29060 [Benincasa hispida]

1.6e-59

91.18

Show/hide

Query:  MAANSSRGGSSFYNANAAPYRSREGLSTRPAAASDEIQLQIDPMQGDLDDEIVGLHSQVKRLRTIAQDIGTEAKYQSDFLNQLQMTMIKAQAGVKNNVRR
        MA++S RGGSSFYN+NAA YRSREGLSTRPAAASDEIQLQIDPMQGDLDDEIVGLHSQVKRLR IAQDIGTEAK Q DFL+QLQMT+IKAQAGVKNNVRR
Subjt:  MAANSSRGGSSFYNANAAPYRSREGLSTRPAAASDEIQLQIDPMQGDLDDEIVGLHSQVKRLRTIAQDIGTEAKYQSDFLNQLQMTMIKAQAGVKNNVRR

Query:  LNKKIIQNGSNHVVQVVVFALICFFIVYMWSKMSRK
        LNKKIIQNGSNHVVQVVVFALICFFIVYMWSK+SR+
Subjt:  LNKKIIQNGSNHVVQVVVFALICFFIVYMWSKMSRK

TrEMBL top hits

e value

%identity

Alignment

A0A1S3CQM7 bet1-like protein At1g29060

5.9e-60

90.44

Show/hide

Query:  MAANSSRGGSSFYNANAAPYRSREGLSTRPAAASDEIQLQIDPMQGDLDDEIVGLHSQVKRLRTIAQDIGTEAKYQSDFLNQLQMTMIKAQAGVKNNVRR
        MA++S RGGSSFYN +AAP+RSREGLSTRPAAASDEIQLQIDPMQGDLDDEIVGLHSQVKRLR IAQDIGTEAK Q DFL+QLQMT+IKAQAGVKNNVRR
Subjt:  MAANSSRGGSSFYNANAAPYRSREGLSTRPAAASDEIQLQIDPMQGDLDDEIVGLHSQVKRLRTIAQDIGTEAKYQSDFLNQLQMTMIKAQAGVKNNVRR

Query:  LNKKIIQNGSNHVVQVVVFALICFFIVYMWSKMSRK
        LNKKIIQNGSNHV+QVVVFALICFFIVYMW+KMSRK
Subjt:  LNKKIIQNGSNHVVQVVVFALICFFIVYMWSKMSRK

A0A5A7TAQ3 Bet1-like protein

5.9e-60

90.44

Show/hide

Query:  MAANSSRGGSSFYNANAAPYRSREGLSTRPAAASDEIQLQIDPMQGDLDDEIVGLHSQVKRLRTIAQDIGTEAKYQSDFLNQLQMTMIKAQAGVKNNVRR
        MA++S RGGSSFYN +AAP+RSREGLSTRPAAASDEIQLQIDPMQGDLDDEIVGLHSQVKRLR IAQDIGTEAK Q DFL+QLQMT+IKAQAGVKNNVRR
Subjt:  MAANSSRGGSSFYNANAAPYRSREGLSTRPAAASDEIQLQIDPMQGDLDDEIVGLHSQVKRLRTIAQDIGTEAKYQSDFLNQLQMTMIKAQAGVKNNVRR

Query:  LNKKIIQNGSNHVVQVVVFALICFFIVYMWSKMSRK
        LNKKIIQNGSNHV+QVVVFALICFFIVYMW+KMSRK
Subjt:  LNKKIIQNGSNHVVQVVVFALICFFIVYMWSKMSRK

A0A6J1DYE9 bet1-like protein At1g29060

9.5e-66

98.53

Show/hide

Query:  MAANSSRGGSSFYNANAAPYRSREGLSTRPAAASDEIQLQIDPMQGDLDDEIVGLHSQVKRLRTIAQDIGTEAKYQSDFLNQLQMTMIKAQAGVKNNVRR
        MAANSSRGGSSFYNANAAPYRSREGLSTRPAAASDEIQLQIDPMQGDLDDEIVGLHSQVKRLRTIAQDIGTEAKYQSDFLNQLQMTMIKAQAGVKNNVRR
Subjt:  MAANSSRGGSSFYNANAAPYRSREGLSTRPAAASDEIQLQIDPMQGDLDDEIVGLHSQVKRLRTIAQDIGTEAKYQSDFLNQLQMTMIKAQAGVKNNVRR

Query:  LNKKIIQNGSNHVVQVVVFALICFFIVYMWSKMSRK
        LNKKIIQNGSNHVVQVVVF LICFF+VYMWSKMSRK
Subjt:  LNKKIIQNGSNHVVQVVVFALICFFIVYMWSKMSRK

A0A6J1FQQ6 bet1-like protein At1g29060

1.0e-59

90.44

Show/hide

Query:  MAANSSRGGSSFYNANAAPYRSREGLSTRPAAASDEIQLQIDPMQGDLDDEIVGLHSQVKRLRTIAQDIGTEAKYQSDFLNQLQMTMIKAQAGVKNNVRR
        MA+NS RGGSSFYN +AAPYRSREGLSTRPAAASDEIQLQIDPMQGDLDD+IVGLH QVKRLR IAQ+IGTEAK Q DFL+QLQMT+IKAQAGVKNNVRR
Subjt:  MAANSSRGGSSFYNANAAPYRSREGLSTRPAAASDEIQLQIDPMQGDLDDEIVGLHSQVKRLRTIAQDIGTEAKYQSDFLNQLQMTMIKAQAGVKNNVRR

Query:  LNKKIIQNGSNHVVQVVVFALICFFIVYMWSKMSRK
        LNKKIIQNGSNHVVQVVVFALICFFIVYMWSK+SRK
Subjt:  LNKKIIQNGSNHVVQVVVFALICFFIVYMWSKMSRK

A0A6J1J0M1 bet1-like protein At1g29060

2.3e-59

89.71

Show/hide

Query:  MAANSSRGGSSFYNANAAPYRSREGLSTRPAAASDEIQLQIDPMQGDLDDEIVGLHSQVKRLRTIAQDIGTEAKYQSDFLNQLQMTMIKAQAGVKNNVRR
        MA+NS RGGSSFYN +AAPYRSREGLSTRP+AASDEIQLQIDPMQGDLDD+IVGLH QVKRLR IAQ+IGTEAK Q DFL+QLQMT+IKAQAGVKNNVRR
Subjt:  MAANSSRGGSSFYNANAAPYRSREGLSTRPAAASDEIQLQIDPMQGDLDDEIVGLHSQVKRLRTIAQDIGTEAKYQSDFLNQLQMTMIKAQAGVKNNVRR

Query:  LNKKIIQNGSNHVVQVVVFALICFFIVYMWSKMSRK
        LNKKIIQNGSNHVVQVVVFALICFFIVYMWSK+SRK
Subjt:  LNKKIIQNGSNHVVQVVVFALICFFIVYMWSKMSRK

SwissProt top hits

e value

%identity

Alignment

Q8L9S0 Bet1-like protein At1g29060

1.4e-42

63.97

Show/hide

Query:  MAANSSRGGSSFYNANAAPYRSREGLSTRPAAASDEIQLQIDPMQGDLDDEIVGLHSQVKRLRTIAQDIGTEAKYQSDFLNQLQMTMIKAQAGVKNNVRR
        MA+N   GGS +    A PYRSREGLSTR A+ S+EIQL+IDPM  DLDDEI+GLH QV++L+ IAQ+IG+EAK Q DFL++LQMT+I+AQAGVKNN+R+
Subjt:  MAANSSRGGSSFYNANAAPYRSREGLSTRPAAASDEIQLQIDPMQGDLDDEIVGLHSQVKRLRTIAQDIGTEAKYQSDFLNQLQMTMIKAQAGVKNNVRR

Query:  LNKKIIQNGSNHVVQVVVFALICFFIVYMWSKMSRK
        LN  II++G+NH++ VV+FAL+ FFI+YMWSKM ++
Subjt:  LNKKIIQNGSNHVVQVVVFALICFFIVYMWSKMSRK

Q8VXX9 Bet1-like protein At4g14600

4.9e-43

63.77

Show/hide

Query:  MAANSSRGGS--SFYNANAAPYRSREGLSTRPAAASDEIQLQIDPMQGDLDDEIVGLHSQVKRLRTIAQDIGTEAKYQSDFLNQLQMTMIKAQAGVKNNV
        MA+N  R G+  S Y   AAPYRSREGLSTR AA S+EIQL+IDPM  DLDDEI GLH QV++L+ IAQ+IG+EAK+Q DFL++LQMT+I+AQAGVKNN+
Subjt:  MAANSSRGGS--SFYNANAAPYRSREGLSTRPAAASDEIQLQIDPMQGDLDDEIVGLHSQVKRLRTIAQDIGTEAKYQSDFLNQLQMTMIKAQAGVKNNV

Query:  RRLNKKIIQNGSNHVVQVVVFALICFFIVYMWSKMSRK
        R+LN  II++G+NH++ VV+FAL+ FF++Y+WSKM ++
Subjt:  RRLNKKIIQNGSNHVVQVVVFALICFFIVYMWSKMSRK

Arabidopsis top hits

e value

%identity

Alignment

AT1G29060.1 Target SNARE coiled-coil domain protein

1.0e-43

63.97

Show/hide

Query:  MAANSSRGGSSFYNANAAPYRSREGLSTRPAAASDEIQLQIDPMQGDLDDEIVGLHSQVKRLRTIAQDIGTEAKYQSDFLNQLQMTMIKAQAGVKNNVRR
        MA+N   GGS +    A PYRSREGLSTR A+ S+EIQL+IDPM  DLDDEI+GLH QV++L+ IAQ+IG+EAK Q DFL++LQMT+I+AQAGVKNN+R+
Subjt:  MAANSSRGGSSFYNANAAPYRSREGLSTRPAAASDEIQLQIDPMQGDLDDEIVGLHSQVKRLRTIAQDIGTEAKYQSDFLNQLQMTMIKAQAGVKNNVRR

Query:  LNKKIIQNGSNHVVQVVVFALICFFIVYMWSKMSRK
        LN  II++G+NH++ VV+FAL+ FFI+YMWSKM ++
Subjt:  LNKKIIQNGSNHVVQVVVFALICFFIVYMWSKMSRK

AT4G14600.1 Target SNARE coiled-coil domain protein

3.5e-44

63.77

Show/hide

Query:  MAANSSRGGS--SFYNANAAPYRSREGLSTRPAAASDEIQLQIDPMQGDLDDEIVGLHSQVKRLRTIAQDIGTEAKYQSDFLNQLQMTMIKAQAGVKNNV
        MA+N  R G+  S Y   AAPYRSREGLSTR AA S+EIQL+IDPM  DLDDEI GLH QV++L+ IAQ+IG+EAK+Q DFL++LQMT+I+AQAGVKNN+
Subjt:  MAANSSRGGS--SFYNANAAPYRSREGLSTRPAAASDEIQLQIDPMQGDLDDEIVGLHSQVKRLRTIAQDIGTEAKYQSDFLNQLQMTMIKAQAGVKNNV

Query:  RRLNKKIIQNGSNHVVQVVVFALICFFIVYMWSKMSRK
        R+LN  II++G+NH++ VV+FAL+ FF++Y+WSKM ++
Subjt:  RRLNKKIIQNGSNHVVQVVVFALICFFIVYMWSKMSRK

Sequences

Show/hide sequences

CDS sequence

Show/hide CDS sequence

ATGGCGGCAAATTCGTCTCGCGGCGGTAGTTCATTCTACAACGCTAACGCCGCTCCTTATCGCTCCAGGGAGGGGCTTAGCACCAGACCGGCCGCTGCTTCCGATGAAAT
TCAACTACAGATCGATCCGATGCAAGGGGACTTGGACGACGAGATCGTCGGTCTCCACAGCCAAGTTAAGAGGCTTAGAACTATTGCTCAAGACATCGGGACAGAAGCAA
AGTATCAGAGTGATTTTCTAAATCAGTTGCAAATGACGATGATCAAAGCTCAAGCAGGGGTGAAGAACAATGTAAGAAGATTGAACAAGAAAATCATACAGAATGGATCG
AATCACGTCGTCCAGGTCGTCGTGTTTGCATTGATCTGTTTCTTTATAGTATATATGTGGTCGAAAATGTCCAGAAAA

mRNA sequence

Show/hide mRNA sequence

Protein sequence

Show/hide protein sequence

MAANSSRGGSSFYNANAAPYRSREGLSTRPAAASDEIQLQIDPMQGDLDDEIVGLHSQVKRLRTIAQDIGTEAKYQSDFLNQLQMTMIKAQAGVKNNVRRLNKKIIQNGS
NHVVQVVVFALICFFIVYMWSKMSRK

MS008367 (gene) of Bitter gourd (TR) v1 genome