| GenBank top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| XP_004136431.1 RNA-binding protein 38 [Cucumis sativus] | 7.1e-98 | 77.25 | Show/hide |
Query: YAHYRSQFGDTTFTKVFVGGLAWETPTEEMRRYFEQFGEILEAVIITDKNTAKSKGYGFVTFRDPESARRACANPNPVIDGRRANCNIAALGRPRPSPPR
Y HYRSQFGDTTFTKVFVGGLAWETPT++M+ YFEQFG+ILEAVIITDKNT+KSKGYGFVTFRDPESARRACANPNP+IDGRRANCNIAALGRPRPSPPR
Subjt: YAHYRSQFGDTTFTKVFVGGLAWETPTEEMRRYFEQFGEILEAVIITDKNTAKSKGYGFVTFRDPESARRACANPNPVIDGRRANCNIAALGRPRPSPPR
Query: GRAQGGINPYQGSTM--QATPSYSGVPAPLNQPPLPPAPPPPPPVVYSPYGYPSYSPDYGY--HPQAVYNPQVQQPQYYHQSPYLYGYSVQSPRATFSNA
GR Q +NPYQGSTM QATPSY GVP+PLNQPP+PP PPP PPVVYSPYGYP+YSPDYGY H QAVYNPQVQQPQ Y Q+PY YGYS S TF N
Subjt: GRAQGGINPYQGSTM--QATPSYSGVPAPLNQPPLPPAPPPPPPVVYSPYGYPSYSPDYGY--HPQAVYNPQVQQPQYYHQSPYLYGYSVQSPRATFSNA
Query: PPQSHHH---RVPPSYLYYPTAAPSPHAHFEPSSSFSNYPP---PPLLRHRFSST
P QSH H +PPSY+YYP P P FEPSS NYPP P ++RHRFSST
Subjt: PPQSHHH---RVPPSYLYYPTAAPSPHAHFEPSSSFSNYPP---PPLLRHRFSST
|
|
| XP_022152706.1 RNA-binding protein 38 [Momordica charantia] | 3.5e-137 | 99.19 | Show/hide |
Query: MAYAHYRSQFGDTTFTKVFVGGLAWETPTEEMRRYFEQFGEILEAVIITDKNTAKSKGYGFVTFRDPESARRACANPNPVIDGRRANCNIAALGRPRPSP
MAYAHYRSQFGDTTFTKVFVGGLAWETPTEEMRRYFEQFGEILEAVIITDKNTAKSKGYGFVTFRDPESARRACANPNPVIDGRRANCNIAALGRPRPSP
Subjt: MAYAHYRSQFGDTTFTKVFVGGLAWETPTEEMRRYFEQFGEILEAVIITDKNTAKSKGYGFVTFRDPESARRACANPNPVIDGRRANCNIAALGRPRPSP
Query: PRGRAQGGINPYQGSTMQATPSYSGVPAPLNQPPLPPAPPPPPPVVYSPYGYPSYSPDYGYHPQAVYNPQVQQPQYYHQSPYLYGYSVQSPRATFSNAPP
PRGRAQGGINPYQGSTMQATPSYSGVPAPLNQPPLPPAPPPPPPVVYSPYGYPSYSPDYGYHPQAVYNPQVQQPQYYHQSPYLYGYSVQSPRATFSNAPP
Subjt: PRGRAQGGINPYQGSTMQATPSYSGVPAPLNQPPLPPAPPPPPPVVYSPYGYPSYSPDYGYHPQAVYNPQVQQPQYYHQSPYLYGYSVQSPRATFSNAPP
Query: QSHHHRVPPSYLYYPTAAPSPHAHFEPSSSFSNYPPPPLLRHRFSST
QSHHHRVPPSYLYYP AAPSPHA FEPSSSFSNYPPPPLLRHRFSST
Subjt: QSHHHRVPPSYLYYPTAAPSPHAHFEPSSSFSNYPPPPLLRHRFSST
|
|
| XP_023522103.1 RNA-binding protein 38-like [Cucurbita pepo subsp. pepo] | 9.6e-95 | 76.21 | Show/hide |
Query: MAYAHYRSQFGDTTFTKVFVGGLAWETPTEEMRRYFEQFGEILEAVIITDKNTAKSKGYGFVTFRDPESARRACANPNPVIDGRRANCNIAALGRPRPSP
M+Y HYRSQFGDTTFTKVFVGGLAWETPT+EMRRYFEQFG+ILEAVIITDKNT+KSKGYGFVTFRD ESARRACANPNP+IDGRRANCNIAA+GRPRPSP
Subjt: MAYAHYRSQFGDTTFTKVFVGGLAWETPTEEMRRYFEQFGEILEAVIITDKNTAKSKGYGFVTFRDPESARRACANPNPVIDGRRANCNIAALGRPRPSP
Query: PRGRAQGGINPYQGSTMQATPSYSGVPAPLNQPPLPPAPPPPPPVVYSPYGYPSYSPDYGYHPQAVYNPQVQQPQYYHQSPYLYGYSVQSPRATFSNAPP
PRGR QGG+NPYQGSTMQA PSYSGVP PLNQPPLPP PPVVYSPYGYP+Y+PDYGYH Q + QQP Y +PY YGYS+QSPR F +P
Subjt: PRGRAQGGINPYQGSTMQATPSYSGVPAPLNQPPLPPAPPPPPPVVYSPYGYPSYSPDYGYHPQAVYNPQVQQPQYYHQSPYLYGYSVQSPRATFSNAPP
Query: QSHHHRVP-PSYLYYPTAAPSPHAHFEPSSSFSNYPPPPLLRHRFSST
QSH RVP P Y+YYP A + A FE SFS PPPPL+RHRF+ST
Subjt: QSHHHRVP-PSYLYYPTAAPSPHAHFEPSSSFSNYPPPPLLRHRFSST
|
|
| XP_023535016.1 RNA-binding protein 38-like [Cucurbita pepo subsp. pepo] | 1.1e-93 | 75.4 | Show/hide |
Query: MAYAHYRSQFGDTTFTKVFVGGLAWETPTEEMRRYFEQFGEILEAVIITDKNTAKSKGYGFVTFRDPESARRACANPNPVIDGRRANCNIAALGRPRPSP
M+Y HYRSQFGDTTFTKVFVGGLAWETPT+EMRRYFEQFG+ILEAVIITDKNT+KSKGYGFVTFRD ESARRACANPNP+IDGRRANCNIAA+GRPRPSP
Subjt: MAYAHYRSQFGDTTFTKVFVGGLAWETPTEEMRRYFEQFGEILEAVIITDKNTAKSKGYGFVTFRDPESARRACANPNPVIDGRRANCNIAALGRPRPSP
Query: PRGRAQGGINPYQGSTMQATPSYSGVPAPLNQPPLPPAPPPPPPVVYSPYGYPSYSPDYGYHPQAVYNPQVQQPQYYHQSPYLYGYSVQSPRATFSNAPP
PRGR QGG+NPYQGSTMQA PSYSGVP PLNQPPLPP PPVVYSPYGYP+Y+PDYGYH Q + QQP Y +PY YGYS+QSPR F +P
Subjt: PRGRAQGGINPYQGSTMQATPSYSGVPAPLNQPPLPPAPPPPPPVVYSPYGYPSYSPDYGYHPQAVYNPQVQQPQYYHQSPYLYGYSVQSPRATFSNAPP
Query: QSHHHRVP-PSYLYYP----TAAPSPHAHFEPSSSFSNYPPPPLLRHRFSST
QSH RVP P Y+YYP AA + A FE SFS PPPPL+RHRF+ST
Subjt: QSHHHRVP-PSYLYYP----TAAPSPHAHFEPSSSFSNYPPPPLLRHRFSST
|
|
| XP_038897135.1 RNA-binding protein 38 [Benincasa hispida] | 1.1e-101 | 79.22 | Show/hide |
Query: MAYAHYRSQFGDTTFTKVFVGGLAWETPTEEMRRYFEQFGEILEAVIITDKNTAKSKGYGFVTFRDPESARRACANPNPVIDGRRANCNIAALGRPRPSP
MAY HYRSQFGDTTFTKVFVGGLAWETPT+ MR YFEQFG+ILEAVIITDKNT+KSKGYGFVTFRD ESARRACAN NP+IDGRRANCNIAALGRPRPSP
Subjt: MAYAHYRSQFGDTTFTKVFVGGLAWETPTEEMRRYFEQFGEILEAVIITDKNTAKSKGYGFVTFRDPESARRACANPNPVIDGRRANCNIAALGRPRPSP
Query: PRGRAQGGINPYQGSTM--QATPSYSGVPAPLNQPPLPPAPPPPPPVVYSPYGYPSYSPDYGY-HPQAVYNPQVQQPQYYHQSPYLYGYSVQSPRATFSN
PRGR Q +NPYQGSTM QATPSY GVP+PLNQPPLPP PPPPPP+VYSPYGYP+YSPDYGY H QAVYNPQVQQPQ Y QSPY YGYS+QSPR TF N
Subjt: PRGRAQGGINPYQGSTM--QATPSYSGVPAPLNQPPLPPAPPPPPPVVYSPYGYPSYSPDYGY-HPQAVYNPQVQQPQYYHQSPYLYGYSVQSPRATFSN
Query: APPQSHHHR--VPPSYLYYPTAAP---SPHAHFEPSSSFSNYPPPPLLRHRFSST
P QSHH R +PPSY+YYP +P + A FE +S NY PPL+RHRFSST
Subjt: APPQSHHHR--VPPSYLYYPTAAP---SPHAHFEPSSSFSNYPPPPLLRHRFSST
|
|
| TrEMBL top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| A0A0A0LGV2 RRM domain-containing protein | 3.4e-98 | 77.25 | Show/hide |
Query: YAHYRSQFGDTTFTKVFVGGLAWETPTEEMRRYFEQFGEILEAVIITDKNTAKSKGYGFVTFRDPESARRACANPNPVIDGRRANCNIAALGRPRPSPPR
Y HYRSQFGDTTFTKVFVGGLAWETPT++M+ YFEQFG+ILEAVIITDKNT+KSKGYGFVTFRDPESARRACANPNP+IDGRRANCNIAALGRPRPSPPR
Subjt: YAHYRSQFGDTTFTKVFVGGLAWETPTEEMRRYFEQFGEILEAVIITDKNTAKSKGYGFVTFRDPESARRACANPNPVIDGRRANCNIAALGRPRPSPPR
Query: GRAQGGINPYQGSTM--QATPSYSGVPAPLNQPPLPPAPPPPPPVVYSPYGYPSYSPDYGY--HPQAVYNPQVQQPQYYHQSPYLYGYSVQSPRATFSNA
GR Q +NPYQGSTM QATPSY GVP+PLNQPP+PP PPP PPVVYSPYGYP+YSPDYGY H QAVYNPQVQQPQ Y Q+PY YGYS S TF N
Subjt: GRAQGGINPYQGSTM--QATPSYSGVPAPLNQPPLPPAPPPPPPVVYSPYGYPSYSPDYGY--HPQAVYNPQVQQPQYYHQSPYLYGYSVQSPRATFSNA
Query: PPQSHHH---RVPPSYLYYPTAAPSPHAHFEPSSSFSNYPP---PPLLRHRFSST
P QSH H +PPSY+YYP P P FEPSS NYPP P ++RHRFSST
Subjt: PPQSHHH---RVPPSYLYYPTAAPSPHAHFEPSSSFSNYPP---PPLLRHRFSST
|
|
| A0A6J1AEH8 RNA-binding protein 24 | 6.5e-89 | 71.54 | Show/hide |
Query: MAYAHYRSQFGDTTFTKVFVGGLAWETPTEEMRRYFEQFGEILEAVIITDKNTAKSKGYGFVTFRDPESARRACANPNPVIDGRRANCNIAALGRPRPSP
MAY HYRS FGDTT TKVFVGGLAWETPTEEMRRYFEQFGEILEAVIITDKNT KSKGYGFVTF DPESARRAC +PNPVIDGRRANCNIA+LGRPRPSP
Subjt: MAYAHYRSQFGDTTFTKVFVGGLAWETPTEEMRRYFEQFGEILEAVIITDKNTAKSKGYGFVTFRDPESARRACANPNPVIDGRRANCNIAALGRPRPSP
Query: PRGRAQGGINPYQGSTMQATPSYSGVPAPLNQPPLPPAPPPPPPVVYSPYGYPSYSPDYGYHPQAVYNPQVQQPQYYHQ----------SPYLYGYSVQS
PRGR QG +PYQG Q PSYSGV A P+PP PPPPPPV+Y PYGYP+YSPDYGYH QA+YNPQ+QQPQYYHQ SPY YGYS+Q+
Subjt: PRGRAQGGINPYQGSTMQATPSYSGVPAPLNQPPLPPAPPPPPPVVYSPYGYPSYSPDYGYHPQAVYNPQVQQPQYYHQ----------SPYLYGYSVQS
Query: PRATFSNAPPQSHHHRVP-PSYLYYPTAAPSPHAHFEPSSSFSNYPPPP--LLRHRFSST
PR TFS PQ+ R+P PSYLYYPT + SFS YPPPP L RH F S+
Subjt: PRATFSNAPPQSHHHRVP-PSYLYYPTAAPSPHAHFEPSSSFSNYPPPP--LLRHRFSST
|
|
| A0A6J1DIJ5 RNA-binding protein 38 | 1.7e-137 | 99.19 | Show/hide |
Query: MAYAHYRSQFGDTTFTKVFVGGLAWETPTEEMRRYFEQFGEILEAVIITDKNTAKSKGYGFVTFRDPESARRACANPNPVIDGRRANCNIAALGRPRPSP
MAYAHYRSQFGDTTFTKVFVGGLAWETPTEEMRRYFEQFGEILEAVIITDKNTAKSKGYGFVTFRDPESARRACANPNPVIDGRRANCNIAALGRPRPSP
Subjt: MAYAHYRSQFGDTTFTKVFVGGLAWETPTEEMRRYFEQFGEILEAVIITDKNTAKSKGYGFVTFRDPESARRACANPNPVIDGRRANCNIAALGRPRPSP
Query: PRGRAQGGINPYQGSTMQATPSYSGVPAPLNQPPLPPAPPPPPPVVYSPYGYPSYSPDYGYHPQAVYNPQVQQPQYYHQSPYLYGYSVQSPRATFSNAPP
PRGRAQGGINPYQGSTMQATPSYSGVPAPLNQPPLPPAPPPPPPVVYSPYGYPSYSPDYGYHPQAVYNPQVQQPQYYHQSPYLYGYSVQSPRATFSNAPP
Subjt: PRGRAQGGINPYQGSTMQATPSYSGVPAPLNQPPLPPAPPPPPPVVYSPYGYPSYSPDYGYHPQAVYNPQVQQPQYYHQSPYLYGYSVQSPRATFSNAPP
Query: QSHHHRVPPSYLYYPTAAPSPHAHFEPSSSFSNYPPPPLLRHRFSST
QSHHHRVPPSYLYYP AAPSPHA FEPSSSFSNYPPPPLLRHRFSST
Subjt: QSHHHRVPPSYLYYPTAAPSPHAHFEPSSSFSNYPPPPLLRHRFSST
|
|
| A0A6J1F8X9 RNA-binding protein 38-like | 6.7e-94 | 76.71 | Show/hide |
Query: MAYAHYRSQFGDTTFTKVFVGGLAWETPTEEMRRYFEQFGEILEAVIITDKNTAKSKGYGFVTFRDPESARRACANPNPVIDGRRANCNIAALGRPRPSP
MAY HYRSQFGDTTFTKVFVGGLAWETPT+EMRRYFEQFG+ILEAVIITDKNT+KSKGYGFVTFRD ESARRACANPNP+IDGRRANCNIAA+GRPRPSP
Subjt: MAYAHYRSQFGDTTFTKVFVGGLAWETPTEEMRRYFEQFGEILEAVIITDKNTAKSKGYGFVTFRDPESARRACANPNPVIDGRRANCNIAALGRPRPSP
Query: PRGRAQGGINPYQGSTMQATPSYSGVPAPLNQPPLPPAPPPPPPVVYSPYGYPSYSPDYGYHPQAVYNPQVQQPQYYHQSPYLYGYSVQSPRATFSNAPP
PRGR QGG+NPYQGSTMQA PSYSGVP PLNQPPL PPPPPPVVYSPYGYP+Y+ DYGYH Q + QQP Y +PY YGYS+QSPR F +P
Subjt: PRGRAQGGINPYQGSTMQATPSYSGVPAPLNQPPLPPAPPPPPPVVYSPYGYPSYSPDYGYHPQAVYNPQVQQPQYYHQSPYLYGYSVQSPRATFSNAPP
Query: QSHHHRVP-PSYLYY-PTAAPSPHAHFEPSSSFSNYPPPPLLRHRFSST
QSH RV P Y+YY P AA + A FE S S YPPPPL+RHRF+ST
Subjt: QSHHHRVP-PSYLYY-PTAAPSPHAHFEPSSSFSNYPPPPLLRHRFSST
|
|
| A0A6J1IJV9 RNA-binding protein 38-like | 1.3e-92 | 75.4 | Show/hide |
Query: MAYAHYRSQFGDTTFTKVFVGGLAWETPTEEMRRYFEQFGEILEAVIITDKNTAKSKGYGFVTFRDPESARRACANPNPVIDGRRANCNIAALGRPRPSP
MAY HYRSQFGDTT TKVFVGGLAWETPT+EMRRYFEQFG+ILEAVIITDKNT+KSKGYGFVTFRD ESARRACANPNP+IDGRRANCNIAA+GRPRPSP
Subjt: MAYAHYRSQFGDTTFTKVFVGGLAWETPTEEMRRYFEQFGEILEAVIITDKNTAKSKGYGFVTFRDPESARRACANPNPVIDGRRANCNIAALGRPRPSP
Query: PRGRAQGGINPYQGSTMQATPSYSGVPAPLNQPPLPPAPPPPPPVVYSPYGYPSYSPDYGYHPQAVYNPQVQQPQYYHQSPYLYGYSVQSPRATFSNAPP
PRGR QGG+NPYQGSTMQA PSYSGVP PLNQPPL PPPPPVVYSPYGYP+Y+PDYGYH ++ QQP Y +PY YGYSVQSPR F P
Subjt: PRGRAQGGINPYQGSTMQATPSYSGVPAPLNQPPLPPAPPPPPPVVYSPYGYPSYSPDYGYHPQAVYNPQVQQPQYYHQSPYLYGYSVQSPRATFSNAPP
Query: QSHHHRVP-PSYLYYPTAAPSPHAHFEPSSSFSNYPPPPLLRHRFSST
QSH RV P Y+YYP P+ A +E S S+ PPPPL+RHRF+ST
Subjt: QSHHHRVP-PSYLYYPTAAPSPHAHFEPSSSFSNYPPPPLLRHRFSST
|
|
| SwissProt top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| Q5ZJX4 RNA-binding protein 38 | 5.0e-22 | 40.93 | Show/hide |
Query: DTTFTKVFVGGLAWETPTEEMRRYFEQFGEILEAVIITDKNTAKSKGYGFVTFRDPESARRACANPNPVIDGRRANCNIAALGRPRPSPPRGRAQG---G
DTTFTK+FVGGL + T +R+YFE FG+I EAV+ITD+ T KS+GYGFVT D +A RAC +PNP+IDGR+AN N+A LG + PR G G
Subjt: DTTFTKVFVGGLAWETPTEEMRRYFEQFGEILEAVIITDKNTAKSKGYGFVTFRDPESARRACANPNPVIDGRRANCNIAALGRPRPSPPRGRAQG---G
Query: INPYQGSTMQ----ATPSYSGVPAPLNQPPLPPAPPPPPPVVYSPY-GYPSYSPDYGYHPQAVYNPQVQQPQYYHQSPYL----YGY--SVQSPRATFSN
+ + +Q TP Y P + QP + P P + SPY Y + S Y + A Y+ Q P Y SP YGY +VQ P +
Subjt: INPYQGSTMQ----ATPSYSGVPAPLNQPPLPPAPPPPPPVVYSPY-GYPSYSPDYGYHPQAVYNPQVQQPQYYHQSPYL----YGY--SVQSPRATFSN
Query: APPQSHHHRVPPSYL
A P + + P L
Subjt: APPQSHHHRVPPSYL
|
|
| Q62176 RNA-binding protein 38 | 4.9e-25 | 44.95 | Show/hide |
Query: DTTFTKVFVGGLAWETPTEEMRRYFEQFGEILEAVIITDKNTAKSKGYGFVTFRDPESARRACANPNPVIDGRRANCNIAALGRPRPSPPRGRAQG--GI
DTTFTK+FVGGL + T +R+YFE FG+I EAV+ITD+ T KS+GYGFVT D +A RAC +PNP+IDGR+AN N+A LG S G A G +
Subjt: DTTFTKVFVGGLAWETPTEEMRRYFEQFGEILEAVIITDKNTAKSKGYGFVTFRDPESARRACANPNPVIDGRRANCNIAALGRPRPSPPRGRAQG--GI
Query: NP-YQGSTMQATPSYSGVPAPLNQPPLPPAPPPPPPVVYSPY-GYPSYSPDYGYHPQAVYNPQVQQPQYYHQSPYL------YGYSVQSPRATFSNAP
+P T TP Y PA + P P P P + SPY Y SP Y +P A Y+ Q P Y SP YGY P+A + AP
Subjt: NP-YQGSTMQATPSYSGVPAPLNQPPLPPAPPPPPPVVYSPY-GYPSYSPDYGYHPQAVYNPQVQQPQYYHQSPYL------YGYSVQSPRATFSNAP
|
|
| Q7T3I7 RNA-binding protein 38 | 6.4e-25 | 43.35 | Show/hide |
Query: DTTFTKVFVGGLAWETPTEEMRRYFEQFGEILEAVIITDKNTAKSKGYGFVTFRDPESARRACANPNPVIDGRRANCNIAALGRPRPSPPRGRAQGGINP
DTTFTK+FVGGL + T +R+YFE FG+I EAV+ITD+ TAKS+GYGFVT D +A RAC +PNP+IDGR+AN N+A LG +P + G+
Subjt: DTTFTKVFVGGLAWETPTEEMRRYFEQFGEILEAVIITDKNTAKSKGYGFVTFRDPESARRACANPNPVIDGRRANCNIAALGRPRPSPPRGRAQGGINP
Query: YQGSTMQ----ATPSYSGVPAPLNQPPLPPAPPPPPPVVYSPY-GYPSYSPDYGYHPQAVYNPQVQQPQYYHQSP---YL-YGYS--VQSPRATFSNAPP
+ +Q TP Y P + QP + P P P + SPY Y + + Y ++ A Y Q P Y SP Y+ YGY+ VQ P +T + APP
Subjt: YQGSTMQ----ATPSYSGVPAPLNQPPLPPAPPPPPPVVYSPY-GYPSYSPDYGYHPQAVYNPQVQQPQYYHQSP---YL-YGYS--VQSPRATFSNAPP
Query: QSH
++
Subjt: QSH
|
|
| Q9H0Z9 RNA-binding protein 38 | 1.8e-24 | 44.44 | Show/hide |
Query: DTTFTKVFVGGLAWETPTEEMRRYFEQFGEILEAVIITDKNTAKSKGYGFVTFRDPESARRACANPNPVIDGRRANCNIAALGRPRPSPPRGRAQG--GI
DTTFTK+FVGGL + T +R+YFE FG+I EAV+ITD+ T KS+GYGFVT D +A RAC +PNP+IDGR+AN N+A LG S G A G +
Subjt: DTTFTKVFVGGLAWETPTEEMRRYFEQFGEILEAVIITDKNTAKSKGYGFVTFRDPESARRACANPNPVIDGRRANCNIAALGRPRPSPPRGRAQG--GI
Query: NP-YQGSTMQATPSYSGVPAPLNQPPLPPAPPPPPPVVYSPY-GYPSYSPDYGYHPQAVYNPQVQQPQYYHQSPYL------YGYSVQSPRATFSNAP
+P T TP Y PA + P P P P + SPY Y SP Y +P A Y+ Q P Y SP Y Y P+A + AP
Subjt: NP-YQGSTMQATPSYSGVPAPLNQPPLPPAPPPPPPVVYSPY-GYPSYSPDYGYHPQAVYNPQVQQPQYYHQSPYL------YGYSVQSPRATFSNAP
|
|
| Q9M1S3 Probable RNA-binding protein ARP1 | 3.5e-23 | 40.08 | Show/hide |
Query: FGDTTFTKVFVGGLAWETPTEEMRRYFEQFGEILEAVIITDKNTAKSKGYGFVTFRDPESARRACANPNPVIDGRRANCNIAAL-GRPRPSPPRGRAQGG
FGDT TKVFVGGLAW+T E M +F ++G+ILEAVII+DK T +SKGYGFVTF+D ++A RAC + P+I+GRRANCN+A+L GR R SP Q G
Subjt: FGDTTFTKVFVGGLAWETPTEEMRRYFEQFGEILEAVIITDKNTAKSKGYGFVTFRDPESARRACANPNPVIDGRRANCNIAAL-GRPRPSPPRGRAQGG
Query: INPYQGSTMQATPSYSGVPAPLNQPP-------------------LPPAPPPPPPVVYSPYGYPSYSPDYGYHPQAVYNPQVQ-QPQYYHQSPYLYGYSV
P G+ +ATP + G + P P A P GY + GY+ Q PQ Q QPQYYH ++YG
Subjt: INPYQGSTMQATPSYSGVPAPLNQPP-------------------LPPAPPPPPPVVYSPYGYPSYSPDYGYHPQAVYNPQVQ-QPQYYHQSPYLYGYSV
Query: QSPRATFSNAPPQSHHHRVPPSYLYYPTAAPSPHAHFEPSSSFSNYP
R A P + V P + P P F SFS P
Subjt: QSPRATFSNAPPQSHHHRVPPSYLYYPTAAPSPHAHFEPSSSFSNYP
|
|
| Arabidopsis top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| AT1G20880.1 RNA-binding (RRM/RBD/RNP motifs) family protein | 8.8e-38 | 46.27 | Show/hide |
Query: HY-RSQFGDTTFTKVFVGGLAWETPTEEMRRYFEQFGEILEAVIITDKNTAKSKGYGFVTFRDPESARRACANPNPVIDGRRANCNIAALGRPRP-----
HY S FGDTTFTKVFVGGLAWET +E +RR+F+Q+G+ILEAV+ITDKNT +SKGYGFVTFRDPE+ARRAC +P P+IDGRRANCN+A+LGR RP
Subjt: HY-RSQFGDTTFTKVFVGGLAWETPTEEMRRYFEQFGEILEAVIITDKNTAKSKGYGFVTFRDPESARRACANPNPVIDGRRANCNIAALGRPRP-----
Query: ----SPPRGRAQGGINPYQGSTMQATPSYSGVPAPLNQPPLPPAPPPPPPVVYSPYGYPSYSPDYGY-HPQAVYNPQVQQPQYYHQSPYLYGY--SVQSP
+P R R +PY GS + G P +Q PP VVY PYG Y PDY Y Q Y P + Q QY +YG +V SP
Subjt: ----SPPRGRAQGGINPYQGSTMQATPSYSGVPAPLNQPPLPPAPPPPPPVVYSPYGYPSYSPDYGY-HPQAVYNPQVQQPQYYHQSPYLYGY--SVQSP
Query: RATF---SNAPPQSHHHRVPPSYLYYPTAAPSPHAHFEPSSSFSNYPPPPLLRHR
+ S+ P +H + Y + + A S+ S YP P H+
Subjt: RATF---SNAPPQSHHHRVPPSYLYYPTAAPSPHAHFEPSSSFSNYPPPPLLRHR
|
|
| AT1G22330.1 RNA-binding (RRM/RBD/RNP motifs) family protein | 6.0e-55 | 54.31 | Show/hide |
Query: AHYRSQFGDTTFTKVFVGGLAWETPTEEMRRYFEQFGEILEAVIITDKNTAKSKGYGFVTFRDPESARRACANPNPVIDGRRANCNIAALGRPRPSPPRG
++YRS FGDTT TKVFVGGLAWETPT+EMRRYF+QFGEILEAVIITDK T KSKGYGFVTFRD +SA RA A+PNPVIDGR+ANCNIA+ GRPRPS PRG
Subjt: AHYRSQFGDTTFTKVFVGGLAWETPTEEMRRYFEQFGEILEAVIITDKNTAKSKGYGFVTFRDPESARRACANPNPVIDGRRANCNIAALGRPRPSPPRG
Query: RAQGGI-NPYQGSTMQATPSYSGVPAPLNQPPLPPAPPPPPPVVYSPYGYPSYSPDYGYHPQAVYNPQVQQPQYYHQSPYLYGYSVQSPRATFSNAPPQS
R QGG + YQG SY+G+ AP+ Q ++Y YGY +Y+ +YGYH QA+YN Q+QQ QYY Q Y G A S
Subjt: RAQGGI-NPYQGSTMQATPSYSGVPAPLNQPPLPPAPPPPPPVVYSPYGYPSYSPDYGYHPQAVYNPQVQQPQYYHQSPYLYGYSVQSPRATFSNAPPQS
Query: HHHRVPPSYLYYPTAAPSPHAHFEPSSSFSNY
+ +P Y Y +P P+ H + + ++
Subjt: HHHRVPPSYLYYPTAAPSPHAHFEPSSSFSNY
|
|
| AT1G76460.1 RNA-binding (RRM/RBD/RNP motifs) family protein | 1.2e-39 | 49.77 | Show/hide |
Query: HY-RSQFGDTTFTKVFVGGLAWETPTEEMRRYFEQFGEILEAVIITDKNTAKSKGYGFVTFRDPESARRACANPNPVIDGRRANCNIAALGRPRPSPPRG
HY S FGDTTFTKVFVGGLAWET +E +R++FEQ+GEILEAV+I DKNT +SKGYGFVTFRDPE+ARRACA+P P+IDGRRANCN+A+LGRPRP P
Subjt: HY-RSQFGDTTFTKVFVGGLAWETPTEEMRRYFEQFGEILEAVIITDKNTAKSKGYGFVTFRDPESARRACANPNPVIDGRRANCNIAALGRPRPSPPRG
Query: RAQGGINPYQGSTMQATPSYSGVPAPL-----NQPPLPPAPPPPPPVVYSPYGYPSYSPDYGY-HPQAVYNPQVQQPQYYHQSPYLYGY--SVQSP---R
I G A+P V P N P P P V PYG +Y P+Y Y Q +Y+P + Q QY +YG +V SP
Subjt: RAQGGINPYQGSTMQATPSYSGVPAPL-----NQPPLPPAPPPPPPVVYSPYGYPSYSPDYGY-HPQAVYNPQVQQPQYYHQSPYLYGY--SVQSP---R
Query: ATFSNAPPQSHHHRVPPSY
S P H + Y
Subjt: ATFSNAPPQSHHHRVPPSY
|
|
| AT1G78260.1 RNA-binding (RRM/RBD/RNP motifs) family protein | 2.1e-60 | 55.31 | Show/hide |
Query: AHYRSQFGDTTFTKVFVGGLAWETPTEEMRRYFEQFGEILEAVIITDKNTAKSKGYGFVTFRDPESARRACANPNPVIDGRRANCNIAALGRPRPSPPRG
++YRS FGDTT+TKVFVGGLAWETPT+EMRRYFEQFGEILEAVIITDKNT KSKGYGFVTFR+ +SA RA A+PNPVIDGR+ANCNIA+ GRPRPSPPRG
Subjt: AHYRSQFGDTTFTKVFVGGLAWETPTEEMRRYFEQFGEILEAVIITDKNTAKSKGYGFVTFRDPESARRACANPNPVIDGRRANCNIAALGRPRPSPPRG
Query: RAQ-GGINPYQGSTMQATPSYSGVPAPLNQPPLPPAPPPPPPVVYSPYGYPSYSPD-YGYHPQAVYNPQVQQPQYYHQ---------------------S
R Q G + YQ +Y+G+ A PLPPA P ++Y YGY +Y+PD +GYH QA+YN Q+QQ QYY Q S
Subjt: RAQ-GGINPYQGSTMQATPSYSGVPAPLNQPPLPPAPPPPPPVVYSPYGYPSYSPD-YGYHPQAVYNPQVQQPQYYHQ---------------------S
Query: PYLYGYSVQSPRATFSNAPPQSHHHRVPPSYLYYPTAAPSPHAHFEPSS-SFSNYP-----PPPLLRHRFSST
PY YGYS+Q+PR P HHH +P Y P H H SS SF YP PPL SST
Subjt: PYLYGYSVQSPRATFSNAPPQSHHHRVPPSYLYYPTAAPSPHAHFEPSS-SFSNYP-----PPPLLRHRFSST
|
|
| AT1G78260.2 RNA-binding (RRM/RBD/RNP motifs) family protein | 2.1e-60 | 55.31 | Show/hide |
Query: AHYRSQFGDTTFTKVFVGGLAWETPTEEMRRYFEQFGEILEAVIITDKNTAKSKGYGFVTFRDPESARRACANPNPVIDGRRANCNIAALGRPRPSPPRG
++YRS FGDTT+TKVFVGGLAWETPT+EMRRYFEQFGEILEAVIITDKNT KSKGYGFVTFR+ +SA RA A+PNPVIDGR+ANCNIA+ GRPRPSPPRG
Subjt: AHYRSQFGDTTFTKVFVGGLAWETPTEEMRRYFEQFGEILEAVIITDKNTAKSKGYGFVTFRDPESARRACANPNPVIDGRRANCNIAALGRPRPSPPRG
Query: RAQ-GGINPYQGSTMQATPSYSGVPAPLNQPPLPPAPPPPPPVVYSPYGYPSYSPD-YGYHPQAVYNPQVQQPQYYHQ---------------------S
R Q G + YQ +Y+G+ A PLPPA P ++Y YGY +Y+PD +GYH QA+YN Q+QQ QYY Q S
Subjt: RAQ-GGINPYQGSTMQATPSYSGVPAPLNQPPLPPAPPPPPPVVYSPYGYPSYSPD-YGYHPQAVYNPQVQQPQYYHQ---------------------S
Query: PYLYGYSVQSPRATFSNAPPQSHHHRVPPSYLYYPTAAPSPHAHFEPSS-SFSNYP-----PPPLLRHRFSST
PY YGYS+Q+PR P HHH +P Y P H H SS SF YP PPL SST
Subjt: PYLYGYSVQSPRATFSNAPPQSHHHRVPPSYLYYPTAAPSPHAHFEPSS-SFSNYP-----PPPLLRHRFSST
|
|
