CuGenDBv2

Gene ID	MS008454
Organism	Momordica charantia cv. TR (Bitter gourd (TR) v1)
Description	Protein of unknown function (DUF1218)
Genome location	scaffold4:1523118..1524412
RNA-Seq Expression	MS008454
Synteny	MS008454
Gene Ontology terms	GO:0016021 - integral component of membrane (cellular component)
InterPro domains	IPR009606 - Modifying wall lignin-1/2

Homology

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GenBank top hits

e value

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XP_022143257.1 uncharacterized protein LOC111013166 [Momordica charantia]

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XP_022143268.1 uncharacterized protein LOC111013177 [Momordica charantia]

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XP_022143291.1 uncharacterized protein LOC111013196 [Momordica charantia]

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XP_022937371.1 uncharacterized protein LOC111443679 [Cucurbita moschata]

1.5e-84

86.77

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XP_038896871.1 uncharacterized protein LOC120085090 [Benincasa hispida]

4.0e-85

86.77

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        MA SVK M+LIVA  GVISFIFGV+AENKKPA+GTPI GKG+VIC+YPGDPTV LGYLSV FLLASSIAGYFSLFYPYQGKSVPRGAMF+SSSFS FFNI
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TrEMBL top hits

e value

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A0A5D3E6F5 Uncharacterized protein

2.2e-84

86.24

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        MAVSVK M+L VA  GV SFIFGV+AENKKPA+GTPI GKG+VIC+YPGDPTV LGYLSV FLLASS+AGY SLFYPYQGKSVPRGAMF+SSSFS FFNI
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A0A6J1CPU8 uncharacterized protein LOC111013196

3.3e-93

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A0A6J1CQA0 uncharacterized protein LOC111013166

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A0A6J1CQA7 uncharacterized protein LOC111013177

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A0A6J1FA61 uncharacterized protein LOC111443679

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SwissProt top hits	e value	%identity	Alignment
No hits found

Arabidopsis top hits

e value

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AT4G31130.1 Protein of unknown function (DUF1218)

7.1e-72

73.3

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        A+ T+GLA++LL+WPT+TEQLHL RNVH NLET CPTAKTGLLGGGAF+SLDS L WLVALMLA NARED+F+E+E
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Sequences

Show/hide sequences

CDS sequence

Show/hide CDS sequence

ATGGCCGTTTCTGTCAAGTCAATGGCTCTCATTGTCGCAACTTTTGGTGTGATATCCTTTATATTTGGAGTCGTAGCTGAAAACAAGAAGCCTGCAGCTGGAACTCCCAT
CCAAGGCAAGGGCCTTGTTATCTGTAAATATCCAGGCGACCCAACTGTGGCGTTGGGATATCTTTCGGTTTTGTTTCTTCTTGCCTCATCGATTGCTGGATACTTTTCCT
TATTCTATCCTTATCAAGGAAAATCTGTTCCTCGAGGTGCCATGTTTAGGAGCAGCAGTTTCTCTGTTTTCTTCAATATTGCTGTGTTCACGACTGGATTAGCTATAACT
TTGCTCGTATGGCCCACGGTCACAGAGCAACTTCACTTGATGCGCAACGTTCATCACAATCTTGAGACAGACTGCCCGACCGCTAAGACCGGTCTTCTGGGTGGCGGTGC
TTTTCTATCCCTGGATTCATCCCTCCTCTGGTTGGTTGCTTTAATGCTGGCTGGGAATGCTCGAGAGGACTACTTTGAAGAAATTGAGGAAACAGGAACCAACAGTGAAG
CTCTTAAGAGCAGTGCA

mRNA sequence

Show/hide mRNA sequence

Protein sequence

Show/hide protein sequence

MAVSVKSMALIVATFGVISFIFGVVAENKKPAAGTPIQGKGLVICKYPGDPTVALGYLSVLFLLASSIAGYFSLFYPYQGKSVPRGAMFRSSSFSVFFNIAVFTTGLAIT
LLVWPTVTEQLHLMRNVHHNLETDCPTAKTGLLGGGAFLSLDSSLLWLVALMLAGNAREDYFEEIEETGTNSEALKSSA

MS008454 (gene) of Bitter gourd (TR) v1 genome