CuGenDBv2

Gene ID	MS008455
Organism	Momordica charantia cv. TR (Bitter gourd (TR) v1)
Description	Protein of unknown function (DUF1218)
Genome location	scaffold4:1528135..1529430
RNA-Seq Expression	MS008455
Synteny	MS008455
Gene Ontology terms	GO:0016021 - integral component of membrane (cellular component)
InterPro domains	IPR009606 - Modifying wall lignin-1/2

Homology

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GenBank top hits

e value

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XP_022143257.1 uncharacterized protein LOC111013166 [Momordica charantia]

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XP_022143268.1 uncharacterized protein LOC111013177 [Momordica charantia]

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100

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XP_022143291.1 uncharacterized protein LOC111013196 [Momordica charantia]

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XP_022937371.1 uncharacterized protein LOC111443679 [Cucurbita moschata]

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XP_038896871.1 uncharacterized protein LOC120085090 [Benincasa hispida]

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87.83

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TrEMBL top hits

e value

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A0A0A0LHD9 Uncharacterized protein

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87.3

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A0A6J1CPU8 uncharacterized protein LOC111013196

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A0A6J1CQA0 uncharacterized protein LOC111013166

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A0A6J1CQA7 uncharacterized protein LOC111013177

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A0A6J1FA61 uncharacterized protein LOC111443679

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SwissProt top hits	e value	%identity	Alignment
No hits found

Arabidopsis top hits

e value

%identity

Alignment

AT4G31130.1 Protein of unknown function (DUF1218)

1.1e-72

71.2

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        A+ T+GLA++LL+WPT+TEQLHLTRNVH NLET CPTAKTGLLGGGAF+SLDS L WLVALMLA NARED+F+E+E +  +  +
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Sequences

Show/hide sequences

CDS sequence

Show/hide CDS sequence

ATGGCTGTTTCTGTCAAGTCTATGGCTCTCATTGTCGCAACTTTTGGTGTGATATCCTTTATATTTGGAGTCGTAGCTGAAAACAAGAAGCCTGCAGCTGGAACTCCCAT
CCCAGGCAAGGGCCTTGTTATCTGTAAATATCCGAGCGATCCAACTGTGGCGTTGGGATATCTTTCGGTTGTGTTTCTTCTTGCTTCATCAATTGCAGGATACTTTTCCT
TGTTCTATCCTTACCAAGGAAAATCTGTTCCTCGAGGTGCCATGTTTAGGAGCAGCAGTTTCTCTGTTTTCTTCAACATTGCTGTGTTCACGACTGGATTGGCTATAACT
TTACTCGTGTGGCCCACGGTCACAGAGCAACTTCACTTGACGCGCAACGTTCATCACAATCTCGAGACAGAGTGCCCAACCGCTAAGACCGGTCTTCTGGGTGGTGGTGC
TTTTCTATCCCTGGATTCGTCCCTGCTCTGGTTGGTTGCCTTGATGCTGGCGGGGAATGCTCGAGAGGACTACTTCGAAGAAATAGAGGAAAAAGGAACCAACAGTGAAG
CTCTTAAGAGCAGCGCA

mRNA sequence

Show/hide mRNA sequence

Protein sequence

Show/hide protein sequence

MAVSVKSMALIVATFGVISFIFGVVAENKKPAAGTPIPGKGLVICKYPSDPTVALGYLSVVFLLASSIAGYFSLFYPYQGKSVPRGAMFRSSSFSVFFNIAVFTTGLAIT
LLVWPTVTEQLHLTRNVHHNLETECPTAKTGLLGGGAFLSLDSSLLWLVALMLAGNAREDYFEEIEEKGTNSEALKSSA

MS008455 (gene) of Bitter gourd (TR) v1 genome