CuGenDBv2

Gene ID	MS008456
Organism	Momordica charantia cv. TR (Bitter gourd (TR) v1)
Description	Protein of unknown function (DUF1218)
Genome location	scaffold4:1533811..1535646
RNA-Seq Expression	MS008456
Synteny	MS008456
Gene Ontology terms	GO:0016021 - integral component of membrane (cellular component)
InterPro domains	IPR009606 - Modifying wall lignin-1/2

Homology

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GenBank top hits

e value

%identity

Alignment

XP_022143257.1 uncharacterized protein LOC111013166 [Momordica charantia]

4.0e-93

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XP_022143268.1 uncharacterized protein LOC111013177 [Momordica charantia]

5.2e-93

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XP_022143291.1 uncharacterized protein LOC111013196 [Momordica charantia]

2.1e-97

100

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XP_022937371.1 uncharacterized protein LOC111443679 [Cucurbita moschata]

4.8e-86

87.83

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        MAVSVK MSL VAT GVISFIFGVVAENKKPA+GTPIPGKG+VIC+YP DPTVALGYLSV FLLASSIAGYFSLFYPYQGKSVPRGA+F+SSSFSIFFN+
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XP_038896871.1 uncharacterized protein LOC120085090 [Benincasa hispida]

7.3e-87

87.3

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        MA SVK MSLIVA  GVISFIFGV+AENKKPA+GTPIPGKG+VIC+YPGDPTV LGYLSV FLLASSIAGYFSLFYPYQGKSVPRGA+F+SSSFS FFN+
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        A+FTTGLAITLL+WPTVTEQLHL RNVHHN+ET CPTAKTGLLGGGAFLSLDSSLFWLVALMLAGNAREDYF+EI EKG N E+LKSSA
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TrEMBL top hits

e value

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Alignment

A0A0A0LHD9 Uncharacterized protein

3.0e-86

87.3

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        MAVSVK MSLIVA  GV SFIFGV+AENKKPA+GTPIPGKG+VIC+YPGDPTV LGYLSV FLLASS AGY SLFYPYQGKSVPRGA+F+SSSFS FFN+
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A0A6J1CPU8 uncharacterized protein LOC111013196

1.0e-97

100

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A0A6J1CQA0 uncharacterized protein LOC111013166

1.9e-93

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A0A6J1CQA7 uncharacterized protein LOC111013177

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A0A6J1FA61 uncharacterized protein LOC111443679

2.3e-86

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SwissProt top hits	e value	%identity	Alignment
No hits found

Arabidopsis top hits

e value

%identity

Alignment

AT4G31130.1 Protein of unknown function (DUF1218)

3.8e-73

70.65

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        MAVS+K MSL+V+  GV+SF+ GV+AENKKPA+GTPI GKG+VICKYP DPTVALGYLS  FLLA ++AGY SLF  Y+GKSVP   +F+S+SFS+FFN+
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        A+ T+GLA++LL+WPT+TEQLHL RNVH NLET CPTAKTGLLGGGAF+SLDS LFWLVALMLA NARED+F+E+E +  +G +
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Sequences

Show/hide sequences

CDS sequence

Show/hide CDS sequence

ATGGCTGTTTCTGTCAAGTCCATGTCTCTCATTGTCGCAACTTTTGGTGTGATATCCTTTATATTTGGAGTCGTAGCTGAAAACAAGAAGCCTGCAGCTGGAACTCCCAT
CCCTGGCAAGGGCCTTGTTATCTGTAAATATCCGGGCGATCCAACTGTGGCGTTGGGATATCTTTCGGTTCTGTTTCTTCTTGCTTCGTCGATTGCAGGATACTTTTCCT
TGTTCTATCCTTACCAAGGAAAATCTGTTCCTCGAGGTGCCATATTTAGGAGCAGCAGTTTCTCTATTTTCTTCAACGTTGCTGTGTTCACAACTGGTTTAGCTATAACA
TTGCTCGTATGGCCCACGGTCACGGAGCAACTTCACTTGATGCGCAACGTTCATCACAATCTCGAGACGGAGTGCCCGACCGCTAAGACCGGTCTTCTAGGTGGTGGTGC
TTTCTTGTCCCTGGATTCGTCCCTCTTCTGGTTGGTTGCCCTGATGCTGGCTGGGAATGCTCGAGAGGACTACTTCGAAGAAATCGAGGAAAAGGGAAGCAACGGTGAAG
CTCTTAAGAGCAGCGCA

mRNA sequence

Show/hide mRNA sequence

Protein sequence

Show/hide protein sequence

MAVSVKSMSLIVATFGVISFIFGVVAENKKPAAGTPIPGKGLVICKYPGDPTVALGYLSVLFLLASSIAGYFSLFYPYQGKSVPRGAIFRSSSFSIFFNVAVFTTGLAIT
LLVWPTVTEQLHLMRNVHHNLETECPTAKTGLLGGGAFLSLDSSLFWLVALMLAGNAREDYFEEIEEKGSNGEALKSSA

MS008456 (gene) of Bitter gourd (TR) v1 genome