; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

MS008490 (gene) of Bitter gourd (TR) v1 genome

Gene IDMS008490
OrganismMomordica charantia cv. TR (Bitter gourd (TR) v1)
DescriptionTranscription factor HY5
Genome locationscaffold4:1775836..1776845
RNA-Seq ExpressionMS008490
SyntenyMS008490
Gene Ontology termsGO:0010017 - red or far-red light signaling pathway (biological process)
GO:0010099 - regulation of photomorphogenesis (biological process)
GO:0010114 - response to red light (biological process)
GO:0010218 - response to far red light (biological process)
GO:0045944 - positive regulation of transcription by RNA polymerase II (biological process)
GO:0005634 - nucleus (cellular component)
GO:0000981 - DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific (molecular function)
GO:0003677 - DNA binding (molecular function)
InterPro domainsIPR004827 - Basic-leucine zipper domain
IPR044280 - Transcriptional activator Hac1/HY5


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
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XP_022142521.1 transcription factor HY5-like isoform X2 [Momordica charantia]3.1e-5795.21Show/hide
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XP_023524405.1 transcription factor HY5-like isoform X1 [Cucurbita pepo subsp. pepo]1.8e-4182.73Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A5D3E623 Transcription factor HY59.7e-4179.45Show/hide
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A0A6J1CMF5 transcription factor HY5-like isoform X21.5e-5795.21Show/hide
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A0A6J1CN91 transcription factor HY5-like isoform X15.8e-6298.63Show/hide
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A0A6J1FK24 transcription factor HY5-like isoform X11.8e-4281.82Show/hide
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A0A6J1IYV9 transcription factor HY5-like isoform X11.1e-4182.73Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
A2VD01 Cyclic AMP-responsive element-binding protein 3-like protein 21.4e-0439.39Show/hide
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O24646 Transcription factor HY56.9e-2860.81Show/hide
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Q1XGE2 Transcriptional activator hacA1.1e-0440Show/hide
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Q8W191 Transcription factor HY5-like1.7e-1344.29Show/hide
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Q9SM50 Transcription factor HY53.1e-2862.84Show/hide
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT3G17609.1 HY5-homolog1.2e-1453.19Show/hide
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AT3G17609.2 HY5-homolog1.2e-1444.29Show/hide
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AT3G17609.3 HY5-homolog1.2e-1453.19Show/hide
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AT3G17609.4 HY5-homolog1.2e-1453.19Show/hide
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AT5G11260.1 Basic-leucine zipper (bZIP) transcription factor family protein4.9e-2960.81Show/hide
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
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ACGGCCCTAGGAGTAGGGGACGAAGCGCCGCTGACAAAGAAAGCAAAAGGCTTAAGAGATTGTTAAGAAACAGAGTTTCAGCCCAGCAAGCAAGGGAGAGGAAAAAGGCG
TATCTAAATGAATTGGAAATTAGAGCAACGAACTTGGAGAAAAGGAACTCCGAGCTTGAAGAAAAGCTGTCCACGTTACAGAATGAAAATCAGATGCTTAGACAAGTACG
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mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
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Protein sequenceShow/hide protein sequence
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