; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

MS008729 (gene) of Bitter gourd (TR) v1 genome

Gene IDMS008729
OrganismMomordica charantia cv. TR (Bitter gourd (TR) v1)
DescriptionSASA domain-containing protein
Genome locationscaffold4:3368290..3369462
RNA-Seq ExpressionMS008729
SyntenyMS008729
Gene Ontology termsGO:0016021 - integral component of membrane (cellular component)
InterPro domainsIPR005181 - Sialate O-acetylesterase domain
IPR036514 - SGNH hydrolase superfamily


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG6608446.1 putative carbohydrate esterase, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]1.6e-12077.4Show/hide
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XP_022941448.1 probable carbohydrate esterase At4g34215 [Cucurbita moschata]7.2e-12176.49Show/hide
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XP_022982273.1 probable carbohydrate esterase At4g34215 [Cucurbita maxima]7.2e-12177.05Show/hide
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XP_023525343.1 probable carbohydrate esterase At4g34215 [Cucurbita pepo subsp. pepo]1.6e-12076.08Show/hide
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XP_038899610.1 probable carbohydrate esterase At4g34215 [Benincasa hispida]3.4e-12380.63Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0L4Z7 SASA domain-containing protein4.2e-11977.44Show/hide
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A0A1S3BVE3 probable carbohydrate esterase At4g342152.8e-11874.83Show/hide
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A0A5A7VA07 Putative carbohydrate esterase2.8e-11874.83Show/hide
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A0A6J1FS50 probable carbohydrate esterase At4g342153.5e-12176.49Show/hide
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A0A6J1J4F1 probable carbohydrate esterase At4g342153.5e-12177.05Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
Q8L9J9 Probable carbohydrate esterase At4g342152.9e-7255.08Show/hide
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        P  IF+L+GQSNMAGRGGV  +   NR  WD ++PP+C+P  SILRL+ADL W +AH+PLH DID+ K  G+GPGM FA+++         VIGLVPCA 
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        GGT+IKEW++GS+LY +++ R   S + GG IKA+LWYQGESD ++  D+E YG  +++   ++R DL++P LPIIQV IASG G Y + VR  Q G++L
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         NV+ VDA GLPL+ D LHL T AQV+LG  LA AY
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT3G53010.1 Domain of unknown function (DUF303)7.5e-7652.9Show/hide
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        +FL  P    SQ      +IF+LAGQSNMAGRGGV N++ TN   WDGV+PP+C   PSILRL + L W +A +PLH DID  KTNG+GPGMPFA+ ++ 
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Query:  HKPASPTVIGLVPCAIGGTSIKEWQQGSNLYNQLLGRARASLRS--GGAIKALLWYQGESDTVNPEDSEMYGRRLNKFFTDIRSDLHIPFLPIIQVGIAS
                +GLVPC+IGGT + +WQ+G  LY + + RA+A++ S  GG+ +A+LWYQGESDTV+  D+ +Y +RL KFF+D+R+DL  P LPIIQV +A+
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Query:  GEGPYKEGVRRGQFGIELRNVMTVDALGLPLEPDGLHLNTPAQVKLGGLLADAYRRFPS
        G GPY + VR+ Q   +L NV  VDA GLPLEPDGLHL T +QV+LG ++A+++   P+
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AT4G34215.1 Domain of unknown function (DUF303)2.0e-7355.08Show/hide
Query:  PAAIFLLAGQSNMAGRGGVTNNSLTNRLTWDGVVPPQCSPTPSILRLAADLTWLQAHDPLHADIDSLKTNGIGPGMPFAHSILMHKPASPTVIGLVPCAI
        P  IF+L+GQSNMAGRGGV  +   NR  WD ++PP+C+P  SILRL+ADL W +AH+PLH DID+ K  G+GPGM FA+++         VIGLVPCA 
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Query:  GGTSIKEWQQGSNLYNQLLGRARASLRSGGAIKALLWYQGESDTVNPEDSEMYGRRLNKFFTDIRSDLHIPFLPIIQVGIASGEGPYKEGVRRGQFGIEL
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         NV+ VDA GLPL+ D LHL T AQV+LG  LA AY
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AT4G34215.2 Domain of unknown function (DUF303)2.0e-7355.08Show/hide
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        P  IF+L+GQSNMAGRGGV  +   NR  WD ++PP+C+P  SILRL+ADL W +AH+PLH DID+ K  G+GPGM FA+++         VIGLVPCA 
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Query:  GGTSIKEWQQGSNLYNQLLGRARASLRSGGAIKALLWYQGESDTVNPEDSEMYGRRLNKFFTDIRSDLHIPFLPIIQVGIASGEGPYKEGVRRGQFGIEL
        GGT+IKEW++GS+LY +++ R   S + GG IKA+LWYQGESD ++  D+E YG  +++   ++R DL++P LPIIQV IASG G Y + VR  Q G++L
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Query:  RNVMTVDALGLPLEPDGLHLNTPAQVKLGGLLADAY
         NV+ VDA GLPL+ D LHL T AQV+LG  LA AY
Subjt:  RNVMTVDALGLPLEPDGLHLNTPAQVKLGGLLADAY


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGCTTTACTTGTGGCCCCTGTTTCTGATGATTCCACTTCCGGCCACGTCTCAGCCATCTCCGGCCGCCATTTTCCTCCTCGCCGGACAGAGCAACATGGCCGGGCGTGG
CGGCGTCACCAACAACAGTCTCACCAACCGCCTGACCTGGGACGGCGTCGTCCCTCCCCAATGCTCCCCCACCCCTTCCATCCTCCGCCTCGCCGCCGATCTCACCTGGC
TCCAAGCCCACGACCCTCTCCACGCCGACATCGATTCCCTCAAGACCAACGGCATTGGCCCCGGAATGCCATTTGCCCACAGCATTCTCATGCACAAACCGGCCAGTCCA
ACGGTGATCGGCCTCGTCCCGTGCGCGATCGGCGGCACTTCCATAAAGGAGTGGCAGCAGGGCTCCAATTTATACAACCAGTTGTTGGGCAGAGCCAGAGCATCGCTGCG
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Protein sequenceShow/hide protein sequence
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