; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

MS008810 (gene) of Bitter gourd (TR) v1 genome

Gene IDMS008810
OrganismMomordica charantia cv. TR (Bitter gourd (TR) v1)
DescriptionUnknown protein
Genome locationscaffold4:3839979..3841693
RNA-Seq ExpressionMS008810
SyntenyMS008810
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InterPro domainsNA


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
XP_022139761.1 uncharacterized protein LOC111010591 isoform X1 [Momordica charantia]5.5e-21499.22Show/hide
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XP_022982258.1 uncharacterized protein LOC111481138 [Cucurbita maxima]1.5e-16377.06Show/hide
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A0A6J1CD84 uncharacterized protein LOC111010591 isoform X12.7e-21499.22Show/hide
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A0A6J1CGI4 uncharacterized protein LOC111010591 isoform X22.5e-21298.97Show/hide
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A0A6J1FNF0 uncharacterized protein LOC1114467541.0e-16577.81Show/hide
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A0A6J1J4D9 uncharacterized protein LOC1114811387.4e-16477.06Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G47310.1 unknown protein1.5e-7643.65Show/hide
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        LS ++I L  +KCY + +TY +     D L L+ + LE VL     N   Q   +  V  K++AS +VRFQLE+E +IG N S  +K   WRT+P +ER 
Subjt:  LSKDSIELLPDKCYGR-NTYTKKSPLLDSLKLRFNTLESVLQRHFSNRILQNSFLGFVKVKMRASVVVRFQLEVESNIGTNSSCYAKLTEWRTRPAVERA

Query:  VFEVLARVNALTLRLKSLTVKKLKPLIVADSIEWRYLLPNISFTKFPSLRVRPEALTLDVKW
         FEV A++     +LK++ ++K+ P I  D+  W  L+ N+SFTKFPSL V  EALTLDVKW
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AT5G64510.1 unknown protein7.1e-1823.17Show/hide
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        +S+L S+ D N      + D+ + I    G+  EE+++S  D+     G + SYE  LE+    L  K  ++V+ W        +    +E     + N 
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Query:  IAS----IAAIRSFKIVGPFELMVEGDAQLSLFLPKNATHVGLKRILVGEGITVEVSEAEEVSVFYSSDLARLLDQTRMTNGKTKFYPFWLPFC------
          S    +  +  F++ GP EL ++    + L LP +     LK++++ +G  V V  A  VS+ +  DL   L+Q+       +F    L         
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Query:  -----LPLLPIRILGSATLSAYRTRNPDDYIRTTFLSKDSIEL---LPDK----CYGRNT---------YTKKSPLLDSLKLRFNTL--ESVLQRHFSNR
              P+L +RI+G  +L A  +++PD+ ++   L+   +EL     DK      G N          +T   P+        N L  E +L      +
Subjt:  -----LPLLPIRILGSATLSAYRTRNPDDYIRTTFLSKDSIEL---LPDK----CYGRNT---------YTKKSPLLDSLKLRFNTL--ESVLQRHFSNR

Query:  ILQNSFLGFVKVKMRASVVVRFQLEVESNIGTNSSCYAKLTEWRTRPAVERAVFEVLARVNALTLRLKSLTVKKLKPLIVADSIEWRYLLPNISFTKFPS
          +      +K K+ A   ++    +E  +           EWRT+P   R  FEVLA+V+   +  ++  V ++ P+ + D+I    +  N++ +K P 
Subjt:  ILQNSFLGFVKVKMRASVVVRFQLEVESNIGTNSSCYAKLTEWRTRPAVERAVFEVLARVNALTLRLKSLTVKKLKPLIVADSIEWRYLLPNISFTKFPS

Query:  LRVRPEALTL
        +   P   TL
Subjt:  LRVRPEALTL


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
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Protein sequenceShow/hide protein sequence
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YIRTTFLSKDSIELLPDKCYGRNTYTKKSPLLDSLKLRFNTLESVLQRHFSNRILQNSFLGFVKVKMRASVVVRFQLEVESNIGTNSSCYAKLTEWRTRPAVERAVFEVL
ARVNALTLRLKSLTVKKLKPLIVADSIEWRYLLPNISFTKFPSLRVRPEALTLDVKW