; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

MS008825 (gene) of Bitter gourd (TR) v1 genome

Gene IDMS008825
OrganismMomordica charantia cv. TR (Bitter gourd (TR) v1)
Description30S ribosomal protein S9
Genome locationscaffold4:4054481..4056258
RNA-Seq ExpressionMS008825
SyntenyMS008825
Gene Ontology termsGO:0006412 - translation (biological process)
GO:0000312 - plastid small ribosomal subunit (cellular component)
GO:0003729 - mRNA binding (molecular function)
GO:0003735 - structural constituent of ribosome (molecular function)
InterPro domainsIPR000754 - Ribosomal protein S9
IPR014721 - Ribosomal protein S5 domain 2-type fold, subgroup
IPR020568 - Ribosomal protein S5 domain 2-type fold
IPR020574 - Ribosomal protein S9, conserved site
IPR023035 - Ribosomal protein S9, bacterial/plastid


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
XP_022143016.1 30S ribosomal protein S9, chloroplastic [Momordica charantia]1.6e-100100Show/hide
Query:  MASSISSLAFSLSSLSFSSQISQKPNGLSFPRSKSLVISHPCNSSPLVVSASAATGVETAELRSFVKSRLPGGFAAQTLIGTGRRKSAIARVVIQEGTGK
        MASSISSLAFSLSSLSFSSQISQKPNGLSFPRSKSLVISHPCNSSPLVVSASAATGVETAELRSFVKSRLPGGFAAQTLIGTGRRKSAIARVVIQEGTGK
Subjt:  MASSISSLAFSLSSLSFSSQISQKPNGLSFPRSKSLVISHPCNSSPLVVSASAATGVETAELRSFVKSRLPGGFAAQTLIGTGRRKSAIARVVIQEGTGK

Query:  VIINYRDAKEYLQGNPLWLQYVKVPLVTLGYESSYDVFVKAEGGGLSGQAQAISLGIARALLKVSDDHRAPLKKEGLLTRDSRVVERKKAGLKKARKAPQ
        VIINYRDAKEYLQGNPLWLQYVKVPLVTLGYESSYDVFVKAEGGGLSGQAQAISLGIARALLKVSDDHRAPLKKEGLLTRDSRVVERKKAGLKKARKAPQ
Subjt:  VIINYRDAKEYLQGNPLWLQYVKVPLVTLGYESSYDVFVKAEGGGLSGQAQAISLGIARALLKVSDDHRAPLKKEGLLTRDSRVVERKKAGLKKARKAPQ

Query:  FSKR
        FSKR
Subjt:  FSKR

XP_022940950.1 30S ribosomal protein S9, chloroplastic [Cucurbita moschata]1.4e-9190.69Show/hide
Query:  MASSISSLAFSLSSLSFSSQISQKPNGLSFPRSKSLVISHPCNSSPLVVSASAATGVETAELRSFVKSRLPGGFAAQTLIGTGRRKSAIARVVIQEGTGK
        MA+S+SSLAFSLSSLSFSSQ+SQ PN LSFPRSKSLVISHP ++SPLVVSASA + VETAEL+++VKSRLPGGFAAQTLIGTGRRKSA+ARVV+QEGTGK
Subjt:  MASSISSLAFSLSSLSFSSQISQKPNGLSFPRSKSLVISHPCNSSPLVVSASAATGVETAELRSFVKSRLPGGFAAQTLIGTGRRKSAIARVVIQEGTGK

Query:  VIINYRDAKEYLQGNPLWLQYVKVPLVTLGYESSYDVFVKAEGGGLSGQAQAISLGIARALLKVSDDHRAPLKKEGLLTRDSRVVERKKAGLKKARKAPQ
        VIINYRDAKEYLQGNPLWLQYVKVPL+TLGYESSYDVFVKAEGGGLSGQAQAISLGIARALLKVS DHR+PLKKEGLLTRDSRVVERKKAGLKKARKAPQ
Subjt:  VIINYRDAKEYLQGNPLWLQYVKVPLVTLGYESSYDVFVKAEGGGLSGQAQAISLGIARALLKVSDDHRAPLKKEGLLTRDSRVVERKKAGLKKARKAPQ

Query:  FSKR
        FSKR
Subjt:  FSKR

XP_022982074.1 30S ribosomal protein S9, chloroplastic [Cucurbita maxima]3.4e-9090.2Show/hide
Query:  MASSISSLAFSLSSLSFSSQISQKPNGLSFPRSKSLVISHPCNSSPLVVSASAATGVETAELRSFVKSRLPGGFAAQTLIGTGRRKSAIARVVIQEGTGK
        MA+S+SSLAFSLSSLSFSSQ+SQ PN LSFPRSKSLVISH  ++SPLVVSASA + VETAEL+++VKSRLPGGFAAQTLIGTGRRKSA+ARVV+QEGTGK
Subjt:  MASSISSLAFSLSSLSFSSQISQKPNGLSFPRSKSLVISHPCNSSPLVVSASAATGVETAELRSFVKSRLPGGFAAQTLIGTGRRKSAIARVVIQEGTGK

Query:  VIINYRDAKEYLQGNPLWLQYVKVPLVTLGYESSYDVFVKAEGGGLSGQAQAISLGIARALLKVSDDHRAPLKKEGLLTRDSRVVERKKAGLKKARKAPQ
        VIINYRDAKEYLQGNPLWLQYVKVPL+TLGYESSYDVFVKAEGGGLSGQAQAISLGIARALLKVS DHR PLKKEGLLTRDSRVVERKKAGLKKARKAPQ
Subjt:  VIINYRDAKEYLQGNPLWLQYVKVPLVTLGYESSYDVFVKAEGGGLSGQAQAISLGIARALLKVSDDHRAPLKKEGLLTRDSRVVERKKAGLKKARKAPQ

Query:  FSKR
        FSKR
Subjt:  FSKR

XP_023523256.1 30S ribosomal protein S9, chloroplastic [Cucurbita pepo subsp. pepo]4.1e-9190.2Show/hide
Query:  MASSISSLAFSLSSLSFSSQISQKPNGLSFPRSKSLVISHPCNSSPLVVSASAATGVETAELRSFVKSRLPGGFAAQTLIGTGRRKSAIARVVIQEGTGK
        MA+S+SSLAFSLSSLSFSSQ+SQ PN LSFPRSKSLVISHP ++SPLVVSASA + VETAEL+++VKSRLPGGFAAQTLIGTGRRKSA+ARVV+QEGTGK
Subjt:  MASSISSLAFSLSSLSFSSQISQKPNGLSFPRSKSLVISHPCNSSPLVVSASAATGVETAELRSFVKSRLPGGFAAQTLIGTGRRKSAIARVVIQEGTGK

Query:  VIINYRDAKEYLQGNPLWLQYVKVPLVTLGYESSYDVFVKAEGGGLSGQAQAISLGIARALLKVSDDHRAPLKKEGLLTRDSRVVERKKAGLKKARKAPQ
        VIINYRDAKEYLQGNPLWLQYVKVPL+TLGYES+YDVFVKAEGGGLSGQAQAISLGIARALLKVS DHR+PLKKEGLLTRDSRVVERKKAGLKKARKAPQ
Subjt:  VIINYRDAKEYLQGNPLWLQYVKVPLVTLGYESSYDVFVKAEGGGLSGQAQAISLGIARALLKVSDDHRAPLKKEGLLTRDSRVVERKKAGLKKARKAPQ

Query:  FSKR
        FSKR
Subjt:  FSKR

XP_038903352.1 30S ribosomal protein S9, chloroplastic [Benincasa hispida]8.2e-9291.18Show/hide
Query:  MASSISSLAFSLSSLSFSSQISQKPNGLSFPRSKSLVISHPCNSSPLVVSASAATGVETAELRSFVKSRLPGGFAAQTLIGTGRRKSAIARVVIQEGTGK
        MA+S+SSLAFSLSSLSFSSQ+S KPN LSFPRSKSL ISH  +++PLVVSASAA GVETA+LRSFVKS LPGGFAAQTLIGTGRRKSA+ARVV++EGTGK
Subjt:  MASSISSLAFSLSSLSFSSQISQKPNGLSFPRSKSLVISHPCNSSPLVVSASAATGVETAELRSFVKSRLPGGFAAQTLIGTGRRKSAIARVVIQEGTGK

Query:  VIINYRDAKEYLQGNPLWLQYVKVPLVTLGYESSYDVFVKAEGGGLSGQAQAISLGIARALLKVSDDHRAPLKKEGLLTRDSRVVERKKAGLKKARKAPQ
        VIINYRDAKEYLQGNPLWLQYVKVPLVTLGYESSYDVFVKAEGGGLSGQAQAISLGIARALLKVSDDHR+PLKKEGLLTRDSRVVERKKAGLKKARKAPQ
Subjt:  VIINYRDAKEYLQGNPLWLQYVKVPLVTLGYESSYDVFVKAEGGGLSGQAQAISLGIARALLKVSDDHRAPLKKEGLLTRDSRVVERKKAGLKKARKAPQ

Query:  FSKR
        FSKR
Subjt:  FSKR

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A1S3CRR0 30S ribosomal protein S9, chloroplastic1.1e-8989.71Show/hide
Query:  MASSISSLAFSLSSLSFSSQISQKPNGLSFPRSKSLVISHPCNSSPLVVSASAATGVETAELRSFVKSRLPGGFAAQTLIGTGRRKSAIARVVIQEGTGK
        MA+SISSLAFSLSSLSFSSQ+S KP  LSFPRSKSL+IS   ++SPL+VSASAA  VETA+L+SFVKS LPGGFAAQTLIGTGRRKSA+ARVV++EGTGK
Subjt:  MASSISSLAFSLSSLSFSSQISQKPNGLSFPRSKSLVISHPCNSSPLVVSASAATGVETAELRSFVKSRLPGGFAAQTLIGTGRRKSAIARVVIQEGTGK

Query:  VIINYRDAKEYLQGNPLWLQYVKVPLVTLGYESSYDVFVKAEGGGLSGQAQAISLGIARALLKVSDDHRAPLKKEGLLTRDSRVVERKKAGLKKARKAPQ
        VIINYRDAKEYLQGNPLWLQYVKVPLVTLGYESSYDVFVKAEGGGLSGQAQAISLGIARALLKVSDDHR+PLKKEGLLTRDSRVVERKKAGLKKARKAPQ
Subjt:  VIINYRDAKEYLQGNPLWLQYVKVPLVTLGYESSYDVFVKAEGGGLSGQAQAISLGIARALLKVSDDHRAPLKKEGLLTRDSRVVERKKAGLKKARKAPQ

Query:  FSKR
        FSKR
Subjt:  FSKR

A0A5A7UBW5 30S ribosomal protein S91.1e-8989.71Show/hide
Query:  MASSISSLAFSLSSLSFSSQISQKPNGLSFPRSKSLVISHPCNSSPLVVSASAATGVETAELRSFVKSRLPGGFAAQTLIGTGRRKSAIARVVIQEGTGK
        MA+SISSLAFSLSSLSFSSQ+S KP  LSFPRSKSL+IS   ++SPL+VSASAA  VETA+L+SFVKS LPGGFAAQTLIGTGRRKSA+ARVV++EGTGK
Subjt:  MASSISSLAFSLSSLSFSSQISQKPNGLSFPRSKSLVISHPCNSSPLVVSASAATGVETAELRSFVKSRLPGGFAAQTLIGTGRRKSAIARVVIQEGTGK

Query:  VIINYRDAKEYLQGNPLWLQYVKVPLVTLGYESSYDVFVKAEGGGLSGQAQAISLGIARALLKVSDDHRAPLKKEGLLTRDSRVVERKKAGLKKARKAPQ
        VIINYRDAKEYLQGNPLWLQYVKVPLVTLGYESSYDVFVKAEGGGLSGQAQAISLGIARALLKVSDDHR+PLKKEGLLTRDSRVVERKKAGLKKARKAPQ
Subjt:  VIINYRDAKEYLQGNPLWLQYVKVPLVTLGYESSYDVFVKAEGGGLSGQAQAISLGIARALLKVSDDHRAPLKKEGLLTRDSRVVERKKAGLKKARKAPQ

Query:  FSKR
        FSKR
Subjt:  FSKR

A0A6J1CNY0 30S ribosomal protein S9, chloroplastic8.0e-101100Show/hide
Query:  MASSISSLAFSLSSLSFSSQISQKPNGLSFPRSKSLVISHPCNSSPLVVSASAATGVETAELRSFVKSRLPGGFAAQTLIGTGRRKSAIARVVIQEGTGK
        MASSISSLAFSLSSLSFSSQISQKPNGLSFPRSKSLVISHPCNSSPLVVSASAATGVETAELRSFVKSRLPGGFAAQTLIGTGRRKSAIARVVIQEGTGK
Subjt:  MASSISSLAFSLSSLSFSSQISQKPNGLSFPRSKSLVISHPCNSSPLVVSASAATGVETAELRSFVKSRLPGGFAAQTLIGTGRRKSAIARVVIQEGTGK

Query:  VIINYRDAKEYLQGNPLWLQYVKVPLVTLGYESSYDVFVKAEGGGLSGQAQAISLGIARALLKVSDDHRAPLKKEGLLTRDSRVVERKKAGLKKARKAPQ
        VIINYRDAKEYLQGNPLWLQYVKVPLVTLGYESSYDVFVKAEGGGLSGQAQAISLGIARALLKVSDDHRAPLKKEGLLTRDSRVVERKKAGLKKARKAPQ
Subjt:  VIINYRDAKEYLQGNPLWLQYVKVPLVTLGYESSYDVFVKAEGGGLSGQAQAISLGIARALLKVSDDHRAPLKKEGLLTRDSRVVERKKAGLKKARKAPQ

Query:  FSKR
        FSKR
Subjt:  FSKR

A0A6J1FS60 30S ribosomal protein S9, chloroplastic6.8e-9290.69Show/hide
Query:  MASSISSLAFSLSSLSFSSQISQKPNGLSFPRSKSLVISHPCNSSPLVVSASAATGVETAELRSFVKSRLPGGFAAQTLIGTGRRKSAIARVVIQEGTGK
        MA+S+SSLAFSLSSLSFSSQ+SQ PN LSFPRSKSLVISHP ++SPLVVSASA + VETAEL+++VKSRLPGGFAAQTLIGTGRRKSA+ARVV+QEGTGK
Subjt:  MASSISSLAFSLSSLSFSSQISQKPNGLSFPRSKSLVISHPCNSSPLVVSASAATGVETAELRSFVKSRLPGGFAAQTLIGTGRRKSAIARVVIQEGTGK

Query:  VIINYRDAKEYLQGNPLWLQYVKVPLVTLGYESSYDVFVKAEGGGLSGQAQAISLGIARALLKVSDDHRAPLKKEGLLTRDSRVVERKKAGLKKARKAPQ
        VIINYRDAKEYLQGNPLWLQYVKVPL+TLGYESSYDVFVKAEGGGLSGQAQAISLGIARALLKVS DHR+PLKKEGLLTRDSRVVERKKAGLKKARKAPQ
Subjt:  VIINYRDAKEYLQGNPLWLQYVKVPLVTLGYESSYDVFVKAEGGGLSGQAQAISLGIARALLKVSDDHRAPLKKEGLLTRDSRVVERKKAGLKKARKAPQ

Query:  FSKR
        FSKR
Subjt:  FSKR

A0A6J1J3K2 30S ribosomal protein S9, chloroplastic1.7e-9090.2Show/hide
Query:  MASSISSLAFSLSSLSFSSQISQKPNGLSFPRSKSLVISHPCNSSPLVVSASAATGVETAELRSFVKSRLPGGFAAQTLIGTGRRKSAIARVVIQEGTGK
        MA+S+SSLAFSLSSLSFSSQ+SQ PN LSFPRSKSLVISH  ++SPLVVSASA + VETAEL+++VKSRLPGGFAAQTLIGTGRRKSA+ARVV+QEGTGK
Subjt:  MASSISSLAFSLSSLSFSSQISQKPNGLSFPRSKSLVISHPCNSSPLVVSASAATGVETAELRSFVKSRLPGGFAAQTLIGTGRRKSAIARVVIQEGTGK

Query:  VIINYRDAKEYLQGNPLWLQYVKVPLVTLGYESSYDVFVKAEGGGLSGQAQAISLGIARALLKVSDDHRAPLKKEGLLTRDSRVVERKKAGLKKARKAPQ
        VIINYRDAKEYLQGNPLWLQYVKVPL+TLGYESSYDVFVKAEGGGLSGQAQAISLGIARALLKVS DHR PLKKEGLLTRDSRVVERKKAGLKKARKAPQ
Subjt:  VIINYRDAKEYLQGNPLWLQYVKVPLVTLGYESSYDVFVKAEGGGLSGQAQAISLGIARALLKVSDDHRAPLKKEGLLTRDSRVVERKKAGLKKARKAPQ

Query:  FSKR
        FSKR
Subjt:  FSKR

SwissProt top hitse value%identityAlignment
B2ITM7 30S ribosomal protein S94.7e-3459.68Show/hide
Query:  GTGRRKSAIARVVIQEGTGKVIINYRDAKEYLQGNPLWLQYVKVPLVTLGYESSYDVFVKAEGGGLSGQAQAISLGIARALLKVSDDHRAPLKKEGLLTR
        GTGRRK+A+ARV +  GTG++ +N +D   Y Q NP +L  +K PL TLG E+ YD+ VKAEGGGL+GQA ++ LG+ARAL ++  D+R PLK EG LTR
Subjt:  GTGRRKSAIARVVIQEGTGKVIINYRDAKEYLQGNPLWLQYVKVPLVTLGYESSYDVFVKAEGGGLSGQAQAISLGIARALLKVSDDHRAPLKKEGLLTR

Query:  DSRVVERKKAGLKKARKAPQFSKR
        D R  ERKK GL KARKAPQ+SKR
Subjt:  DSRVVERKKAGLKKARKAPQFSKR

P82278 30S ribosomal protein S9, chloroplastic8.5e-7674.52Show/hide
Query:  MASSISSLAFSLSSLSFSSQISQKPNGLSFPRSKSLVISHPCNSSPLVVSASAATG----VETAELRSFVKSRLPGGFAAQTLIGTGRRKSAIARVVIQE
        MA SISSL  S +SLSF+S ++ KP  L   R+K   +S+P    PLV++A++AT      ETA+L  FVKSRLPGGFAAQT+IGTGRRK AIARVV+QE
Subjt:  MASSISSLAFSLSSLSFSSQISQKPNGLSFPRSKSLVISHPCNSSPLVVSASAATG----VETAELRSFVKSRLPGGFAAQTLIGTGRRKSAIARVVIQE

Query:  GTGKVIINYRDAKEYLQGNPLWLQYVKVPLVTLGYESSYDVFVKAEGGGLSGQAQAISLGIARALLKVSDDHRAPLKKEGLLTRDSRVVERKKAGLKKAR
        GTGK IINYRDAKEYLQGNPLWLQYVK PL TLGYE++YDVFVKA GGGLSGQAQAISLG+ARALLKVS  HRAPLK+EGLLTRDSR+VERKK GLKKAR
Subjt:  GTGKVIINYRDAKEYLQGNPLWLQYVKVPLVTLGYESSYDVFVKAEGGGLSGQAQAISLGIARALLKVSDDHRAPLKKEGLLTRDSRVVERKKAGLKKAR

Query:  KAPQFSKR
        KAPQFSKR
Subjt:  KAPQFSKR

Q8DMK7 30S ribosomal protein S92.5e-3561.6Show/hide
Query:  IGTGRRKSAIARVVIQEGTGKVIINYRDAKEYLQGNPLWLQYVKVPLVTLGYESSYDVFVKAEGGGLSGQAQAISLGIARALLKVSDDHRAPLKKEGLLT
        +GTGRRKSA+ARV +  G+G++ IN R+  +YLQ NP++L  VK PL TLG E+SYD++V A GGGL+GQA AI LGIARAL ++  ++R PLK EG LT
Subjt:  IGTGRRKSAIARVVIQEGTGKVIINYRDAKEYLQGNPLWLQYVKVPLVTLGYESSYDVFVKAEGGGLSGQAQAISLGIARALLKVSDDHRAPLKKEGLLT

Query:  RDSRVVERKKAGLKKARKAPQFSKR
        RD R  ER+K GL+KARKAPQ+SKR
Subjt:  RDSRVVERKKAGLKKARKAPQFSKR

Q9MUV1 30S ribosomal protein S9, chloroplastic3.3e-3564.8Show/hide
Query:  IGTGRRKSAIARVVIQEGTGKVIINYRDAKEYLQGNPLWLQYVKVPLVTLGYESSYDVFVKAEGGGLSGQAQAISLGIARALLKVSDDHRAPLKKEGLLT
        +GTGRRKSA+ARV +  G G+VIIN      YLQ N  +L  V+ PL TLG E +YD+ VKA GGGL+GQA+AI LG+ARAL  +   +R PLKKEG LT
Subjt:  IGTGRRKSAIARVVIQEGTGKVIINYRDAKEYLQGNPLWLQYVKVPLVTLGYESSYDVFVKAEGGGLSGQAQAISLGIARALLKVSDDHRAPLKKEGLLT

Query:  RDSRVVERKKAGLKKARKAPQFSKR
        RDSRV ERKK GLKKARKAPQFSKR
Subjt:  RDSRVVERKKAGLKKARKAPQFSKR

Q9XJ27 30S ribosomal protein S9, chloroplastic5.0e-7675.96Show/hide
Query:  SSISSLAFSLSSLSFSSQISQKPNGLSFPRSKSLVISHPCNS---SPLVVSASAAT---GVETAELRSFVKSRLPGGFAAQTLIGTGRRKSAIARVVIQE
        +SI++LA SLSSLSFSSQ+SQ+PN +SFPR+ S V + P  S   + L ++A+ +      E  EL+ +VKSRLPGGFAAQ +IGTGRRK AIARVV+QE
Subjt:  SSISSLAFSLSSLSFSSQISQKPNGLSFPRSKSLVISHPCNS---SPLVVSASAAT---GVETAELRSFVKSRLPGGFAAQTLIGTGRRKSAIARVVIQE

Query:  GTGKVIINYRDAKEYLQGNPLWLQYVKVPLVTLGYESSYDVFVKAEGGGLSGQAQAISLGIARALLKVSDDHRAPLKKEGLLTRDSRVVERKKAGLKKAR
        GTGKVIINYRDAKEYLQGNPLWLQYVKVPLVTLGYE+SYD+FVKA GGGLSGQAQAI+LG+ARALLKVS DHR+PLKKEGLLTRD+RVVERKKAGLKKAR
Subjt:  GTGKVIINYRDAKEYLQGNPLWLQYVKVPLVTLGYESSYDVFVKAEGGGLSGQAQAISLGIARALLKVSDDHRAPLKKEGLLTRDSRVVERKKAGLKKAR

Query:  KAPQFSKR
        KAPQFSKR
Subjt:  KAPQFSKR

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G74970.1 ribosomal protein S93.6e-7775.96Show/hide
Query:  SSISSLAFSLSSLSFSSQISQKPNGLSFPRSKSLVISHPCNS---SPLVVSASAAT---GVETAELRSFVKSRLPGGFAAQTLIGTGRRKSAIARVVIQE
        +SI++LA SLSSLSFSSQ+SQ+PN +SFPR+ S V + P  S   + L ++A+ +      E  EL+ +VKSRLPGGFAAQ +IGTGRRK AIARVV+QE
Subjt:  SSISSLAFSLSSLSFSSQISQKPNGLSFPRSKSLVISHPCNS---SPLVVSASAAT---GVETAELRSFVKSRLPGGFAAQTLIGTGRRKSAIARVVIQE

Query:  GTGKVIINYRDAKEYLQGNPLWLQYVKVPLVTLGYESSYDVFVKAEGGGLSGQAQAISLGIARALLKVSDDHRAPLKKEGLLTRDSRVVERKKAGLKKAR
        GTGKVIINYRDAKEYLQGNPLWLQYVKVPLVTLGYE+SYD+FVKA GGGLSGQAQAI+LG+ARALLKVS DHR+PLKKEGLLTRD+RVVERKKAGLKKAR
Subjt:  GTGKVIINYRDAKEYLQGNPLWLQYVKVPLVTLGYESSYDVFVKAEGGGLSGQAQAISLGIARALLKVSDDHRAPLKKEGLLTRDSRVVERKKAGLKKAR

Query:  KAPQFSKR
        KAPQFSKR
Subjt:  KAPQFSKR

AT3G49080.1 Ribosomal protein S5 domain 2-like superfamily protein2.4e-1745.97Show/hide
Query:  GTGRRKSAIARVVIQEGTGKVIINYRDAKEYLQGNPLWLQYVKVPLVTLGYESSYDVFVKAEGGGLSGQAQAISLGIARALLKVSDDHRAPLKKEGLLTR
        GTGRRK +IARV IQ G GK  +N ++   Y          ++ PL        +D+    +GGG +GQ  AI LGI+RAL     D R  L+  G LTR
Subjt:  GTGRRKSAIARVVIQEGTGKVIINYRDAKEYLQGNPLWLQYVKVPLVTLGYESSYDVFVKAEGGGLSGQAQAISLGIARALLKVSDDHRAPLKKEGLLTR

Query:  DSRVVERKKAGLKKARKAPQFSKR
        DSRVVERKK G  KARK+ Q+ KR
Subjt:  DSRVVERKKAGLKKARKAPQFSKR


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGCTTCTTCTATATCCTCTCTTGCATTTTCTCTCTCTTCTCTCTCGTTTTCTTCCCAAATATCGCAGAAGCCAAACGGCCTGTCCTTTCCTCGCTCAAAATCTCTGGT
AATTTCCCATCCCTGCAATTCCTCCCCACTTGTGGTATCTGCCTCCGCCGCTACCGGCGTGGAGACGGCGGAGCTTAGGAGCTTCGTGAAATCGAGGCTTCCTGGTGGCT
TCGCTGCGCAAACGCTTATTGGCACGGGTCGCCGGAAATCTGCCATTGCTCGCGTTGTCATCCAAGAAGGCACTGGCAAAGTTATAATCAATTACCGTGACGCTAAGGAA
TACCTTCAAGGAAACCCATTGTGGCTTCAATATGTGAAAGTTCCGTTAGTAACATTGGGATATGAAAGTAGCTACGACGTATTCGTTAAAGCCGAAGGAGGGGGCCTCTC
TGGCCAGGCTCAGGCAATTTCGCTCGGCATTGCTCGTGCGTTGCTAAAGGTGAGTGATGATCACAGGGCACCTCTAAAGAAAGAAGGGCTTTTGACAAGAGACTCTAGAG
TGGTGGAGAGGAAGAAGGCTGGTCTCAAGAAAGCCCGTAAAGCCCCACAATTCTCCAAGCGT
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGGCTTCTTCTATATCCTCTCTTGCATTTTCTCTCTCTTCTCTCTCGTTTTCTTCCCAAATATCGCAGAAGCCAAACGGCCTGTCCTTTCCTCGCTCAAAATCTCTGGT
AATTTCCCATCCCTGCAATTCCTCCCCACTTGTGGTATCTGCCTCCGCCGCTACCGGCGTGGAGACGGCGGAGCTTAGGAGCTTCGTGAAATCGAGGCTTCCTGGTGGCT
TCGCTGCGCAAACGCTTATTGGCACGGGTCGCCGGAAATCTGCCATTGCTCGCGTTGTCATCCAAGAAGGCACTGGCAAAGTTATAATCAATTACCGTGACGCTAAGGAA
TACCTTCAAGGAAACCCATTGTGGCTTCAATATGTGAAAGTTCCGTTAGTAACATTGGGATATGAAAGTAGCTACGACGTATTCGTTAAAGCCGAAGGAGGGGGCCTCTC
TGGCCAGGCTCAGGCAATTTCGCTCGGCATTGCTCGTGCGTTGCTAAAGGTGAGTGATGATCACAGGGCACCTCTAAAGAAAGAAGGGCTTTTGACAAGAGACTCTAGAG
TGGTGGAGAGGAAGAAGGCTGGTCTCAAGAAAGCCCGTAAAGCCCCACAATTCTCCAAGCGT
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MASSISSLAFSLSSLSFSSQISQKPNGLSFPRSKSLVISHPCNSSPLVVSASAATGVETAELRSFVKSRLPGGFAAQTLIGTGRRKSAIARVVIQEGTGKVIINYRDAKE
YLQGNPLWLQYVKVPLVTLGYESSYDVFVKAEGGGLSGQAQAISLGIARALLKVSDDHRAPLKKEGLLTRDSRVVERKKAGLKKARKAPQFSKR