; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

MS008933 (gene) of Bitter gourd (TR) v1 genome

Gene IDMS008933
OrganismMomordica charantia cv. TR (Bitter gourd (TR) v1)
DescriptionProtein Ycf2
Genome locationscaffold446:133173..133304
RNA-Seq ExpressionMS008933
SyntenyMS008933
Gene Ontology termsGO:0009570 - chloroplast stroma (cellular component)
GO:0016021 - integral component of membrane (cellular component)
GO:0005524 - ATP binding (molecular function)
GO:0016887 - ATPase activity (molecular function)
InterPro domainsNA


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
ASY96395.1 Ycf2 [Cucumis melo subsp. agrestis]4.9e-1088.37Show/hide
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QRW36598.1 hypothetical chloroplast RF21 [Cucumis melo]4.9e-1088.37Show/hide
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YP_009751949.1 Ycf2 protein [Cyclanthera pedata]4.9e-1088.37Show/hide
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YP_009752118.1 Ycf2 protein [Dendrosicyos socotranus]9.9e-1190.7Show/hide
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YP_009945458.1 Ycf2 [Sechium edule]4.9e-1088.37Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A1S4EU72 Protein Ycf22.4e-1088.37Show/hide
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A0A249RYX8 Protein Ycf22.4e-1088.37Show/hide
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A0A249RZ46 Protein Ycf22.4e-1088.37Show/hide
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A0A6H0EUM8 Protein Ycf24.8e-1190.7Show/hide
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G3ETW1 Protein Ycf22.4e-1088.37Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
A0A379 Protein Ycf24.6e-1183.72Show/hide
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B1A978 Protein Ycf29.3e-1283.72Show/hide
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P56786 Protein Ycf27.9e-1181.4Show/hide
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Q09WV7 Protein Ycf25.5e-1286.05Show/hide
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Q0ZIV6 Protein Ycf24.6e-1183.72Show/hide
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
ATCG00860.1 Chloroplast Ycf2;ATPase, AAA type, core5.6e-1281.4Show/hide
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ATCG01280.1 Chloroplast Ycf2;ATPase, AAA type, core5.6e-1281.4Show/hide
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
AGTGGCGATATTGATGATAGTGACGATATCGACCGTGACCTTGATACGAAACTGGAGCTTCTAACTATGGTGAATGCGCTAACTATGGATATGATGCTAGAAATAGACCG
ATTTTATATTGCCCTTCGAATA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
AGTGGCGATATTGATGATAGTGACGATATCGACCGTGACCTTGATACGAAACTGGAGCTTCTAACTATGGTGAATGCGCTAACTATGGATATGATGCTAGAAATAGACCG
ATTTTATATTGCCCTTCGAATA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
SGDIDDSDDIDRDLDTKLELLTMVNALTMDMMLEIDRFYIALRI