; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

MS008980 (gene) of Bitter gourd (TR) v1 genome

Gene IDMS008980
OrganismMomordica charantia cv. TR (Bitter gourd (TR) v1)
DescriptionBnaCnng13060D protein
Genome locationscaffold399:308817..309023
RNA-Seq ExpressionMS008980
SyntenyMS008980
Gene Ontology termsGO:0006412 - translation (biological process)
GO:0015935 - small ribosomal subunit (cellular component)
GO:0003735 - structural constituent of ribosome (molecular function)
InterPro domainsNA


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
CAF1728916.1 unnamed protein product [Brassica napus]7.2e-32100Show/hide
Query:  LSPSVADHPLGPATDHRLGKLLPHQLANQTRAPPRADSSFCSSAYGVLAAVSSCCSPPKGRFLRVTHPS
        LSPSVADHPLGPATDHRLGKLLPHQLANQTRAPPRADSSFCSSAYGVLAAVSSCCSPPKGRFLRVTHPS
Subjt:  LSPSVADHPLGPATDHRLGKLLPHQLANQTRAPPRADSSFCSSAYGVLAAVSSCCSPPKGRFLRVTHPS
CDY45547.1 BnaCnng13060D [Brassica napus]7.2e-32100Show/hide
Query:  LSPSVADHPLGPATDHRLGKLLPHQLANQTRAPPRADSSFCSSAYGVLAAVSSCCSPPKGRFLRVTHPS
        LSPSVADHPLGPATDHRLGKLLPHQLANQTRAPPRADSSFCSSAYGVLAAVSSCCSPPKGRFLRVTHPS
Subjt:  LSPSVADHPLGPATDHRLGKLLPHQLANQTRAPPRADSSFCSSAYGVLAAVSSCCSPPKGRFLRVTHPS
KAG4909459.1 hypothetical protein JHK87_055575 [Glycine soja]7.2e-32100Show/hide
Query:  LSPSVADHPLGPATDHRLGKLLPHQLANQTRAPPRADSSFCSSAYGVLAAVSSCCSPPKGRFLRVTHPS
        LSPSVADHPLGPATDHRLGKLLPHQLANQTRAPPRADSSFCSSAYGVLAAVSSCCSPPKGRFLRVTHPS
Subjt:  LSPSVADHPLGPATDHRLGKLLPHQLANQTRAPPRADSSFCSSAYGVLAAVSSCCSPPKGRFLRVTHPS
KAG5383812.1 hypothetical protein IGI04_035282, partial [Brassica rapa subsp. trilocularis]7.2e-32100Show/hide
Query:  LSPSVADHPLGPATDHRLGKLLPHQLANQTRAPPRADSSFCSSAYGVLAAVSSCCSPPKGRFLRVTHPS
        LSPSVADHPLGPATDHRLGKLLPHQLANQTRAPPRADSSFCSSAYGVLAAVSSCCSPPKGRFLRVTHPS
Subjt:  LSPSVADHPLGPATDHRLGKLLPHQLANQTRAPPRADSSFCSSAYGVLAAVSSCCSPPKGRFLRVTHPS
QCD96519.1 hypothetical protein DEO72_LG6g1223 [Vigna unguiculata]7.2e-32100Show/hide
Query:  LSPSVADHPLGPATDHRLGKLLPHQLANQTRAPPRADSSFCSSAYGVLAAVSSCCSPPKGRFLRVTHPS
        LSPSVADHPLGPATDHRLGKLLPHQLANQTRAPPRADSSFCSSAYGVLAAVSSCCSPPKGRFLRVTHPS
Subjt:  LSPSVADHPLGPATDHRLGKLLPHQLANQTRAPPRADSSFCSSAYGVLAAVSSCCSPPKGRFLRVTHPS
TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A078I637 BnaCnng13060D protein3.5e-32100Show/hide
Query:  LSPSVADHPLGPATDHRLGKLLPHQLANQTRAPPRADSSFCSSAYGVLAAVSSCCSPPKGRFLRVTHPS
        LSPSVADHPLGPATDHRLGKLLPHQLANQTRAPPRADSSFCSSAYGVLAAVSSCCSPPKGRFLRVTHPS
Subjt:  LSPSVADHPLGPATDHRLGKLLPHQLANQTRAPPRADSSFCSSAYGVLAAVSSCCSPPKGRFLRVTHPS
A0A394DF89 Uncharacterized protein3.5e-32100Show/hide
Query:  LSPSVADHPLGPATDHRLGKLLPHQLANQTRAPPRADSSFCSSAYGVLAAVSSCCSPPKGRFLRVTHPS
        LSPSVADHPLGPATDHRLGKLLPHQLANQTRAPPRADSSFCSSAYGVLAAVSSCCSPPKGRFLRVTHPS
Subjt:  LSPSVADHPLGPATDHRLGKLLPHQLANQTRAPPRADSSFCSSAYGVLAAVSSCCSPPKGRFLRVTHPS
A0A3P6D4D0 Uncharacterized protein3.5e-32100Show/hide
Query:  LSPSVADHPLGPATDHRLGKLLPHQLANQTRAPPRADSSFCSSAYGVLAAVSSCCSPPKGRFLRVTHPS
        LSPSVADHPLGPATDHRLGKLLPHQLANQTRAPPRADSSFCSSAYGVLAAVSSCCSPPKGRFLRVTHPS
Subjt:  LSPSVADHPLGPATDHRLGKLLPHQLANQTRAPPRADSSFCSSAYGVLAAVSSCCSPPKGRFLRVTHPS
A0A6A5N1F4 Uncharacterized protein3.5e-32100Show/hide
Query:  LSPSVADHPLGPATDHRLGKLLPHQLANQTRAPPRADSSFCSSAYGVLAAVSSCCSPPKGRFLRVTHPS
        LSPSVADHPLGPATDHRLGKLLPHQLANQTRAPPRADSSFCSSAYGVLAAVSSCCSPPKGRFLRVTHPS
Subjt:  LSPSVADHPLGPATDHRLGKLLPHQLANQTRAPPRADSSFCSSAYGVLAAVSSCCSPPKGRFLRVTHPS
A0A6D2LA75 Uncharacterized protein3.5e-32100Show/hide
Query:  LSPSVADHPLGPATDHRLGKLLPHQLANQTRAPPRADSSFCSSAYGVLAAVSSCCSPPKGRFLRVTHPS
        LSPSVADHPLGPATDHRLGKLLPHQLANQTRAPPRADSSFCSSAYGVLAAVSSCCSPPKGRFLRVTHPS
Subjt:  LSPSVADHPLGPATDHRLGKLLPHQLANQTRAPPRADSSFCSSAYGVLAAVSSCCSPPKGRFLRVTHPS
SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
No hits found

Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
CTCAGTCCCAGTGTGGCTGATCATCCTCTCGGACCAGCTACTGATCATCGCCTTGGTAAGCTATTGCCTCACCAACTAGCTAATCAGACGAGAGCCCCTCCTCGGGCGGA
TTCCTCCTTTTGCTCCTCAGCGTACGGGGTATTAGCAGCCGTTTCCAGCTGTTGTTCCCCTCCCAAGGGCAGGTTCTTACGCGTTACTCACCCGTCC
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
CTCAGTCCCAGTGTGGCTGATCATCCTCTCGGACCAGCTACTGATCATCGCCTTGGTAAGCTATTGCCTCACCAACTAGCTAATCAGACGAGAGCCCCTCCTCGGGCGGA
TTCCTCCTTTTGCTCCTCAGCGTACGGGGTATTAGCAGCCGTTTCCAGCTGTTGTTCCCCTCCCAAGGGCAGGTTCTTACGCGTTACTCACCCGTCC
Protein sequenceShow/hide protein sequence
LSPSVADHPLGPATDHRLGKLLPHQLANQTRAPPRADSSFCSSAYGVLAAVSSCCSPPKGRFLRVTHPS