; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

MS009122 (gene) of Bitter gourd (TR) v1 genome

Gene IDMS009122
OrganismMomordica charantia cv. TR (Bitter gourd (TR) v1)
DescriptionRibosomal protein S14
Genome locationscaffold220:45278..45580
RNA-Seq ExpressionMS009122
SyntenyMS009122
Gene Ontology termsGO:0006412 - translation (biological process)
GO:0005739 - mitochondrion (cellular component)
GO:0015935 - small ribosomal subunit (cellular component)
GO:0003735 - structural constituent of ribosome (molecular function)
InterPro domainsIPR001209 - Ribosomal protein S14
IPR018271 - Ribosomal protein S14, conserved site


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG7032953.1 Ribosomal protein S14, mitochondrial, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]4.4e-4694.06Show/hide
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XP_022134507.1 uncharacterized protein LOC111006733 [Momordica charantia]7.2e-4999.01Show/hide
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XP_022938933.1 uncharacterized protein LOC111444996 [Cucurbita moschata]1.5e-4695.05Show/hide
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XP_023550870.1 uncharacterized protein LOC111808878 [Cucurbita pepo subsp. pepo]2.0e-4694.06Show/hide
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XP_038884392.1 ribosomal protein S14, mitochondrial [Benincasa hispida]2.3e-4796.04Show/hide
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A0A0A0LSR8 Uncharacterized protein1.4e-4285.15Show/hide
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A0A1S4E169 ribosomal protein S14, mitochondrial2.2e-4386.14Show/hide
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A0A5D3CKB3 Ribosomal protein S142.2e-4386.14Show/hide
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A0A6J1C264 uncharacterized protein LOC1110067333.5e-4999.01Show/hide
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A0A6J1FKA4 uncharacterized protein LOC1114449967.3e-4795.05Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
P05716 Ribosomal protein S14, mitochondrial3.3e-3673.47Show/hide
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P14875 Ribosomal protein S14, mitochondrial3.9e-3773.47Show/hide
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P26873 Ribosomal protein S14, mitochondrial4.1e-3168.09Show/hide
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        I DH RR L AK+ELKR  YKA+C D +LPN +R +  +KLSKLPRNSS TR+RNRCIFTGRPR+VY+LFR+SRIVFR+LASKG ++G+ KS W
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P46752 Ribosomal protein S14, mitochondrial4.3e-2056.52Show/hide
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        D  RR+L  K+E KR LYKA+ +D +L  D+R     KL+KLPRNSS  R++NRCI TGR  +VY+  R+SRI FRDLA++GLI G  KSSW
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P49387 Ribosomal protein S14, mitochondrial2.3e-3470.41Show/hide
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT2G34520.1 mitochondrial ribosomal protein S144.4e-3670.71Show/hide
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        G KRN  DH RR LAA+FEL+RKLYKA C DP LP+++R+  RYKLSKLPRNS+F R+RNRC+FTGR R+V +LFRVSRIVFR LASKG +MG+ KSSW
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ATCG00330.1 chloroplast ribosomal protein S145.1e-0838.89Show/hide
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        R++L  K+ L +R   K +   PSL    +     KL   PRNS+ TRL  RC  TGRPRA Y+ F +S  + R++    L+ G  +SSW
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGTCGGGGGACAAGCGGAACATTCTTGATCACTACCGCCGACAGCTCGCTGCGAAGTTTGAGTTGAAGCGGAAGCTTTACAAAGCCGTTTGCAATGATCCGAGTCTTCC
CAATGATGTGCGAGAAGATCAGCGTTATAAGCTGTCGAAGTTGCCCAGAAACAGTTCATTTACTCGACTGAGGAATCGCTGCATTTTCACCGGCCGGCCTAGGGCTGTCT
ACCAGCTTTTCCGTGTTTCTCGTATCGTTTTCCGTGATCTGGCGTCCAAAGGTCTTATAATGGGTGTCAAGAAATCCTCCTGG
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGTCGGGGGACAAGCGGAACATTCTTGATCACTACCGCCGACAGCTCGCTGCGAAGTTTGAGTTGAAGCGGAAGCTTTACAAAGCCGTTTGCAATGATCCGAGTCTTCC
CAATGATGTGCGAGAAGATCAGCGTTATAAGCTGTCGAAGTTGCCCAGAAACAGTTCATTTACTCGACTGAGGAATCGCTGCATTTTCACCGGCCGGCCTAGGGCTGTCT
ACCAGCTTTTCCGTGTTTCTCGTATCGTTTTCCGTGATCTGGCGTCCAAAGGTCTTATAATGGGTGTCAAGAAATCCTCCTGG
Protein sequenceShow/hide protein sequence
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