; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

MS009163 (gene) of Bitter gourd (TR) v1 genome

Gene IDMS009163
OrganismMomordica charantia cv. TR (Bitter gourd (TR) v1)
Descriptionchlorophyll(Ide) b reductase NOL, chloroplastic
Genome locationscaffold220:338259..344831
RNA-Seq ExpressionMS009163
SyntenyMS009163
Gene Ontology termsGO:0015996 - chlorophyll catabolic process (biological process)
GO:0034256 - chlorophyll(ide) b reductase activity (molecular function)
InterPro domainsIPR002347 - Short-chain dehydrogenase/reductase SDR
IPR020904 - Short-chain dehydrogenase/reductase, conserved site
IPR036291 - NAD(P)-binding domain superfamily


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
XP_022134271.1 chlorophyll(ide) b reductase NOL, chloroplastic [Momordica charantia]9.8e-19498.58Show/hide
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XP_023550435.1 chlorophyll(ide) b reductase NOL, chloroplastic [Cucurbita pepo subsp. pepo]2.0e-17089.8Show/hide
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XP_038885315.1 chlorophyll(ide) b reductase NOL, chloroplastic isoform X2 [Benincasa hispida]1.7e-16989.34Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0KE83 Uncharacterized protein9.9e-16888.18Show/hide
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A0A1S3C3P2 chlorophyll(Ide) b reductase NOL, chloroplastic isoform X17.6e-16888.54Show/hide
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A0A6J1BXF3 chlorophyll(Ide) b reductase NOL, chloroplastic4.7e-19498.58Show/hide
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A0A6J1FGR3 chlorophyll(Ide) b reductase NOL, chloroplastic7.4e-17190.08Show/hide
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A0A6J1JWB8 chlorophyll(Ide) b reductase NOL, chloroplastic1.3e-17090.08Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
D2WKD9 Farnesol dehydrogenase4.3e-1932.47Show/hide
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         L EV+ TN +GL++C ++A + M  +   GHI +I+   G      P+   Y A+K +V  +T++++ ELR      + V ++SPG+V T++L
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Q5N800 Probable chlorophyll(ide) b reductase NYC1, chloroplastic9.3e-5446.36Show/hide
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        P NV+ITGST+G+G ALA++FL +GD VVI SRS E V  ++  L E   E                 V GT CDV + EDVK LV F +  L  IDIWI
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        NNAG+N   F+PLV  SDED+ ++V+TN +G ++C REA+ +M +Q +GGH+FN+DGAGS G  TP  A YG+TK  +     SL  E R      V VH
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          SPGMV TDLL+SG++ +  + F N++ E PE VA  LVP +R +  +G      I +LT
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Q84ST4 Chlorophyll(ide) b reductase NOL, chloroplastic5.3e-13483.81Show/hide
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Q8LEU3 Chlorophyll(ide) b reductase NOL, chloroplastic2.7e-13881.42Show/hide
Query:  RNGDVNSYSASIKAELFQQREPMVPPYNVLITGSTKGIGYALAKQFLKAGDNVVICSRSAERVESSVQSLREEFGEQHVWGTKCDVREGEDVKNLVTFVQ
        +N  V   SA+++A +  +REPM PPYN+LITGSTKGIGYALA++FLKAGDNVVICSRSAERVE++VQSL+EEFGE HVWGTKCDV EG+DV+ LV + Q
Subjt:  RNGDVNSYSASIKAELFQQREPMVPPYNVLITGSTKGIGYALAKQFLKAGDNVVICSRSAERVESSVQSLREEFGEQHVWGTKCDVREGEDVKNLVTFVQ

Query:  KNLKYIDIWINNAGSNAYSFKPLVEASDEDLIEVVTTNALGLMICCREAIKMMLNQPRGGHIFNIDGAGSDGRPTPRFAAYGATKRSVVHLTKSLQAELR
        KNLKYIDIWINNAGSNAYSFKPL EASDEDLIEVV TN LGLM+CCREA+ MML Q RGGHIFNIDGAGSDGRPTPRFAAYGATKRSVVHLTKSLQAEL+
Subjt:  KNLKYIDIWINNAGSNAYSFKPLVEASDEDLIEVVTTNALGLMICCREAIKMMLNQPRGGHIFNIDGAGSDGRPTPRFAAYGATKRSVVHLTKSLQAELR

Query:  MQDVKNVVVHNLSPGMVTTDLLMSGANTKQAKFFINVLAEPPEVVAEYLVPNIRSIPTNGSTRPTYIRFLTGLKAYSQIFSRLAFGARRNKYLLED
        MQDVKNVVVHNLSPGMVTTDLLMSGA TKQAKFFINVLAEP EVVAEYLVPNIR+IP +GS +PTYIRFLTG+KAY++IFSR+A GAR+N+Y+ E+
Subjt:  MQDVKNVVVHNLSPGMVTTDLLMSGANTKQAKFFINVLAEPPEVVAEYLVPNIRSIPTNGSTRPTYIRFLTGLKAYSQIFSRLAFGARRNKYLLED

Q93ZA0 Probable chlorophyll(ide) b reductase NYC1, chloroplastic1.1e-4943.6Show/hide
Query:  PYNVLITGSTKGIGYALAKQFLKAGDNVVICSRSAERVESSV---------------QSLREEFGEQHVWGTKCDVREGEDVKNLVTFVQKNLKYIDIWI
        P NV+ITGST+G+G ALA++FL +GD V++ SRS+E V+ +V               +S R++  +  V G  CDV + EDV+ L  F  K L  I+IWI
Subjt:  PYNVLITGSTKGIGYALAKQFLKAGDNVVICSRSAERVESSV---------------QSLREEFGEQHVWGTKCDVREGEDVKNLVTFVQKNLKYIDIWI

Query:  NNAGSNAYSFKPLVEASDEDLIEVVTTNALGLMICCREAIKMMLNQPRGGHIFNIDGAGSDGRPTPRFAAYGATKRSVVHLTKSLQAELRMQDVKNVVVH
        NNAG+N   F+PL+E ++ED+ ++V+TN +G ++C R A+ +M  Q  GGHIFN+DGAGS G  TP  A YG+TK  +     S+  E       NV +H
Subjt:  NNAGSNAYSFKPLVEASDEDLIEVVTTNALGLMICCREAIKMMLNQPRGGHIFNIDGAGSDGRPTPRFAAYGATKRSVVHLTKSLQAELRMQDVKNVVVH

Query:  NLSPGMVTTDLLMSGANTKQAKFFINVLAEPPEVVAEYLVPNIRSIPTNG
          SPGMV T+LL+SG++ K  + F N++ E PE VA  LVP +R +  +G
Subjt:  NLSPGMVTTDLLMSGANTKQAKFFINVLAEPPEVVAEYLVPNIRSIPTNG

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G10310.1 NAD(P)-binding Rossmann-fold superfamily protein6.7e-1531.19Show/hide
Query:  MVPPYNVLITGSTKGIGYALAKQFLKAGDNVVICSRSAERVESSVQSLREEFGEQHVWGTKCDVREGEDVKNLVTFVQKNLKYIDIWINNAGSNAYSFKP
        +V    VLITG +KG+G ALA +  K G  V+ C+RS E++ +    L       H+  T  DV+    V+ +   + +     DI +NNAG+   + K 
Subjt:  MVPPYNVLITGSTKGIGYALAKQFLKAGDNVVICSRSAERVESSVQSLREEFGEQHVWGTKCDVREGEDVKNLVTFVQKNLKYIDIWINNAGSNAYSFKP

Query:  LVEASDEDLIEVVTTNALGLMICCREAIKMMLNQPRGGHIFNIDGAGSDGRPTPRFAAYGATKRSVVHLTKSLQAELRMQDVKNVVVHNLSPGMVTTDLL
        + E S ED   V+ TN  G+    R  I +ML + +G  +    G G  G      A Y A+K ++  L++++  E+    V+ + V  L+PG++ T+LL
Subjt:  LVEASDEDLIEVVTTNALGLMICCREAIKMMLNQPRGGHIFNIDGAGSDGRPTPRFAAYGATKRSVVHLTKSLQAELRMQDVKNVVVHNLSPGMVTTDLL

Query:  MS
         S
Subjt:  MS

AT1G24360.1 NAD(P)-binding Rossmann-fold superfamily protein9.6e-1429.29Show/hide
Query:  VLITGSTKGIGYALAKQFLKAGDNVVI-CSRSAERVESSVQSLREEFGEQHVWGTKCDVREGEDVKNLVTFVQKNLKYIDIWINNAGSNAYSFKPLVEAS
        V+ITG+++GIG A+A    KAG  V++  +RSA+  E   + + E  G+   +G   DV +  DV  ++         ID+ +NNAG    +   L+   
Subjt:  VLITGSTKGIGYALAKQFLKAGDNVVI-CSRSAERVESSVQSLREEFGEQHVWGTKCDVREGEDVKNLVTFVQKNLKYIDIWINNAGSNAYSFKPLVEAS

Query:  DEDLIEVVTTNALGLMICCREAIKMMLNQPRGGHIFNIDGA----GSDGRPTPRFAAYGATKRSVVHLTKSLQAELRMQDVKNVVVHNLSPGMVTTDL
             EV+  N  G+ +C + A+K+M+ + R G I NI       G+ G+     A Y A K  V+  +K+   E      +N+ V+ + PG + +D+
Subjt:  DEDLIEVVTTNALGLMICCREAIKMMLNQPRGGHIFNIDGA----GSDGRPTPRFAAYGATKRSVVHLTKSLQAELRMQDVKNVVVHNLSPGMVTTDL

AT4G13250.1 NAD(P)-binding Rossmann-fold superfamily protein7.5e-5143.6Show/hide
Query:  PYNVLITGSTKGIGYALAKQFLKAGDNVVICSRSAERVESSV---------------QSLREEFGEQHVWGTKCDVREGEDVKNLVTFVQKNLKYIDIWI
        P NV+ITGST+G+G ALA++FL +GD V++ SRS+E V+ +V               +S R++  +  V G  CDV + EDV+ L  F  K L  I+IWI
Subjt:  PYNVLITGSTKGIGYALAKQFLKAGDNVVICSRSAERVESSV---------------QSLREEFGEQHVWGTKCDVREGEDVKNLVTFVQKNLKYIDIWI

Query:  NNAGSNAYSFKPLVEASDEDLIEVVTTNALGLMICCREAIKMMLNQPRGGHIFNIDGAGSDGRPTPRFAAYGATKRSVVHLTKSLQAELRMQDVKNVVVH
        NNAG+N   F+PL+E ++ED+ ++V+TN +G ++C R A+ +M  Q  GGHIFN+DGAGS G  TP  A YG+TK  +     S+  E       NV +H
Subjt:  NNAGSNAYSFKPLVEASDEDLIEVVTTNALGLMICCREAIKMMLNQPRGGHIFNIDGAGSDGRPTPRFAAYGATKRSVVHLTKSLQAELRMQDVKNVVVH

Query:  NLSPGMVTTDLLMSGANTKQAKFFINVLAEPPEVVAEYLVPNIRSIPTNG
          SPGMV T+LL+SG++ K  + F N++ E PE VA  LVP +R +  +G
Subjt:  NLSPGMVTTDLLMSGANTKQAKFFINVLAEPPEVVAEYLVPNIRSIPTNG

AT4G13250.2 NAD(P)-binding Rossmann-fold superfamily protein2.7e-4842.8Show/hide
Query:  PYNVLITGSTKGIGYALAKQFLKAGDNVVICSRSAERVESSV---------------QSLREEFGEQHVWGTKCDVREGEDVKNLVTFVQKNLKYIDIWI
        P NV+ITG  +G+G ALA++FL +GD V++ SRS+E V+ +V               +S R++  +  V G  CDV + EDV+ L  F  K L  I+IWI
Subjt:  PYNVLITGSTKGIGYALAKQFLKAGDNVVICSRSAERVESSV---------------QSLREEFGEQHVWGTKCDVREGEDVKNLVTFVQKNLKYIDIWI

Query:  NNAGSNAYSFKPLVEASDEDLIEVVTTNALGLMICCREAIKMMLNQPRGGHIFNIDGAGSDGRPTPRFAAYGATKRSVVHLTKSLQAELRMQDVKNVVVH
        NNAG+N   F+PL+E ++ED+ ++V+TN +G ++C R A+ +M  Q  GGHIFN+DGAGS G  TP  A YG+TK  +     S+  E       NV +H
Subjt:  NNAGSNAYSFKPLVEASDEDLIEVVTTNALGLMICCREAIKMMLNQPRGGHIFNIDGAGSDGRPTPRFAAYGATKRSVVHLTKSLQAELRMQDVKNVVVH

Query:  NLSPGMVTTDLLMSGANTKQAKFFINVLAEPPEVVAEYLVPNIRSIPTNG
          SPGMV T+LL+SG++ K  + F N++ E PE VA  LVP +R +  +G
Subjt:  NLSPGMVTTDLLMSGANTKQAKFFINVLAEPPEVVAEYLVPNIRSIPTNG

AT5G04900.1 NYC1-like1.9e-13981.42Show/hide
Query:  RNGDVNSYSASIKAELFQQREPMVPPYNVLITGSTKGIGYALAKQFLKAGDNVVICSRSAERVESSVQSLREEFGEQHVWGTKCDVREGEDVKNLVTFVQ
        +N  V   SA+++A +  +REPM PPYN+LITGSTKGIGYALA++FLKAGDNVVICSRSAERVE++VQSL+EEFGE HVWGTKCDV EG+DV+ LV + Q
Subjt:  RNGDVNSYSASIKAELFQQREPMVPPYNVLITGSTKGIGYALAKQFLKAGDNVVICSRSAERVESSVQSLREEFGEQHVWGTKCDVREGEDVKNLVTFVQ

Query:  KNLKYIDIWINNAGSNAYSFKPLVEASDEDLIEVVTTNALGLMICCREAIKMMLNQPRGGHIFNIDGAGSDGRPTPRFAAYGATKRSVVHLTKSLQAELR
        KNLKYIDIWINNAGSNAYSFKPL EASDEDLIEVV TN LGLM+CCREA+ MML Q RGGHIFNIDGAGSDGRPTPRFAAYGATKRSVVHLTKSLQAEL+
Subjt:  KNLKYIDIWINNAGSNAYSFKPLVEASDEDLIEVVTTNALGLMICCREAIKMMLNQPRGGHIFNIDGAGSDGRPTPRFAAYGATKRSVVHLTKSLQAELR

Query:  MQDVKNVVVHNLSPGMVTTDLLMSGANTKQAKFFINVLAEPPEVVAEYLVPNIRSIPTNGSTRPTYIRFLTGLKAYSQIFSRLAFGARRNKYLLED
        MQDVKNVVVHNLSPGMVTTDLLMSGA TKQAKFFINVLAEP EVVAEYLVPNIR+IP +GS +PTYIRFLTG+KAY++IFSR+A GAR+N+Y+ E+
Subjt:  MQDVKNVVVHNLSPGMVTTDLLMSGANTKQAKFFINVLAEPPEVVAEYLVPNIRSIPTNGSTRPTYIRFLTGLKAYSQIFSRLAFGARRNKYLLED


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGCTTCCCCTCCATCTTCTTCCCTCCTCTCTCCGTTTCCGTTCCTCTCCCGGAACCATGGCTTCTTCTTCTCTCATCCTTCCGGCCGACGTATATCAATCTGCAAATC
GGAGTACAGCTCCAGTCTTCCAACAGTTCGTTCGCGCCAGATATCCAACATTCCGAGGAATGGCGACGTGAATTCCTATTCTGCATCCATAAAGGCCGAATTATTTCAGC
AGAGGGAGCCCATGGTTCCTCCTTATAACGTTTTGATCACCGGCTCTACCAAAGGAATAGGATATGCATTGGCTAAACAGTTTCTGAAAGCAGGTGACAATGTTGTAATC
TGTTCACGATCAGCTGAGAGGGTAGAATCTTCTGTTCAAAGCCTGAGAGAAGAATTTGGGGAGCAGCATGTGTGGGGTACTAAATGTGACGTACGAGAAGGAGAGGATGT
AAAGAATTTAGTCACATTTGTGCAGAAAAATCTTAAATACATTGACATATGGATCAATAATGCAGGATCAAATGCTTATAGCTTTAAGCCTTTGGTTGAGGCTTCAGATG
AAGATCTCATTGAAGTTGTCACTACAAATGCTCTTGGTTTGATGATATGTTGCCGAGAGGCAATAAAGATGATGTTAAACCAACCTCGAGGGGGTCATATTTTCAACATT
GATGGGGCTGGTTCTGATGGACGACCCACCCCTAGGTTTGCTGCATATGGGGCAACCAAAAGAAGTGTTGTTCATTTAACGAAGTCATTACAGGCGGAATTGCGGATGCA
GGATGTGAAAAATGTTGTAGTGCACAATCTTTCGCCTGGGATGGTTACAACTGATCTTCTCATGTCTGGTGCTAATACAAAGCAGGCGAAATTTTTCATCAATGTCTTGG
CAGAACCACCTGAAGTGGTCGCAGAATACCTTGTTCCAAACATAAGATCCATTCCAACCAATGGTTCAACAAGGCCCACGTACATTCGTTTCCTCACTGGACTGAAAGCT
TATTCCCAGATATTTTCAAGACTTGCCTTTGGTGCAAGAAGAAACAAATATCTTCTAGAAGAT
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGGCTTCCCCTCCATCTTCTTCCCTCCTCTCTCCGTTTCCGTTCCTCTCCCGGAACCATGGCTTCTTCTTCTCTCATCCTTCCGGCCGACGTATATCAATCTGCAAATC
GGAGTACAGCTCCAGTCTTCCAACAGTTCGTTCGCGCCAGATATCCAACATTCCGAGGAATGGCGACGTGAATTCCTATTCTGCATCCATAAAGGCCGAATTATTTCAGC
AGAGGGAGCCCATGGTTCCTCCTTATAACGTTTTGATCACCGGCTCTACCAAAGGAATAGGATATGCATTGGCTAAACAGTTTCTGAAAGCAGGTGACAATGTTGTAATC
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AAAGAATTTAGTCACATTTGTGCAGAAAAATCTTAAATACATTGACATATGGATCAATAATGCAGGATCAAATGCTTATAGCTTTAAGCCTTTGGTTGAGGCTTCAGATG
AAGATCTCATTGAAGTTGTCACTACAAATGCTCTTGGTTTGATGATATGTTGCCGAGAGGCAATAAAGATGATGTTAAACCAACCTCGAGGGGGTCATATTTTCAACATT
GATGGGGCTGGTTCTGATGGACGACCCACCCCTAGGTTTGCTGCATATGGGGCAACCAAAAGAAGTGTTGTTCATTTAACGAAGTCATTACAGGCGGAATTGCGGATGCA
GGATGTGAAAAATGTTGTAGTGCACAATCTTTCGCCTGGGATGGTTACAACTGATCTTCTCATGTCTGGTGCTAATACAAAGCAGGCGAAATTTTTCATCAATGTCTTGG
CAGAACCACCTGAAGTGGTCGCAGAATACCTTGTTCCAAACATAAGATCCATTCCAACCAATGGTTCAACAAGGCCCACGTACATTCGTTTCCTCACTGGACTGAAAGCT
TATTCCCAGATATTTTCAAGACTTGCCTTTGGTGCAAGAAGAAACAAATATCTTCTAGAAGAT
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MASPPSSSLLSPFPFLSRNHGFFFSHPSGRRISICKSEYSSSLPTVRSRQISNIPRNGDVNSYSASIKAELFQQREPMVPPYNVLITGSTKGIGYALAKQFLKAGDNVVI
CSRSAERVESSVQSLREEFGEQHVWGTKCDVREGEDVKNLVTFVQKNLKYIDIWINNAGSNAYSFKPLVEASDEDLIEVVTTNALGLMICCREAIKMMLNQPRGGHIFNI
DGAGSDGRPTPRFAAYGATKRSVVHLTKSLQAELRMQDVKNVVVHNLSPGMVTTDLLMSGANTKQAKFFINVLAEPPEVVAEYLVPNIRSIPTNGSTRPTYIRFLTGLKA
YSQIFSRLAFGARRNKYLLED