; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

MS009216 (gene) of Bitter gourd (TR) v1 genome

Gene IDMS009216
OrganismMomordica charantia cv. TR (Bitter gourd (TR) v1)
DescriptionGPI-anchor transamidase isoform X1
Genome locationscaffold220:812809..813089
RNA-Seq ExpressionMS009216
SyntenyMS009216
Gene Ontology termsNA
InterPro domainsNA


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAA0062564.1 GPI-anchor transamidase isoform X1 [Cucumis melo var. makuwa]3.5e-0534.09Show/hide
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        L   F + W F G+    + Q+++GS  K    +IW   +  L   IWFE NQRIF+G+        D     A++WC+ ++EF  YS
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TYK19563.1 uncharacterized protein E5676_scaffold416G00660 [Cucumis melo var. makuwa]8.5e-0438.36Show/hide
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        I+  PFK K   +W    CA++  + IW ERN R+F+G++     IG  V    S W   S+ FC YS  N N
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XP_030483308.1 uncharacterized protein LOC115699905 [Cannabis sativa]1.7e-0430.85Show/hide
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        KL   F ++W   G+    +V  + G   ++    +W+ AVL + + IW ERN RIF+G E S E++ ++V  + + W   ++ F ++SF++ N
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XP_038903695.1 uncharacterized protein LOC120090219 [Benincasa hispida]2.2e-0436.17Show/hide
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        KL   F+L      + K  + QL+      +   ++W  AV  L   +WFERNQRIF  + TS ++  +     ASSWCL S  F  YS  +FN
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A5A7V5N8 GPI-anchor transamidase isoform X11.7e-0534.09Show/hide
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A0A5D3D7T2 Uncharacterized protein4.1e-0438.36Show/hide
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        I+  PFK K   +W    CA++  + IW ERN R+F+G++     IG  V    S W   S+ FC YS  N N
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A0A803QEA6 Uncharacterized protein6.4e-0530.77Show/hide
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        L  EF ++W    +    LV  + GS   ++   +W+  VL + + +W ERN RIF+G E+S E + D++  + +SW   ++ F   SF++
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
No hits found

Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
AAGCTGTTCAAAGAGTTCAGTCTAAGGTGGTGCTTCTCTGGAAATTGCAAGGATGCTTTGGTTCAGCTTATTGTTGGCTCCCCATTCAAAAGAAAAGTGCTCATCATTTG
GCAATGTGCAGTGTTGCTACCCTTTAGGATTTGGTTTGAAAGAAATCAGAGGATTTTCAAAGGCCAGGAAACGTCTAGTGAGAACATTGGGGATCAAGTGCATTCTTTTG
CTTCCTCGTGGTGCCTTACCTCAAGAGAGTTTTGTAAATACAGCTTTGTAAATTTTAAT
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
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Protein sequenceShow/hide protein sequence
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