; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

MS009278 (gene) of Bitter gourd (TR) v1 genome

Gene IDMS009278
OrganismMomordica charantia cv. TR (Bitter gourd (TR) v1)
DescriptionSerine/arginine repetitive matrix-like protein
Genome locationscaffold195:403352..404623
RNA-Seq ExpressionMS009278
SyntenyMS009278
Gene Ontology termsGO:0003677 - DNA binding (molecular function)
InterPro domainsNA


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
XP_022136380.1 uncharacterized protein LOC111008104 [Momordica charantia]9.0e-22699.29Show/hide
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XP_022931532.1 homeobox protein prospero-like [Cucurbita moschata]9.4e-17580.86Show/hide
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XP_022985085.1 uncharacterized serine-rich protein C215.13 [Cucurbita maxima]2.5e-17581.08Show/hide
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XP_023551901.1 uncharacterized protein LOC111809733 [Cucurbita pepo subsp. pepo]1.5e-17580.94Show/hide
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XP_038878848.1 uncharacterized serine-rich protein C215.13-like [Benincasa hispida]2.9e-17681.66Show/hide
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        LFLDGKLVPLQ+SSVKPSVN  KSTRC   PETAA+SRRRVEEECSTDPYLFSPKAPRCSSRWRELLGLKK+YQSSS           AKNE+HK TT+S
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        SSYFSEANSKALKY LHRSSKSSLSSSLDSSLSLPLLKDSDSESVSLSSSRVSLSSSSSGHEHEDLHRLSLDC+NKPN+NPI LHRNPN    NNPPRMR
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        VTPVLNVPVCSSLRGSSKS SVFGFG LF+GT  SSSRNHQSS++ S
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A5A7V5R8 Putative serine-rich protein1.4e-16878.9Show/hide
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        K  TTSSSSYFSEANSKALKY LHRSSKSSLSSSLDSSLSLPLLKDSDSESVSLSSSRVSLSSSSSGHEHEDLHRLSLDC+NKPN+NPI LHRNPN    
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        NNPPRMR+VKPR KSE +NPR  STADH      RVGRSPIRRT GE  S+SSRLGIRGVSVDSPRMNSSGKIVFHNLERSSSSPSSFNGGPKFK RGME
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        RSYSANVRVTPVLNVPVCSSLRGSSKS SVFGFG L       SSRNHQ+S++ S
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A0A5D3CZJ6 Putative serine-rich protein4.1e-16879.03Show/hide
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        LF DGKLVPLQ+SS KPSVN  KSTRC   PET  +SRRRVEEECSTDPYLFSPKAPRCSSRWRELLGLKK+YQSS               SAKNENHK 
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         TTSSSSYFSEANSKALKY LHRSSKSSLSSSLDSSLSLPLLKDSDSESVSLSSSRVSLSSSSSGHEHEDLHRLSLDC+NKPN+NPI LHRNPN    NN
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        PPRMR+VKPR KSE +NPR  STADH      RVGRSPIRRT GE  S+SSRLGIRGVSVDSPRMNSSGKIVFHNLERSSSSPSSFNGGPKFK RGMERS
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        YSANVRVTPVLNVPVCSSLRGSSKS SVFGFG L       SSRNHQ+S++ S
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A0A6J1C3Q8 uncharacterized protein LOC1110081044.3e-22699.29Show/hide
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        LLH SSKSSLSSSLDSSLSLPLLKDSDSESVSLSSSRVSLSSSSSGHEHEDLHRLSLDCDNKPNSNPIFLHRNPNP GTNNPPRMRMVKPRSKSETTNPR
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A0A6J1ETX7 homeobox protein prospero-like4.6e-17580.86Show/hide
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A0A6J1JAD5 uncharacterized serine-rich protein C215.131.2e-17581.08Show/hide
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        KPR KSE TNPRST+  DH     RVGRSP+RRT GES+SSRL GIRGVSVDSPRMNSSGKIVFHNLERSSSSPS+FNGGPKFK RGMERSYSANVRVTP
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Query:  VLNVPVCSSLRGSSKSASVFGFGQLFSGTAASSSRNHQSSTNRS
        VLNVPVCSSLRGSSKSASVFGFG LF+GT     R+HQSS++ S
Subjt:  VLNVPVCSSLRGSSKSASVFGFGQLFSGTAASSSRNHQSSTNRS

SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G56020.1 unknown protein1.0e-6546.82Show/hide
Query:  MASACVNNVGMSPENFLDCSSAPCHSPYGWLSPRISFSRDFTDGSPASSKLAGAKSKPKPKPAPAGESEIRDPDPELSVCEFEFRLQDPVAMMLPADELF
        MASACV + G+SPE F         S YGW SPR+S +RD        ++ + +  K +  P P    EI+DP     V +FEF L+DPV  ML ADELF
Subjt:  MASACVNNVGMSPENFLDCSSAPCHSPYGWLSPRISFSRDFTDGSPASSKLAGAKSKPKPKPAPAGESEIRDPDPELSVCEFEFRLQDPVAMMLPADELF

Query:  LDGKLVPLQLSSVKPSVNEFKSTRCDELPE-----TAAKSRRRVEEECSTDPYLFSPKAPRCSSRWRELLGLKKVYQSSSAKNENHKTTSSSSYFSEANS
         DGKLVPL+ S  K +     +T      E        KS RR+E E S    LFSPKAPRC++RWRELLGLK++   ++ + E     SSSS  +   +
Subjt:  LDGKLVPLQLSSVKPSVNEFKSTRCDELPE-----TAAKSRRRVEEECSTDPYLFSPKAPRCSSRWRELLGLKKVYQSSSAKNENHKTTSSSSYFSEANS

Query:  KALKYLLHRSSKSSLSSSLDSSLSLPLLKDSD-SESVSLSSSRVSL-SSSSSGHEHEDLHRLSLDCDNKPNSNPIFLHRNPNPTGTNNPPRMRMVKPRSK
         + K  LHR SKSS      ++ S PL K+SD SES+S++SSR+SL SSSSS HE +DL RLSLD D KP++NP    R    +   N PR+R+ KPR  
Subjt:  KALKYLLHRSSKSSLSSSLDSSLSLPLLKDSD-SESVSLSSSRVSL-SSSSSGHEHEDLHRLSLDCDNKPNSNPIFLHRNPNPTGTNNPPRMRMVKPRSK

Query:  SETTNPRSTADHRVGRSPIRRTQGESASSR-LGIRGVSV--DSPRMNSSGKIVFHNLERSSSSPSSFNGGPKFKQ-RGMERSYSANVRVTPVLNVPVCSS
           + P                 G S+SS  +  RG++V  DSPR+N+SGKIVFH LERSSSSP SF GGP+ KQ  GM RSYSANVR+TPVLNVPVCS 
Subjt:  SETTNPRSTADHRVGRSPIRRTQGESASSR-LGIRGVSV--DSPRMNSSGKIVFHNLERSSSSPSSFNGGPKFKQ-RGMERSYSANVRVTPVLNVPVCSS

Query:  LRGSSKSASVFGFGQLFSGTAASSS
          G         FGQLFS +++SSS
Subjt:  LRGSSKSASVFGFGQLFSGTAASSS

AT1G79060.1 unknown protein9.0e-7549.2Show/hide
Query:  MASACVNNVGMSPENFLDCSSAPCHSPYGWLSPRISFSRDFTDGSPASSKLAGAKSKPKPKPAPAGESEIRDPDPELSVCEFEFRLQDPVAMMLPADELF
        MAS CVNNV +S +             YG  +PR SFSRD  DG  +S  +A               SEI   +  +   +FEFRL++    MLPADELF
Subjt:  MASACVNNVGMSPENFLDCSSAPCHSPYGWLSPRISFSRDFTDGSPASSKLAGAKSKPKPKPAPAGESEIRDPDPELSVCEFEFRLQDPVAMMLPADELF

Query:  LDGKLVPLQLSSVKPSVNEFKSTRCDELPETAAKSRR----RVEEECSTDPYLFSPKAPRCSSRWRELLGLKKVYQSSSAKNENHKTTSSSSYFSEANSK
         DGKLV  Q              +  +  E   K RR     +E     D   FSPKAPRCSSRWR+LLGLK+  Q+SS       TT+++     +++ 
Subjt:  LDGKLVPLQLSSVKPSVNEFKSTRCDELPETAAKSRR----RVEEECSTDPYLFSPKAPRCSSRWRELLGLKKVYQSSSAKNENHKTTSSSSYFSEANSK

Query:  ALKYLLHRSSKSSLSSSLDSSL--SLPLLKDSDSESVSLSSSRVSLSSSSSGHEHEDLHRLSLDCDNKPNSNPIF-LHRN-------PNPTGTNNPPRMR
        +LK  LHRSS+SS SSS D+SL  SLPLLKDSDSESVS+SSSR+SLSSSSSGH+HEDL RLSLD + +PN N I  L+ N       P  +   NPPRMR
Subjt:  ALKYLLHRSSKSSLSSSLDSSL--SLPLLKDSDSESVSLSSSRVSLSSSSSGHEHEDLHRLSLDCDNKPNSNPIF-LHRN-------PNPTGTNNPPRMR

Query:  MVKPRSKSETTNPRSTADHRVGRSPIRRTQGESASSRLGIRGVSVDSPRMNSSGKIVFHNLERSSSSPSSFNGGPK-FKQRGMERSYSANVRVTPVLNVP
        +V   +         T   RVGRSP+RR+ GE  +S +  RGVSVDSPR+NSSGKIVF NLERSSSSPSSFNGG   ++ RGMERSYS+NVRVTPVLNVP
Subjt:  MVKPRSKSETTNPRSTADHRVGRSPIRRTQGESASSRLGIRGVSVDSPRMNSSGKIVFHNLERSSSSPSSFNGGPK-FKQRGMERSYSANVRVTPVLNVP

Query:  VCSSLRGSSKSASVFGFGQLFSGTAASSSRNHQSSTNRS
        VC S+RG S       FGQ FS +++SSS  +  + N +
Subjt:  VCSSLRGSSKSASVFGFGQLFSGTAASSSRNHQSSTNRS

AT3G05980.1 unknown protein4.4e-0529.32Show/hide
Query:  LSPRISFSRDFTDGSPASSKLAGAKSKPKPKPAPAGESEIRDPDPELSVCEFEFRLQDPVA--MMLPADELFLDGKLVPL-QLSSVKPSVNEFKSTRCDE
        L PRISFS D +DG                 P    E  ++     + V +FEF   + V+   ML ADELF +GKL+P  Q+   +   N    T  +E
Subjt:  LSPRISFSRDFTDGSPASSKLAGAKSKPKPKPAPAGESEIRDPDPELSVCEFEFRLQDPVA--MMLPADELFLDGKLVPL-QLSSVKPSVNEFKSTRCDE

Query:  LPETAAKSRRRVEEECST-----------DPYLFSPKAPRCSSRWRELLGLKKVYQSSSAKNENHKTTSSSSYFSEANSKALKYLLHRSSK
          E      ++ ++E +            DP   SP+ P+C+  W+ELL LKK    SS+       +S S   S ++S +L+    R  K
Subjt:  LPETAAKSRRRVEEECST-----------DPYLFSPKAPRCSSRWRELLGLKKVYQSSSAKNENHKTTSSSSYFSEANSKALKYLLHRSSK

AT3G12970.1 unknown protein7.2e-5644.87Show/hide
Query:  MASACVNNVGMSPENFLDCSSAPCHSPYGWLSPRISFSRDFTDGSPASSKLAGAKSKPKPKPAPAGESEIRDPDPELSVCEFEFRLQDPVAMMLPADELF
        MAS CV NVG SP              + W S ++S +R+               S+P    APA E+E    DP   V +FEF L+DPV  ML ADELF
Subjt:  MASACVNNVGMSPENFLDCSSAPCHSPYGWLSPRISFSRDFTDGSPASSKLAGAKSKPKPKPAPAGESEIRDPDPELSVCEFEFRLQDPVAMMLPADELF

Query:  LDGKLVPLQLSSVK-PSVNEFKSTRCDELPETAAKSRRRVEEECS--TDPYLFSPKAPRCSSRWRELLGLKKVYQSSSAKNENHKTTSSSSYFSEAN---
         DGKLVPL+ S V  P      S     +  TA K  RR+E E S   DPYLFSP+APRC+ RWRELLGLK++     AK +   + SSSS  S ++   
Subjt:  LDGKLVPLQLSSVK-PSVNEFKSTRCDELPETAAKSRRRVEEECS--TDPYLFSPKAPRCSSRWRELLGLKKVYQSSSAKNENHKTTSSSSYFSEAN---

Query:  -SKALKYLLHRSSKSSLSSSLDSSLSLPLLKDSD---SESVSLSSSRVSL-SSSSSGHEHEDLHRLSLDCDNKPNSNPIFLHRNPNPTGTNNPPRMRMVK
         + + ++ L+RSSKS+           P  KDSD   S S S+SSSR+SL SSSSSGHE +DL RLSLD DNKP              GT N        
Subjt:  -SKALKYLLHRSSKSSLSSSLDSSLSLPLLKDSD---SESVSLSSSRVSL-SSSSSGHEHEDLHRLSLDCDNKPNSNPIFLHRNPNPTGTNNPPRMRMVK

Query:  PRSKSETTNPRSTADHRVGRSPIRRTQ-GESASSRLGIR--GVSVDSPRMNSSGKIVFHNLERSSSSPSSFNGGPKFK-QRGMERSYSANVRVTPVLNVP
        P ++S   +     +    R P R TQ  ES  S +  R   V+ DSPR+N+SGKIVFH LERSSSSP +F GGP+ K   GM RS+SANVR+TPVLNVP
Subjt:  PRSKSETTNPRSTADHRVGRSPIRRTQ-GESASSRLGIR--GVSVDSPRMNSSGKIVFHNLERSSSSPSSFNGGPKFK-QRGMERSYSANVRVTPVLNVP

Query:  VCSSLRGSSKSASVFGFGQLFSGTAASSSRNHQSSTNRS
        V SSLR   KS     FGQLF+ ++++SS +  SS NR+
Subjt:  VCSSLRGSSKSASVFGFGQLFSGTAASSSRNHQSSTNRS


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGCTTCCGCATGTGTTAACAATGTCGGAATGTCGCCGGAGAACTTTCTCGACTGTTCTTCTGCTCCTTGCCATTCCCCCTACGGCTGGCTCAGTCCTCGTATCTCCTT
CAGCCGCGACTTCACGGATGGCTCCCCGGCCTCCTCTAAGCTCGCCGGAGCTAAATCTAAGCCTAAGCCTAAGCCTGCGCCTGCCGGTGAGTCCGAGATTCGAGATCCGG
ATCCTGAACTCTCCGTCTGTGAGTTCGAGTTCCGGCTTCAAGATCCCGTCGCGATGATGCTCCCTGCGGATGAGCTTTTCCTCGATGGAAAGCTGGTGCCGCTCCAGCTC
TCGTCTGTTAAACCATCGGTCAACGAGTTTAAATCCACGAGGTGTGACGAGTTGCCGGAGACTGCTGCTAAATCCCGCCGGAGAGTTGAGGAGGAATGCAGTACGGATCC
GTATCTGTTCTCTCCCAAGGCGCCGAGATGTTCCAGTCGATGGAGGGAGCTTTTAGGGCTGAAGAAGGTGTACCAGAGCAGCAGCGCCAAAAATGAAAATCACAAAACGA
CATCGTCATCGTCTTACTTCTCGGAAGCGAATTCGAAGGCGCTGAAGTATCTTCTTCATCGGAGTTCGAAATCGTCGTTGTCTTCTTCCCTCGATTCCTCGCTGAGCCTT
CCACTTTTGAAGGATTCCGATAGCGAGTCTGTTTCGCTATCTTCATCTCGCGTTTCGCTTTCATCTTCTTCTTCAGGCCACGAACACGAAGATCTCCACAGACTCTCACT
CGATTGCGACAACAAGCCGAACTCAAATCCGATTTTCCTCCATAGGAACCCTAACCCGACCGGCACCAATAATCCGCCGCGCATGAGAATGGTGAAACCGCGGTCTAAAT
CAGAGACAACCAATCCGAGATCAACCGCGGATCATCGAGTAGGACGGAGCCCGATCCGGCGCACGCAAGGGGAATCGGCGAGTAGCAGGTTAGGAATCCGAGGAGTATCC
GTAGACAGTCCCCGAATGAACTCCTCGGGGAAAATCGTATTCCACAACTTGGAGAGAAGCTCGAGCAGTCCGAGTAGCTTCAATGGCGGACCAAAATTCAAGCAGAGAGG
AATGGAGCGGTCGTACTCGGCGAACGTGAGAGTGACTCCAGTACTCAACGTTCCAGTCTGTTCTTCCCTGAGAGGATCCTCGAAATCCGCCTCCGTCTTCGGATTCGGGC
AGTTGTTCTCCGGCACCGCCGCAAGCAGCAGCAGAAACCACCAGAGTAGCACTAACCGCAGT
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGGCTTCCGCATGTGTTAACAATGTCGGAATGTCGCCGGAGAACTTTCTCGACTGTTCTTCTGCTCCTTGCCATTCCCCCTACGGCTGGCTCAGTCCTCGTATCTCCTT
CAGCCGCGACTTCACGGATGGCTCCCCGGCCTCCTCTAAGCTCGCCGGAGCTAAATCTAAGCCTAAGCCTAAGCCTGCGCCTGCCGGTGAGTCCGAGATTCGAGATCCGG
ATCCTGAACTCTCCGTCTGTGAGTTCGAGTTCCGGCTTCAAGATCCCGTCGCGATGATGCTCCCTGCGGATGAGCTTTTCCTCGATGGAAAGCTGGTGCCGCTCCAGCTC
TCGTCTGTTAAACCATCGGTCAACGAGTTTAAATCCACGAGGTGTGACGAGTTGCCGGAGACTGCTGCTAAATCCCGCCGGAGAGTTGAGGAGGAATGCAGTACGGATCC
GTATCTGTTCTCTCCCAAGGCGCCGAGATGTTCCAGTCGATGGAGGGAGCTTTTAGGGCTGAAGAAGGTGTACCAGAGCAGCAGCGCCAAAAATGAAAATCACAAAACGA
CATCGTCATCGTCTTACTTCTCGGAAGCGAATTCGAAGGCGCTGAAGTATCTTCTTCATCGGAGTTCGAAATCGTCGTTGTCTTCTTCCCTCGATTCCTCGCTGAGCCTT
CCACTTTTGAAGGATTCCGATAGCGAGTCTGTTTCGCTATCTTCATCTCGCGTTTCGCTTTCATCTTCTTCTTCAGGCCACGAACACGAAGATCTCCACAGACTCTCACT
CGATTGCGACAACAAGCCGAACTCAAATCCGATTTTCCTCCATAGGAACCCTAACCCGACCGGCACCAATAATCCGCCGCGCATGAGAATGGTGAAACCGCGGTCTAAAT
CAGAGACAACCAATCCGAGATCAACCGCGGATCATCGAGTAGGACGGAGCCCGATCCGGCGCACGCAAGGGGAATCGGCGAGTAGCAGGTTAGGAATCCGAGGAGTATCC
GTAGACAGTCCCCGAATGAACTCCTCGGGGAAAATCGTATTCCACAACTTGGAGAGAAGCTCGAGCAGTCCGAGTAGCTTCAATGGCGGACCAAAATTCAAGCAGAGAGG
AATGGAGCGGTCGTACTCGGCGAACGTGAGAGTGACTCCAGTACTCAACGTTCCAGTCTGTTCTTCCCTGAGAGGATCCTCGAAATCCGCCTCCGTCTTCGGATTCGGGC
AGTTGTTCTCCGGCACCGCCGCAAGCAGCAGCAGAAACCACCAGAGTAGCACTAACCGCAGT
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MASACVNNVGMSPENFLDCSSAPCHSPYGWLSPRISFSRDFTDGSPASSKLAGAKSKPKPKPAPAGESEIRDPDPELSVCEFEFRLQDPVAMMLPADELFLDGKLVPLQL
SSVKPSVNEFKSTRCDELPETAAKSRRRVEEECSTDPYLFSPKAPRCSSRWRELLGLKKVYQSSSAKNENHKTTSSSSYFSEANSKALKYLLHRSSKSSLSSSLDSSLSL
PLLKDSDSESVSLSSSRVSLSSSSSGHEHEDLHRLSLDCDNKPNSNPIFLHRNPNPTGTNNPPRMRMVKPRSKSETTNPRSTADHRVGRSPIRRTQGESASSRLGIRGVS
VDSPRMNSSGKIVFHNLERSSSSPSSFNGGPKFKQRGMERSYSANVRVTPVLNVPVCSSLRGSSKSASVFGFGQLFSGTAASSSRNHQSSTNRS