; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

MS009685 (gene) of Bitter gourd (TR) v1 genome

Gene IDMS009685
OrganismMomordica charantia cv. TR (Bitter gourd (TR) v1)
DescriptionP-loop containing nucleoside triphosphate hydrolases superfamily protein
Genome locationscaffold813:3242158..3245146
RNA-Seq ExpressionMS009685
SyntenyMS009685
Gene Ontology termsGO:0016021 - integral component of membrane (cellular component)
GO:0005525 - GTP binding (molecular function)
InterPro domainsIPR027417 - P-loop containing nucleoside triphosphate hydrolase


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
XP_008458044.1 PREDICTED: uncharacterized protein LOC103497586 isoform X1 [Cucumis melo]4.0e-17373.23Show/hide
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        LY  YV R  EQ +    +    EI+W EIRH+WLDE
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XP_022151793.1 uncharacterized protein LOC111019687 [Momordica charantia]4.5e-21790.44Show/hide
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        EMLKQWMTKGVRHGELVTRKSDASSLINRMRCKSKTGRSFSLSRGIRMINFVIFVVDGASVCKSMDGDDD EKDY QAITTAFN PYLSYGDDKPVVVIT
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XP_022954210.1 uncharacterized protein LOC111456535 [Cucurbita moschata]3.1e-16572.64Show/hide
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        QWMTKGV HGELV RKSDASSLINRMRCK++  + F LSR +RMINFV+FVVDG SV KSMDG DD EKDY + ITTAFNCPYLSYGDDKPVVVITHGDL
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        LSF DRVRVR HLGNLLGIP  KQIFDIP+SYDPVTEL+IIDMLHYCLEH+D  L  K WTV KDH+S +SA  YF+T+MVIVIISAYLY  YV   PEQ
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Query:  VEAARDDSKRLEIIWSEIRHMWLD
         E  ++ SK +EI+W EIRHMWLD
Subjt:  VEAARDDSKRLEIIWSEIRHMWLD

XP_023548122.1 uncharacterized protein LOC111806854 [Cucurbita pepo subsp. pepo]1.1e-16573.11Show/hide
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        K D+ D+ENG I+GEFD  ESQFSS+ L+VEI RRR+NNV REI +S D+LRIRSENLNQAKRKILSYSPG+WIEQVGGMKLSDYDIP+T SL+L+GPKG
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        QWMTKGV HGELV RKSDASSLINRMRCK++  + F LSR +RMINFVIFVVDG SV KSMDG +D EKDY + ITTAFNCPYLSYGDDKPVVVITHGDL
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        LSF DRVRVR HLGNLLGIP  KQIFDIP+SYDPVTEL+IIDMLHYCLEH+D  L  K WTV KDHVS +SA  YF+T MVIVIISAYLY  YV   PEQ
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         E  ++ SK +EI+W EIRHMWLD
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XP_038899526.1 uncharacterized protein LOC120086808 isoform X1 [Benincasa hispida]1.9e-16773.41Show/hide
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        DQ DVENG IIGEFDEIES++SSA L+V+ICRRR+N V REI +SYD+LR RSEN NQAK+KILSYSPGAWIEQVGGMKLSDYDIP+TTSL+L+GPKGSG
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        KSSLINRISKVFEEDHFT +RAQVSC                             NSSGEDGTFFLQEYMI R SKSFCLYDTRGLSDD SDNIE+LKQW
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Query:  MTKGVRHGELVTRKSDASSLINRMRCKSKTGRSFSLSRGIRMINFVIFVVDGASVCKSMDGDDDKEKDYTQAITTAFNCPYLSYGDDKPVVVITHGDLLS
        MTKGVRHGELVTRKSDASSLINRMRCK++  +SF  SR IRMINFVIFVVDG SV +S+DG DDK+KDY + ITTAFNCPYLSYGDDKPVVV+THGDLLS
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Query:  FRDRVRVRIHLGNLLGIPPTKQIFDIPESYDPVTELSIIDMLHYCLEHSDNYLPLKGWTVLKDHVSFIS-ARIYFITVMVIVIISAYLYLAY-VRRLPEQ
        F DRVRVR HLGNLLGIPPTKQIFDIP+ YDPVTEL+IID+LHYCLEH+D  LP KGWTV+KDH+  IS A I F+ +MVI IISAY+Y  Y V R PEQ
Subjt:  FRDRVRVRIHLGNLLGIPPTKQIFDIPESYDPVTELSIIDMLHYCLEHSDNYLPLKGWTVLKDHVSFIS-ARIYFITVMVIVIISAYLYLAY-VRRLPEQ

Query:  VEAARDDSKRLEIIWSEIRHMWLDE
            ++    LEI+W EIRH+WL+E
Subjt:  VEAARDDSKRLEIIWSEIRHMWLDE

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0K6S8 Uncharacterized protein4.9e-16169.43Show/hide
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        RG NK       DQ +VENG IIGEF+EIES++SSA LDV+ICR R N V REI +SYD+LRIRSENLNQAK+KILSYSPGAWIEQVGGMKLSDYDIP+T
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Query:  TSLLLVGPKGSGKSSLINRISKVFEEDHFTLDRAQVSCISLNSFGRSLNENITHLFELKICNFFWVDNSSGEDGTFFLQEYMIPRHSKSFCLYDTRGLSD
        TSL+L+GPKGSGKSSLINRISKVFEEDHF  +RAQVSC                             NSSGEDGTFFL EYMI R SKSFCLYDTRGLS+
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Query:  DSSDNIEMLKQWMTKGVRHGELVTRKSDASSLINRMRCKSKTGRSFSLSRGIRMINFVIFVVDGASVCKSMDGDDDKEKDYTQAITTAFNCPYLSYGDDK
        D SDNIEMLKQWM+KGV HG+LVTRKSDASSLINRMRCK++  +SF  SR +R+INFVIFVVDG SV KS+DG DDK+KDY + ITTAFNCPYLSYGDDK
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        PVVV+THGDLLSF + VRVR HLGNLLGIP TKQIFDIP+ YDPVTEL+IIDMLHYCLEH+D  LP K WTV+KD  S  +A IYF+ +++IV ISA LY
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          YV    EQ    +     +EI+W EIRH+WLDE
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A0A1S3C716 uncharacterized protein LOC103497586 isoform X11.9e-17373.23Show/hide
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        RGYNK       DQ +VENG IIGEFDEIE ++SSA LDV+ICRRR++ V REI +SYD+LR RSENL QAK+K LSYSPGAWIEQVGGMKLSDYDIP+T
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Query:  TSLLLVGPKGSGKSSLINRISKVFEEDHFTLDRAQVSCISLNSFG-RSLNENITHLFELKICNFFW-VDNSSGEDGTFFLQEYMIPRHSKSFCLYDTRGL
         SL+L+GPKGSGKSSLINRISKVFEEDHF  +RAQVSCISLN+F    L EN +HLFELKICN FW + NSSGE GTFFL EYMI R SKSFCLYDTRGL
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        SDD SDNIE LKQWM+KGVRHGELVTRKSDAS+ INRM+CK++  +SF  SR IR+INFVIFVVDG SV KS+DG DDK+KDY + ITTAFNCPYLSYGD
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        LY  YV R  EQ +    +    EI+W EIRH+WLDE
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A0A6J1DD58 uncharacterized protein LOC1110196872.2e-21790.44Show/hide
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        EMLKQWMTKGVRHGELVTRKSDASSLINRMRCKSKTGRSFSLSRGIRMINFVIFVVDGASVCKSMDGDDD EKDY QAITTAFN PYLSYGDDKPVVVIT
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        HGDLLSF DRVRVRIHLGNLLGIPPTKQIFDIPESYDPVTELSIIDMLHYCLEHSD YLPLKGWTVLKDHVSFISARIYFITVMVIVII+AYLYLAYV R
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        LPEQVEAARDDSKRLEIIWSEIRHMWLDE
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A0A6J1GRU3 uncharacterized protein LOC1114565351.5e-16572.64Show/hide
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        K D+ D+ENG I+GEFD  ESQFSS+ L+VEI RRR+NNV REI +S D+LRIRSENLNQAKRKILSYSPG+WIEQVGGMKLSDYDIP+T SL+L+GPKG
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        SGKSSLINRISKVF+ED F  +RAQVSC                             NSSGEDGTFFLQEYMI R SKSFCLYDTRGLSDDS +NIE+LK
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        QWMTKGV HGELV RKSDASSLINRMRCK++  + F LSR +RMINFV+FVVDG SV KSMDG DD EKDY + ITTAFNCPYLSYGDDKPVVVITHGDL
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        LSF DRVRVR HLGNLLGIP  KQIFDIP+SYDPVTEL+IIDMLHYCLEH+D  L  K WTV KDH+S +SA  YF+T+MVIVIISAYLY  YV   PEQ
Subjt:  LSFRDRVRVRIHLGNLLGIPPTKQIFDIPESYDPVTELSIIDMLHYCLEHSDNYLPLKGWTVLKDHVSFISARIYFITVMVIVIISAYLYLAYVRRLPEQ

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         E  ++ SK +EI+W EIRHMWLD
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A0A6J1JVI8 uncharacterized protein LOC1114882252.8e-16472.64Show/hide
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        K D+ D+ENG I+GEFD  ESQFSS+ L+VEI RRR+NNV REI +S D+LRIRSENLNQAKRKILSYSPG+WIEQVGGMKLSDYDIP+T SL+L+GPKG
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Query:  SGKSSLINRISKVFEEDHFTLDRAQVSCISLNSFGRSLNENITHLFELKICNFFWVDNSSGEDGTFFLQEYMIPRHSKSFCLYDTRGLSDDSSDNIEMLK
        SGKSSLINRI KVF+ED F  +RAQVSC                             NSSGEDGTFFLQEYMI R SKSFCLYDTRGLSDDS +NIE+LK
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        QWMTKGV HGELV RKSDASSLINRM CK++  + F LSR +RMINFVIFVVDG SV KSMDG DD EKDY   ITTAFNCPYLSYGDDKPVVVITHGDL
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        LSF DRVRVR +LGNLLGIP  KQIFDIP+SYDPVTEL+IIDMLHYCLEH+D  L  K WTV KDHVS +SA  YF+TVMVIVIISAYLY  YV   PEQ
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         E  ++ SK +EI+W EIRHMWLD
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT4G13030.1 P-loop containing nucleoside triphosphate hydrolases superfamily protein1.0e-7344.76Show/hide
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        +D F LDRAQ       SFG                       +  + GT+F+QEYMI R  S SFCLYDTRGLS   SSDN  M++QWMT+GV HGE V
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           SD+S L +R+     TG         R +N +IFVV+   + KSM    + E  Y   ITTAFN P L + DDKP VV+THGD+LS  +R RVR+ L
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        G LLGIPP KQIFDIPES D  T ++I ++L Y L+H+D    +LP K +T+ K     ++    +I+++ I+ I+  L++A
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AT4G13030.2 P-loop containing nucleoside triphosphate hydrolases superfamily protein1.0e-7344.76Show/hide
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
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mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
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Protein sequenceShow/hide protein sequence
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