CuGenDBv2

Gene ID	MS009932
Organism	Momordica charantia cv. TR (Bitter gourd (TR) v1)
Description	RAB6-interacting golgin
Genome location	scaffold943_1:103046..104596
RNA-Seq Expression	MS009932
Synteny	MS009932
Gene Ontology terms	GO:0005794 - Golgi apparatus (cellular component)
InterPro domains	IPR007033 - RAB6-interacting golgin

Homology

Show/hide homology

GenBank top hits

e value

%identity

Alignment

KAG6595202.1 hypothetical protein SDJN03_11755, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]

1.7e-63

85.98

Show/hide

Query:  QGEQNQ-----QLMLQNSGNLSFSSKEDEEMSKSALSAFREKEEEIERMRIQIQHKLQARLGRVEEETRRLSSIREELEAIGDPTRKEIGQIRKKIDAVN
        Q EQN      QLMLQNSGN SFSSK+DEEMSKSALSAFREKEEEIERMR ++Q KLQARLGRVEEE RRL+SIREELEAI DP RKEIGQIRK+IDAVN
Subjt:  QGEQNQ-----QLMLQNSGNLSFSSKEDEEMSKSALSAFREKEEEIERMRIQIQHKLQARLGRVEEETRRLSSIREELEAIGDPTRKEIGQIRKKIDAVN

Query:  KELKPLGQTCQKKEKEYKDALDAFNEKNNEKVQLISKLMEMVGESERLRMKRLEELSKHVDNTS
        KELKPLGQTCQK+EKEYKDALDAFNEKN+EKVQL+SKLMEMVGESERLR++RLEELSKHVDNTS
Subjt:  KELKPLGQTCQKKEKEYKDALDAFNEKNNEKVQLISKLMEMVGESERLRMKRLEELSKHVDNTS

XP_022143816.1 uncharacterized protein LOC111013636 [Momordica charantia]

1.9e-75

100

Show/hide

Query:  MQAQGEQNQQLMLQNSGNLSFSSKEDEEMSKSALSAFREKEEEIERMRIQIQHKLQARLGRVEEETRRLSSIREELEAIGDPTRKEIGQIRKKIDAVNKE
        MQAQGEQNQQLMLQNSGNLSFSSKEDEEMSKSALSAFREKEEEIERMRIQIQHKLQARLGRVEEETRRLSSIREELEAIGDPTRKEIGQIRKKIDAVNKE
Subjt:  MQAQGEQNQQLMLQNSGNLSFSSKEDEEMSKSALSAFREKEEEIERMRIQIQHKLQARLGRVEEETRRLSSIREELEAIGDPTRKEIGQIRKKIDAVNKE

Query:  LKPLGQTCQKKEKEYKDALDAFNEKNNEKVQLISKLMEMVGESERLRMKRLEELSKHVDNTS
        LKPLGQTCQKKEKEYKDALDAFNEKNNEKVQLISKLMEMVGESERLRMKRLEELSKHVDNTS
Subjt:  LKPLGQTCQKKEKEYKDALDAFNEKNNEKVQLISKLMEMVGESERLRMKRLEELSKHVDNTS

XP_022962812.1 uncharacterized protein KIAA1211-like [Cucurbita moschata]

4.8e-63

85.37

Show/hide

Query:  QGEQNQ-----QLMLQNSGNLSFSSKEDEEMSKSALSAFREKEEEIERMRIQIQHKLQARLGRVEEETRRLSSIREELEAIGDPTRKEIGQIRKKIDAVN
        Q EQN      QLMLQNSGN SFSSK+DEEMSKSALSAFREKEEEIERMR ++Q KLQARLGRVEEE RRL+SIREELEAI DP RKEIGQIRK+IDAVN
Subjt:  QGEQNQ-----QLMLQNSGNLSFSSKEDEEMSKSALSAFREKEEEIERMRIQIQHKLQARLGRVEEETRRLSSIREELEAIGDPTRKEIGQIRKKIDAVN

Query:  KELKPLGQTCQKKEKEYKDALDAFNEKNNEKVQLISKLMEMVGESERLRMKRLEELSKHVDNTS
        KELKPLGQTCQK+EKEYKDAL+AFNEKN+EKVQL+SKLMEMVGESERLR++RLEELSKHVDNTS
Subjt:  KELKPLGQTCQKKEKEYKDALDAFNEKNNEKVQLISKLMEMVGESERLRMKRLEELSKHVDNTS

XP_022972692.1 uncharacterized protein KIAA1211-like [Cucurbita maxima]

7.5e-64

86.59

Show/hide

Query:  QGEQNQ-----QLMLQNSGNLSFSSKEDEEMSKSALSAFREKEEEIERMRIQIQHKLQARLGRVEEETRRLSSIREELEAIGDPTRKEIGQIRKKIDAVN
        Q EQN      QLMLQNSGN SFSSK+DEEMSKSALSAFREKEEEIERMR ++Q KLQARLGRVEEE RRL+SIREELEAI DP RKEIGQIRK+IDAVN
Subjt:  QGEQNQ-----QLMLQNSGNLSFSSKEDEEMSKSALSAFREKEEEIERMRIQIQHKLQARLGRVEEETRRLSSIREELEAIGDPTRKEIGQIRKKIDAVN

Query:  KELKPLGQTCQKKEKEYKDALDAFNEKNNEKVQLISKLMEMVGESERLRMKRLEELSKHVDNTS
        KELKPLGQTCQKKEKEYKDALDAFNEKN+EKVQL+SKLMEMVGESERLR++RLEELSKHVDNTS
Subjt:  KELKPLGQTCQKKEKEYKDALDAFNEKNNEKVQLISKLMEMVGESERLRMKRLEELSKHVDNTS

XP_023517191.1 uncharacterized protein KIAA1211-like [Cucurbita pepo subsp. pepo]

1.7e-63

85.98

Show/hide

Query:  QGEQNQ-----QLMLQNSGNLSFSSKEDEEMSKSALSAFREKEEEIERMRIQIQHKLQARLGRVEEETRRLSSIREELEAIGDPTRKEIGQIRKKIDAVN
        Q EQN      QLMLQNSGN SFSSK+DEEMSKSALSAFREKEEEIERMR ++Q KLQARLGRVEEE RRL+SIREELEAI DP RKEIGQIRK+IDAVN
Subjt:  QGEQNQ-----QLMLQNSGNLSFSSKEDEEMSKSALSAFREKEEEIERMRIQIQHKLQARLGRVEEETRRLSSIREELEAIGDPTRKEIGQIRKKIDAVN

Query:  KELKPLGQTCQKKEKEYKDALDAFNEKNNEKVQLISKLMEMVGESERLRMKRLEELSKHVDNTS
        KELKPLGQTCQK+EKEYKDALDAFNEKN+EKVQL+SKLMEMVGESERLR++RLEELSKHVDNTS
Subjt:  KELKPLGQTCQKKEKEYKDALDAFNEKNNEKVQLISKLMEMVGESERLRMKRLEELSKHVDNTS

TrEMBL top hits

e value

%identity

Alignment

A0A6J1CRG0 RAB6-interacting golgin

9.2e-76

100

Show/hide

Query:  MQAQGEQNQQLMLQNSGNLSFSSKEDEEMSKSALSAFREKEEEIERMRIQIQHKLQARLGRVEEETRRLSSIREELEAIGDPTRKEIGQIRKKIDAVNKE
        MQAQGEQNQQLMLQNSGNLSFSSKEDEEMSKSALSAFREKEEEIERMRIQIQHKLQARLGRVEEETRRLSSIREELEAIGDPTRKEIGQIRKKIDAVNKE
Subjt:  MQAQGEQNQQLMLQNSGNLSFSSKEDEEMSKSALSAFREKEEEIERMRIQIQHKLQARLGRVEEETRRLSSIREELEAIGDPTRKEIGQIRKKIDAVNKE

Query:  LKPLGQTCQKKEKEYKDALDAFNEKNNEKVQLISKLMEMVGESERLRMKRLEELSKHVDNTS
        LKPLGQTCQKKEKEYKDALDAFNEKNNEKVQLISKLMEMVGESERLRMKRLEELSKHVDNTS
Subjt:  LKPLGQTCQKKEKEYKDALDAFNEKNNEKVQLISKLMEMVGESERLRMKRLEELSKHVDNTS

A0A6J1EJF7 RAB6-interacting golgin

2.2e-61

85.62

Show/hide

Query:  QGEQNQQLMLQNSGNLSFSSKEDEEMSKSALSAFREKEEEIERMRIQIQHKLQARLGRVEEETRRLSSIREELEAI-GDPTRKEIGQIRKKIDAVNKELK
        Q  Q  Q+MLQNSGNLSFSSKEDEEMSKSALSAFREKEEEIERMR ++Q KLQARLGRVEEE+RRL+SIREELE I GDPTRKEIGQIRK+ID +NKELK
Subjt:  QGEQNQQLMLQNSGNLSFSSKEDEEMSKSALSAFREKEEEIERMRIQIQHKLQARLGRVEEETRRLSSIREELEAI-GDPTRKEIGQIRKKIDAVNKELK

Query:  PLGQTCQKKEKEYKDALDAFNEKNNEKVQLISKLMEMVGESERLRMKRLEELSKHVDNTS
        PLGQ CQKKEKEYKDALDAFNEKNNEKV  ISKLMEMVGESER+R+KRLEELSKHVDN +
Subjt:  PLGQTCQKKEKEYKDALDAFNEKNNEKVQLISKLMEMVGESERLRMKRLEELSKHVDNTS

A0A6J1HDL2 RAB6-interacting golgin

2.3e-63

85.37

Show/hide

Query:  QGEQNQ-----QLMLQNSGNLSFSSKEDEEMSKSALSAFREKEEEIERMRIQIQHKLQARLGRVEEETRRLSSIREELEAIGDPTRKEIGQIRKKIDAVN
        Q EQN      QLMLQNSGN SFSSK+DEEMSKSALSAFREKEEEIERMR ++Q KLQARLGRVEEE RRL+SIREELEAI DP RKEIGQIRK+IDAVN
Subjt:  QGEQNQ-----QLMLQNSGNLSFSSKEDEEMSKSALSAFREKEEEIERMRIQIQHKLQARLGRVEEETRRLSSIREELEAIGDPTRKEIGQIRKKIDAVN

Query:  KELKPLGQTCQKKEKEYKDALDAFNEKNNEKVQLISKLMEMVGESERLRMKRLEELSKHVDNTS
        KELKPLGQTCQK+EKEYKDAL+AFNEKN+EKVQL+SKLMEMVGESERLR++RLEELSKHVDNTS
Subjt:  KELKPLGQTCQKKEKEYKDALDAFNEKNNEKVQLISKLMEMVGESERLRMKRLEELSKHVDNTS

A0A6J1I5J6 RAB6-interacting golgin

3.6e-64

86.59

Show/hide

Query:  QGEQNQ-----QLMLQNSGNLSFSSKEDEEMSKSALSAFREKEEEIERMRIQIQHKLQARLGRVEEETRRLSSIREELEAIGDPTRKEIGQIRKKIDAVN
        Q EQN      QLMLQNSGN SFSSK+DEEMSKSALSAFREKEEEIERMR ++Q KLQARLGRVEEE RRL+SIREELEAI DP RKEIGQIRK+IDAVN
Subjt:  QGEQNQ-----QLMLQNSGNLSFSSKEDEEMSKSALSAFREKEEEIERMRIQIQHKLQARLGRVEEETRRLSSIREELEAIGDPTRKEIGQIRKKIDAVN

Query:  KELKPLGQTCQKKEKEYKDALDAFNEKNNEKVQLISKLMEMVGESERLRMKRLEELSKHVDNTS
        KELKPLGQTCQKKEKEYKDALDAFNEKN+EKVQL+SKLMEMVGESERLR++RLEELSKHVDNTS
Subjt:  KELKPLGQTCQKKEKEYKDALDAFNEKNNEKVQLISKLMEMVGESERLRMKRLEELSKHVDNTS

A0A6J1IS07 RAB6-interacting golgin

4.4e-62

87.34

Show/hide

Query:  QGEQNQQLMLQNSGNLSFSSKEDEEMSKSALSAFREKEEEIERMRIQIQHKLQARLGRVEEETRRLSSIREELEAI-GDPTRKEIGQIRKKIDAVNKELK
        Q  Q  Q+MLQNSGNLSFSSKEDEEMSKSALSAFREKEEEIERMR ++Q KLQARLGRVEEE+RRL+SIREELE I GDPTRKEIGQIRK+ID +NKELK
Subjt:  QGEQNQQLMLQNSGNLSFSSKEDEEMSKSALSAFREKEEEIERMRIQIQHKLQARLGRVEEETRRLSSIREELEAI-GDPTRKEIGQIRKKIDAVNKELK

Query:  PLGQTCQKKEKEYKDALDAFNEKNNEKVQLISKLMEMVGESERLRMKRLEELSKHVDN
        PLGQ CQKKEKEYKDALDAFNEKNNEKVQ ISKLMEMVGESER+R+KRLEELSKHVDN
Subjt:  PLGQTCQKKEKEYKDALDAFNEKNNEKVQLISKLMEMVGESERLRMKRLEELSKHVDN

SwissProt top hits

e value

%identity

Alignment

B1H222 RAB6-interacting golgin

4.1e-04

28.69

Show/hide

Query:  REKEEEIERMRIQIQHKLQARLGRVEEETRRLSSIREELEAIGDPTRKEIGQIRKKIDAVNKELKPLGQTCQKKEKEYKDALDAFNEKNNEKVQLISKLM
        R  EE+ +R +  +   +  R  R + ET +L  I++EL+A+ D    +IG +R +ID  + E     +   + E EY  A      K   K QL   L 
Subjt:  REKEEEIERMRIQIQHKLQARLGRVEEETRRLSSIREELEAIGDPTRKEIGQIRKKIDAVNKELKPLGQTCQKKEKEYKDALDAFNEKNNEKVQLISKLM

Query:  EMVGESERLRMKRLEELSKHVD
         ++ ++E  + ++LEEL + +D
Subjt:  EMVGESERLRMKRLEELSKHVD

Q8BRM2 RAB6-interacting golgin

9.0e-04

28.69

Show/hide

Query:  REKEEEIERMRIQIQHKLQARLGRVEEETRRLSSIREELEAIGDPTRKEIGQIRKKIDAVNKELKPLGQTCQKKEKEYKDALDAFNEKNNEKVQLISKLM
        R  EE+ +R +  +   +  R  + + ET +L  I++EL+A+ D    +IG +R +ID  + E     +   + E EY  A      K   K QL   L 
Subjt:  REKEEEIERMRIQIQHKLQARLGRVEEETRRLSSIREELEAIGDPTRKEIGQIRKKIDAVNKELKPLGQTCQKKEKEYKDALDAFNEKNNEKVQLISKLM

Query:  EMVGESERLRMKRLEELSKHVD
         ++ ++E  + K+LEEL + +D
Subjt:  EMVGESERLRMKRLEELSKHVD

Arabidopsis top hits

e value

%identity

Alignment

AT2G36410.1 Family of unknown function (DUF662)

6.1e-48

64.63

Show/hide

Query:  QAQGEQNQQLMLQNSGNLSFS---SKEDEEMSKSALSAFREKEEEIERMRIQIQHKLQARLGRVEEETRRLSSIREELEAIGDPTRKEIGQIRKKIDAVN
        Q Q +Q    M+ ++G+LSFS   S+EDEEM++SALSAFR KE+EIE+ R++++ ++QA+LGRVE+ET+RLS+IREELE++ DP RKE+  +RKKID+VN
Subjt:  QAQGEQNQQLMLQNSGNLSFS---SKEDEEMSKSALSAFREKEEEIERMRIQIQHKLQARLGRVEEETRRLSSIREELEAIGDPTRKEIGQIRKKIDAVN

Query:  KELKPLGQTCQKKEKEYKDALDAFNEKNNEKVQLISKLMEM---VGESERLRMKRLEELSKHVD
        KELKPLG T QKKE+EYK+ALD FNEKN EKVQLI+KLMEM   VGESE+LRM +LEELSK ++
Subjt:  KELKPLGQTCQKKEKEYKDALDAFNEKNNEKVQLISKLMEM---VGESERLRMKRLEELSKHVD

AT2G36410.2 Family of unknown function (DUF662)

3.3e-49

65.22

Show/hide

Query:  QAQGEQNQQLMLQNSGNLSFS---SKEDEEMSKSALSAFREKEEEIERMRIQIQHKLQARLGRVEEETRRLSSIREELEAIGDPTRKEIGQIRKKIDAVN
        Q Q +Q    M+ ++G+LSFS   S+EDEEM++SALSAFR KE+EIE+ R++++ ++QA+LGRVE+ET+RLS+IREELE++ DP RKE+  +RKKID+VN
Subjt:  QAQGEQNQQLMLQNSGNLSFS---SKEDEEMSKSALSAFREKEEEIERMRIQIQHKLQARLGRVEEETRRLSSIREELEAIGDPTRKEIGQIRKKIDAVN

Query:  KELKPLGQTCQKKEKEYKDALDAFNEKNNEKVQLISKLMEMVGESERLRMKRLEELSKHVD
        KELKPLG T QKKE+EYK+ALD FNEKN EKVQLI+KLME+VGESE+LRM +LEELSK ++
Subjt:  KELKPLGQTCQKKEKEYKDALDAFNEKNNEKVQLISKLMEMVGESERLRMKRLEELSKHVD

AT2G36410.3 Family of unknown function (DUF662)

4.7e-48

64.6

Show/hide

Query:  QAQGEQNQQLMLQNSGNLSFS---SKEDEEMSKSALSAFREKEEEIERMRIQIQHKLQARLGRVEEETRRLSSIREELEAIGDPTRKEIGQIRKKIDAVN
        Q Q +Q    M+ ++G+LSFS   S+EDEEM++SALSAFR KE+EIE+ R++++ ++QA+LGRVE+ET+RLS+IREELE++ DP RKE+  +RKKID+VN
Subjt:  QAQGEQNQQLMLQNSGNLSFS---SKEDEEMSKSALSAFREKEEEIERMRIQIQHKLQARLGRVEEETRRLSSIREELEAIGDPTRKEIGQIRKKIDAVN

Query:  KELKPLGQTCQKKEKEYKDALDAFNEKNNEKVQLISKLMEMVGESERLRMKRLEELSKHVD
        KELKPLG T QKK  EYK+ALD FNEKN EKVQLI+KLME+VGESE+LRM +LEELSK ++
Subjt:  KELKPLGQTCQKKEKEYKDALDAFNEKNNEKVQLISKLMEMVGESERLRMKRLEELSKHVD

AT3G09980.1 Family of unknown function (DUF662)

3.8e-50

66.46

Show/hide

Query:  AQGEQNQQLMLQNSGNLSFS---SKEDEEMSKSALSAFREKEEEIERMRIQIQHKLQARLGRVEEETRRLSSIREELEAIGDPTRKEIGQIRKKIDAVNK
        A    ++QL  Q SG++SFS   SKEDEEMS++ALSAFR KEEEIE+ +++I+ ++QA+LGRVEEET+RL+ IREELE + DP RKE+  +RKKID+VNK
Subjt:  AQGEQNQQLMLQNSGNLSFS---SKEDEEMSKSALSAFREKEEEIERMRIQIQHKLQARLGRVEEETRRLSSIREELEAIGDPTRKEIGQIRKKIDAVNK

Query:  ELKPLGQTCQKKEKEYKDALDAFNEKNNEKVQLISKLMEMVGESERLRMKRLEELSKHVDN
        ELKPLG T QKKE+EYK+AL+AFNEKN EKVQLI++LME+VGESE++RMK+LEELSK++D+
Subjt:  ELKPLGQTCQKKEKEYKDALDAFNEKNNEKVQLISKLMEMVGESERLRMKRLEELSKHVDN

AT3G52920.2 Family of unknown function (DUF662)

8.0e-48

64.02

Show/hide

Query:  QAQGEQNQQLMLQNSGNLSFS---SKEDEEMSKSALSAFREKEEEIERMRIQIQHKLQARLGRVEEETRRLSSIREELEAIGDPTRKEIGQIRKKIDAVN
        +A  +  QQ+M     +LSFS   SKEDEEM++SALSAFR KE+EIE+ +++++ +++A+LGRVEEETRRL+SIREELE + DP RKE+  +RKKID+VN
Subjt:  QAQGEQNQQLMLQNSGNLSFS---SKEDEEMSKSALSAFREKEEEIERMRIQIQHKLQARLGRVEEETRRLSSIREELEAIGDPTRKEIGQIRKKIDAVN

Query:  KELKPLGQTCQKKEKEYKDALDAFNEKNNEKVQLISKLMEMVGESERLRMKRLEELSKHVDNTS
        KELKPLG T QKKE+EYK+ALD FNEKN EKVQLI+KLME+VGESE+LR+K+L+ELS+ +D  S
Subjt:  KELKPLGQTCQKKEKEYKDALDAFNEKNNEKVQLISKLMEMVGESERLRMKRLEELSKHVDNTS

Sequences

Show/hide sequences

CDS sequence

Show/hide CDS sequence

ATGCAGGCGCAGGGGGAGCAGAATCAGCAGCTAATGTTGCAGAATTCTGGAAATTTGAGCTTCAGCAGTAAGGAAGATGAAGAGATGTCGAAATCCGCGCTTTCGGCTTT
TAGGGAAAAGGAGGAGGAGATCGAGCGCATGAGAATCCAAATTCAGCACAAACTTCAAGCTCGACTCGGCCGAGTCGAGGAAGAAACCAGGCGTTTGTCCTCCATTCGAG
AGGAGCTTGAAGCAATAGGGGATCCAACGAGGAAGGAAATTGGACAAATTCGTAAGAAAATTGATGCTGTAAACAAGGAATTAAAGCCTCTTGGACAGACCTGCCAAAAG
AAGGAGAAAGAATACAAAGATGCCCTTGATGCGTTTAACGAAAAGAACAATGAAAAAGTACAGTTAATATCAAAACTAATGGAGATGGTTGGTGAAAGCGAAAGGCTAAG
GATGAAGAGGTTGGAAGAGCTGAGTAAGCATGTCGATAACACTTCC

mRNA sequence

Show/hide mRNA sequence

Protein sequence

Show/hide protein sequence

MQAQGEQNQQLMLQNSGNLSFSSKEDEEMSKSALSAFREKEEEIERMRIQIQHKLQARLGRVEEETRRLSSIREELEAIGDPTRKEIGQIRKKIDAVNKELKPLGQTCQK
KEKEYKDALDAFNEKNNEKVQLISKLMEMVGESERLRMKRLEELSKHVDNTS

MS009932 (gene) of Bitter gourd (TR) v1 genome