| GenBank top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| KAA0043575.1 exopolygalacturonase-like [Cucumis melo var. makuwa] | 7.0e-47 | 70.63 | Show/hide |
Query: SVGSLGKYPTDKSVIDVLVKNCTIFNTTNGARIKTWAGTMLGLANEIIFKDIILNNVKYPVIIDQIYGTKKKK----KLSDFHFRNVRGTLTTNVTMLL-
SVGSLGKY +KSV +VLVKNCTIFN TNGARIKTWA + GLA+ IIF+DI++ NVK P+IIDQ YGTKKKK K+SD HF+N+RGT TTNV +LL
Subjt: SVGSLGKYPTDKSVIDVLVKNCTIFNTTNGARIKTWAGTMLGLANEIIFKDIILNNVKYPVIIDQIYGTKKKK----KLSDFHFRNVRGTLTTNVTMLL-
Query: -SALFPCEGVELNDINLVYSGTSLRNTAIVSSCLNVKIATYGV
S L PCEGVEL DINL Y GT+LRNT IVSSC N KIAT+GV
Subjt: -SALFPCEGVELNDINLVYSGTSLRNTAIVSSCLNVKIATYGV
|
|
| KAA0048658.1 exopolygalacturonase-like [Cucumis melo var. makuwa] | 2.0e-46 | 69.93 | Show/hide |
Query: SVGSLGKYPTDKSVIDVLVKNCTIFNTTNGARIKTWAGTMLGLANEIIFKDIILNNVKYPVIIDQIYGTKKKK----KLSDFHFRNVRGTLTTNVTMLL-
SVGSLGKY +KSV +VLVKNCTIFN TNGARIKTWA + GLA+ IIF+DI++ NVK P+IIDQ YGTKKKK K+SD HF+N+RGT TTNV +LL
Subjt: SVGSLGKYPTDKSVIDVLVKNCTIFNTTNGARIKTWAGTMLGLANEIIFKDIILNNVKYPVIIDQIYGTKKKK----KLSDFHFRNVRGTLTTNVTMLL-
Query: -SALFPCEGVELNDINLVYSGTSLRNTAIVSSCLNVKIATYGV
S L PCEGVEL DINL Y GT+LRNT IVSSC N KI T+GV
Subjt: -SALFPCEGVELNDINLVYSGTSLRNTAIVSSCLNVKIATYGV
|
|
| KAA0048661.1 exopolygalacturonase-like [Cucumis melo var. makuwa] | 7.0e-47 | 70.63 | Show/hide |
Query: SVGSLGKYPTDKSVIDVLVKNCTIFNTTNGARIKTWAGTMLGLANEIIFKDIILNNVKYPVIIDQIYGTKKKK----KLSDFHFRNVRGTLTTNVTMLL-
SVGSLGKY +KSV +VLVKNCTIFN TNGARIKTWA + GLA+ IIF+DI++ NVK P+IIDQ YGTKKKK K+SD HF+N+RGT TTNV +LL
Subjt: SVGSLGKYPTDKSVIDVLVKNCTIFNTTNGARIKTWAGTMLGLANEIIFKDIILNNVKYPVIIDQIYGTKKKK----KLSDFHFRNVRGTLTTNVTMLL-
Query: -SALFPCEGVELNDINLVYSGTSLRNTAIVSSCLNVKIATYGV
S L PCEGVEL DINL Y GT+LRNT IVSSC N KIAT+GV
Subjt: -SALFPCEGVELNDINLVYSGTSLRNTAIVSSCLNVKIATYGV
|
|
| XP_022153668.1 exopolygalacturonase-like [Momordica charantia] | 1.4e-50 | 74.83 | Show/hide |
Query: SVGSLGKYPTDKSVIDVLVKNCTIFNTTNGARIKTWAGTMLGLANEIIFKDIILNNVKYPVIIDQIYGTKKKK----KLSDFHFRNVRGTLTTNVTMLL-
SVGSLGKYP +KSV+ VLVKNCTIFNTTNGARIKTWAGT+ G A EIIF+DII+ NVK P+IIDQ YGTK+KK ++SD HF+N+RGT TTNV +LL
Subjt: SVGSLGKYPTDKSVIDVLVKNCTIFNTTNGARIKTWAGTMLGLANEIIFKDIILNNVKYPVIIDQIYGTKKKK----KLSDFHFRNVRGTLTTNVTMLL-
Query: -SALFPCEGVELNDINLVYSGTSLRNTAIVSSCLNVKIATYGV
SALFPCEGVEL DINL YSGT+ RNT IVSSCLN KIAT GV
Subjt: -SALFPCEGVELNDINLVYSGTSLRNTAIVSSCLNVKIATYGV
|
|
| XP_031745093.1 polygalacturonase-like [Cucumis sativus] | 4.6e-46 | 69.93 | Show/hide |
Query: SVGSLGKYPTDKSVIDVLVKNCTIFNTTNGARIKTWAGTMLGLANEIIFKDIILNNVKYPVIIDQIYGTKKKK----KLSDFHFRNVRGTLTTNVTMLL-
SVGSLGKY +K V DVLVKNCTIFN TNGARIKTWA + GLA+ IIF+DI++ NVK P+IIDQ YGTKKKK K+S+ F+N+RGT TTNV +LL
Subjt: SVGSLGKYPTDKSVIDVLVKNCTIFNTTNGARIKTWAGTMLGLANEIIFKDIILNNVKYPVIIDQIYGTKKKK----KLSDFHFRNVRGTLTTNVTMLL-
Query: -SALFPCEGVELNDINLVYSGTSLRNTAIVSSCLNVKIATYGV
S LFPCEGVEL DINL Y GT+LRNT IVSSC N KIAT+GV
Subjt: -SALFPCEGVELNDINLVYSGTSLRNTAIVSSCLNVKIATYGV
|
|
| TrEMBL top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| A0A5A7TQ89 Exopolygalacturonase-like | 3.4e-47 | 70.63 | Show/hide |
Query: SVGSLGKYPTDKSVIDVLVKNCTIFNTTNGARIKTWAGTMLGLANEIIFKDIILNNVKYPVIIDQIYGTKKKK----KLSDFHFRNVRGTLTTNVTMLL-
SVGSLGKY +KSV +VLVKNCTIFN TNGARIKTWA + GLA+ IIF+DI++ NVK P+IIDQ YGTKKKK K+SD HF+N+RGT TTNV +LL
Subjt: SVGSLGKYPTDKSVIDVLVKNCTIFNTTNGARIKTWAGTMLGLANEIIFKDIILNNVKYPVIIDQIYGTKKKK----KLSDFHFRNVRGTLTTNVTMLL-
Query: -SALFPCEGVELNDINLVYSGTSLRNTAIVSSCLNVKIATYGV
S L PCEGVEL DINL Y GT+LRNT IVSSC N KIAT+GV
Subjt: -SALFPCEGVELNDINLVYSGTSLRNTAIVSSCLNVKIATYGV
|
|
| A0A5A7U0D6 Exopolygalacturonase-like | 9.9e-47 | 69.93 | Show/hide |
Query: SVGSLGKYPTDKSVIDVLVKNCTIFNTTNGARIKTWAGTMLGLANEIIFKDIILNNVKYPVIIDQIYGTKKKK----KLSDFHFRNVRGTLTTNVTMLL-
SVGSLGKY +KSV +VLVKNCTIFN TNGARIKTWA + GLA+ IIF+DI++ NVK P+IIDQ YGTKKKK K+SD HF+N+RGT TTNV +LL
Subjt: SVGSLGKYPTDKSVIDVLVKNCTIFNTTNGARIKTWAGTMLGLANEIIFKDIILNNVKYPVIIDQIYGTKKKK----KLSDFHFRNVRGTLTTNVTMLL-
Query: -SALFPCEGVELNDINLVYSGTSLRNTAIVSSCLNVKIATYGV
S L PCEGVEL DINL Y GT+LRNT IVSSC N KI T+GV
Subjt: -SALFPCEGVELNDINLVYSGTSLRNTAIVSSCLNVKIATYGV
|
|
| A0A5A7U4W1 Exopolygalacturonase-like | 3.4e-47 | 70.63 | Show/hide |
Query: SVGSLGKYPTDKSVIDVLVKNCTIFNTTNGARIKTWAGTMLGLANEIIFKDIILNNVKYPVIIDQIYGTKKKK----KLSDFHFRNVRGTLTTNVTMLL-
SVGSLGKY +KSV +VLVKNCTIFN TNGARIKTWA + GLA+ IIF+DI++ NVK P+IIDQ YGTKKKK K+SD HF+N+RGT TTNV +LL
Subjt: SVGSLGKYPTDKSVIDVLVKNCTIFNTTNGARIKTWAGTMLGLANEIIFKDIILNNVKYPVIIDQIYGTKKKK----KLSDFHFRNVRGTLTTNVTMLL-
Query: -SALFPCEGVELNDINLVYSGTSLRNTAIVSSCLNVKIATYGV
S L PCEGVEL DINL Y GT+LRNT IVSSC N KIAT+GV
Subjt: -SALFPCEGVELNDINLVYSGTSLRNTAIVSSCLNVKIATYGV
|
|
| A0A6J1DI36 exopolygalacturonase-like | 6.6e-51 | 74.83 | Show/hide |
Query: SVGSLGKYPTDKSVIDVLVKNCTIFNTTNGARIKTWAGTMLGLANEIIFKDIILNNVKYPVIIDQIYGTKKKK----KLSDFHFRNVRGTLTTNVTMLL-
SVGSLGKYP +KSV+ VLVKNCTIFNTTNGARIKTWAGT+ G A EIIF+DII+ NVK P+IIDQ YGTK+KK ++SD HF+N+RGT TTNV +LL
Subjt: SVGSLGKYPTDKSVIDVLVKNCTIFNTTNGARIKTWAGTMLGLANEIIFKDIILNNVKYPVIIDQIYGTKKKK----KLSDFHFRNVRGTLTTNVTMLL-
Query: -SALFPCEGVELNDINLVYSGTSLRNTAIVSSCLNVKIATYGV
SALFPCEGVEL DINL YSGT+ RNT IVSSCLN KIAT GV
Subjt: -SALFPCEGVELNDINLVYSGTSLRNTAIVSSCLNVKIATYGV
|
|
| A0A6J1JX85 exopolygalacturonase-like | 5.4e-45 | 66.43 | Show/hide |
Query: SVGSLGKYPTDKSVIDVLVKNCTIFNTTNGARIKTWAGTMLGLANEIIFKDIILNNVKYPVIIDQIYGTKKKK----KLSDFHFRNVRGTLTTNVTMLL-
S+GSLG+Y T+KSV+DVLV+NCTIFN TNGARIKTWA T+ G A I+F +I++ VK P+IIDQ YGTK+KK K+SD HF+N+RGT TTNV +LL
Subjt: SVGSLGKYPTDKSVIDVLVKNCTIFNTTNGARIKTWAGTMLGLANEIIFKDIILNNVKYPVIIDQIYGTKKKK----KLSDFHFRNVRGTLTTNVTMLL-
Query: -SALFPCEGVELNDINLVYSGTSLRNTAIVSSCLNVKIATYGV
S LFPCEGVEL DINL Y G SL+NT VSSCLN KI T+GV
Subjt: -SALFPCEGVELNDINLVYSGTSLRNTAIVSSCLNVKIATYGV
|
|
| SwissProt top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| P24548 Exopolygalacturonase (Fragment) | 6.7e-24 | 44.68 | Show/hide |
Query: SVGSLGKYPTDKSVIDVLVKNCTIFNTTNGARIKTWAGTMLGLANEIIFKDIILNNVKYPVIIDQIY--------GTKKKKKLSDFHFRNVRGTLTTN--
SVGSLG+Y ++SV+ + VKNCTI + NG RIKTW + G A+E+ F+DI +N+V P++IDQ Y KLS F+N++GT TT
Subjt: SVGSLGKYPTDKSVIDVLVKNCTIFNTTNGARIKTWAGTMLGLANEIIFKDIILNNVKYPVIIDQIY--------GTKKKKKLSDFHFRNVRGTLTTN--
Query: VTMLLSALFPCEGVELNDINLVYSGTSLRNTAIVSSCLNVK
V ++ S FPC GVEL DI+L YSG + S C N+K
Subjt: VTMLLSALFPCEGVELNDINLVYSGTSLRNTAIVSSCLNVK
|
|
| P49063 Exopolygalacturonase clone GBGA483 | 6.7e-24 | 42.55 | Show/hide |
Query: SVGSLGKYPTDKSVIDVLVKNCTIFNTTNGARIKTWAGTMLGLANEIIFKDIILNNVKYPVIIDQIY--------GTKKKKKLSDFHFRNVRGTLTTNVT
S+GSLG+YP ++ V V V+ C I NT NG RIKTW G+ G+A+ I+F+DI ++NV PV+IDQ Y G + KLSD + ++GT T V
Subjt: SVGSLGKYPTDKSVIDVLVKNCTIFNTTNGARIKTWAGTMLGLANEIIFKDIILNNVKYPVIIDQIY--------GTKKKKKLSDFHFRNVRGTLTTNVT
Query: --MLLSALFPCEGVELNDINLVYSGTSLRNTAIVSSCLNVK
++ S PC + L+DINLV++G + VS+C N+K
Subjt: --MLLSALFPCEGVELNDINLVYSGTSLRNTAIVSSCLNVK
|
|
| Q05967 Polygalacturonase | 4.6e-25 | 43.15 | Show/hide |
Query: SVGSLGKYPTDKSVIDVLVKNCTIFNTTNGARIKTWAGTMLGLANEIIFKDIILNNVKYPVIIDQIY--------GTKKKKKLSDFHFRNVRGTLTTN--
SVGSLG P +K V+ V V+NCT NT NG RIKTW + G+ N++ F+DII+ NV PV+IDQ+Y + K+S F+N++GT T
Subjt: SVGSLGKYPTDKSVIDVLVKNCTIFNTTNGARIKTWAGTMLGLANEIIFKDIILNNVKYPVIIDQIY--------GTKKKKKLSDFHFRNVRGTLTTN--
Query: VTMLLSALFPCEGVELNDINLVYSGTSLRNTAIVSSCLNVKIATYG
V++L S PCEG+E+ DI++ YSG + SSC N+K + G
Subjt: VTMLLSALFPCEGVELNDINLVYSGTSLRNTAIVSSCLNVKIATYG
|
|
| Q39766 Polygalacturonase | 1.8e-24 | 43.15 | Show/hide |
Query: SVGSLGKYPTDKSVIDVLVKNCTIFNTTNGARIKTWAGTMLGLANEIIFKDIILNNVKYPVIIDQIY--------GTKKKKKLSDFHFRNVRGT--LTTN
S+GSLGK+ ++ V + + NCTI NT+NGARIKTW G G +EI F+DI +NNV P++IDQ Y + K KLS+ F+N+RGT L
Subjt: SVGSLGKYPTDKSVIDVLVKNCTIFNTTNGARIKTWAGTMLGLANEIIFKDIILNNVKYPVIIDQIY--------GTKKKKKLSDFHFRNVRGT--LTTN
Query: VTMLLSALFPCEGVELNDINLVYSGTSLRNTAIVSSCLNVKIATYG
+ + S PC+ VEL DI++ ++G S CLNVK T G
Subjt: VTMLLSALFPCEGVELNDINLVYSGTSLRNTAIVSSCLNVKIATYG
|
|
| Q39786 Polygalacturonase | 2.3e-24 | 43.15 | Show/hide |
Query: SVGSLGKYPTDKSVIDVLVKNCTIFNTTNGARIKTWAGTMLGLANEIIFKDIILNNVKYPVIIDQIY--------GTKKKKKLSDFHFRNVRGT--LTTN
S+GSLGK+ ++ V + + NCTI NT+NGARIKTW G G +EI F+DI +NNV P++IDQ Y + K KLS+ F+N+RGT L
Subjt: SVGSLGKYPTDKSVIDVLVKNCTIFNTTNGARIKTWAGTMLGLANEIIFKDIILNNVKYPVIIDQIY--------GTKKKKKLSDFHFRNVRGT--LTTN
Query: VTMLLSALFPCEGVELNDINLVYSGTSLRNTAIVSSCLNVKIATYG
+ + S PC+ VEL DI++ ++G S CLNVK T G
Subjt: VTMLLSALFPCEGVELNDINLVYSGTSLRNTAIVSSCLNVKIATYG
|
|
| Arabidopsis top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| AT1G02790.1 polygalacturonase 4 | 7.5e-23 | 45.83 | Show/hide |
Query: SVGSLGKYPTDKSVIDVLVKNCTIFNTTNGARIKTWAGTMLGLANEIIFKDIILNNVKYPVIIDQIYGTK---KKKKLSDFHFRNVRGTLTTN--VTMLL
SVGSLGKY ++ V + V NCT+ T NG RIKTW G+ A +I F++II+ +VK P+IIDQ YG++ + +SD F+N+RGT T V ++
Subjt: SVGSLGKYPTDKSVIDVLVKNCTIFNTTNGARIKTWAGTMLGLANEIIFKDIILNNVKYPVIIDQIYGTK---KKKKLSDFHFRNVRGTLTTN--VTMLL
Query: SALFPCEGVELNDINLVYSG
S PC+GV + D+NL Y G
Subjt: SALFPCEGVELNDINLVYSG
|
|
| AT3G07840.1 Pectin lyase-like superfamily protein | 3.9e-19 | 44.44 | Show/hide |
Query: SVGSLGKYPTDKSVIDVLVKNCTIFNTTNGARIKTW-AGTMLGLANEIIFKDIILNNVKYPVIIDQIY----GTKKKK----KLSDFHFRNVRGTLTTN-
SVGSLG+Y ++ V + V NCT+ T NG RIKTW + A+ I F++IILNNV P++IDQ Y K+K KL D F+N+RGT
Subjt: SVGSLGKYPTDKSVIDVLVKNCTIFNTTNGARIKTW-AGTMLGLANEIIFKDIILNNVKYPVIIDQIY----GTKKKK----KLSDFHFRNVRGTLTTN-
Query: -VTMLLSALFPCEGVELNDINLVYSG
V +L S PC VE+ +INL Y G
Subjt: -VTMLLSALFPCEGVELNDINLVYSG
|
|
| AT3G07850.1 Pectin lyase-like superfamily protein | 4.7e-25 | 42.55 | Show/hide |
Query: SVGSLGKYPTDKSVIDVLVKNCTIFNTTNGARIKTWAGTMLGLANEIIFKDIILNNVKYPVIIDQIY--------GTKKKKKLSDFHFRNVRGTLTTNVT
S+GSLG+YP ++ V V V+ C I NT NG RIKTW G+ G+A+ I+F+DI ++NV PV+IDQ Y G + KLSD + ++GT T V
Subjt: SVGSLGKYPTDKSVIDVLVKNCTIFNTTNGARIKTWAGTMLGLANEIIFKDIILNNVKYPVIIDQIY--------GTKKKKKLSDFHFRNVRGTLTTNVT
Query: --MLLSALFPCEGVELNDINLVYSGTSLRNTAIVSSCLNVK
++ S PC + L+DINLV++G + VS+C N+K
Subjt: --MLLSALFPCEGVELNDINLVYSGTSLRNTAIVSSCLNVK
|
|
| AT3G14040.1 Pectin lyase-like superfamily protein | 3.3e-26 | 43.97 | Show/hide |
Query: SVGSLGKYPTDKSVIDVLVKNCTIFNTTNGARIKTWAGTMLGLANEIIFKDIILNNVKYPVIIDQIY--------GTKKKKKLSDFHFRNVRGTLTTNVT
S+GSLG+YP ++ V V V+ C I NT NG RIKTW G+ G+A+ I+F+DI ++NV PV+IDQ Y G K KLSD +N++GT T V
Subjt: SVGSLGKYPTDKSVIDVLVKNCTIFNTTNGARIKTWAGTMLGLANEIIFKDIILNNVKYPVIIDQIY--------GTKKKKKLSDFHFRNVRGTLTTNVT
Query: --MLLSALFPCEGVELNDINLVYSGTSLRNTAIVSSCLNVK
++ S PC + L+DINLV++G + VS+C N+K
Subjt: --MLLSALFPCEGVELNDINLVYSGTSLRNTAIVSSCLNVK
|
|
| AT4G18180.1 Pectin lyase-like superfamily protein | 4.9e-22 | 41.33 | Show/hide |
Query: SVGSLGKYPTDKSVIDVLVKNCTIFNTTNGARIKTWAGTM-LGLANEIIFKDIILNNVKYPVIIDQIY--------GTKKKKKLSDFHFRNVRGTLTTNV
SVGSLG+YP +K V ++VK+C I TTNG RIKTWA + L A + F++II+NNV P+IIDQ Y K +LS+ +F+N+RGT ++ V
Subjt: SVGSLGKYPTDKSVIDVLVKNCTIFNTTNGARIKTWAGTM-LGLANEIIFKDIILNNVKYPVIIDQIY--------GTKKKKKLSDFHFRNVRGTLTTNV
Query: TMLL--SALFPCEGVELNDINLVYS--------GTSLRNTAIVSSCLNVK
+ L S PC+ V L +++L S ++ N A+ SSC NV+
Subjt: TMLL--SALFPCEGVELNDINLVYS--------GTSLRNTAIVSSCLNVK
|
|
