; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

MS009991 (gene) of Bitter gourd (TR) v1 genome

Gene IDMS009991
OrganismMomordica charantia cv. TR (Bitter gourd (TR) v1)
Descriptionglycosyltransferase-like KOBITO 1
Genome locationscaffold505:36869..37155
RNA-Seq ExpressionMS009991
SyntenyMS009991
Gene Ontology termsGO:0009737 - response to abscisic acid (biological process)
GO:0030244 - cellulose biosynthetic process (biological process)
GO:0016021 - integral component of membrane (cellular component)
GO:0016740 - transferase activity (molecular function)
InterPro domainsIPR044224 - Glycosyltransferase-like KOBITO 1


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG6601048.1 Glycosyltransferase-like KOBITO 1, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]9.2e-3088.37Show/hide
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KAG7031859.1 Glycosyltransferase-like KOBITO 1, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]9.2e-3088.37Show/hide
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XP_016900290.1 PREDICTED: glycosyltransferase-like KOBITO 1 [Cucumis melo]1.6e-2987.21Show/hide
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XP_022139121.1 glycosyltransferase-like KOBITO 1 [Momordica charantia]5.2e-3394.19Show/hide
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XP_022956384.1 glycosyltransferase-like KOBITO 1 [Cucurbita moschata]9.2e-3088.37Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0KQ04 Uncharacterized protein1.7e-2986.05Show/hide
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A0A1S4DX39 glycosyltransferase-like KOBITO 17.6e-3087.21Show/hide
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A0A5A7SS67 Glycosyltransferase-like KOBITO 17.6e-3087.21Show/hide
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A0A6J1CBQ5 glycosyltransferase-like KOBITO 12.5e-3394.19Show/hide
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A0A6J1GYV9 glycosyltransferase-like KOBITO 14.5e-3088.37Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
B3H5R0 Glycosyltransferase-like At2g414512.7e-0848.61Show/hide
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        SS SS SR  LL+TFLPL+LA LAF+LQWR G+ D  T+W   +Y F GM     +   + S  S S C++L
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Q5XV99 Glycosyltransferase-like At3g572003.7e-1351.58Show/hide
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        Y S+SS    ++ + SSSS+SRL LL+T LPL+LA  AFVLQWRGGL DP T WS   ++F GM  +      R S  S SGC++ LG S SP F
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Q9C9Z9 Glycosyltransferase-like KOBITO 16.1e-0846.53Show/hide
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        I+ +SSSSS+       SRLLLLLT LP++LA LAF+LQWR GGL DPA     +  S P    L  +  P    +S +S  S  S+S C NL  S SP 
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        F
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT2G41451.1 unknown protein1.9e-0948.61Show/hide
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AT3G08550.1 elongation defective 1 protein / ELD1 protein4.3e-0946.53Show/hide
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Query:  F
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AT3G57200.1 unknown protein2.6e-1451.58Show/hide
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
CAATATAAATCAAACAGTTCGTATCTTAAACGAATAACGCAGACCTCTTCATCATCCTCTACTTCCAGACTTCTTCTTCTTCTAACCTTCCTCCCTCTCACTCTTGCAGC
CTTGGCTTTCGTCCTCCAATGGCGCGGTGGACTCACCGATCCCGCCACTCGCTGGTCTCCCCCGTCATACCAGTTCCTCGGCATGGACGCCTCCCCACTCTCCCCGATTT
CCCGCCATTCCCCGCCTTCTGCTTCTGGCTGTCTCAATCTTGGCCTGAGTGTCTCGCCTTTGTTC
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
CAATATAAATCAAACAGTTCGTATCTTAAACGAATAACGCAGACCTCTTCATCATCCTCTACTTCCAGACTTCTTCTTCTTCTAACCTTCCTCCCTCTCACTCTTGCAGC
CTTGGCTTTCGTCCTCCAATGGCGCGGTGGACTCACCGATCCCGCCACTCGCTGGTCTCCCCCGTCATACCAGTTCCTCGGCATGGACGCCTCCCCACTCTCCCCGATTT
CCCGCCATTCCCCGCCTTCTGCTTCTGGCTGTCTCAATCTTGGCCTGAGTGTCTCGCCTTTGTTC
Protein sequenceShow/hide protein sequence
QYKSNSSYLKRITQTSSSSSTSRLLLLLTFLPLTLAALAFVLQWRGGLTDPATRWSPPSYQFLGMDASPLSPISRHSPPSASGCLNLGLSVSPLF