; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

MS010031 (gene) of Bitter gourd (TR) v1 genome

Gene IDMS010031
OrganismMomordica charantia cv. TR (Bitter gourd (TR) v1)
DescriptionChlorophyll A-B binding protein
Genome locationscaffold779:79086..79643
RNA-Seq ExpressionMS010031
SyntenyMS010031
Gene Ontology termsGO:0009535 - chloroplast thylakoid membrane (cellular component)
GO:0016021 - integral component of membrane (cellular component)
InterPro domainsNA


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG6578732.1 hypothetical protein SDJN03_23180, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]6.3e-7584.41Show/hide
Query:  MAAIPSSSLQFPNSLPFPSNSKPHKTKPLTFVTRAADPETPAADPEPGSDGDDFENRLAKVRLKYRSGTGKKAEIRKARKSNKGSTAGAGGSSVYLPPVP
        MAAIPSSSLQFPNSL   SNSKPHK K LTFVTRAADPE+PAAD EP SDGDDFE+RLA  RL+ R GTGKKAEIRKARKS KGST  A  SSVYLPPVP
Subjt:  MAAIPSSSLQFPNSLPFPSNSKPHKTKPLTFVTRAADPETPAADPEPGSDGDDFENRLAKVRLKYRSGTGKKAEIRKARKSNKGSTAGAGGSSVYLPPVP

Query:  LKEAVSGGLKVEFGFSPFSERINGWIAILGISALVLVELATGKGVINYHTPAIILIQVYFVAAVAAVYVKFEKEKVSVWPPEEVKN
        LKEAVSGGLKVEFGFSP+SERINGWIAILG+SALVLVELATGKGVINYHTPAIILIQVYFVAA AA+Y+K+EKEKVSVWP +E+K+
Subjt:  LKEAVSGGLKVEFGFSPFSERINGWIAILGISALVLVELATGKGVINYHTPAIILIQVYFVAAVAAVYVKFEKEKVSVWPPEEVKN

XP_004149820.1 uncharacterized protein LOC101221723 [Cucumis sativus]1.7e-7584.49Show/hide
Query:  MAAIPSSSLQFPNSLPFPSNSKPHKTKPLTFVTRAADPETPAADPE-PGSDGDDFENRLAKVRLKYRSGTGKKAEIRKARKSNKGSTAGAGGSSVYLPPV
        MAAIPSSSLQFPNSL  PSNSKP K K LTF+TRAADPE+PA D E PGSDGDDFE+RLAKVR++YRSGTGKKAEIRKARKS +GST  A  SSVYLPPV
Subjt:  MAAIPSSSLQFPNSLPFPSNSKPHKTKPLTFVTRAADPETPAADPE-PGSDGDDFENRLAKVRLKYRSGTGKKAEIRKARKSNKGSTAGAGGSSVYLPPV

Query:  PLKEAVSGGLKVEFGFSPFSERINGWIAILGISALVLVELATGKGVINYHTPAIILIQVYFVAAVAAVYVKFEKEKVSVWPPEEVKN
         LKEAVSGGLKVEFGFSP+SERINGWIAILGISALVLVELATGK VI+YHTPAIILIQVYFVAAVAAVY+K+EKEKVSVWP +E+K+
Subjt:  PLKEAVSGGLKVEFGFSPFSERINGWIAILGISALVLVELATGKGVINYHTPAIILIQVYFVAAVAAVYVKFEKEKVSVWPPEEVKN

XP_022133568.1 uncharacterized protein LOC111006119 [Momordica charantia]7.2e-95100Show/hide
Query:  MAAIPSSSLQFPNSLPFPSNSKPHKTKPLTFVTRAADPETPAADPEPGSDGDDFENRLAKVRLKYRSGTGKKAEIRKARKSNKGSTAGAGGSSVYLPPVP
        MAAIPSSSLQFPNSLPFPSNSKPHKTKPLTFVTRAADPETPAADPEPGSDGDDFENRLAKVRLKYRSGTGKKAEIRKARKSNKGSTAGAGGSSVYLPPVP
Subjt:  MAAIPSSSLQFPNSLPFPSNSKPHKTKPLTFVTRAADPETPAADPEPGSDGDDFENRLAKVRLKYRSGTGKKAEIRKARKSNKGSTAGAGGSSVYLPPVP

Query:  LKEAVSGGLKVEFGFSPFSERINGWIAILGISALVLVELATGKGVINYHTPAIILIQVYFVAAVAAVYVKFEKEKVSVWPPEEVKN
        LKEAVSGGLKVEFGFSPFSERINGWIAILGISALVLVELATGKGVINYHTPAIILIQVYFVAAVAAVYVKFEKEKVSVWPPEEVKN
Subjt:  LKEAVSGGLKVEFGFSPFSERINGWIAILGISALVLVELATGKGVINYHTPAIILIQVYFVAAVAAVYVKFEKEKVSVWPPEEVKN

XP_023550096.1 uncharacterized protein LOC111808391 [Cucurbita pepo subsp. pepo]4.4e-7685.48Show/hide
Query:  MAAIPSSSLQFPNSLPFPSNSKPHKTKPLTFVTRAADPETPAADPEPGSDGDDFENRLAKVRLKYRSGTGKKAEIRKARKSNKGSTAGAGGSSVYLPPVP
        MAAIPSSSLQFPNSL F SNSKPHK K LTFVTRAADPE+PAAD EP SDGDDFE+RLA  RL+ R GTGKKAEIRKARKS KGSTA A  SSVYLPPVP
Subjt:  MAAIPSSSLQFPNSLPFPSNSKPHKTKPLTFVTRAADPETPAADPEPGSDGDDFENRLAKVRLKYRSGTGKKAEIRKARKSNKGSTAGAGGSSVYLPPVP

Query:  LKEAVSGGLKVEFGFSPFSERINGWIAILGISALVLVELATGKGVINYHTPAIILIQVYFVAAVAAVYVKFEKEKVSVWPPEEVKN
        LKEAVSGGLKVEFGFSP+SERINGWIAILG+SALVLVELATGKGVINYHTPAIILIQVYFVAA AA+Y+K+EKEKVSVWP +E+K+
Subjt:  LKEAVSGGLKVEFGFSPFSERINGWIAILGISALVLVELATGKGVINYHTPAIILIQVYFVAAVAAVYVKFEKEKVSVWPPEEVKN

XP_038890345.1 uncharacterized protein LOC120079944 [Benincasa hispida]2.0e-7686.02Show/hide
Query:  MAAIPSSSLQFPNSLPFPSNSKPHKTKPLTFVTRAADPETPAADPEPGSDGDDFENRLAKVRLKYRSGTGKKAEIRKARKSNKGSTAGAGGSSVYLPPVP
        MAAIPSSSLQFPNSL     + P K K LTFVTRAADPE+PAAD E GSDGDDFE+RLAKVRL+YRSGTGKKAEIRKARKS KGST  A  SSVYLPPVP
Subjt:  MAAIPSSSLQFPNSLPFPSNSKPHKTKPLTFVTRAADPETPAADPEPGSDGDDFENRLAKVRLKYRSGTGKKAEIRKARKSNKGSTAGAGGSSVYLPPVP

Query:  LKEAVSGGLKVEFGFSPFSERINGWIAILGISALVLVELATGKGVINYHTPAIILIQVYFVAAVAAVYVKFEKEKVSVWPPEEVKN
        LKEAVSGGLKVEFGFSP+SERINGWIAILGISALVLVELATGKGVINYHTPAIILIQVYFVAAVAA+Y+K+EKEKVSVWPP+E+KN
Subjt:  LKEAVSGGLKVEFGFSPFSERINGWIAILGISALVLVELATGKGVINYHTPAIILIQVYFVAAVAAVYVKFEKEKVSVWPPEEVKN

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0KS45 Uncharacterized protein8.1e-7684.49Show/hide
Query:  MAAIPSSSLQFPNSLPFPSNSKPHKTKPLTFVTRAADPETPAADPE-PGSDGDDFENRLAKVRLKYRSGTGKKAEIRKARKSNKGSTAGAGGSSVYLPPV
        MAAIPSSSLQFPNSL  PSNSKP K K LTF+TRAADPE+PA D E PGSDGDDFE+RLAKVR++YRSGTGKKAEIRKARKS +GST  A  SSVYLPPV
Subjt:  MAAIPSSSLQFPNSLPFPSNSKPHKTKPLTFVTRAADPETPAADPE-PGSDGDDFENRLAKVRLKYRSGTGKKAEIRKARKSNKGSTAGAGGSSVYLPPV

Query:  PLKEAVSGGLKVEFGFSPFSERINGWIAILGISALVLVELATGKGVINYHTPAIILIQVYFVAAVAAVYVKFEKEKVSVWPPEEVKN
         LKEAVSGGLKVEFGFSP+SERINGWIAILGISALVLVELATGK VI+YHTPAIILIQVYFVAAVAAVY+K+EKEKVSVWP +E+K+
Subjt:  PLKEAVSGGLKVEFGFSPFSERINGWIAILGISALVLVELATGKGVINYHTPAIILIQVYFVAAVAAVYVKFEKEKVSVWPPEEVKN

A0A1S3CJX9 uncharacterized protein LOC1035016671.5e-7482.89Show/hide
Query:  MAAIPSSSLQFPNSLPFPSNSKPHKTKPLTFVTRAADPE-TPAADPEPGSDGDDFENRLAKVRLKYRSGTGKKAEIRKARKSNKGSTAGAGGSSVYLPPV
        MAAIPSSSLQFPNSL  PSNSK HK + LTF+TRAADPE TP+   +PGSDGDDFE+RLAKVR +YRSGTGKKAEIRKARKS KGST  A  SSVYLPPV
Subjt:  MAAIPSSSLQFPNSLPFPSNSKPHKTKPLTFVTRAADPE-TPAADPEPGSDGDDFENRLAKVRLKYRSGTGKKAEIRKARKSNKGSTAGAGGSSVYLPPV

Query:  PLKEAVSGGLKVEFGFSPFSERINGWIAILGISALVLVELATGKGVINYHTPAIILIQVYFVAAVAAVYVKFEKEKVSVWPPEEVKN
        PLKE VSGGLKVEFGFSP+SERINGWIAILGISALVLVELATGK VI+YHTPAIILIQVYFVAAV AVY+K+EKEKVSVWP +E+K+
Subjt:  PLKEAVSGGLKVEFGFSPFSERINGWIAILGISALVLVELATGKGVINYHTPAIILIQVYFVAAVAAVYVKFEKEKVSVWPPEEVKN

A0A5D3C1D6 Uncharacterized protein5.2e-7583.42Show/hide
Query:  MAAIPSSSLQFPNSLPFPSNSKPHKTKPLTFVTRAADPE-TPAADPEPGSDGDDFENRLAKVRLKYRSGTGKKAEIRKARKSNKGSTAGAGGSSVYLPPV
        MAAIPSSSLQFPNSL  PSNSK HK + LTF+TRAADPE TP+   +PGSDGDDFE+RLAKVR +YRSGTGKKAEIRKARKS KGST  A  SSVYLPPV
Subjt:  MAAIPSSSLQFPNSLPFPSNSKPHKTKPLTFVTRAADPE-TPAADPEPGSDGDDFENRLAKVRLKYRSGTGKKAEIRKARKSNKGSTAGAGGSSVYLPPV

Query:  PLKEAVSGGLKVEFGFSPFSERINGWIAILGISALVLVELATGKGVINYHTPAIILIQVYFVAAVAAVYVKFEKEKVSVWPPEEVKN
        PLKE VSGGLKVEFGFSP+SERINGWIAILGISALVLVELATGK VI+YHTPAIILIQVYFVAAVAAVY+K+EKEKVSVWP +E+K+
Subjt:  PLKEAVSGGLKVEFGFSPFSERINGWIAILGISALVLVELATGKGVINYHTPAIILIQVYFVAAVAAVYVKFEKEKVSVWPPEEVKN

A0A6J1BZH5 uncharacterized protein LOC1110061193.5e-95100Show/hide
Query:  MAAIPSSSLQFPNSLPFPSNSKPHKTKPLTFVTRAADPETPAADPEPGSDGDDFENRLAKVRLKYRSGTGKKAEIRKARKSNKGSTAGAGGSSVYLPPVP
        MAAIPSSSLQFPNSLPFPSNSKPHKTKPLTFVTRAADPETPAADPEPGSDGDDFENRLAKVRLKYRSGTGKKAEIRKARKSNKGSTAGAGGSSVYLPPVP
Subjt:  MAAIPSSSLQFPNSLPFPSNSKPHKTKPLTFVTRAADPETPAADPEPGSDGDDFENRLAKVRLKYRSGTGKKAEIRKARKSNKGSTAGAGGSSVYLPPVP

Query:  LKEAVSGGLKVEFGFSPFSERINGWIAILGISALVLVELATGKGVINYHTPAIILIQVYFVAAVAAVYVKFEKEKVSVWPPEEVKN
        LKEAVSGGLKVEFGFSPFSERINGWIAILGISALVLVELATGKGVINYHTPAIILIQVYFVAAVAAVYVKFEKEKVSVWPPEEVKN
Subjt:  LKEAVSGGLKVEFGFSPFSERINGWIAILGISALVLVELATGKGVINYHTPAIILIQVYFVAAVAAVYVKFEKEKVSVWPPEEVKN

A0A6J1FK14 uncharacterized protein LOC1114447341.5e-7483.87Show/hide
Query:  MAAIPSSSLQFPNSLPFPSNSKPHKTKPLTFVTRAADPETPAADPEPGSDGDDFENRLAKVRLKYRSGTGKKAEIRKARKSNKGSTAGAGGSSVYLPPVP
        MAAIPSSSLQFPNSL    NSKPHK K LTFVTRAADPE+PAAD EP SDGDDFE+RLA  RL+ R GTGKKAEIRKARKS KGST  A  SSVYLPPVP
Subjt:  MAAIPSSSLQFPNSLPFPSNSKPHKTKPLTFVTRAADPETPAADPEPGSDGDDFENRLAKVRLKYRSGTGKKAEIRKARKSNKGSTAGAGGSSVYLPPVP

Query:  LKEAVSGGLKVEFGFSPFSERINGWIAILGISALVLVELATGKGVINYHTPAIILIQVYFVAAVAAVYVKFEKEKVSVWPPEEVKN
        LKEAVSGGLKVEFGFSP+SERINGWIAILG+SALVLVELATGKGVINYHTPAIILIQVYFVAA AA+Y+K+EKEKVSVWP +E+K+
Subjt:  LKEAVSGGLKVEFGFSPFSERINGWIAILGISALVLVELATGKGVINYHTPAIILIQVYFVAAVAAVYVKFEKEKVSVWPPEEVKN

SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT3G12345.1 unknown protein4.6e-4757.87Show/hide
Query:  FPNSLPFPSNSKPHKTKPLTF------VTRAADPETPAADPEPGSDGDDFENRLAKVRLKYRSGTGKKAEIRKARKSNKGSTAGAGGSSVYLPPVPLKEA
        FP SL F    KP+  +  T        T    P+      E G+D D FE+RL+ +RL+YRSGTGKKAE+RK++K + GS   + G+ +YLPPV LKEA
Subjt:  FPNSLPFPSNSKPHKTKPLTF------VTRAADPETPAADPEPGSDGDDFENRLAKVRLKYRSGTGKKAEIRKARKSNKGSTAGAGGSSVYLPPVPLKEA

Query:  VSGGLKVEFGFSPFSERINGWIAILGISALVLVELATGKGVINYHTPAIILIQVYFVAAVAAVYVKFEKEKVSVWPPE
        VSGGLKVE GFSPFSERING IA LG++AL+LVELATGK V+NYHTP+++ +Q+YFVAAV+A++VK EKEKVSVWP +
Subjt:  VSGGLKVEFGFSPFSERINGWIAILGISALVLVELATGKGVINYHTPAIILIQVYFVAAVAAVYVKFEKEKVSVWPPE


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGCGGCGATTCCATCTTCCTCCCTGCAATTCCCAAACTCTCTCCCATTCCCTTCCAATTCGAAGCCTCACAAGACGAAGCCCCTGACCTTCGTAACTCGTGCAGCAGA
TCCGGAAACCCCTGCCGCCGATCCAGAGCCGGGATCGGACGGCGACGATTTCGAGAACCGCCTCGCCAAGGTCCGGCTAAAGTACCGGAGCGGAACGGGGAAGAAGGCGG
AGATACGGAAGGCGCGGAAGTCCAATAAAGGATCCACCGCCGGCGCCGGCGGCTCATCGGTGTACCTCCCGCCGGTGCCGCTGAAGGAGGCGGTTTCCGGCGGCCTTAAA
GTGGAATTCGGCTTTAGTCCGTTCAGCGAGAGGATAAATGGATGGATTGCGATCCTCGGAATCTCGGCTCTGGTGCTGGTGGAACTGGCTACCGGAAAAGGCGTCATAAA
TTACCACACGCCGGCGATAATTCTGATTCAGGTGTACTTCGTAGCGGCGGTTGCTGCTGTGTATGTTAAATTCGAGAAGGAGAAGGTTAGTGTTTGGCCGCCGGAGGAAG
TGAAAAAT
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGGCGGCGATTCCATCTTCCTCCCTGCAATTCCCAAACTCTCTCCCATTCCCTTCCAATTCGAAGCCTCACAAGACGAAGCCCCTGACCTTCGTAACTCGTGCAGCAGA
TCCGGAAACCCCTGCCGCCGATCCAGAGCCGGGATCGGACGGCGACGATTTCGAGAACCGCCTCGCCAAGGTCCGGCTAAAGTACCGGAGCGGAACGGGGAAGAAGGCGG
AGATACGGAAGGCGCGGAAGTCCAATAAAGGATCCACCGCCGGCGCCGGCGGCTCATCGGTGTACCTCCCGCCGGTGCCGCTGAAGGAGGCGGTTTCCGGCGGCCTTAAA
GTGGAATTCGGCTTTAGTCCGTTCAGCGAGAGGATAAATGGATGGATTGCGATCCTCGGAATCTCGGCTCTGGTGCTGGTGGAACTGGCTACCGGAAAAGGCGTCATAAA
TTACCACACGCCGGCGATAATTCTGATTCAGGTGTACTTCGTAGCGGCGGTTGCTGCTGTGTATGTTAAATTCGAGAAGGAGAAGGTTAGTGTTTGGCCGCCGGAGGAAG
TGAAAAAT
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MAAIPSSSLQFPNSLPFPSNSKPHKTKPLTFVTRAADPETPAADPEPGSDGDDFENRLAKVRLKYRSGTGKKAEIRKARKSNKGSTAGAGGSSVYLPPVPLKEAVSGGLK
VEFGFSPFSERINGWIAILGISALVLVELATGKGVINYHTPAIILIQVYFVAAVAAVYVKFEKEKVSVWPPEEVKN