; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

MS010268 (gene) of Bitter gourd (TR) v1 genome

Gene IDMS010268
OrganismMomordica charantia cv. TR (Bitter gourd (TR) v1)
DescriptionChlororespiratory reduction 42
Genome locationscaffold391:1268107..1268617
RNA-Seq ExpressionMS010268
SyntenyMS010268
Gene Ontology termsNA
InterPro domainsIPR021495 - Protein of unknown function DUF3148


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG6570328.1 hypothetical protein SDJN03_29243, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]1.6e-5184.44Show/hide
Query:  MAAPLSAATGIPRPSISI--INPISSFNFSNCLSTGIQPRSFVIKCESSASAADETPPAKSRKLEIGSPVIVVEAPKMIKTAASVPCLRVNSGIINPGDV
        MA  LS+AT IPRPSI I  ++ ISSFN SN LST  QPRS ++KCESSASAAD TPPAKS KLEIGSPVIVVEAPKMIKTAASVPCLRVNSGIINPGDV
Subjt:  MAAPLSAATGIPRPSISI--INPISSFNFSNCLSTGIQPRSFVIKCESSASAADETPPAKSRKLEIGSPVIVVEAPKMIKTAASVPCLRVNSGIINPGDV

Query:  GRIVSRKPKDVWAVRLKVGTYLIDGRYFKPLELDQ
        GRIVSRKPKDVW VRLKVGTYLIDGRYF+PLELDQ
Subjt:  GRIVSRKPKDVWAVRLKVGTYLIDGRYFKPLELDQ
XP_022153826.1 uncharacterized protein LOC111021250 [Momordica charantia]1.1e-5797.58Show/hide
Query:  MAAPLSAATGIPRPSISIINPISSFNFSNCLSTGIQPRSFVIKCESSASAADETPPAKSRKLEIGSPVIVVEAPKMIKTAASVPCLRVNSGIINPGDVGR
        MAA LSAAT IPRPSISIIN ISSFNFSNCLSTGIQPRSFVIKCESSASAADETPPAKSRKLEIGSPVIVVEAPKMIKTAASVPCLRVNSGIINPGDVGR
Subjt:  MAAPLSAATGIPRPSISIINPISSFNFSNCLSTGIQPRSFVIKCESSASAADETPPAKSRKLEIGSPVIVVEAPKMIKTAASVPCLRVNSGIINPGDVGR

Query:  IVSRKPKDVWAVRLKVGTYLIDGR
        IVSRKPKDVWAVRLKVGTYLIDGR
Subjt:  IVSRKPKDVWAVRLKVGTYLIDGR
XP_022944245.1 uncharacterized protein LOC111448751 [Cucurbita moschata]1.6e-5184.44Show/hide
Query:  MAAPLSAATGIPRPS--ISIINPISSFNFSNCLSTGIQPRSFVIKCESSASAADETPPAKSRKLEIGSPVIVVEAPKMIKTAASVPCLRVNSGIINPGDV
        MA  LS+AT IPRPS  I I++ ISSFN SN LST  QPRS ++KCESSASAAD TPPAKS KLEIGSPVIVVEAPKMIKTAASVPCLRVNSGIINPGDV
Subjt:  MAAPLSAATGIPRPS--ISIINPISSFNFSNCLSTGIQPRSFVIKCESSASAADETPPAKSRKLEIGSPVIVVEAPKMIKTAASVPCLRVNSGIINPGDV

Query:  GRIVSRKPKDVWAVRLKVGTYLIDGRYFKPLELDQ
        GRIVSRKPKDVW VRLKVGTYLIDGRYF+PLELDQ
Subjt:  GRIVSRKPKDVWAVRLKVGTYLIDGRYFKPLELDQ
XP_022985824.1 uncharacterized protein LOC111483753 [Cucurbita maxima]7.5e-5487.41Show/hide
Query:  MAAPLSAATGIPRPS--ISIINPISSFNFSNCLSTGIQPRSFVIKCESSASAADETPPAKSRKLEIGSPVIVVEAPKMIKTAASVPCLRVNSGIINPGDV
        MA  LS+AT IPRPS  I I+N ISSFN SN LST  QPRSFV KCESSASAAD TPPAKSRKLEIGSPVIVVEAPKMIKTAASVPCLRVNSGIINPGDV
Subjt:  MAAPLSAATGIPRPS--ISIINPISSFNFSNCLSTGIQPRSFVIKCESSASAADETPPAKSRKLEIGSPVIVVEAPKMIKTAASVPCLRVNSGIINPGDV

Query:  GRIVSRKPKDVWAVRLKVGTYLIDGRYFKPLELDQ
        GRIVSRKPKDVW VRLKVGTYLIDGRYF+PLELDQ
Subjt:  GRIVSRKPKDVWAVRLKVGTYLIDGRYFKPLELDQ
XP_023513105.1 uncharacterized protein LOC111777646 [Cucurbita pepo subsp. pepo]1.9e-5285.19Show/hide
Query:  MAAPLSAATGIPRPS--ISIINPISSFNFSNCLSTGIQPRSFVIKCESSASAADETPPAKSRKLEIGSPVIVVEAPKMIKTAASVPCLRVNSGIINPGDV
        MA  LS+AT IPRPS  I I++ ISSFN SN LST  QPRS ++KCESSASAAD TPPAKSRKLEIGSPVIVVEAPKMIKTAASVPCLRVNSGIINPGDV
Subjt:  MAAPLSAATGIPRPS--ISIINPISSFNFSNCLSTGIQPRSFVIKCESSASAADETPPAKSRKLEIGSPVIVVEAPKMIKTAASVPCLRVNSGIINPGDV

Query:  GRIVSRKPKDVWAVRLKVGTYLIDGRYFKPLELDQ
        GRIVSRKPKDVW VRLKVGTYLIDGRYF+PLELDQ
Subjt:  GRIVSRKPKDVWAVRLKVGTYLIDGRYFKPLELDQ
TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A1S3BMX2 uncharacterized protein LOC1034915962.1e-4982.09Show/hide
Query:  MAAPLSAATGIPRPSISIINPISSFNFSNCLSTGIQPRSFVIKCESSASAAD-ETPPAKSRKLEIGSPVIVVEAPKMIKTAASVPCLRVNSGIINPGDVG
        MAA  S  T I RPSI  +  ISSFN SN LST  QPRS ++KCESSASAAD +TPPAKS+KLEIGSPVIV+EAPKMIKTAASVPCLRVNSGIINPGDVG
Subjt:  MAAPLSAATGIPRPSISIINPISSFNFSNCLSTGIQPRSFVIKCESSASAAD-ETPPAKSRKLEIGSPVIVVEAPKMIKTAASVPCLRVNSGIINPGDVG

Query:  RIVSRKPKDVWAVRLKVGTYLIDGRYFKPLELDQ
        RIVSRKPKDVWAVRLKVGTYLIDGRYF+ LELDQ
Subjt:  RIVSRKPKDVWAVRLKVGTYLIDGRYFKPLELDQ
A0A5A7T9E1 Chlororespiratory reduction 422.1e-4982.09Show/hide
Query:  MAAPLSAATGIPRPSISIINPISSFNFSNCLSTGIQPRSFVIKCESSASAAD-ETPPAKSRKLEIGSPVIVVEAPKMIKTAASVPCLRVNSGIINPGDVG
        MAA  S  T I RPSI  +  ISSFN SN LST  QPRS ++KCESSASAAD +TPPAKS+KLEIGSPVIV+EAPKMIKTAASVPCLRVNSGIINPGDVG
Subjt:  MAAPLSAATGIPRPSISIINPISSFNFSNCLSTGIQPRSFVIKCESSASAAD-ETPPAKSRKLEIGSPVIVVEAPKMIKTAASVPCLRVNSGIINPGDVG

Query:  RIVSRKPKDVWAVRLKVGTYLIDGRYFKPLELDQ
        RIVSRKPKDVWAVRLKVGTYLIDGRYF+ LELDQ
Subjt:  RIVSRKPKDVWAVRLKVGTYLIDGRYFKPLELDQ
A0A6J1DLV6 uncharacterized protein LOC1110212505.4e-5897.58Show/hide
Query:  MAAPLSAATGIPRPSISIINPISSFNFSNCLSTGIQPRSFVIKCESSASAADETPPAKSRKLEIGSPVIVVEAPKMIKTAASVPCLRVNSGIINPGDVGR
        MAA LSAAT IPRPSISIIN ISSFNFSNCLSTGIQPRSFVIKCESSASAADETPPAKSRKLEIGSPVIVVEAPKMIKTAASVPCLRVNSGIINPGDVGR
Subjt:  MAAPLSAATGIPRPSISIINPISSFNFSNCLSTGIQPRSFVIKCESSASAADETPPAKSRKLEIGSPVIVVEAPKMIKTAASVPCLRVNSGIINPGDVGR

Query:  IVSRKPKDVWAVRLKVGTYLIDGR
        IVSRKPKDVWAVRLKVGTYLIDGR
Subjt:  IVSRKPKDVWAVRLKVGTYLIDGR
A0A6J1FYJ7 uncharacterized protein LOC1114487517.6e-5284.44Show/hide
Query:  MAAPLSAATGIPRPS--ISIINPISSFNFSNCLSTGIQPRSFVIKCESSASAADETPPAKSRKLEIGSPVIVVEAPKMIKTAASVPCLRVNSGIINPGDV
        MA  LS+AT IPRPS  I I++ ISSFN SN LST  QPRS ++KCESSASAAD TPPAKS KLEIGSPVIVVEAPKMIKTAASVPCLRVNSGIINPGDV
Subjt:  MAAPLSAATGIPRPS--ISIINPISSFNFSNCLSTGIQPRSFVIKCESSASAADETPPAKSRKLEIGSPVIVVEAPKMIKTAASVPCLRVNSGIINPGDV

Query:  GRIVSRKPKDVWAVRLKVGTYLIDGRYFKPLELDQ
        GRIVSRKPKDVW VRLKVGTYLIDGRYF+PLELDQ
Subjt:  GRIVSRKPKDVWAVRLKVGTYLIDGRYFKPLELDQ
A0A6J1JEC4 uncharacterized protein LOC1114837533.6e-5487.41Show/hide
Query:  MAAPLSAATGIPRPS--ISIINPISSFNFSNCLSTGIQPRSFVIKCESSASAADETPPAKSRKLEIGSPVIVVEAPKMIKTAASVPCLRVNSGIINPGDV
        MA  LS+AT IPRPS  I I+N ISSFN SN LST  QPRSFV KCESSASAAD TPPAKSRKLEIGSPVIVVEAPKMIKTAASVPCLRVNSGIINPGDV
Subjt:  MAAPLSAATGIPRPS--ISIINPISSFNFSNCLSTGIQPRSFVIKCESSASAADETPPAKSRKLEIGSPVIVVEAPKMIKTAASVPCLRVNSGIINPGDV

Query:  GRIVSRKPKDVWAVRLKVGTYLIDGRYFKPLELDQ
        GRIVSRKPKDVW VRLKVGTYLIDGRYF+PLELDQ
Subjt:  GRIVSRKPKDVWAVRLKVGTYLIDGRYFKPLELDQ
SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT5G20935.1 unknown protein1.9e-3173.49Show/hide
Query:  ADETPPAKSRKLEIGSPVIVVEAPKMIKTAASVPCLRVNSGIINPGDVGRIVSRKPKDVWAVRLKVGTYLIDGRYFKPLELDQ
        A+E P  KS KL++GSP+I+VEAPK+IKTAAS+PCLR NSG++ PGDVGRIVSRKPKD+WAVRL +GTYL+DG+YFK LELD+
Subjt:  ADETPPAKSRKLEIGSPVIVVEAPKMIKTAASVPCLRVNSGIINPGDVGRIVSRKPKDVWAVRLKVGTYLIDGRYFKPLELDQ

Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGCTGCTCCGCTTTCTGCTGCTACCGGAATTCCACGCCCAAGCATTAGCATCATCAATCCAATCTCTTCATTCAACTTCTCCAACTGCTTAAGCACCGGTATTCAACC
GCGAAGCTTCGTCATCAAGTGTGAATCAAGTGCATCGGCAGCGGACGAGACGCCGCCGGCAAAGAGCCGGAAACTCGAGATCGGCTCCCCCGTAATCGTAGTCGAGGCTC
CCAAAATGATAAAGACCGCAGCCTCAGTTCCATGCCTGCGGGTCAATTCCGGCATAATCAACCCCGGCGACGTTGGCAGAATCGTGTCGAGAAAACCTAAAGACGTGTGG
GCCGTGCGGCTTAAAGTGGGGACTTACCTCATCGATGGAAGGTATTTTAAACCATTAGAGCTCGATCAG
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGGCTGCTCCGCTTTCTGCTGCTACCGGAATTCCACGCCCAAGCATTAGCATCATCAATCCAATCTCTTCATTCAACTTCTCCAACTGCTTAAGCACCGGTATTCAACC
GCGAAGCTTCGTCATCAAGTGTGAATCAAGTGCATCGGCAGCGGACGAGACGCCGCCGGCAAAGAGCCGGAAACTCGAGATCGGCTCCCCCGTAATCGTAGTCGAGGCTC
CCAAAATGATAAAGACCGCAGCCTCAGTTCCATGCCTGCGGGTCAATTCCGGCATAATCAACCCCGGCGACGTTGGCAGAATCGTGTCGAGAAAACCTAAAGACGTGTGG
GCCGTGCGGCTTAAAGTGGGGACTTACCTCATCGATGGAAGGTATTTTAAACCATTAGAGCTCGATCAG
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MAAPLSAATGIPRPSISIINPISSFNFSNCLSTGIQPRSFVIKCESSASAADETPPAKSRKLEIGSPVIVVEAPKMIKTAASVPCLRVNSGIINPGDVGRIVSRKPKDVW
AVRLKVGTYLIDGRYFKPLELDQ