; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

MS011041 (gene) of Bitter gourd (TR) v1 genome

Gene IDMS011041
OrganismMomordica charantia cv. TR (Bitter gourd (TR) v1)
DescriptionGeranyl diphosphate synthase
Genome locationscaffold35:3821002..3832002
RNA-Seq ExpressionMS011041
SyntenyMS011041
Gene Ontology termsGO:0006744 - ubiquinone biosynthetic process (biological process)
GO:0008299 - isoprenoid biosynthetic process (biological process)
GO:0009793 - embryo development ending in seed dormancy (biological process)
GO:0005739 - mitochondrion (cellular component)
GO:0009507 - chloroplast (cellular component)
GO:1990234 - transferase complex (cellular component)
GO:0004161 - dimethylallyltranstransferase activity (molecular function)
GO:0050347 - trans-octaprenyltranstransferase activity (molecular function)
InterPro domainsIPR000092 - Polyprenyl synthetase
IPR008949 - Isoprenoid synthase domain superfamily
IPR033749 - Polyprenyl synthetase, conserved site


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
AEM42978.1 geranyl diphosphate synthase [Siraitia grosvenorii]7.6e-21792.91Show/hide
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XP_022977414.1 solanesyl diphosphate synthase 3, chloroplastic/mitochondrial [Cucurbita maxima]3.2e-21592.43Show/hide
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XP_023543316.1 solanesyl diphosphate synthase 3, chloroplastic/mitochondrial [Cucurbita pepo subsp. pepo]4.2e-21592.2Show/hide
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XP_038883641.1 solanesyl diphosphate synthase 3, chloroplastic/mitochondrial isoform X1 [Benincasa hispida]6.4e-21692.67Show/hide
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A0A6J1EDF1 solanesyl diphosphate synthase 3, chloroplastic/mitochondrial1.3e-21491.96Show/hide
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A0A6J1IRB5 solanesyl diphosphate synthase 3, chloroplastic/mitochondrial1.5e-21592.43Show/hide
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K7NBK7 Geranyl diphosphate synthase3.7e-21792.91Show/hide
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Subjt:  LGLAYQLIDDVLDFTGTSASLGKGSLSDIRHGIITAPLLFAMEEFPQLRTVVDRGFDNPKNIDIAMEYLGKSRGIQRARELAAKHANLAAEAIDSLPEND

Query:  DEDVRRSRRALVDLTQRVITRTK
        DEDVR+SR+ALVDLTQRV+TRTK
Subjt:  DEDVRRSRRALVDLTQRVITRTK

SwissProt top hitse value%identityAlignment
Q0INZ4 Probable solanesyl-diphosphate synthase 3, chloroplastic1.0e-6242.49Show/hide
Query:  LVADELSLLANRLRAMVVAEVPKLASAAEYFFKLGVEGKRFRPTVLLLMSTALNVPIPKPLPHPVEDHLTMDLRTRQQCVAEITEMIHVASLLHDDVLDD
        +VAD+L  L N L+++V AE P L SAAE  F  G  GKR RP ++ L+S A             E    ++L T  Q +AEI EMIH ASL+HDDV+DD
Subjt:  LVADELSLLANRLRAMVVAEVPKLASAAEYFFKLGVEGKRFRPTVLLLMSTALNVPIPKPLPHPVEDHLTMDLRTRQQCVAEITEMIHVASLLHDDVLDD

Query:  ADTRRGISSLNSLMGNKISVLAGDFLLSRACVTLASLKNTEVVSLIAQVVEHLVTGETMQMTTTSDQRYSMEYYLQKTYYKTASLISNSCKSIAILAGQT
        +  RRG  +++ L G +++VLAGDF+ +++   LA+L+N EV+ LI+QV++   +GE  Q +T  D   +++ YL K+YYKTASLI+ S +S AI +G +
Subjt:  ADTRRGISSLNSLMGNKISVLAGDFLLSRACVTLASLKNTEVVSLIAQVVEHLVTGETMQMTTTSDQRYSMEYYLQKTYYKTASLISNSCKSIAILAGQT

Query:  AEVAILAYEYGKNLGLAYQLIDDVLDFTGTSASLGKGSLSDIRHGIITAPLLFAMEEFPQLRTVVDRGFDNPKNIDIAMEYLGKSRGIQRARELAAKHAN
          +    YEYG+NLGL++Q++DD+LDFT ++  LGK + SD+  G +TAP++FA+++ PQLR ++D  F    ++  A+E + +S GI+RA ELA +   
Subjt:  AEVAILAYEYGKNLGLAYQLIDDVLDFTGTSASLGKGSLSDIRHGIITAPLLFAMEEFPQLRTVVDRGFDNPKNIDIAMEYLGKSRGIQRARELAAKHAN

Query:  LAAEAIDSLPEND
        +A +++  LP ++
Subjt:  LAAEAIDSLPEND

Q33DR2 All trans-polyprenyl-diphosphate synthase PDSS18.2e-6537.93Show/hide
Query:  EIMYLAYPTLHGLGRQIHHQSSSIV--------EEQLDPFSLVADELSLLANRLRAMVVAEVPKLASAAEYFFKLGVEGKRFRPTVLLLMSTALNVPIPK
        +I+  A PT+H +  Q H ++ ++         E+  DPF L   +L  L   +R  +     +L   +EY+F    +GK FRP +++LM+ A N     
Subjt:  EIMYLAYPTLHGLGRQIHHQSSSIV--------EEQLDPFSLVADELSLLANRLRAMVVAEVPKLASAAEYFFKLGVEGKRFRPTVLLLMSTALNVPIPK

Query:  PLPHPVEDHLTMDLRTRQQCVAEITEMIHVASLLHDDVLDDADTRRGISSLNSLMGNKISVLAGDFLLSRACVTLASLKNTEVVSLIAQVVEHLVTGETM
             +  +   +++  Q+ +A + EMIH A+L+HDDV+DDA +RRG  ++N + G K +VLAGD +LS A V LA + NT VVS++AQV+E LV GE +
Subjt:  PLPHPVEDHLTMDLRTRQQCVAEITEMIHVASLLHDDVLDDADTRRGISSLNSLMGNKISVLAGDFLLSRACVTLASLKNTEVVSLIAQVVEHLVTGETM

Query:  QMTTTSDQRYSMEYYLQKTYYKTASLISNSCKSIAILAGQTAEVAILAYEYGKNLGLAYQLIDDVLDFTGTSASLGKGSLSDIRHGIITAPLLFAMEEFP
        Q+ +  ++     +YL+KT+ KTASLI+NSCK++++L      V  +AY+YGKN+G+A+QLIDDVLDFT  S  +GK + +D++ GI T P+LFA ++FP
Subjt:  QMTTTSDQRYSMEYYLQKTYYKTASLISNSCKSIAILAGQTAEVAILAYEYGKNLGLAYQLIDDVLDFTGTSASLGKGSLSDIRHGIITAPLLFAMEEFP

Query:  QLRTVVDRGFDNPKNIDIAMEYLGKSRGIQRARELAAKHANLAAEAIDSLPENDDEDVRRSRRALVDLTQRVITRTK
        ++  ++ R F  P ++D A +Y+ +S G+Q+   LA ++ + A   I  L  + + D      AL+ L++ V+TR K
Subjt:  QLRTVVDRGFDNPKNIDIAMEYLGKSRGIQRARELAAKHANLAAEAIDSLPENDDEDVRRSRRALVDLTQRVITRTK

Q5HZ00 Solanesyl diphosphate synthase 3, chloroplastic/mitochondrial7.8e-15668.78Show/hide
Query:  MLFSRGLSRI-SRIPRNSSCCCWFLSNRS--DTRPVLLPNVLSLHPSESDRQALGCREIMYLAYPTLHGLGRQIHHQSSSIVEEQLDPFSLVADELSLLA
        MLF+R ++RI S+  RN S   ++ S++S    R  ++P+      S+S  +   CR    L  P   G   Q++HQSSS+VEE+LDPFSLVADELSLL+
Subjt:  MLFSRGLSRI-SRIPRNSSCCCWFLSNRS--DTRPVLLPNVLSLHPSESDRQALGCREIMYLAYPTLHGLGRQIHHQSSSIVEEQLDPFSLVADELSLLA

Query:  NRLRAMVVAEVPKLASAAEYFFKLGVEGKRFRPTVLLLMSTALNVPIPKPLPHPVEDHLTMDLRTRQQCVAEITEMIHVASLLHDDVLDDADTRRGISSL
        N+LR MV+AEVPKLASAAEYFFK GV+GK+FR T+LLLM+TALNV +P+ L     D +T +LR RQ+ +AEITEMIHVASLLHDDVLDDADTRRG+ SL
Subjt:  NRLRAMVVAEVPKLASAAEYFFKLGVEGKRFRPTVLLLMSTALNVPIPKPLPHPVEDHLTMDLRTRQQCVAEITEMIHVASLLHDDVLDDADTRRGISSL

Query:  NSLMGNKISVLAGDFLLSRACVTLASLKNTEVVSLIAQVVEHLVTGETMQMTTTSDQRYSMEYYLQKTYYKTASLISNSCKSIAILAGQTAEVAILAYEY
        N +MGNK+SVLAGDFLLSRAC  LA+LKNTEVV+L+A  VEHLVTGETM++T++++QRYSM+YY+QKTYYKTASLISNSCK++A+L GQTAEVA+LA+EY
Subjt:  NSLMGNKISVLAGDFLLSRACVTLASLKNTEVVSLIAQVVEHLVTGETMQMTTTSDQRYSMEYYLQKTYYKTASLISNSCKSIAILAGQTAEVAILAYEY

Query:  GKNLGLAYQLIDDVLDFTGTSASLGKGSLSDIRHGIITAPLLFAMEEFPQLRTVVDRGFDNPKNIDIAMEYLGKSRGIQRARELAAKHANLAAEAIDSLP
        G+NLGLA+QLIDD+LDFTGTSASLGKGSLSDIRHG+ITAP+LFAMEEFPQLR VVD+   +P+N+DIA+EYLGKS+GIQRARELA +HANLAA AI SLP
Subjt:  GKNLGLAYQLIDDVLDFTGTSASLGKGSLSDIRHGIITAPLLFAMEEFPQLRTVVDRGFDNPKNIDIAMEYLGKSRGIQRARELAAKHANLAAEAIDSLP

Query:  ENDDEDVRRSRRALVDLTQRVITRTK
        E D+EDV+RSRRAL+DLT RVITR K
Subjt:  ENDDEDVRRSRRALVDLTQRVITRTK

Q653T6 Solanesyl-diphosphate synthase 1, mitochondrial5.0e-14772Show/hide
Query:  QALGCREIMYLAYPTLHGLGRQIHHQSSSIVEEQLDPFSLVADELSLLANRLRAMVVAEVPKLASAAEYFFKLGVEGKRFRPTVLLLMSTALNVPIPKPL
        + +GCR   +++   LH    Q+     S  EEQ DPF LVADELSLLANRLR+MV AEVPKLASAAEYFFK+G EGKRFRPTVLLLM++AL  P+    
Subjt:  QALGCREIMYLAYPTLHGLGRQIHHQSSSIVEEQLDPFSLVADELSLLANRLRAMVVAEVPKLASAAEYFFKLGVEGKRFRPTVLLLMSTALNVPIPKPL

Query:  PHPVEDHLTMDLRTRQQCVAEITEMIHVASLLHDDVLDDADTRRGISSLNSLMGNKISVLAGDFLLSRACVTLASLKNTEVVSLIAQVVEHLVTGETMQM
           V   L   LRTRQQ +AEITEMIHVASLLHDDVLDDADTRRG+SSLN +MGNK+SVLAGDFLLSRACV LA+L NTEVVSL+A  VEHLVTGETMQ+
Subjt:  PHPVEDHLTMDLRTRQQCVAEITEMIHVASLLHDDVLDDADTRRGISSLNSLMGNKISVLAGDFLLSRACVTLASLKNTEVVSLIAQVVEHLVTGETMQM

Query:  TTTSDQRYSMEYYLQKTYYKTASLISNSCKSIAILAGQTAEVAILAYEYGKNLGLAYQLIDDVLDFTGTSASLGKGSLSDIRHGIITAPLLFAMEEFPQL
        +T+ +QR SM+YYLQKTYYKTASLISNSCK++AILAG TA+V++LAYEYG+NLGLA+QLIDDVLDFTGTSASLGKGSL+DIRHGIITAP+L+AMEEFPQL
Subjt:  TTTSDQRYSMEYYLQKTYYKTASLISNSCKSIAILAGQTAEVAILAYEYGKNLGLAYQLIDDVLDFTGTSASLGKGSLSDIRHGIITAPLLFAMEEFPQL

Query:  RTVVDRGFDNPKNIDIAMEYLGKSRGIQRARELAAKHANLAAEAIDSLPENDDEDVRRSRRALVDLTQRVITRTK
          VVDRGFDNP N+++A++YL KSRGI++ +ELA +HAN A +AI++LP++DDEDV  SRRAL+D+T+RVITRTK
Subjt:  RTVVDRGFDNPKNIDIAMEYLGKSRGIQRARELAAKHANLAAEAIDSLPENDDEDVRRSRRALVDLTQRVITRTK

Q7S565 Probable hexaprenyl pyrophosphate synthase, mitochondrial1.0e-6241.64Show/hide
Query:  LDPFSLVADELSLLANRLRAMVVAEVPKLASAAEYFFKLGVEGKRFRPTVLLLMS--TALNVPIPK-----------------PL----------PHPVE
        +DP  LVA E+  L   +R ++ +  P L  AA+Y+ +   EGK  RP ++LLMS  TAL    P+                 PL            PV 
Subjt:  LDPFSLVADELSLLANRLRAMVVAEVPKLASAAEYFFKLGVEGKRFRPTVLLLMS--TALNVPIPK-----------------PL----------PHPVE

Query:  DHLTMDLRTRQQCVAEITEMIHVASLLHDDVLDDADTRRGISSLNSLMGNKISVLAGDFLLSRACVTLASLKNTEVVSLIAQVVEHLVTGETMQMTTTS-
             D+   Q+ +AEITE+IH ASLLHDDV+D +++RRG  S N   GNK++VLAGDFLL RA V LA L++ EVV L+A V+ +LV GE MQ+  T+ 
Subjt:  DHLTMDLRTRQQCVAEITEMIHVASLLHDDVLDDADTRRGISSLNSLMGNKISVLAGDFLLSRACVTLASLKNTEVVSLIAQVVEHLVTGETMQMTTTS-

Query:  ---DQRYSME---YYLQKTYYKTASLISNSCKSIAILAGQTAEVAILAYEYGKNLGLAYQLIDDVLDFTGTSASLGKGSLSDIRHGIITAPLLFAMEEFP
           + ++S E   YYLQKTY KTASLIS SC++ A+L G  A     AY YGKNLGLA+QL+DD+LD+T +   LGK + +D+  G+ TAPLLFA +  P
Subjt:  ---DQRYSME---YYLQKTYYKTASLISNSCKSIAILAGQTAEVAILAYEYGKNLGLAYQLIDDVLDFTGTSASLGKGSLSDIRHGIITAPLLFAMEEFP

Query:  QLRTVVDRGFDNPKNIDIAMEYLGKSRGIQRARELAAKHANLAAEAIDSLPENDDEDVRRSRRALVDLTQRVITRTK
        +L  +V R F+   +   A E + +S GI++ R LA  +A  A EAI   P+++ +D       L+++  + + R K
Subjt:  QLRTVVDRGFDNPKNIDIAMEYLGKSRGIQRARELAAKHANLAAEAIDSLPENDDEDVRRSRRALVDLTQRVITRTK

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G17050.1 solanesyl diphosphate synthase 28.2e-6041.08Show/hide
Query:  FSLVADELSLLANRLRAMVVAEVPKLASAAEYFFKLGVEGKRFRPTVLLLMSTALNVPIPKPLPHPVEDHLTMDLRTRQQCVAEITEMIHVASLLHDDVL
        F +VAD+L  L + L ++V AE P L SAAE  F  G  GKR RP ++ L+S A             E     +L    + + EI EMIH ASL+HDDVL
Subjt:  FSLVADELSLLANRLRAMVVAEVPKLASAAEYFFKLGVEGKRFRPTVLLLMSTALNVPIPKPLPHPVEDHLTMDLRTRQQCVAEITEMIHVASLLHDDVL

Query:  DDADTRRGISSLNSLMGNKISVLAGDFLLSRACVTLASLKNTEVVSLIAQVVEHLVTGETMQMTTTSDQRYSMEYYLQKTYYKTASLISNSCKSIAILAG
        D++D RRG  +++ L G +++VLAGDF+ ++A   LA+L+N EV+ LI+QV++   +GE  Q ++  D    ++ Y+ K+YYKTASL++ S K  AI + 
Subjt:  DDADTRRGISSLNSLMGNKISVLAGDFLLSRACVTLASLKNTEVVSLIAQVVEHLVTGETMQMTTTSDQRYSMEYYLQKTYYKTASLISNSCKSIAILAG

Query:  QTAEVAILAYEYGKNLGLAYQLIDDVLDFTGTSASLGKGSLSDIRHGIITAPLLFAMEEFPQLRTVVDRGFDNPKNIDIAMEYLGKSRGIQRARELAAKH
          ++VA   Y++GKNLGL++Q++DD+LDFT ++  LGK + +D+  G ITAP++FA+E  P+LR +++  F  P +++ A+E +    GI++A+ELA + 
Subjt:  QTAEVAILAYEYGKNLGLAYQLIDDVLDFTGTSASLGKGSLSDIRHGIITAPLLFAMEEFPQLRTVVDRGFDNPKNIDIAMEYLGKSRGIQRARELAAKH

Query:  ANLAAEAIDSLPEN
        A LA + ++ LP +
Subjt:  ANLAAEAIDSLPEN

AT1G78510.1 solanesyl diphosphate synthase 15.3e-5940.35Show/hide
Query:  LHGLGRQIHHQSSSIVEEQLDP------FSLVADELSLLANRLRAMVVAEVPKLASAAEYFFKLGVEGKRFRPTVLLLMSTALNVPIPKPLPHPVEDHLT
        L+G+G Q    S  + +E   P      F LVA +L  L + L ++V AE P L SAAE  F  G  GKR RP ++ L+S A             E    
Subjt:  LHGLGRQIHHQSSSIVEEQLDP------FSLVADELSLLANRLRAMVVAEVPKLASAAEYFFKLGVEGKRFRPTVLLLMSTALNVPIPKPLPHPVEDHLT

Query:  MDLRTRQQCVAEITEMIHVASLLHDDVLDDADTRRGISSLNSLMGNKISVLAGDFLLSRACVTLASLKNTEVVSLIAQVVEHLVTGETMQMTTTSDQRYS
         +L T  + +AEI EMIH ASL+HDDVLD++D RRG  +++ L G +++VLAGDF+ ++A   LA+L+N EV+ LI+QV++   +GE  Q ++  D    
Subjt:  MDLRTRQQCVAEITEMIHVASLLHDDVLDDADTRRGISSLNSLMGNKISVLAGDFLLSRACVTLASLKNTEVVSLIAQVVEHLVTGETMQMTTTSDQRYS

Query:  MEYYLQKTYYKTASLISNSCKSIAILAGQTAEVAILAYEYGKNLGLAYQLIDDVLDFTGTSASLGKGSLSDIRHGIITAPLLFAMEEFPQLRTVVDRGFD
        ++ YL K++YKTASL++ S K  AI +    +V    YE+GKNLGL++Q++DD+LDFT ++  LGK + SD+  G +TAP++FA+E  P+LR +++  F 
Subjt:  MEYYLQKTYYKTASLISNSCKSIAILAGQTAEVAILAYEYGKNLGLAYQLIDDVLDFTGTSASLGKGSLSDIRHGIITAPLLFAMEEFPQLRTVVDRGFD

Query:  NPKNIDIAMEYLGKSRGIQRARELAAKHANLAAEAIDSLPEN
           +++ A+E + K  GI+RA+ELA + A+ A + +  LP +
Subjt:  NPKNIDIAMEYLGKSRGIQRARELAAKHANLAAEAIDSLPEN

AT1G78510.2 solanesyl diphosphate synthase 11.5e-5841.72Show/hide
Query:  FSLVADELSLLANRLRAMVVAEVPKLASAAEYFFKLGVEGKRFRPTVLLLMSTALNVPIPKPLPHPVEDHLTMDLRTRQQCVAEITEMIHVASLLHDDVL
        F LVA +L  L + L ++V AE P L SAAE  F  G  GKR RP ++ L+S A             E     +L T  + +AEI EMIH ASL+HDDVL
Subjt:  FSLVADELSLLANRLRAMVVAEVPKLASAAEYFFKLGVEGKRFRPTVLLLMSTALNVPIPKPLPHPVEDHLTMDLRTRQQCVAEITEMIHVASLLHDDVL

Query:  DDADTRRGISSLNSLMGNKISVLAGDFLLSRACVTLASLKNTEVVSLIAQVVEHLVTGETMQMTTTSDQRYSMEYYLQKTYYKTASLISNSCKSIAILAG
        D++D RRG  +++ L G +++VLAGDF+ ++A   LA+L+N EV+ LI+QV++   +GE  Q ++  D    ++ YL K++YKTASL++ S K  AI + 
Subjt:  DDADTRRGISSLNSLMGNKISVLAGDFLLSRACVTLASLKNTEVVSLIAQVVEHLVTGETMQMTTTSDQRYSMEYYLQKTYYKTASLISNSCKSIAILAG

Query:  QTAEVAILAYEYGKNLGLAYQLIDDVLDFTGTSASLGKGSLSDIRHGIITAPLLFAMEEFPQLRTVVDRGFDNPKNIDIAMEYLGKSRGIQRARELAAKH
           +V    YE+GKNLGL++Q++DD+LDFT ++  LGK + SD+  G +TAP++FA+E  P+LR +++  F    +++ A+E + K  GI+RA+ELA + 
Subjt:  QTAEVAILAYEYGKNLGLAYQLIDDVLDFTGTSASLGKGSLSDIRHGIITAPLLFAMEEFPQLRTVVDRGFDNPKNIDIAMEYLGKSRGIQRARELAAKH

Query:  ANLAAEAIDSLPEN
        A+ A + +  LP +
Subjt:  ANLAAEAIDSLPEN

AT2G34630.1 geranyl diphosphate synthase 11.4e-13676.64Show/hide
Query:  MVVAEVPKLASAAEYFFKLGVEGKRFRPTVLLLMSTALNVPIPKPLPHPVEDHLTMDLRTRQQCVAEITEMIHVASLLHDDVLDDADTRRGISSLNSLMG
        MV+AEVPKLASAAEYFFK GV+GK+FR T+LLLM+TALNV +P+ L     D +T +LR RQ+ +AEITEMIHVASLLHDDVLDDADTRRG+ SLN +MG
Subjt:  MVVAEVPKLASAAEYFFKLGVEGKRFRPTVLLLMSTALNVPIPKPLPHPVEDHLTMDLRTRQQCVAEITEMIHVASLLHDDVLDDADTRRGISSLNSLMG

Query:  NKISVLAGDFLLSRACVTLASLKNTEVVSLIAQVVEHLVTGETMQMTTTSDQRYSMEYYLQKTYYKTASLISNSCKSIAILAGQTAEVAILAYEYGKNLG
        NK+SVLAGDFLLSRAC  LA+LKNTEVV+L+A  VEHLVTGETM++T++++QRYSM+YY+QKTYYKTASLISNSCK++A+L GQTAEVA+LA+EYG+NLG
Subjt:  NKISVLAGDFLLSRACVTLASLKNTEVVSLIAQVVEHLVTGETMQMTTTSDQRYSMEYYLQKTYYKTASLISNSCKSIAILAGQTAEVAILAYEYGKNLG

Query:  LAYQLIDDVLDFTGTSASLGKGSLSDIRHGIITAPLLFAMEEFPQLRTVVDRGFDNPKNIDIAMEYLGKSRGIQRARELAAKHANLAAEAIDSLPENDDE
        LA+QLIDD+LDFTGTSASLGKGSLSDIRHG+ITAP+LFAMEEFPQLR VVD+   +P+N+DIA+EYLGKS+GIQRARELA +HANLAA AI SLPE D+E
Subjt:  LAYQLIDDVLDFTGTSASLGKGSLSDIRHGIITAPLLFAMEEFPQLRTVVDRGFDNPKNIDIAMEYLGKSRGIQRARELAAKHANLAAEAIDSLPENDDE

Query:  DVRRSRRALVDLTQRVITRTK
        DV+RSRRAL+DLT RVITR K
Subjt:  DVRRSRRALVDLTQRVITRTK

AT2G34630.2 geranyl diphosphate synthase 15.5e-15768.78Show/hide
Query:  MLFSRGLSRI-SRIPRNSSCCCWFLSNRS--DTRPVLLPNVLSLHPSESDRQALGCREIMYLAYPTLHGLGRQIHHQSSSIVEEQLDPFSLVADELSLLA
        MLF+R ++RI S+  RN S   ++ S++S    R  ++P+      S+S  +   CR    L  P   G   Q++HQSSS+VEE+LDPFSLVADELSLL+
Subjt:  MLFSRGLSRI-SRIPRNSSCCCWFLSNRS--DTRPVLLPNVLSLHPSESDRQALGCREIMYLAYPTLHGLGRQIHHQSSSIVEEQLDPFSLVADELSLLA

Query:  NRLRAMVVAEVPKLASAAEYFFKLGVEGKRFRPTVLLLMSTALNVPIPKPLPHPVEDHLTMDLRTRQQCVAEITEMIHVASLLHDDVLDDADTRRGISSL
        N+LR MV+AEVPKLASAAEYFFK GV+GK+FR T+LLLM+TALNV +P+ L     D +T +LR RQ+ +AEITEMIHVASLLHDDVLDDADTRRG+ SL
Subjt:  NRLRAMVVAEVPKLASAAEYFFKLGVEGKRFRPTVLLLMSTALNVPIPKPLPHPVEDHLTMDLRTRQQCVAEITEMIHVASLLHDDVLDDADTRRGISSL

Query:  NSLMGNKISVLAGDFLLSRACVTLASLKNTEVVSLIAQVVEHLVTGETMQMTTTSDQRYSMEYYLQKTYYKTASLISNSCKSIAILAGQTAEVAILAYEY
        N +MGNK+SVLAGDFLLSRAC  LA+LKNTEVV+L+A  VEHLVTGETM++T++++QRYSM+YY+QKTYYKTASLISNSCK++A+L GQTAEVA+LA+EY
Subjt:  NSLMGNKISVLAGDFLLSRACVTLASLKNTEVVSLIAQVVEHLVTGETMQMTTTSDQRYSMEYYLQKTYYKTASLISNSCKSIAILAGQTAEVAILAYEY

Query:  GKNLGLAYQLIDDVLDFTGTSASLGKGSLSDIRHGIITAPLLFAMEEFPQLRTVVDRGFDNPKNIDIAMEYLGKSRGIQRARELAAKHANLAAEAIDSLP
        G+NLGLA+QLIDD+LDFTGTSASLGKGSLSDIRHG+ITAP+LFAMEEFPQLR VVD+   +P+N+DIA+EYLGKS+GIQRARELA +HANLAA AI SLP
Subjt:  GKNLGLAYQLIDDVLDFTGTSASLGKGSLSDIRHGIITAPLLFAMEEFPQLRTVVDRGFDNPKNIDIAMEYLGKSRGIQRARELAAKHANLAAEAIDSLP

Query:  ENDDEDVRRSRRALVDLTQRVITRTK
        E D+EDV+RSRRAL+DLT RVITR K
Subjt:  ENDDEDVRRSRRALVDLTQRVITRTK


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGTTGTTTTCTCGAGGACTTTCCCGGATTTCGAGGATTCCCAGAAACAGCTCCTGTTGTTGCTGGTTCCTCTCTAATCGATCAGATACTCGTCCAGTTCTTCTACCCAA
TGTTCTCTCTTTGCATCCTTCGGAATCTGATCGGCAGGCTCTAGGATGCAGAGAAATCATGTACTTGGCTTATCCCACTTTGCATGGTTTGGGACGTCAAATTCATCATC
AAAGCAGCTCTATAGTTGAGGAACAGCTTGATCCATTCTCACTTGTTGCAGACGAGTTATCGCTCCTTGCCAATAGACTACGGGCAATGGTAGTTGCTGAGGTTCCAAAA
CTTGCTTCTGCTGCTGAATATTTCTTCAAACTGGGCGTTGAAGGGAAGAGATTTCGTCCAACGGTTTTATTGCTGATGTCAACTGCTTTAAATGTGCCAATACCCAAACC
TCTTCCTCATCCTGTAGAAGACCATTTGACAATGGATCTACGCACGAGACAACAATGTGTAGCCGAAATCACTGAGATGATTCATGTGGCCAGCCTTCTACATGATGATG
TATTGGATGATGCAGACACAAGACGTGGCATTAGTTCGTTAAATTCTCTGATGGGAAATAAGATATCAGTTTTAGCTGGAGACTTTTTGCTCTCTCGAGCGTGTGTTACA
CTCGCCTCTTTAAAAAACACAGAGGTGGTATCATTAATAGCACAAGTTGTGGAACATCTCGTGACTGGTGAAACTATGCAAATGACTACAACATCTGATCAACGTTATAG
CATGGAATATTACTTGCAGAAGACATATTATAAGACTGCATCATTGATTTCGAACAGTTGCAAATCTATAGCCATTCTTGCTGGACAAACAGCGGAAGTTGCGATATTGG
CTTACGAGTATGGAAAAAATCTGGGGTTAGCATATCAACTGATTGATGATGTTCTTGACTTCACCGGGACTTCTGCTTCACTTGGAAAGGGTTCTTTATCTGACATCCGC
CATGGAATCATTACAGCTCCATTATTATTTGCCATGGAAGAGTTCCCCCAGTTGCGTACGGTTGTGGATCGTGGTTTTGACAATCCTAAAAACATCGATATCGCAATGGA
GTACCTCGGGAAGAGTCGTGGAATACAACGTGCAAGAGAGCTAGCAGCAAAACATGCCAATCTAGCTGCAGAAGCTATCGATTCTCTACCCGAGAACGATGATGAAGACG
TAAGAAGGTCGAGAAGGGCACTTGTAGATCTCACTCAAAGAGTCATTACAAGAACAAAG
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGTTGTTTTCTCGAGGACTTTCCCGGATTTCGAGGATTCCCAGAAACAGCTCCTGTTGTTGCTGGTTCCTCTCTAATCGATCAGATACTCGTCCAGTTCTTCTACCCAA
TGTTCTCTCTTTGCATCCTTCGGAATCTGATCGGCAGGCTCTAGGATGCAGAGAAATCATGTACTTGGCTTATCCCACTTTGCATGGTTTGGGACGTCAAATTCATCATC
AAAGCAGCTCTATAGTTGAGGAACAGCTTGATCCATTCTCACTTGTTGCAGACGAGTTATCGCTCCTTGCCAATAGACTACGGGCAATGGTAGTTGCTGAGGTTCCAAAA
CTTGCTTCTGCTGCTGAATATTTCTTCAAACTGGGCGTTGAAGGGAAGAGATTTCGTCCAACGGTTTTATTGCTGATGTCAACTGCTTTAAATGTGCCAATACCCAAACC
TCTTCCTCATCCTGTAGAAGACCATTTGACAATGGATCTACGCACGAGACAACAATGTGTAGCCGAAATCACTGAGATGATTCATGTGGCCAGCCTTCTACATGATGATG
TATTGGATGATGCAGACACAAGACGTGGCATTAGTTCGTTAAATTCTCTGATGGGAAATAAGATATCAGTTTTAGCTGGAGACTTTTTGCTCTCTCGAGCGTGTGTTACA
CTCGCCTCTTTAAAAAACACAGAGGTGGTATCATTAATAGCACAAGTTGTGGAACATCTCGTGACTGGTGAAACTATGCAAATGACTACAACATCTGATCAACGTTATAG
CATGGAATATTACTTGCAGAAGACATATTATAAGACTGCATCATTGATTTCGAACAGTTGCAAATCTATAGCCATTCTTGCTGGACAAACAGCGGAAGTTGCGATATTGG
CTTACGAGTATGGAAAAAATCTGGGGTTAGCATATCAACTGATTGATGATGTTCTTGACTTCACCGGGACTTCTGCTTCACTTGGAAAGGGTTCTTTATCTGACATCCGC
CATGGAATCATTACAGCTCCATTATTATTTGCCATGGAAGAGTTCCCCCAGTTGCGTACGGTTGTGGATCGTGGTTTTGACAATCCTAAAAACATCGATATCGCAATGGA
GTACCTCGGGAAGAGTCGTGGAATACAACGTGCAAGAGAGCTAGCAGCAAAACATGCCAATCTAGCTGCAGAAGCTATCGATTCTCTACCCGAGAACGATGATGAAGACG
TAAGAAGGTCGAGAAGGGCACTTGTAGATCTCACTCAAAGAGTCATTACAAGAACAAAG
Protein sequenceShow/hide protein sequence
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LASAAEYFFKLGVEGKRFRPTVLLLMSTALNVPIPKPLPHPVEDHLTMDLRTRQQCVAEITEMIHVASLLHDDVLDDADTRRGISSLNSLMGNKISVLAGDFLLSRACVT
LASLKNTEVVSLIAQVVEHLVTGETMQMTTTSDQRYSMEYYLQKTYYKTASLISNSCKSIAILAGQTAEVAILAYEYGKNLGLAYQLIDDVLDFTGTSASLGKGSLSDIR
HGIITAPLLFAMEEFPQLRTVVDRGFDNPKNIDIAMEYLGKSRGIQRARELAAKHANLAAEAIDSLPENDDEDVRRSRRALVDLTQRVITRTK