CuGenDBv2

Gene ID	MS011518
Organism	Momordica charantia cv. TR (Bitter gourd (TR) v1)
Description	VQ domain-containing protein
Genome location	scaffold239:2547777..2548238
RNA-Seq Expression	MS011518
Synteny	MS011518
Gene Ontology terms	NA
InterPro domains	IPR008889 - VQ IPR039610 - VQ motif-containing protein 29

Homology

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GenBank top hits

e value

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Alignment

KAG6604115.1 VQ motif-containing protein 29, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]

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XP_011657908.1 uncharacterized protein LOC105435910 [Cucumis sativus]

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XP_022950153.1 uncharacterized protein LOC111453330 [Cucurbita moschata]

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XP_038883814.1 uncharacterized protein LOC120074676 [Benincasa hispida]

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TrEMBL top hits

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Alignment

A0A0A0KJR2 VQ domain-containing protein

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A0A1S3B142 uncharacterized protein LOC103484869

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A0A6J1GE45 uncharacterized protein LOC111453330

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A0A6J1HHA9 uncharacterized protein LOC111463479

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A0A6J1IPH4 uncharacterized protein LOC111477640

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74.07

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SwissProt top hits

e value

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Alignment

Q9SZG3 VQ motif-containing protein 29

1.6e-05

32.06

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        TS    S S+L    +  E   R   +Y ++L S RK   KP K+PAI +P+ P  P VY+V+P+NF+ LVQ+LTG  E  + + + +     D A++  
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        S  A + ++        G F   N +  ++W
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Arabidopsis top hits

e value

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Alignment

AT2G22880.1 VQ motif-containing protein

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35.9

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        FS  S+L S RK   KPWKKP         P+VY+V+P+NF++LVQ+LTG AE     + ++   P+ I        + + T  K    D     +L+ S
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            W +FP LSP  L+
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AT4G37710.1 VQ motif-containing protein

1.1e-06

32.06

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        TS    S S+L    +  E   R   +Y ++L S RK   KP K+PAI +P+ P  P VY+V+P+NF+ LVQ+LTG  E  + + + +     D A++  
Subjt:  TSSSSSSSSFLAQKPDQSEHVRREFSSY-SNLRSVRKPMGKPWKKPAI-APMPPTRPRVYKVDPINFRDLVQKLTGLAELRSPRLQKMAPPPLDIARRQE

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        S  A + ++        G F   N +  ++W
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Sequences

Show/hide sequences

CDS sequence

Show/hide CDS sequence

ATGGAGGCATTTTCTGCTTATACTACTTCTTCTTCTTCCTCATCTTCCAGCTTTTTGGCTCAAAAACCTGATCAATCCGAGCACGTGAGGCGGGAATTTTCGAGTTATTC
GAATCTTCGTTCGGTTCGGAAGCCGATGGGGAAGCCGTGGAAGAAGCCGGCGATTGCGCCGATGCCACCCACTCGGCCGAGAGTCTACAAGGTGGACCCAATTAACTTCC
GGGATCTGGTCCAGAAACTCACCGGCTTGGCTGAGCTCCGATCTCCGCGGCTGCAGAAAATGGCGCCGCCGCCGCTTGATATTGCGCGGCGGCAAGAGTCGGGCGGCGCG
GCGGAGGCCACGGCGGTGAAGGTGGATGAGGTGGACGGAGGAAGCTTCCTTGAGCTGAATTTGTCACCCTTCAACAAATGGTGCTCTTTCCCTGCTTTGAGCCCGGAAAC
TCTTGCCATTTTGGATGCAATT

mRNA sequence

Show/hide mRNA sequence

Protein sequence

Show/hide protein sequence

MEAFSAYTTSSSSSSSSFLAQKPDQSEHVRREFSSYSNLRSVRKPMGKPWKKPAIAPMPPTRPRVYKVDPINFRDLVQKLTGLAELRSPRLQKMAPPPLDIARRQESGGA
AEATAVKVDEVDGGSFLELNLSPFNKWCSFPALSPETLAILDAI

MS011518 (gene) of Bitter gourd (TR) v1 genome