; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

MS011627 (gene) of Bitter gourd (TR) v1 genome

Gene IDMS011627
OrganismMomordica charantia cv. TR (Bitter gourd (TR) v1)
DescriptionRab family
Genome locationscaffold239:3362445..3364952
RNA-Seq ExpressionMS011627
SyntenyMS011627
Gene Ontology termsGO:0006886 - intracellular protein transport (biological process)
GO:0006890 - retrograde vesicle-mediated transport, Golgi to endoplasmic reticulum (biological process)
GO:0006891 - intra-Golgi vesicle-mediated transport (biological process)
GO:0042147 - retrograde transport, endosome to Golgi (biological process)
GO:0005794 - Golgi apparatus (cellular component)
GO:0005829 - cytosol (cellular component)
GO:0003924 - GTPase activity (molecular function)
GO:0005525 - GTP binding (molecular function)
InterPro domainsIPR001806 - Small GTPase
IPR005225 - Small GTP-binding protein domain
IPR027417 - P-loop containing nucleoside triphosphate hydrolase


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
XP_004143465.1 ras-related protein RABH1e [Cucumis sativus]1.1e-10799.03Show/hide
Query:  MATVSPLAKYKLVFLGDQSVGKTSIITRFMYDKFDTTYQATIGIDFLSKTMYLEDRTIRLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSSVAVVVYDVSNRQSFLNT
        MATVSPLAKYKLVFLGDQSVGKTSIITRFMYDKFDTTYQATIGIDFLSKTMYLEDRTIRLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSSVAVVVYDVSNRQSFLNT
Subjt:  MATVSPLAKYKLVFLGDQSVGKTSIITRFMYDKFDTTYQATIGIDFLSKTMYLEDRTIRLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSSVAVVVYDVSNRQSFLNT

Query:  NKWIEEVRTERGSDVIIVLVGNKTDLVEKRQVSIEEGDAKSREFGVMFIETSAKAGFNIKPLFRKIAAALPGMETLSSTRQEDMVDVNLKPAVNSSQAEQ
         KWIEEVRTERGSDVIIVLVGNKTDLVEKRQVSIEEGDAKSREFGVMFIETSAKAGFNIKPLFRKIAAALPGMETLSSTRQEDMVDVNLKPAVNSSQ+EQ
Subjt:  NKWIEEVRTERGSDVIIVLVGNKTDLVEKRQVSIEEGDAKSREFGVMFIETSAKAGFNIKPLFRKIAAALPGMETLSSTRQEDMVDVNLKPAVNSSQAEQ

Query:  QGGGCAC
        QGGGCAC
Subjt:  QGGGCAC

XP_022132839.1 ras-related protein RABH1e [Momordica charantia]1.7e-10899.52Show/hide
Query:  MATVSPLAKYKLVFLGDQSVGKTSIITRFMYDKFDTTYQATIGIDFLSKTMYLEDRTIRLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSSVAVVVYDVSNRQSFLNT
        MATVSPLAKYKLVFLGDQSVGKTSIITRFMYDKFDTTYQATIGIDFLSKTMYLEDRTIRLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSSVAVVVYDVSNRQSFLNT
Subjt:  MATVSPLAKYKLVFLGDQSVGKTSIITRFMYDKFDTTYQATIGIDFLSKTMYLEDRTIRLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSSVAVVVYDVSNRQSFLNT

Query:  NKWIEEVRTERGSDVIIVLVGNKTDLVEKRQVSIEEGDAKSREFGVMFIETSAKAGFNIKPLFRKIAAALPGMETLSSTRQEDMVDVNLKPAVNSSQAEQ
        NKWIEEVRTERGSDV+IVLVGNKTDLVEKRQVSIEEGDAKSREFGVMFIETSAKAGFNIKPLFRKIAAALPGMETLSSTRQEDMVDVNLKPAVNSSQAEQ
Subjt:  NKWIEEVRTERGSDVIIVLVGNKTDLVEKRQVSIEEGDAKSREFGVMFIETSAKAGFNIKPLFRKIAAALPGMETLSSTRQEDMVDVNLKPAVNSSQAEQ

Query:  QGGGCAC
        QGGGCAC
Subjt:  QGGGCAC

XP_022950086.1 ras-related protein RABH1e [Cucurbita moschata]1.4e-10799.03Show/hide
Query:  MATVSPLAKYKLVFLGDQSVGKTSIITRFMYDKFDTTYQATIGIDFLSKTMYLEDRTIRLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSSVAVVVYDVSNRQSFLNT
        MATVSPLAKYKLVFLGDQSVGKTSIITRFMYDKFDTTYQATIGIDFLSKTMYLEDRTIRLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSSVAVVVYDVSNRQSFLNT
Subjt:  MATVSPLAKYKLVFLGDQSVGKTSIITRFMYDKFDTTYQATIGIDFLSKTMYLEDRTIRLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSSVAVVVYDVSNRQSFLNT

Query:  NKWIEEVRTERGSDVIIVLVGNKTDLVEKRQVSIEEGDAKSREFGVMFIETSAKAGFNIKPLFRKIAAALPGMETLSSTRQEDMVDVNLKPAVNSSQAEQ
         KWIEEVRTERGSDVIIVLVGNKTDLVEKRQVSIEEGDAKSREFGVMFIETSAKAGFNIKPLFRKIAAALPGMETLSSTRQEDMVDVNLKPAVNSSQ EQ
Subjt:  NKWIEEVRTERGSDVIIVLVGNKTDLVEKRQVSIEEGDAKSREFGVMFIETSAKAGFNIKPLFRKIAAALPGMETLSSTRQEDMVDVNLKPAVNSSQAEQ

Query:  QGGGCAC
        QGGGCAC
Subjt:  QGGGCAC

XP_022962792.1 ras-related protein RABH1e-like [Cucurbita moschata]5.4e-10798.55Show/hide
Query:  MATVSPLAKYKLVFLGDQSVGKTSIITRFMYDKFDTTYQATIGIDFLSKTMYLEDRTIRLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSSVAVVVYDVSNRQSFLNT
        MATVSPLAKYKLVFLGDQSVGKTSIITRFMYDKFDTTYQATIGIDFLSKTMYLEDRTIRLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSSVAVVVYDVSNRQSFLNT
Subjt:  MATVSPLAKYKLVFLGDQSVGKTSIITRFMYDKFDTTYQATIGIDFLSKTMYLEDRTIRLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSSVAVVVYDVSNRQSFLNT

Query:  NKWIEEVRTERGSDVIIVLVGNKTDLVEKRQVSIEEGDAKSREFGVMFIETSAKAGFNIKPLFRKIAAALPGMETLSSTRQEDMVDVNLKPAVNSSQAEQ
         KWIEEVRTERGSDVIIVLVGNKTDLVEKRQVSIEEGDAKSREFGVMFIETSAKAGFNIKPLFRKIAAALPGMETLSSTRQEDMVDVNLKPAVNSS  EQ
Subjt:  NKWIEEVRTERGSDVIIVLVGNKTDLVEKRQVSIEEGDAKSREFGVMFIETSAKAGFNIKPLFRKIAAALPGMETLSSTRQEDMVDVNLKPAVNSSQAEQ

Query:  QGGGCAC
        QGGGCAC
Subjt:  QGGGCAC

XP_023003400.1 ras-related protein RABH1e [Cucurbita maxima]1.2e-10698.07Show/hide
Query:  MATVSPLAKYKLVFLGDQSVGKTSIITRFMYDKFDTTYQATIGIDFLSKTMYLEDRTIRLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSSVAVVVYDVSNRQSFLNT
        MATVSPLAKYKLVFLGDQSVGKTSIITRFMYDKFDTTYQATIGIDFLSKTMYLEDRTIRLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSSVAVVVYDVSNRQSFLNT
Subjt:  MATVSPLAKYKLVFLGDQSVGKTSIITRFMYDKFDTTYQATIGIDFLSKTMYLEDRTIRLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSSVAVVVYDVSNRQSFLNT

Query:  NKWIEEVRTERGSDVIIVLVGNKTDLVEKRQVSIEEGDAKSREFGVMFIETSAKAGFNIKPLFRKIAAALPGMETLSSTRQEDMVDVNLKPAVNSSQAEQ
         KWIEEVRTERGSDVIIVLVGNKTDLV+KRQVSIEEGDAKSREFGVMFIETSAKAGFNIKPLFRKIAAALPGMETLSSTRQEDMVDVNLKPAVNSS  EQ
Subjt:  NKWIEEVRTERGSDVIIVLVGNKTDLVEKRQVSIEEGDAKSREFGVMFIETSAKAGFNIKPLFRKIAAALPGMETLSSTRQEDMVDVNLKPAVNSSQAEQ

Query:  QGGGCAC
        QGGGCAC
Subjt:  QGGGCAC

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0KGR9 Uncharacterized protein5.2e-10899.03Show/hide
Query:  MATVSPLAKYKLVFLGDQSVGKTSIITRFMYDKFDTTYQATIGIDFLSKTMYLEDRTIRLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSSVAVVVYDVSNRQSFLNT
        MATVSPLAKYKLVFLGDQSVGKTSIITRFMYDKFDTTYQATIGIDFLSKTMYLEDRTIRLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSSVAVVVYDVSNRQSFLNT
Subjt:  MATVSPLAKYKLVFLGDQSVGKTSIITRFMYDKFDTTYQATIGIDFLSKTMYLEDRTIRLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSSVAVVVYDVSNRQSFLNT

Query:  NKWIEEVRTERGSDVIIVLVGNKTDLVEKRQVSIEEGDAKSREFGVMFIETSAKAGFNIKPLFRKIAAALPGMETLSSTRQEDMVDVNLKPAVNSSQAEQ
         KWIEEVRTERGSDVIIVLVGNKTDLVEKRQVSIEEGDAKSREFGVMFIETSAKAGFNIKPLFRKIAAALPGMETLSSTRQEDMVDVNLKPAVNSSQ+EQ
Subjt:  NKWIEEVRTERGSDVIIVLVGNKTDLVEKRQVSIEEGDAKSREFGVMFIETSAKAGFNIKPLFRKIAAALPGMETLSSTRQEDMVDVNLKPAVNSSQAEQ

Query:  QGGGCAC
        QGGGCAC
Subjt:  QGGGCAC

A0A1S3B1I2 ras-related protein RABH1e5.2e-10899.03Show/hide
Query:  MATVSPLAKYKLVFLGDQSVGKTSIITRFMYDKFDTTYQATIGIDFLSKTMYLEDRTIRLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSSVAVVVYDVSNRQSFLNT
        MATVSPLAKYKLVFLGDQSVGKTSIITRFMYDKFDTTYQATIGIDFLSKTMYLEDRTIRLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSSVAVVVYDVSNRQSFLNT
Subjt:  MATVSPLAKYKLVFLGDQSVGKTSIITRFMYDKFDTTYQATIGIDFLSKTMYLEDRTIRLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSSVAVVVYDVSNRQSFLNT

Query:  NKWIEEVRTERGSDVIIVLVGNKTDLVEKRQVSIEEGDAKSREFGVMFIETSAKAGFNIKPLFRKIAAALPGMETLSSTRQEDMVDVNLKPAVNSSQAEQ
         KWIEEVRTERGSDVIIVLVGNKTDLVEKRQVSIEEGDAKSREFGVMFIETSAKAGFNIKPLFRKIAAALPGMETLSSTRQEDMVDVNLKPAVNSSQ+EQ
Subjt:  NKWIEEVRTERGSDVIIVLVGNKTDLVEKRQVSIEEGDAKSREFGVMFIETSAKAGFNIKPLFRKIAAALPGMETLSSTRQEDMVDVNLKPAVNSSQAEQ

Query:  QGGGCAC
        QGGGCAC
Subjt:  QGGGCAC

A0A6J1BU83 ras-related protein RABH1e8.1e-10999.52Show/hide
Query:  MATVSPLAKYKLVFLGDQSVGKTSIITRFMYDKFDTTYQATIGIDFLSKTMYLEDRTIRLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSSVAVVVYDVSNRQSFLNT
        MATVSPLAKYKLVFLGDQSVGKTSIITRFMYDKFDTTYQATIGIDFLSKTMYLEDRTIRLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSSVAVVVYDVSNRQSFLNT
Subjt:  MATVSPLAKYKLVFLGDQSVGKTSIITRFMYDKFDTTYQATIGIDFLSKTMYLEDRTIRLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSSVAVVVYDVSNRQSFLNT

Query:  NKWIEEVRTERGSDVIIVLVGNKTDLVEKRQVSIEEGDAKSREFGVMFIETSAKAGFNIKPLFRKIAAALPGMETLSSTRQEDMVDVNLKPAVNSSQAEQ
        NKWIEEVRTERGSDV+IVLVGNKTDLVEKRQVSIEEGDAKSREFGVMFIETSAKAGFNIKPLFRKIAAALPGMETLSSTRQEDMVDVNLKPAVNSSQAEQ
Subjt:  NKWIEEVRTERGSDVIIVLVGNKTDLVEKRQVSIEEGDAKSREFGVMFIETSAKAGFNIKPLFRKIAAALPGMETLSSTRQEDMVDVNLKPAVNSSQAEQ

Query:  QGGGCAC
        QGGGCAC
Subjt:  QGGGCAC

A0A6J1GDU2 ras-related protein RABH1e6.8e-10899.03Show/hide
Query:  MATVSPLAKYKLVFLGDQSVGKTSIITRFMYDKFDTTYQATIGIDFLSKTMYLEDRTIRLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSSVAVVVYDVSNRQSFLNT
        MATVSPLAKYKLVFLGDQSVGKTSIITRFMYDKFDTTYQATIGIDFLSKTMYLEDRTIRLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSSVAVVVYDVSNRQSFLNT
Subjt:  MATVSPLAKYKLVFLGDQSVGKTSIITRFMYDKFDTTYQATIGIDFLSKTMYLEDRTIRLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSSVAVVVYDVSNRQSFLNT

Query:  NKWIEEVRTERGSDVIIVLVGNKTDLVEKRQVSIEEGDAKSREFGVMFIETSAKAGFNIKPLFRKIAAALPGMETLSSTRQEDMVDVNLKPAVNSSQAEQ
         KWIEEVRTERGSDVIIVLVGNKTDLVEKRQVSIEEGDAKSREFGVMFIETSAKAGFNIKPLFRKIAAALPGMETLSSTRQEDMVDVNLKPAVNSSQ EQ
Subjt:  NKWIEEVRTERGSDVIIVLVGNKTDLVEKRQVSIEEGDAKSREFGVMFIETSAKAGFNIKPLFRKIAAALPGMETLSSTRQEDMVDVNLKPAVNSSQAEQ

Query:  QGGGCAC
        QGGGCAC
Subjt:  QGGGCAC

A0A6J1IN20 ras-related protein RABH1e-like2.6e-10798.55Show/hide
Query:  MATVSPLAKYKLVFLGDQSVGKTSIITRFMYDKFDTTYQATIGIDFLSKTMYLEDRTIRLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSSVAVVVYDVSNRQSFLNT
        MATVSPLAKYKLVFLGDQSVGKTSIITRFMYDKFDTTYQATIGIDFLSKTMYLEDRTIRLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSSVAVVVYDVSNRQSFLNT
Subjt:  MATVSPLAKYKLVFLGDQSVGKTSIITRFMYDKFDTTYQATIGIDFLSKTMYLEDRTIRLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSSVAVVVYDVSNRQSFLNT

Query:  NKWIEEVRTERGSDVIIVLVGNKTDLVEKRQVSIEEGDAKSREFGVMFIETSAKAGFNIKPLFRKIAAALPGMETLSSTRQEDMVDVNLKPAVNSSQAEQ
         KWIEEVRTERGSDVIIVLVGNKTDLVEKRQVSIEEGDAKSREFGVMFIETSAKAGFNIKPLFRKIAAALPGMETLSSTRQEDMVDVNLKPAVNSS  EQ
Subjt:  NKWIEEVRTERGSDVIIVLVGNKTDLVEKRQVSIEEGDAKSREFGVMFIETSAKAGFNIKPLFRKIAAALPGMETLSSTRQEDMVDVNLKPAVNSSQAEQ

Query:  QGGGCAC
        QGGGCAC
Subjt:  QGGGCAC

SwissProt top hitse value%identityAlignment
O80501 Ras-related protein RABH1b6.8e-9787.02Show/hide
Query:  MATVSPLAKYKLVFLGDQSVGKTSIITRFMYDKFDTTYQATIGIDFLSKTMYLEDRTIRLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSSVAVVVYDVSNRQSFLNT
        MA VS LAKYKLVFLGDQSVGKTSIITRFMYDKFD TYQATIGIDFLSKTMYLEDRT+RLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSSVAV+VYDV++RQSFLNT
Subjt:  MATVSPLAKYKLVFLGDQSVGKTSIITRFMYDKFDTTYQATIGIDFLSKTMYLEDRTIRLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSSVAVVVYDVSNRQSFLNT

Query:  NKWIEEVRTERGSDVIIVLVGNKTDLVEKRQVSIEEGDAKSREFGVMFIETSAKAGFNIKPLFRKIAAALPGMETLSSTRQEDMVDVNLKPA-VNSSQAE
         KWI+EVRTERGSDVI+VLVGNKTDLV+KRQVSIEE +AK+RE  VMFIETSAKAGFNIK LFRKIAAALPGMETLSST+QEDMVDVNLK +  N+S A+
Subjt:  NKWIEEVRTERGSDVIIVLVGNKTDLVEKRQVSIEEGDAKSREFGVMFIETSAKAGFNIKPLFRKIAAALPGMETLSSTRQEDMVDVNLKPA-VNSSQAE

Query:  QQGGGCAC
        QQ GGC+C
Subjt:  QQGGGCAC

Q9LFT9 Ras-related protein RABH1e4.9e-10390.82Show/hide
Query:  MATVSPLAKYKLVFLGDQSVGKTSIITRFMYDKFDTTYQATIGIDFLSKTMYLEDRTIRLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSSVAVVVYDVSNRQSFLNT
        MA+VSPLAKYKLVFLGDQSVGKTSIITRFMYDKFDTTYQATIGIDFLSKTMYLEDRT+RLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSSVAV+VYDV+NRQSFLNT
Subjt:  MATVSPLAKYKLVFLGDQSVGKTSIITRFMYDKFDTTYQATIGIDFLSKTMYLEDRTIRLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSSVAVVVYDVSNRQSFLNT

Query:  NKWIEEVRTERGSDVIIVLVGNKTDLVEKRQVSIEEGDAKSREFGVMFIETSAKAGFNIKPLFRKIAAALPGMETLSSTRQEDMVDVNLKPAVNSSQAEQ
        +KWIE+VRTERGSDVIIVLVGNKTDLV+KRQVSIEEGD K+R++GV+FIETSAKAGFNIKPLFRKIAAALPGMETLSST+QEDMVDVNLK + NS+Q EQ
Subjt:  NKWIEEVRTERGSDVIIVLVGNKTDLVEKRQVSIEEGDAKSREFGVMFIETSAKAGFNIKPLFRKIAAALPGMETLSSTRQEDMVDVNLKPAVNSSQAEQ

Query:  QGGGCAC
        Q GGCAC
Subjt:  QGGGCAC

Q9LV79 Ras-related protein RABH1a3.1e-8177.89Show/hide
Query:  YKLVFLGDQSVGKTSIITRFMYDKFDTTYQATIGIDFLSKTMYLEDRTIRLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSSVAVVVYDVSNRQSFLNTNKWIEEVRT
        YKLVFLGDQ VGKTSIIT FMY KFDT+YQATIGIDFLSKT   EDRT RLQLWDTAGQERF+SL+PSYIRDSSVAV+VYDV+++QSF+NT+KWIEEVR 
Subjt:  YKLVFLGDQSVGKTSIITRFMYDKFDTTYQATIGIDFLSKTMYLEDRTIRLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSSVAVVVYDVSNRQSFLNTNKWIEEVRT

Query:  ERGSDVIIVLVGNKTDLVEKRQVSIEEGDAKSREFGVMFIETSAKAGFNIKPLFRKIAAALPGMETLSSTRQEDMVDVNLKPAVNSSQA-EQQGGGCAC
        ERGS VIIVLVGNKTDLV KRQVSIEEG+ K+REFG +F+ETSAKAGFNIKPLF KI +AL G E +S T+QED+VDVNLKP + SSQA  QQ   C+C
Subjt:  ERGSDVIIVLVGNKTDLVEKRQVSIEEGDAKSREFGVMFIETSAKAGFNIKPLFRKIAAALPGMETLSSTRQEDMVDVNLKPAVNSSQA-EQQGGGCAC

Q9SID8 Ras-related protein RABH1d4.6e-10189.37Show/hide
Query:  MATVSPLAKYKLVFLGDQSVGKTSIITRFMYDKFDTTYQATIGIDFLSKTMYLEDRTIRLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSSVAVVVYDVSNRQSFLNT
        MA+VSPLAKYKLVFLGDQSVGKTSIITRFMYDKFDTTYQATIGIDFLSKTMYLEDRT+RLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSSVAVVVYDV+NR SFLNT
Subjt:  MATVSPLAKYKLVFLGDQSVGKTSIITRFMYDKFDTTYQATIGIDFLSKTMYLEDRTIRLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSSVAVVVYDVSNRQSFLNT

Query:  NKWIEEVRTERGSDVIIVLVGNKTDLVEKRQVSIEEGDAKSREFGVMFIETSAKAGFNIKPLFRKIAAALPGMETLSSTRQEDMVDVNLKPAVNSSQAEQ
        +KWIEEVR ER  DVIIVLVGNKTDLVEKRQVSIEEGD+K RE+GVMFIETSAKAGFNIKPLFRKIAAALPGME+ S+T+ EDMVDVNLKP  NSSQ +Q
Subjt:  NKWIEEVRTERGSDVIIVLVGNKTDLVEKRQVSIEEGDAKSREFGVMFIETSAKAGFNIKPLFRKIAAALPGMETLSSTRQEDMVDVNLKPAVNSSQAEQ

Query:  QGGGCAC
        QGG C+C
Subjt:  QGGGCAC

Q9SMR4 Ras-related protein RABH1c1.2e-9081.31Show/hide
Query:  MATVSPLAKYKLVFLGDQSVGKTSIITRFMYDKFDTTYQATIGIDFLSKTMYLEDRTIRLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSSVAVVVYDVSNRQSFLNT
        MA+VSPLAK+KLVFLGDQSVGKTSIITRFMYDKFDTTYQ TIGIDFLSKTMYLEDRT+RLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSSVA+VVYDVSNRQ+FLNT
Subjt:  MATVSPLAKYKLVFLGDQSVGKTSIITRFMYDKFDTTYQATIGIDFLSKTMYLEDRTIRLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSSVAVVVYDVSNRQSFLNT

Query:  NKWIEEVRTERG-SDVIIVLVGNKTDLVEKRQVSIEEGDAKSREFGVMFIETSAKAGFNIKPLFRKIAAALPGMETLS-STRQEDMVDVNLKPAVNSSQA
        +KWIE+V  ERG S+VIIVLVGNKTDLVEKRQVSI EG+ K +E+GVMFIETSAK  FNIK LFRKIAAALPG+++ S +T+ +DMVDVNLK   NSSQ 
Subjt:  NKWIEEVRTERG-SDVIIVLVGNKTDLVEKRQVSIEEGDAKSREFGVMFIETSAKAGFNIKPLFRKIAAALPGMETLS-STRQEDMVDVNLKPAVNSSQA

Query:  EQQ-----GGGCAC
        EQQ     GGGC+C
Subjt:  EQQ-----GGGCAC

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT2G22290.1 RAB GTPase homolog H1D3.2e-10289.37Show/hide
Query:  MATVSPLAKYKLVFLGDQSVGKTSIITRFMYDKFDTTYQATIGIDFLSKTMYLEDRTIRLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSSVAVVVYDVSNRQSFLNT
        MA+VSPLAKYKLVFLGDQSVGKTSIITRFMYDKFDTTYQATIGIDFLSKTMYLEDRT+RLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSSVAVVVYDV+NR SFLNT
Subjt:  MATVSPLAKYKLVFLGDQSVGKTSIITRFMYDKFDTTYQATIGIDFLSKTMYLEDRTIRLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSSVAVVVYDVSNRQSFLNT

Query:  NKWIEEVRTERGSDVIIVLVGNKTDLVEKRQVSIEEGDAKSREFGVMFIETSAKAGFNIKPLFRKIAAALPGMETLSSTRQEDMVDVNLKPAVNSSQAEQ
        +KWIEEVR ER  DVIIVLVGNKTDLVEKRQVSIEEGD+K RE+GVMFIETSAKAGFNIKPLFRKIAAALPGME+ S+T+ EDMVDVNLKP  NSSQ +Q
Subjt:  NKWIEEVRTERGSDVIIVLVGNKTDLVEKRQVSIEEGDAKSREFGVMFIETSAKAGFNIKPLFRKIAAALPGMETLSSTRQEDMVDVNLKPAVNSSQAEQ

Query:  QGGGCAC
        QGG C+C
Subjt:  QGGGCAC

AT2G44610.1 Ras-related small GTP-binding family protein4.8e-9887.02Show/hide
Query:  MATVSPLAKYKLVFLGDQSVGKTSIITRFMYDKFDTTYQATIGIDFLSKTMYLEDRTIRLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSSVAVVVYDVSNRQSFLNT
        MA VS LAKYKLVFLGDQSVGKTSIITRFMYDKFD TYQATIGIDFLSKTMYLEDRT+RLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSSVAV+VYDV++RQSFLNT
Subjt:  MATVSPLAKYKLVFLGDQSVGKTSIITRFMYDKFDTTYQATIGIDFLSKTMYLEDRTIRLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSSVAVVVYDVSNRQSFLNT

Query:  NKWIEEVRTERGSDVIIVLVGNKTDLVEKRQVSIEEGDAKSREFGVMFIETSAKAGFNIKPLFRKIAAALPGMETLSSTRQEDMVDVNLKPA-VNSSQAE
         KWI+EVRTERGSDVI+VLVGNKTDLV+KRQVSIEE +AK+RE  VMFIETSAKAGFNIK LFRKIAAALPGMETLSST+QEDMVDVNLK +  N+S A+
Subjt:  NKWIEEVRTERGSDVIIVLVGNKTDLVEKRQVSIEEGDAKSREFGVMFIETSAKAGFNIKPLFRKIAAALPGMETLSSTRQEDMVDVNLKPA-VNSSQAE

Query:  QQGGGCAC
        QQ GGC+C
Subjt:  QQGGGCAC

AT4G39890.1 RAB GTPase homolog H1C8.8e-9281.31Show/hide
Query:  MATVSPLAKYKLVFLGDQSVGKTSIITRFMYDKFDTTYQATIGIDFLSKTMYLEDRTIRLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSSVAVVVYDVSNRQSFLNT
        MA+VSPLAK+KLVFLGDQSVGKTSIITRFMYDKFDTTYQ TIGIDFLSKTMYLEDRT+RLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSSVA+VVYDVSNRQ+FLNT
Subjt:  MATVSPLAKYKLVFLGDQSVGKTSIITRFMYDKFDTTYQATIGIDFLSKTMYLEDRTIRLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSSVAVVVYDVSNRQSFLNT

Query:  NKWIEEVRTERG-SDVIIVLVGNKTDLVEKRQVSIEEGDAKSREFGVMFIETSAKAGFNIKPLFRKIAAALPGMETLS-STRQEDMVDVNLKPAVNSSQA
        +KWIE+V  ERG S+VIIVLVGNKTDLVEKRQVSI EG+ K +E+GVMFIETSAK  FNIK LFRKIAAALPG+++ S +T+ +DMVDVNLK   NSSQ 
Subjt:  NKWIEEVRTERG-SDVIIVLVGNKTDLVEKRQVSIEEGDAKSREFGVMFIETSAKAGFNIKPLFRKIAAALPGMETLS-STRQEDMVDVNLKPAVNSSQA

Query:  EQQ-----GGGCAC
        EQQ     GGGC+C
Subjt:  EQQ-----GGGCAC

AT5G10260.1 RAB GTPase homolog H1E3.5e-10490.82Show/hide
Query:  MATVSPLAKYKLVFLGDQSVGKTSIITRFMYDKFDTTYQATIGIDFLSKTMYLEDRTIRLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSSVAVVVYDVSNRQSFLNT
        MA+VSPLAKYKLVFLGDQSVGKTSIITRFMYDKFDTTYQATIGIDFLSKTMYLEDRT+RLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSSVAV+VYDV+NRQSFLNT
Subjt:  MATVSPLAKYKLVFLGDQSVGKTSIITRFMYDKFDTTYQATIGIDFLSKTMYLEDRTIRLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSSVAVVVYDVSNRQSFLNT

Query:  NKWIEEVRTERGSDVIIVLVGNKTDLVEKRQVSIEEGDAKSREFGVMFIETSAKAGFNIKPLFRKIAAALPGMETLSSTRQEDMVDVNLKPAVNSSQAEQ
        +KWIE+VRTERGSDVIIVLVGNKTDLV+KRQVSIEEGD K+R++GV+FIETSAKAGFNIKPLFRKIAAALPGMETLSST+QEDMVDVNLK + NS+Q EQ
Subjt:  NKWIEEVRTERGSDVIIVLVGNKTDLVEKRQVSIEEGDAKSREFGVMFIETSAKAGFNIKPLFRKIAAALPGMETLSSTRQEDMVDVNLKPAVNSSQAEQ

Query:  QGGGCAC
        Q GGCAC
Subjt:  QGGGCAC

AT5G64990.1 RAB GTPase homolog H1A2.2e-8277.89Show/hide
Query:  YKLVFLGDQSVGKTSIITRFMYDKFDTTYQATIGIDFLSKTMYLEDRTIRLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSSVAVVVYDVSNRQSFLNTNKWIEEVRT
        YKLVFLGDQ VGKTSIIT FMY KFDT+YQATIGIDFLSKT   EDRT RLQLWDTAGQERF+SL+PSYIRDSSVAV+VYDV+++QSF+NT+KWIEEVR 
Subjt:  YKLVFLGDQSVGKTSIITRFMYDKFDTTYQATIGIDFLSKTMYLEDRTIRLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSSVAVVVYDVSNRQSFLNTNKWIEEVRT

Query:  ERGSDVIIVLVGNKTDLVEKRQVSIEEGDAKSREFGVMFIETSAKAGFNIKPLFRKIAAALPGMETLSSTRQEDMVDVNLKPAVNSSQA-EQQGGGCAC
        ERGS VIIVLVGNKTDLV KRQVSIEEG+ K+REFG +F+ETSAKAGFNIKPLF KI +AL G E +S T+QED+VDVNLKP + SSQA  QQ   C+C
Subjt:  ERGSDVIIVLVGNKTDLVEKRQVSIEEGDAKSREFGVMFIETSAKAGFNIKPLFRKIAAALPGMETLSSTRQEDMVDVNLKPAVNSSQA-EQQGGGCAC


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGCGACGGTTTCTCCTCTCGCCAAGTACAAGCTCGTCTTCCTCGGCGATCAATCGGTTGGCAAAACCAGCATTATCACCCGCTTCATGTACGACAAGTTTGATACCAC
CTATCAGGCTACAATTGGAATTGACTTCTTGTCCAAAACAATGTACCTTGAAGATCGAACAATTCGATTGCAGCTTTGGGATACTGCTGGACAAGAAAGATTTAGAAGTC
TCATTCCAAGTTACATAAGAGATTCTTCTGTCGCAGTAGTAGTCTATGATGTATCTAATAGACAATCATTCTTGAACACTAATAAGTGGATTGAGGAGGTACGAACGGAA
CGGGGCAGTGATGTGATAATTGTTCTTGTTGGGAACAAAACTGATCTTGTTGAGAAAAGGCAAGTTTCAATCGAAGAAGGTGATGCCAAATCTCGTGAGTTTGGAGTCAT
GTTTATCGAAACTAGTGCCAAAGCTGGATTCAACATCAAGCCTCTCTTTCGTAAGATTGCTGCAGCGCTGCCGGGGATGGAAACTCTGTCTTCTACAAGGCAGGAGGACA
TGGTTGACGTAAATTTGAAGCCTGCAGTGAATTCATCCCAGGCGGAACAGCAAGGAGGAGGTTGTGCATGC
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGGCGACGGTTTCTCCTCTCGCCAAGTACAAGCTCGTCTTCCTCGGCGATCAATCGGTTGGCAAAACCAGCATTATCACCCGCTTCATGTACGACAAGTTTGATACCAC
CTATCAGGCTACAATTGGAATTGACTTCTTGTCCAAAACAATGTACCTTGAAGATCGAACAATTCGATTGCAGCTTTGGGATACTGCTGGACAAGAAAGATTTAGAAGTC
TCATTCCAAGTTACATAAGAGATTCTTCTGTCGCAGTAGTAGTCTATGATGTATCTAATAGACAATCATTCTTGAACACTAATAAGTGGATTGAGGAGGTACGAACGGAA
CGGGGCAGTGATGTGATAATTGTTCTTGTTGGGAACAAAACTGATCTTGTTGAGAAAAGGCAAGTTTCAATCGAAGAAGGTGATGCCAAATCTCGTGAGTTTGGAGTCAT
GTTTATCGAAACTAGTGCCAAAGCTGGATTCAACATCAAGCCTCTCTTTCGTAAGATTGCTGCAGCGCTGCCGGGGATGGAAACTCTGTCTTCTACAAGGCAGGAGGACA
TGGTTGACGTAAATTTGAAGCCTGCAGTGAATTCATCCCAGGCGGAACAGCAAGGAGGAGGTTGTGCATGC
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MATVSPLAKYKLVFLGDQSVGKTSIITRFMYDKFDTTYQATIGIDFLSKTMYLEDRTIRLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSSVAVVVYDVSNRQSFLNTNKWIEEVRTE
RGSDVIIVLVGNKTDLVEKRQVSIEEGDAKSREFGVMFIETSAKAGFNIKPLFRKIAAALPGMETLSSTRQEDMVDVNLKPAVNSSQAEQQGGGCAC