; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

MS011883 (gene) of Bitter gourd (TR) v1 genome

Gene IDMS011883
OrganismMomordica charantia cv. TR (Bitter gourd (TR) v1)
Descriptiontranscription factor bHLH69-like
Genome locationscaffold1150:192275..194646
RNA-Seq ExpressionMS011883
SyntenyMS011883
Gene Ontology termsGO:0005634 - nucleus (cellular component)
GO:0046983 - protein dimerization activity (molecular function)
InterPro domainsIPR011598 - Myc-type, basic helix-loop-helix (bHLH) domain
IPR036638 - Helix-loop-helix DNA-binding domain superfamily


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG7036370.1 Transcription factor bHLH69 [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]2.4e-11879.29Show/hide
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XP_022155559.1 transcription factor bHLH69-like isoform X2 [Momordica charantia]1.1e-13994.27Show/hide
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XP_022995865.1 transcription factor bHLH69-like isoform X3 [Cucurbita maxima]1.1e-11577.78Show/hide
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XP_023533990.1 transcription factor bHLH69-like [Cucurbita pepo subsp. pepo]8.5e-11678.14Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A6J1DMR9 transcription factor bHLH69-like isoform X25.3e-14094.27Show/hide
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A0A6J1DNA1 transcription factor bHLH69-like isoform X15.3e-14094.27Show/hide
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A0A6J1ESR3 transcription factor bHLH69-like8.6e-11477.06Show/hide
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        MEGQNGCN SVQ+LS+  GANVNIVS+VPGDCTNHHHV  ADR++NQTNFP + EWTQ  K +PTFVEFIAETSNF RK STK+M+A VP S+I+ +DGV
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A0A6J1K067 transcription factor bHLH69-like isoform X35.4e-11677.78Show/hide
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        SEIHGE SYNHP GS +SKPTDSRK+   G LSKPR+ SSSRRGYSTDRQRRIRIAERLEALQ LLP +SKGNQAS LDDVIDH+K+LQLQIK       
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A0A6J1K988 transcription factor bHLH69-like isoform X15.4e-11677.78Show/hide
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        MEGQNGCN SVQ+LS+  GANVNIVS+VPGDCTNHHHV PADR++NQTNFP + EWTQ  KT+PTFVEFIAETSNF RK STK+M+A VP S+++ +DGV
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        SEIHGE SYNHP GS +SKPTDSRK+   G LSKPR+ SSSRRGYSTDRQRRIRIAERLEALQ LLP +SKGNQAS LDDVIDH+K+LQLQIK       
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               DLSQSK+GGESSSEPF FVEGYGHYMSHQEMQGEPLEEMVGKLLEVDP AAAQLLENKGLF+MPMDF EGLC
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
D0PX88 bHLH transcription factor RHL12.8e-1333.33Show/hide
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        G+ +  P  S      G   + +    +RRG +TD      R RR RIAER++ALQEL+P ++K ++AS+LD++ID+VK LQLQ+KV  ++     A + 
Subjt:  GSDSSKPTDSRKNKAPGILSKPRSNSSSRRGYSTD------RQRRIRIAERLEALQELLPQSSKGNQASVLDDVIDHVKHLQLQIKVGGLA----FALIY

Query:  TVMQDLSQSKLGGESSSEPFRFVEGYGHYMSHQEMQGEP--------LEEMVGKLLEVDPSAAAQLLENKGLFLMPMDFAEGL
         ++ D+S    GG    +      G G  +                  E  V KL+E D  +A Q L+ KGL LMP+  A  +
Subjt:  TVMQDLSQSKLGGESSSEPFRFVEGYGHYMSHQEMQGEP--------LEEMVGKLLEVDPSAAAQLLENKGLFLMPMDFAEGL

Q8S3D5 Transcription factor LRL21.6e-1632.35Show/hide
Query:  TEWTQNV--KTTPTFVEFIAETSNFSRKASTKEMLANVPFSTIEAVDGVSE--IHGEFSYNHPTGSDSSKPTDSRKNKAP---GILSKPRSNSS--SRRG
        T W  +V   T P   +    T      A ++  +  +P S     D +      G   ++ P GS     T S+   +    G  ++P++     +RRG
Subjt:  TEWTQNV--KTTPTFVEFIAETSNFSRKASTKEMLANVPFSTIEAVDGVSE--IHGEFSYNHPTGSDSSKPTDSRKNKAP---GILSKPRSNSS--SRRG

Query:  YSTD------RQRRIRIAERLEALQELLPQSSKGNQASVLDDVIDHVKHLQLQIKVGGLAFALIYTVMQDLSQSKLGG-ESSSEPFRFVEGYGHYMSHQE
         +TD      R RR RIAER+++LQEL+P  +K ++AS+LD++ID+VK LQLQ+KV              LS S+LGG  S+S       G  H  +   
Subjt:  YSTD------RQRRIRIAERLEALQELLPQSSKGNQASVLDDVIDHVKHLQLQIKVGGLAFALIYTVMQDLSQSKLGG-ESSSEPFRFVEGYGHYMSHQE

Query:  MQGEPLEEMVGKLLEVDPSAAAQLLENKGLFLMPMDFA
         + +  E  V KL+E D  +A Q L+ KGL LMP+  A
Subjt:  MQGEPLEEMVGKLLEVDPSAAAQLLENKGLFLMPMDFA

Q93Y00 Transcription factor bHLH79.1e-1235.29Show/hide
Query:  RSNSSSRRGYSTD------RQRRIRIAERLEALQELLPQSSKGNQASVLDDVIDHVKHLQLQIKVGGLAFALIYTVMQDLSQSKLGGESSSEPF------
        R    +RRG +TD      R RR RIAER+ +LQEL+P  +K ++A+++D+++D+VK L+LQ+KV              LS S+LGG  +  P       
Subjt:  RSNSSSRRGYSTD------RQRRIRIAERLEALQELLPQSSKGNQASVLDDVIDHVKHLQLQIKVGGLAFALIYTVMQDLSQSKLGGESSSEPF------

Query:  -RFVEGYGHYMSHQEMQGEPLEEMVGKLLEVDPSAAAQLLENKGLFLMPMDFA
           VE     +  ++   +  E  V KL+E +  AA QLL++K L +MP+  A
Subjt:  -RFVEGYGHYMSHQEMQGEPLEEMVGKLLEVDPSAAAQLLENKGLFLMPMDFA

Q9LSQ3 Transcription factor LRL36.7e-1535.23Show/hide
Query:  APGILSKPRSNSSSRRGYSTD------RQRRIRIAERLEALQELLPQSSKGNQASVLDDVIDHVKHLQLQIKVGGLAFALIYTVMQDLSQSKLGGESS--
        AP +  KPR    +RRG +TD      R RR RIAER+++LQEL+P ++K ++AS+LD++I++V+ LQLQ+KV              LS S+LGG  S  
Subjt:  APGILSKPRSNSSSRRGYSTD------RQRRIRIAERLEALQELLPQSSKGNQASVLDDVIDHVKHLQLQIKVGGLAFALIYTVMQDLSQSKLGGESS--

Query:  -----------------SEPFRFVEGYGHYMSHQEMQGEPLEEMVGKLLEVDPSAAAQLLENKGLFLMPMDFAEGL
                         + P   + G G+            E+ V KL+E D  +A Q L+ KGL LMP+  A  +
Subjt:  -----------------SEPFRFVEGYGHYMSHQEMQGEPLEEMVGKLLEVDPSAAAQLLENKGLFLMPMDFAEGL

Q9ZUG9 Transcription factor LRL15.2e-1536.26Show/hide
Query:  SKPTDSRKNKAPGILSKP---RSNSSSRRGYSTD------RQRRIRIAERLEALQELLPQSSKGNQASVLDDVIDHVKHLQLQIKVGGLAFALIYTVMQD
        ++P  S      G ++ P   R+   +RRG +TD      R RR RIAER++ALQEL+P  +K ++AS+LD++ID+VK LQLQ+KV              
Subjt:  SKPTDSRKNKAPGILSKP---RSNSSSRRGYSTD------RQRRIRIAERLEALQELLPQSSKGNQASVLDDVIDHVKHLQLQIKVGGLAFALIYTVMQD

Query:  LSQSKLGGESSSEPFRFVEGYGHYMSHQEMQG------------EPLEEMVGKLLEVDPSAAAQLLENKGLFLMPMDFAEGL
        LS S+LGG +S        G  H  +   M G               E  V KL+E D  +A Q L+ KGL LMP+  A  +
Subjt:  LSQSKLGGESSSEPFRFVEGYGHYMSHQEMQG------------EPLEEMVGKLLEVDPSAAAQLLENKGLFLMPMDFAEGL

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G03040.1 basic helix-loop-helix (bHLH) DNA-binding superfamily protein6.5e-1335.29Show/hide
Query:  RSNSSSRRGYSTD------RQRRIRIAERLEALQELLPQSSKGNQASVLDDVIDHVKHLQLQIKVGGLAFALIYTVMQDLSQSKLGGESSSEPF------
        R    +RRG +TD      R RR RIAER+ +LQEL+P  +K ++A+++D+++D+VK L+LQ+KV              LS S+LGG  +  P       
Subjt:  RSNSSSRRGYSTD------RQRRIRIAERLEALQELLPQSSKGNQASVLDDVIDHVKHLQLQIKVGGLAFALIYTVMQDLSQSKLGGESSSEPF------

Query:  -RFVEGYGHYMSHQEMQGEPLEEMVGKLLEVDPSAAAQLLENKGLFLMPMDFA
           VE     +  ++   +  E  V KL+E +  AA QLL++K L +MP+  A
Subjt:  -RFVEGYGHYMSHQEMQGEPLEEMVGKLLEVDPSAAAQLLENKGLFLMPMDFA

AT2G24260.1 LJRHL1-like 13.7e-1636.26Show/hide
Query:  SKPTDSRKNKAPGILSKP---RSNSSSRRGYSTD------RQRRIRIAERLEALQELLPQSSKGNQASVLDDVIDHVKHLQLQIKVGGLAFALIYTVMQD
        ++P  S      G ++ P   R+   +RRG +TD      R RR RIAER++ALQEL+P  +K ++AS+LD++ID+VK LQLQ+KV              
Subjt:  SKPTDSRKNKAPGILSKP---RSNSSSRRGYSTD------RQRRIRIAERLEALQELLPQSSKGNQASVLDDVIDHVKHLQLQIKVGGLAFALIYTVMQD

Query:  LSQSKLGGESSSEPFRFVEGYGHYMSHQEMQG------------EPLEEMVGKLLEVDPSAAAQLLENKGLFLMPMDFAEGL
        LS S+LGG +S        G  H  +   M G               E  V KL+E D  +A Q L+ KGL LMP+  A  +
Subjt:  LSQSKLGGESSSEPFRFVEGYGHYMSHQEMQG------------EPLEEMVGKLLEVDPSAAAQLLENKGLFLMPMDFAEGL

AT4G30980.1 LJRHL1-like 21.1e-1732.35Show/hide
Query:  TEWTQNV--KTTPTFVEFIAETSNFSRKASTKEMLANVPFSTIEAVDGVSE--IHGEFSYNHPTGSDSSKPTDSRKNKAP---GILSKPRSNSS--SRRG
        T W  +V   T P   +    T      A ++  +  +P S     D +      G   ++ P GS     T S+   +    G  ++P++     +RRG
Subjt:  TEWTQNV--KTTPTFVEFIAETSNFSRKASTKEMLANVPFSTIEAVDGVSE--IHGEFSYNHPTGSDSSKPTDSRKNKAP---GILSKPRSNSS--SRRG

Query:  YSTD------RQRRIRIAERLEALQELLPQSSKGNQASVLDDVIDHVKHLQLQIKVGGLAFALIYTVMQDLSQSKLGG-ESSSEPFRFVEGYGHYMSHQE
         +TD      R RR RIAER+++LQEL+P  +K ++AS+LD++ID+VK LQLQ+KV              LS S+LGG  S+S       G  H  +   
Subjt:  YSTD------RQRRIRIAERLEALQELLPQSSKGNQASVLDDVIDHVKHLQLQIKVGGLAFALIYTVMQDLSQSKLGG-ESSSEPFRFVEGYGHYMSHQE

Query:  MQGEPLEEMVGKLLEVDPSAAAQLLENKGLFLMPMDFA
         + +  E  V KL+E D  +A Q L+ KGL LMP+  A
Subjt:  MQGEPLEEMVGKLLEVDPSAAAQLLENKGLFLMPMDFA

AT5G58010.1 LJRHL1-like 34.8e-1635.23Show/hide
Query:  APGILSKPRSNSSSRRGYSTD------RQRRIRIAERLEALQELLPQSSKGNQASVLDDVIDHVKHLQLQIKVGGLAFALIYTVMQDLSQSKLGGESS--
        AP +  KPR    +RRG +TD      R RR RIAER+++LQEL+P ++K ++AS+LD++I++V+ LQLQ+KV              LS S+LGG  S  
Subjt:  APGILSKPRSNSSSRRGYSTD------RQRRIRIAERLEALQELLPQSSKGNQASVLDDVIDHVKHLQLQIKVGGLAFALIYTVMQDLSQSKLGGESS--

Query:  -----------------SEPFRFVEGYGHYMSHQEMQGEPLEEMVGKLLEVDPSAAAQLLENKGLFLMPMDFAEGL
                         + P   + G G+            E+ V KL+E D  +A Q L+ KGL LMP+  A  +
Subjt:  -----------------SEPFRFVEGYGHYMSHQEMQGEPLEEMVGKLLEVDPSAAAQLLENKGLFLMPMDFAEGL

AT5G64980.1 unknown protein3.1e-2341.26Show/hide
Query:  NSSSRRGYSTDRQRRIRIAERLEALQELLPQSSKG-NQASVLDDVIDHVKHLQLQIKVGGLAFALIYTVMQDLSQSKLGGESSSEPFRFVEGYGHYMSHQ
        ++ S + Y+ +R+R+ RIA+ ++AL +LLP   +G N    L+ ++DHVK L LQ              M++LS+S+LGGE  S P  F+EGYGHY+ H+
Subjt:  NSSSRRGYSTDRQRRIRIAERLEALQELLPQSSKG-NQASVLDDVIDHVKHLQLQIKVGGLAFALIYTVMQDLSQSKLGGESSSEPFRFVEGYGHYMSHQ

Query:  EMQGEPLEEMVGKLLEVDPSAAAQLLENKGLFLMPMDFAEGLC
        +   + LEE++  LL  D  AAA LLE+KGL+L P+   +G C
Subjt:  EMQGEPLEEMVGKLLEVDPSAAAQLLENKGLFLMPMDFAEGLC


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGAAGGACAAAATGGCTGCAACAACTCTGTACAAATTCTCTCAGTGAAACTTGGTGCGAATGTCAACATTGTTTCCCGTGTACCAGGAGATTGTACAAACCATCACCA
TGTTTTACCTGCTGATAGGAGTGTAAACCAAACCAACTTCCCCCTCTTAACTGAGTGGACACAAAATGTGAAAACAACTCCCACCTTTGTTGAGTTTATTGCTGAAACTT
CAAACTTTTCTAGAAAGGCGTCTACCAAAGAGATGTTAGCAAACGTTCCTTTCAGTACTATTGAAGCTGTTGATGGAGTCTCTGAGATTCATGGAGAATTTTCATACAAT
CATCCCACAGGTTCAGACAGTTCGAAACCTACCGATTCACGCAAGAACAAGGCACCAGGTATACTATCCAAACCACGTTCCAATTCATCAAGTCGAAGAGGCTATTCAAC
TGATCGCCAACGCAGGATAAGGATAGCTGAAAGACTTGAAGCATTGCAGGAACTTCTTCCTCAGTCTTCAAAGGGAAATCAAGCATCTGTTTTGGATGATGTTATTGACC
ACGTAAAGCACTTACAGCTTCAAATAAAGGTAGGCGGCCTGGCTTTTGCTCTCATCTATACGGTCATGCAGGACTTGAGTCAGAGCAAACTAGGAGGAGAATCATCTTCT
GAGCCTTTTAGATTCGTTGAGGGATATGGTCACTACATGAGCCATCAAGAGATGCAGGGCGAACCACTTGAGGAGATGGTGGGAAAACTGCTGGAAGTTGACCCGTCAGC
TGCAGCTCAGCTACTGGAGAACAAGGGCCTGTTTTTGATGCCCATGGATTTTGCTGAAGGATTATGC
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGGAAGGACAAAATGGCTGCAACAACTCTGTACAAATTCTCTCAGTGAAACTTGGTGCGAATGTCAACATTGTTTCCCGTGTACCAGGAGATTGTACAAACCATCACCA
TGTTTTACCTGCTGATAGGAGTGTAAACCAAACCAACTTCCCCCTCTTAACTGAGTGGACACAAAATGTGAAAACAACTCCCACCTTTGTTGAGTTTATTGCTGAAACTT
CAAACTTTTCTAGAAAGGCGTCTACCAAAGAGATGTTAGCAAACGTTCCTTTCAGTACTATTGAAGCTGTTGATGGAGTCTCTGAGATTCATGGAGAATTTTCATACAAT
CATCCCACAGGTTCAGACAGTTCGAAACCTACCGATTCACGCAAGAACAAGGCACCAGGTATACTATCCAAACCACGTTCCAATTCATCAAGTCGAAGAGGCTATTCAAC
TGATCGCCAACGCAGGATAAGGATAGCTGAAAGACTTGAAGCATTGCAGGAACTTCTTCCTCAGTCTTCAAAGGGAAATCAAGCATCTGTTTTGGATGATGTTATTGACC
ACGTAAAGCACTTACAGCTTCAAATAAAGGTAGGCGGCCTGGCTTTTGCTCTCATCTATACGGTCATGCAGGACTTGAGTCAGAGCAAACTAGGAGGAGAATCATCTTCT
GAGCCTTTTAGATTCGTTGAGGGATATGGTCACTACATGAGCCATCAAGAGATGCAGGGCGAACCACTTGAGGAGATGGTGGGAAAACTGCTGGAAGTTGACCCGTCAGC
TGCAGCTCAGCTACTGGAGAACAAGGGCCTGTTTTTGATGCCCATGGATTTTGCTGAAGGATTATGC
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MEGQNGCNNSVQILSVKLGANVNIVSRVPGDCTNHHHVLPADRSVNQTNFPLLTEWTQNVKTTPTFVEFIAETSNFSRKASTKEMLANVPFSTIEAVDGVSEIHGEFSYN
HPTGSDSSKPTDSRKNKAPGILSKPRSNSSSRRGYSTDRQRRIRIAERLEALQELLPQSSKGNQASVLDDVIDHVKHLQLQIKVGGLAFALIYTVMQDLSQSKLGGESSS
EPFRFVEGYGHYMSHQEMQGEPLEEMVGKLLEVDPSAAAQLLENKGLFLMPMDFAEGLC