; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

MS011889 (gene) of Bitter gourd (TR) v1 genome

Gene IDMS011889
OrganismMomordica charantia cv. TR (Bitter gourd (TR) v1)
Descriptionfasciclin-like arabinogalactan protein 17
Genome locationscaffold1150:227487..227606
RNA-Seq ExpressionMS011889
SyntenyMS011889
Gene Ontology termsNA
InterPro domainsNA


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG2683160.1 hypothetical protein I3760_10G019700 [Carya illinoinensis]6.7e-0670Show/hide
Query:  AVSPEGVPKVDPRTHRLKKLTSPVSTRAPAILPIYNALAP
        AV PEG P+VDPRTHRLKK  +PV   AP +LPIY+ALAP
Subjt:  AVSPEGVPKVDPRTHRLKKLTSPVSTRAPAILPIYNALAP
KZV28410.1 fasciclin-like arabinogalactan protein 16-like [Dorcoceras hygrometricum]3.0e-0672.5Show/hide
Query:  AVSPEGVPKVDPRTHRLKKLTSPVSTRAPAILPIYNALAP
        AV PEG P+VDPRTHRLKK  SPV   AP +LPIY+ALAP
Subjt:  AVSPEGVPKVDPRTHRLKKLTSPVSTRAPAILPIYNALAP
XP_021657068.1 fasciclin-like arabinogalactan protein 17 isoform X1 [Hevea brasiliensis]6.7e-0670Show/hide
Query:  AVSPEGVPKVDPRTHRLKKLTSPVSTRAPAILPIYNALAP
        AV PEG P+VDPRTHRLKK  +PV   AP +LPIY+ALAP
Subjt:  AVSPEGVPKVDPRTHRLKKLTSPVSTRAPAILPIYNALAP
XP_022151429.1 fasciclin-like arabinogalactan protein 17 [Momordica charantia]3.0e-0672.5Show/hide
Query:  AVSPEGVPKVDPRTHRLKKLTSPVSTRAPAILPIYNALAP
        AV PEG P+VDPRTHRLKK   PVS  AP +LPIY+ALAP
Subjt:  AVSPEGVPKVDPRTHRLKKLTSPVSTRAPAILPIYNALAP
XP_023891774.1 fasciclin-like arabinogalactan protein 16 [Quercus suber]6.7e-0670Show/hide
Query:  AVSPEGVPKVDPRTHRLKKLTSPVSTRAPAILPIYNALAP
        AV PEG P+VDPRTHRLKK  +PV   AP +LPIY+ALAP
Subjt:  AVSPEGVPKVDPRTHRLKKLTSPVSTRAPAILPIYNALAP
TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A067KM42 Uncharacterized protein3.2e-0670Show/hide
Query:  AVSPEGVPKVDPRTHRLKKLTSPVSTRAPAILPIYNALAP
        AV PEG P+VDPRTHRLKK  +PV   AP +LPIY+ALAP
Subjt:  AVSPEGVPKVDPRTHRLKKLTSPVSTRAPAILPIYNALAP
A0A2Z7B354 Fasciclin-like arabinogalactan protein 16-like1.5e-0672.5Show/hide
Query:  AVSPEGVPKVDPRTHRLKKLTSPVSTRAPAILPIYNALAP
        AV PEG P+VDPRTHRLKK  SPV   AP +LPIY+ALAP
Subjt:  AVSPEGVPKVDPRTHRLKKLTSPVSTRAPAILPIYNALAP
A0A6A6KKX2 FAS1 domain-containing protein3.2e-0670Show/hide
Query:  AVSPEGVPKVDPRTHRLKKLTSPVSTRAPAILPIYNALAP
        AV PEG P+VDPRTHRLKK  +PV   AP +LPIY+ALAP
Subjt:  AVSPEGVPKVDPRTHRLKKLTSPVSTRAPAILPIYNALAP
A0A6J1DD23 fasciclin-like arabinogalactan protein 171.5e-0672.5Show/hide
Query:  AVSPEGVPKVDPRTHRLKKLTSPVSTRAPAILPIYNALAP
        AV PEG P+VDPRTHRLKK   PVS  AP +LPIY+ALAP
Subjt:  AVSPEGVPKVDPRTHRLKKLTSPVSTRAPAILPIYNALAP
A0A7J7GB95 Uncharacterized protein3.2e-0667.5Show/hide
Query:  AVSPEGVPKVDPRTHRLKKLTSPVSTRAPAILPIYNALAP
        A+ PEG P+VDPRTHRLKK  SPV   AP +LPIY+A+AP
Subjt:  AVSPEGVPKVDPRTHRLKKLTSPVSTRAPAILPIYNALAP
SwissProt top hitse value%identityAlignment
Q66GR0 Fasciclin-like arabinogalactan protein 175.3e-0660Show/hide
Query:  AVSPEGVPKVDPRTHRLKKLTSPVSTRAPAILPIYNALAP
        AV PEG P+VDPRT+RLKK  +PV   +P  LPI +A+AP
Subjt:  AVSPEGVPKVDPRTHRLKKLTSPVSTRAPAILPIYNALAP
Q8RWC5 Fasciclin-like arabinogalactan protein 163.7e-0762.5Show/hide
Query:  AVSPEGVPKVDPRTHRLKKLTSPVSTRAPAILPIYNALAP
        AV PEG P+VDPRTHRLKK +  V   AP +LPIY+A++P
Subjt:  AVSPEGVPKVDPRTHRLKKLTSPVSTRAPAILPIYNALAP
Q93W32 Fasciclin-like arabinogalactan protein 187.7e-0557.14Show/hide
Query:  AVSPEGVPKVDPRTHRLKKLTSPVSTRA--PAILPIYNALAP
        AV PEG P++DPRT+RLKK  + VS  A  P +LPI +A+AP
Subjt:  AVSPEGVPKVDPRTHRLKKLTSPVSTRA--PAILPIYNALAP
Q9FT45 Fasciclin-like arabinogalactan protein 155.7e-0860Show/hide
Query:  AVSPEGVPKVDPRTHRLKKLTSPVSTRAPAILPIYNALAP
        AV PEG P+VDPRTHRLKK  +P+   AP +LP+Y+A++P
Subjt:  AVSPEGVPKVDPRTHRLKKLTSPVSTRAPAILPIYNALAP
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT2G35860.1 FASCICLIN-like arabinogalactan protein 16 precursor2.6e-0862.5Show/hide
Query:  AVSPEGVPKVDPRTHRLKKLTSPVSTRAPAILPIYNALAP
        AV PEG P+VDPRTHRLKK +  V   AP +LPIY+A++P
Subjt:  AVSPEGVPKVDPRTHRLKKLTSPVSTRAPAILPIYNALAP
AT3G11700.1 FASCICLIN-like arabinogalactan protein 18 precursor5.5e-0657.14Show/hide
Query:  AVSPEGVPKVDPRTHRLKKLTSPVSTRA--PAILPIYNALAP
        AV PEG P++DPRT+RLKK  + VS  A  P +LPI +A+AP
Subjt:  AVSPEGVPKVDPRTHRLKKLTSPVSTRA--PAILPIYNALAP
AT3G52370.1 FASCICLIN-like arabinogalactan protein 15 precursor4.0e-0960Show/hide
Query:  AVSPEGVPKVDPRTHRLKKLTSPVSTRAPAILPIYNALAP
        AV PEG P+VDPRTHRLKK  +P+   AP +LP+Y+A++P
Subjt:  AVSPEGVPKVDPRTHRLKKLTSPVSTRAPAILPIYNALAP
AT5G06390.1 FASCICLIN-like arabinogalactan protein 17 precursor3.8e-0760Show/hide
Query:  AVSPEGVPKVDPRTHRLKKLTSPVSTRAPAILPIYNALAP
        AV PEG P+VDPRT+RLKK  +PV   +P  LPI +A+AP
Subjt:  AVSPEGVPKVDPRTHRLKKLTSPVSTRAPAILPIYNALAP

Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
GCTGTTTCGCCGGAAGGTGTGCCGAAAGTCGACCCACGAACCCACCGATTGAAGAAGTTGACCTCACCTGTATCCACACGAGCCCCAGCTATTTTGCCAATCTACAATGC
CTTAGCCCCC
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
GCTGTTTCGCCGGAAGGTGTGCCGAAAGTCGACCCACGAACCCACCGATTGAAGAAGTTGACCTCACCTGTATCCACACGAGCCCCAGCTATTTTGCCAATCTACAATGC
CTTAGCCCCC
Protein sequenceShow/hide protein sequence
AVSPEGVPKVDPRTHRLKKLTSPVSTRAPAILPIYNALAP