; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

MS011990 (gene) of Bitter gourd (TR) v1 genome

Gene IDMS011990
OrganismMomordica charantia cv. TR (Bitter gourd (TR) v1)
DescriptionAB hydrolase-1 domain-containing protein
Genome locationscaffold123_2:457381..461198
RNA-Seq ExpressionMS011990
SyntenyMS011990
Gene Ontology termsGO:0009694 - jasmonic acid metabolic process (biological process)
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InterPro domainsIPR000073 - Alpha/beta hydrolase fold-1
IPR029058 - Alpha/Beta hydrolase fold


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAA0039238.1 putative methylesterase 12 [Cucumis melo var. makuwa]1.9e-18494.17Show/hide
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XP_008459661.1 PREDICTED: putative methylesterase 12, chloroplastic [Cucumis melo]7.8e-19493.15Show/hide
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XP_011656114.1 putative methylesterase 14, chloroplastic [Cucumis sativus]8.6e-19392.6Show/hide
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XP_022150007.1 putative methylesterase 12, chloroplastic [Momordica charantia]1.8e-20398.91Show/hide
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XP_038891147.1 putative methylesterase 14, chloroplastic [Benincasa hispida]8.6e-19393.19Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0KUW5 AB hydrolase-1 domain-containing protein4.2e-19392.6Show/hide
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A0A1S3CA81 putative methylesterase 12, chloroplastic3.8e-19493.15Show/hide
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A0A5A7T8M1 Putative methylesterase 129.3e-18594.17Show/hide
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A0A6J1D9J3 putative methylesterase 12, chloroplastic9.0e-20498.91Show/hide
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A0A6J1EBT1 putative methylesterase 12, chloroplastic isoform X23.9e-18388.49Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
F4I0K9 Putative methylesterase 15, chloroplastic2.1e-8048.06Show/hide
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        ST   V S+S+R+R+ +DP     Q   ++ K+ GA+                   K+FVL+HG GFGAWCWYKTI+LLE+ G    A+DL GSG+   D
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        TN + +LA+Y KPL  +   L   EKV+LVGH  GGAC+SYA+E +P+KI+KAI+I A M+A  Q   D+F  +  S    M+   LF+Y NGK  PPT 
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          F++  ++  +FNQSP KDVALA VSMRP P  P++EKL +S KNYG+ RRF+I+T+ DD+A+   +Q+ +++ NPPE+VF +K SDH PFFS+PQSL+
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        +IL+EI+Q+P
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F4IE65 Putative methylesterase 13, chloroplastic5.8e-8348.7Show/hide
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        S++  V S+SSR+R+ +DP     Q           +   E N      +E  + K+FVL+HG GFGAWCWYKTI+LLE+ G    A++L GSG+   DT
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Query:  NRVNTLAEYSKPLTDYLQDLPDDEKVVLVGHSSGGACLSYALEHFPNKISKAIYICATMVATGQRPFDVFMDELGSEETFMKDSKLFIYGNGKDKPPTGF
        N + +LA YSKPL  + + L   EKV+LVGH  GGAC+SYA+E FP KI+KA++I A M+A GQ   D+F  +LGS +  M+ +++F+Y NGK  PPT  
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Query:  MFEKEQMKGLYFNQSPTKDVALAMVSMRPFPLGPIMEKLSLSPKNYGTGRRFFIQTLDDHALSPDVQEKLVRENPPERVFKIKASDHCPFFSKPQSLHKI
         F++  ++   FNQSP KD+ALA VS+RP P  P+ EK+ +S KNYG+ RRF+I+T++D+A+   +QE +++ NPPE+VF++K SDH PFFS+PQSL+KI
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Query:  LLEIAQIP
        L+EI+QIP
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Q940H7 Putative methylesterase 12, chloroplastic4.5e-14469.38Show/hide
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        MGNR+IC  KKDV      +GS+S+R+ RSQRKL ++EE L ++ALS+A+ Q Q+SQRFDGS S+R+GSTSSRR  LSD FSN K               
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             Q PEFLE+LK KKFVL+HGEGFGAWCWYKTI+ LEE GLSP+ +DL GSG ++TD N V+TL EYSKPL + +Q+LP +EKV+LVGHS+GGAC+S
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        SLS + YG GRRF++QTLDD ALSPDVQEKLVREN PE VFKIK SDHCPFFSKPQSLHKILLEIAQIP
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Q9FVW3 Putative methylesterase 14, chloroplastic4.5e-14468.75Show/hide
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        MGN++I   KKD K+    GSKS+RM RSQRKL ++EE L ++ALS+A+ Q QLSQRFDGS S+RVGSTS+R+R LSDPFSNGK                
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            Q P+F E+L  KKFVL+HGEGFGAWCWYK ++ LEE GLSP+ +DL G G ++TDTN V+TL EYSKPL D L++LP++EKV+LVGHS+GGA +SY
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        ALE FP KISKAI++CATMV+ GQRPFDVF +ELGS E FMK+S+  IYGNGKDKPPTGFMFEK  MKGLYFNQSP KD+ALAM+SMRP PLGP+MEK+S
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        L+ + YG GRRF++QTLDD ALSPDVQEKLVREN PE VFKIK SDHCPFFSKPQSLHKILLEIAQIP
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Q9FW03 Putative methylesterase 11, chloroplastic1.1e-8145.85Show/hide
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        R   S+R  + E+  +Q+ AL+ A    +       S  FD S S+R   + S++  L    S+  +S  D  L           L     L++L+   F
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        VL+HG  FGAWCWYKTI+LLEE G    AIDL G GI+  + N + +L++Y KPLTD L+ LP  EKV+LVGH  GGAC+SYA+E FP+KISKA+++ A 
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Query:  MVATGQRPFDVFMDELGSEETFMKDSKLFIYGNGKDKPPTGFMFEKEQMKGLYFNQSPTKDVALAMVSMRPFPLGPIMEKLSLSPKNYGTGRRFFIQTLD
        M+  GQ   D+F  + G  +  M+ +++FIY NG + PPT    +K  +K L FNQSP+KDVALA VSMR  P  P++EKLSLS  NYG+ RR++I+TL+
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Query:  DHALSPDVQEKLVRENPPERVFKIKASDHCPFFSKPQSLHKILLEIAQI
        D+A+   +QE ++  +PPE+V+++K +DH PFFSKPQ+LHK+LLEIA+I
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G26360.1 methyl esterase 134.1e-8448.7Show/hide
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        S++  V S+SSR+R+ +DP     Q           +   E N      +E  + K+FVL+HG GFGAWCWYKTI+LLE+ G    A++L GSG+   DT
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Query:  NRVNTLAEYSKPLTDYLQDLPDDEKVVLVGHSSGGACLSYALEHFPNKISKAIYICATMVATGQRPFDVFMDELGSEETFMKDSKLFIYGNGKDKPPTGF
        N + +LA YSKPL  + + L   EKV+LVGH  GGAC+SYA+E FP KI+KA++I A M+A GQ   D+F  +LGS +  M+ +++F+Y NGK  PPT  
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         F++  ++   FNQSP KD+ALA VS+RP P  P+ EK+ +S KNYG+ RRF+I+T++D+A+   +QE +++ NPPE+VF++K SDH PFFS+PQSL+KI
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Query:  LLEIAQIP
        L+EI+QIP
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AT1G33990.1 methyl esterase 143.2e-14568.75Show/hide
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        MGN++I   KKD K+    GSKS+RM RSQRKL ++EE L ++ALS+A+ Q QLSQRFDGS S+RVGSTS+R+R LSDPFSNGK                
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Query:  EANLQAPEFLENLKAKKFVLIHGEGFGAWCWYKTISLLEEVGLSPIAIDLKGSGIDLTDTNRVNTLAEYSKPLTDYLQDLPDDEKVVLVGHSSGGACLSY
            Q P+F E+L  KKFVL+HGEGFGAWCWYK ++ LEE GLSP+ +DL G G ++TDTN V+TL EYSKPL D L++LP++EKV+LVGHS+GGA +SY
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Query:  ALEHFPNKISKAIYICATMVATGQRPFDVFMDELGSEETFMKDSKLFIYGNGKDKPPTGFMFEKEQMKGLYFNQSPTKDVALAMVSMRPFPLGPIMEKLS
        ALE FP KISKAI++CATMV+ GQRPFDVF +ELGS E FMK+S+  IYGNGKDKPPTGFMFEK  MKGLYFNQSP KD+ALAM+SMRP PLGP+MEK+S
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        L+ + YG GRRF++QTLDD ALSPDVQEKLVREN PE VFKIK SDHCPFFSKPQSLHKILLEIAQIP
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AT1G69240.1 methyl esterase 151.5e-8148.06Show/hide
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        ST   V S+S+R+R+ +DP     Q   ++ K+ GA+                   K+FVL+HG GFGAWCWYKTI+LLE+ G    A+DL GSG+   D
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Query:  TNRVNTLAEYSKPLTDYLQDLPDDEKVVLVGHSSGGACLSYALEHFPNKISKAIYICATMVATGQRPFDVFMDELGSEETFMKDSKLFIYGNGKDKPPTG
        TN + +LA+Y KPL  +   L   EKV+LVGH  GGAC+SYA+E +P+KI+KAI+I A M+A  Q   D+F  +  S    M+   LF+Y NGK  PPT 
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Query:  FMFEKEQMKGLYFNQSPTKDVALAMVSMRPFPLGPIMEKLSLSPKNYGTGRRFFIQTL-DDHALSPDVQEKLVRENPPERVFKIKASDHCPFFSKPQSLH
          F++  ++  +FNQSP KDVALA VSMRP P  P++EKL +S KNYG+ RRF+I+T+ DD+A+   +Q+ +++ NPPE+VF +K SDH PFFS+PQSL+
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Query:  KILLEIAQIP
        +IL+EI+Q+P
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AT3G29770.1 methyl esterase 117.8e-8345.85Show/hide
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        R   S+R  + E+  +Q+ AL+ A    +       S  FD S S+R   + S++  L    S+  +S  D  L           L     L++L+   F
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        VL+HG  FGAWCWYKTI+LLEE G    AIDL G GI+  + N + +L++Y KPLTD L+ LP  EKV+LVGH  GGAC+SYA+E FP+KISKA+++ A 
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        D+A+   +QE ++  +PPE+V+++K +DH PFFSKPQ+LHK+LLEIA+I
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AT4G09900.1 methyl esterase 123.2e-14569.38Show/hide
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        SLS + YG GRRF++QTLDD ALSPDVQEKLVREN PE VFKIK SDHCPFFSKPQSLHKILLEIAQIP
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
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GCAGAAGCAAGCTCTCTCGTTGGCTCTTCAACAGCTCCAATTATCACAGAGGTTCGATGGATCGACTTCCAAAAGAGTTGGTTCAACAAGCTCTCGGAGACGTAATCTCT
CCGATCCATTCTCTAATGGGAAACAGAGCAAGAGAGATTCAAAGTTGTATGGAGCAGATGTAACTTCAGGCGAAGCAAATCTGCAGGCACCAGAATTTCTGGAAAATCTG
AAAGCAAAAAAATTTGTTTTAATTCATGGTGAAGGGTTTGGAGCTTGGTGCTGGTACAAAACGATTTCTCTACTGGAGGAAGTCGGATTGTCTCCCATAGCCATCGATCT
CAAAGGTTCCGGTATTGATCTAACAGATACAAACAGGGTGAATACTCTTGCAGAGTATTCAAAGCCATTGACTGATTATCTACAAGATCTTCCTGATGATGAAAAGGTTG
TTCTAGTAGGTCACAGTAGCGGAGGCGCTTGTCTTTCTTATGCATTGGAGCATTTTCCGAATAAGATATCGAAAGCAATTTATATCTGTGCGACGATGGTGGCTACTGGC
CAGAGACCTTTTGATGTATTCATGGACGAGCTTGGATCTGAAGAGACTTTTATGAAAGACTCAAAACTTTTTATCTATGGGAATGGAAAAGATAAACCTCCTACAGGGTT
CATGTTCGAGAAAGAGCAAATGAAGGGGTTGTACTTCAATCAGTCTCCTACAAAGGATGTTGCATTGGCAATGGTTTCCATGAGACCTTTCCCACTTGGTCCAATCATGG
AGAAGCTTTCACTGTCCCCCAAAAACTACGGGACCGGGCGACGATTCTTCATTCAAACACTGGACGATCACGCTCTCTCGCCTGATGTTCAAGAAAAGCTGGTCAGGGAA
AACCCACCTGAAAGAGTTTTCAAGATCAAAGCCAGTGATCACTGCCCTTTTTTCTCTAAGCCTCAGTCACTTCACAAGATCCTCCTGGAAATTGCTCAAATACCA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
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Protein sequenceShow/hide protein sequence
MGNRLICKSKKDVKENGSKSRRMGRSQRKLQSEEEFLQKQALSLALQQLQLSQRFDGSTSKRVGSTSSRRRNLSDPFSNGKQSKRDSKLYGADVTSGEANLQAPEFLENL
KAKKFVLIHGEGFGAWCWYKTISLLEEVGLSPIAIDLKGSGIDLTDTNRVNTLAEYSKPLTDYLQDLPDDEKVVLVGHSSGGACLSYALEHFPNKISKAIYICATMVATG
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NPPERVFKIKASDHCPFFSKPQSLHKILLEIAQIP