; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

MS012287 (gene) of Bitter gourd (TR) v1 genome

Gene IDMS012287
OrganismMomordica charantia cv. TR (Bitter gourd (TR) v1)
DescriptionRas-related protein Rab-1A
Genome locationscaffold797:1215862..1217939
RNA-Seq ExpressionMS012287
SyntenyMS012287
Gene Ontology termsGO:0003924 - GTPase activity (molecular function)
GO:0005525 - GTP binding (molecular function)
InterPro domainsIPR001806 - Small GTPase
IPR005225 - Small GTP-binding protein domain
IPR027417 - P-loop containing nucleoside triphosphate hydrolase


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
XP_004148356.1 ras-related protein RABD2c [Cucumis sativus]6.5e-10598.98Show/hide
Query:  DYLFKLLLIGDSGVGKSCLLLRFADDSYLDSYISTIGVDFKIRTVEQDGKTIKLQIWDTAGQERFRTITSSYYRGAHGIIVVYDVTDQDSFNNVKQWLNE
        DYLFKLLLIGDSGVGKSCLLLRFADDSYLDSYISTIGVDFKIRTVEQDGKTIKLQIWDTAGQERFRTITSSYYRGAHGIIVVYDVTDQ+SFNNVKQWLNE
Subjt:  DYLFKLLLIGDSGVGKSCLLLRFADDSYLDSYISTIGVDFKIRTVEQDGKTIKLQIWDTAGQERFRTITSSYYRGAHGIIVVYDVTDQDSFNNVKQWLNE

Query:  IDRYASENVNKLLVGNKCDLTANKVVSYETAKAFADEIGIPFMETSAKSATNVEEAFMAMAAEIKNRMATQPMNNARPPTVNIRGQPVNQKAGCCSS
        IDRYASENVNKLLVGNKCDLTANKVVSYETAKAFADEIGIPFMETSAKSATNVEEAFMAMAAEIKNRMATQPMNNARPPTVNIRGQPVNQK+GCCSS
Subjt:  IDRYASENVNKLLVGNKCDLTANKVVSYETAKAFADEIGIPFMETSAKSATNVEEAFMAMAAEIKNRMATQPMNNARPPTVNIRGQPVNQKAGCCSS

XP_022159480.1 ras-related protein RABD2c [Momordica charantia]1.0e-105100Show/hide
Query:  DYLFKLLLIGDSGVGKSCLLLRFADDSYLDSYISTIGVDFKIRTVEQDGKTIKLQIWDTAGQERFRTITSSYYRGAHGIIVVYDVTDQDSFNNVKQWLNE
        DYLFKLLLIGDSGVGKSCLLLRFADDSYLDSYISTIGVDFKIRTVEQDGKTIKLQIWDTAGQERFRTITSSYYRGAHGIIVVYDVTDQDSFNNVKQWLNE
Subjt:  DYLFKLLLIGDSGVGKSCLLLRFADDSYLDSYISTIGVDFKIRTVEQDGKTIKLQIWDTAGQERFRTITSSYYRGAHGIIVVYDVTDQDSFNNVKQWLNE

Query:  IDRYASENVNKLLVGNKCDLTANKVVSYETAKAFADEIGIPFMETSAKSATNVEEAFMAMAAEIKNRMATQPMNNARPPTVNIRGQPVNQKAGCCSS
        IDRYASENVNKLLVGNKCDLTANKVVSYETAKAFADEIGIPFMETSAKSATNVEEAFMAMAAEIKNRMATQPMNNARPPTVNIRGQPVNQKAGCCSS
Subjt:  IDRYASENVNKLLVGNKCDLTANKVVSYETAKAFADEIGIPFMETSAKSATNVEEAFMAMAAEIKNRMATQPMNNARPPTVNIRGQPVNQKAGCCSS

XP_022931789.1 ras-related protein RABD2c [Cucurbita moschata]2.9e-10599.49Show/hide
Query:  DYLFKLLLIGDSGVGKSCLLLRFADDSYLDSYISTIGVDFKIRTVEQDGKTIKLQIWDTAGQERFRTITSSYYRGAHGIIVVYDVTDQDSFNNVKQWLNE
        DYLFKLLLIGDSGVGKSCLLLRFADDSYLDSYISTIGVDFKIRTVEQDGKTIKLQIWDTAGQERFRTITSSYYRGAHGIIVVYDVTDQDSFNNVKQWLNE
Subjt:  DYLFKLLLIGDSGVGKSCLLLRFADDSYLDSYISTIGVDFKIRTVEQDGKTIKLQIWDTAGQERFRTITSSYYRGAHGIIVVYDVTDQDSFNNVKQWLNE

Query:  IDRYASENVNKLLVGNKCDLTANKVVSYETAKAFADEIGIPFMETSAKSATNVEEAFMAMAAEIKNRMATQPMNNARPPTVNIRGQPVNQKAGCCSS
        IDRYASENVNKLLVGNKCDLTANKVVSYETAKAFADEIGIPFMETSAKSATNVEEAFMAMAAEIKNRMATQPMNNARPPTVNIRGQPVNQK GCCSS
Subjt:  IDRYASENVNKLLVGNKCDLTANKVVSYETAKAFADEIGIPFMETSAKSATNVEEAFMAMAAEIKNRMATQPMNNARPPTVNIRGQPVNQKAGCCSS

XP_022958560.1 ras-related protein RABD2c-like [Cucurbita moschata]2.9e-10599.49Show/hide
Query:  DYLFKLLLIGDSGVGKSCLLLRFADDSYLDSYISTIGVDFKIRTVEQDGKTIKLQIWDTAGQERFRTITSSYYRGAHGIIVVYDVTDQDSFNNVKQWLNE
        DYLFKLLLIGDSGVGKSCLLLRFADDSYLDSYISTIGVDFKIRTVEQDGKTIKLQIWDTAGQERFRTITSSYYRGAHGIIVVYDVTDQDSFNNVKQWLNE
Subjt:  DYLFKLLLIGDSGVGKSCLLLRFADDSYLDSYISTIGVDFKIRTVEQDGKTIKLQIWDTAGQERFRTITSSYYRGAHGIIVVYDVTDQDSFNNVKQWLNE

Query:  IDRYASENVNKLLVGNKCDLTANKVVSYETAKAFADEIGIPFMETSAKSATNVEEAFMAMAAEIKNRMATQPMNNARPPTVNIRGQPVNQKAGCCSS
        IDRYASENVNKLLVGNKCDLTANKVVSYETAKAFADEIGIPFMETSAKSATNVEEAFMAMAAEIKNRMATQPMNNARPPTVNIRGQPVNQK GCCSS
Subjt:  IDRYASENVNKLLVGNKCDLTANKVVSYETAKAFADEIGIPFMETSAKSATNVEEAFMAMAAEIKNRMATQPMNNARPPTVNIRGQPVNQKAGCCSS

XP_023554189.1 GTP-binding protein YPTM2 [Cucurbita pepo subsp. pepo]6.5e-10598.98Show/hide
Query:  DYLFKLLLIGDSGVGKSCLLLRFADDSYLDSYISTIGVDFKIRTVEQDGKTIKLQIWDTAGQERFRTITSSYYRGAHGIIVVYDVTDQDSFNNVKQWLNE
        DYLFKLLLIGDSGVGKSCLLLRFADDSYLDSYISTIGVDFKIRTVEQDGKTIKLQIWDTAGQERFRTITSSYYRGAHGIIVVYDVTDQDSFNNVKQWLNE
Subjt:  DYLFKLLLIGDSGVGKSCLLLRFADDSYLDSYISTIGVDFKIRTVEQDGKTIKLQIWDTAGQERFRTITSSYYRGAHGIIVVYDVTDQDSFNNVKQWLNE

Query:  IDRYASENVNKLLVGNKCDLTANKVVSYETAKAFADEIGIPFMETSAKSATNVEEAFMAMAAEIKNRMATQPMNNARPPTVNIRGQPVNQKAGCCSS
        IDRYASENVNKLLVGNKCDLTANKVVSYETAKAFADEIGIPFMETSAKSATNVE+AFMAMAAEIKNRMATQPMNNARPPTVNIRGQPVNQK GCCSS
Subjt:  IDRYASENVNKLLVGNKCDLTANKVVSYETAKAFADEIGIPFMETSAKSATNVEEAFMAMAAEIKNRMATQPMNNARPPTVNIRGQPVNQKAGCCSS

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A5A7TAX6 Ras-related protein RABD2c3.1e-10598.98Show/hide
Query:  DYLFKLLLIGDSGVGKSCLLLRFADDSYLDSYISTIGVDFKIRTVEQDGKTIKLQIWDTAGQERFRTITSSYYRGAHGIIVVYDVTDQDSFNNVKQWLNE
        DYLFKLLLIGDSGVGKSCLLLRFADDSYLDSYISTIGVDFKIRTVEQDGKTIKLQIWDTAGQERFRTITSSYYRGAHGIIVVYDVTDQ+SFNNVKQWLNE
Subjt:  DYLFKLLLIGDSGVGKSCLLLRFADDSYLDSYISTIGVDFKIRTVEQDGKTIKLQIWDTAGQERFRTITSSYYRGAHGIIVVYDVTDQDSFNNVKQWLNE

Query:  IDRYASENVNKLLVGNKCDLTANKVVSYETAKAFADEIGIPFMETSAKSATNVEEAFMAMAAEIKNRMATQPMNNARPPTVNIRGQPVNQKAGCCSS
        IDRYASENVNKLLVGNKCDLTANKVVSYETAKAFADEIGIPFMETSAKSATNVEEAFMAMAAEIKNRMATQPMNNARPPTVNIRGQPVNQK+GCCSS
Subjt:  IDRYASENVNKLLVGNKCDLTANKVVSYETAKAFADEIGIPFMETSAKSATNVEEAFMAMAAEIKNRMATQPMNNARPPTVNIRGQPVNQKAGCCSS

A0A6J1DYV6 ras-related protein RABD2c4.8e-106100Show/hide
Query:  DYLFKLLLIGDSGVGKSCLLLRFADDSYLDSYISTIGVDFKIRTVEQDGKTIKLQIWDTAGQERFRTITSSYYRGAHGIIVVYDVTDQDSFNNVKQWLNE
        DYLFKLLLIGDSGVGKSCLLLRFADDSYLDSYISTIGVDFKIRTVEQDGKTIKLQIWDTAGQERFRTITSSYYRGAHGIIVVYDVTDQDSFNNVKQWLNE
Subjt:  DYLFKLLLIGDSGVGKSCLLLRFADDSYLDSYISTIGVDFKIRTVEQDGKTIKLQIWDTAGQERFRTITSSYYRGAHGIIVVYDVTDQDSFNNVKQWLNE

Query:  IDRYASENVNKLLVGNKCDLTANKVVSYETAKAFADEIGIPFMETSAKSATNVEEAFMAMAAEIKNRMATQPMNNARPPTVNIRGQPVNQKAGCCSS
        IDRYASENVNKLLVGNKCDLTANKVVSYETAKAFADEIGIPFMETSAKSATNVEEAFMAMAAEIKNRMATQPMNNARPPTVNIRGQPVNQKAGCCSS
Subjt:  IDRYASENVNKLLVGNKCDLTANKVVSYETAKAFADEIGIPFMETSAKSATNVEEAFMAMAAEIKNRMATQPMNNARPPTVNIRGQPVNQKAGCCSS

A0A6J1EV78 ras-related protein RABD2c1.4e-10599.49Show/hide
Query:  DYLFKLLLIGDSGVGKSCLLLRFADDSYLDSYISTIGVDFKIRTVEQDGKTIKLQIWDTAGQERFRTITSSYYRGAHGIIVVYDVTDQDSFNNVKQWLNE
        DYLFKLLLIGDSGVGKSCLLLRFADDSYLDSYISTIGVDFKIRTVEQDGKTIKLQIWDTAGQERFRTITSSYYRGAHGIIVVYDVTDQDSFNNVKQWLNE
Subjt:  DYLFKLLLIGDSGVGKSCLLLRFADDSYLDSYISTIGVDFKIRTVEQDGKTIKLQIWDTAGQERFRTITSSYYRGAHGIIVVYDVTDQDSFNNVKQWLNE

Query:  IDRYASENVNKLLVGNKCDLTANKVVSYETAKAFADEIGIPFMETSAKSATNVEEAFMAMAAEIKNRMATQPMNNARPPTVNIRGQPVNQKAGCCSS
        IDRYASENVNKLLVGNKCDLTANKVVSYETAKAFADEIGIPFMETSAKSATNVEEAFMAMAAEIKNRMATQPMNNARPPTVNIRGQPVNQK GCCSS
Subjt:  IDRYASENVNKLLVGNKCDLTANKVVSYETAKAFADEIGIPFMETSAKSATNVEEAFMAMAAEIKNRMATQPMNNARPPTVNIRGQPVNQKAGCCSS

A0A6J1H3U9 ras-related protein RABD2c-like1.4e-10599.49Show/hide
Query:  DYLFKLLLIGDSGVGKSCLLLRFADDSYLDSYISTIGVDFKIRTVEQDGKTIKLQIWDTAGQERFRTITSSYYRGAHGIIVVYDVTDQDSFNNVKQWLNE
        DYLFKLLLIGDSGVGKSCLLLRFADDSYLDSYISTIGVDFKIRTVEQDGKTIKLQIWDTAGQERFRTITSSYYRGAHGIIVVYDVTDQDSFNNVKQWLNE
Subjt:  DYLFKLLLIGDSGVGKSCLLLRFADDSYLDSYISTIGVDFKIRTVEQDGKTIKLQIWDTAGQERFRTITSSYYRGAHGIIVVYDVTDQDSFNNVKQWLNE

Query:  IDRYASENVNKLLVGNKCDLTANKVVSYETAKAFADEIGIPFMETSAKSATNVEEAFMAMAAEIKNRMATQPMNNARPPTVNIRGQPVNQKAGCCSS
        IDRYASENVNKLLVGNKCDLTANKVVSYETAKAFADEIGIPFMETSAKSATNVEEAFMAMAAEIKNRMATQPMNNARPPTVNIRGQPVNQK GCCSS
Subjt:  IDRYASENVNKLLVGNKCDLTANKVVSYETAKAFADEIGIPFMETSAKSATNVEEAFMAMAAEIKNRMATQPMNNARPPTVNIRGQPVNQKAGCCSS

A0A6J1K501 ras-related protein RABD2c1.4e-10599.49Show/hide
Query:  DYLFKLLLIGDSGVGKSCLLLRFADDSYLDSYISTIGVDFKIRTVEQDGKTIKLQIWDTAGQERFRTITSSYYRGAHGIIVVYDVTDQDSFNNVKQWLNE
        DYLFKLLLIGDSGVGKSCLLLRFADDSYLDSYISTIGVDFKIRTVEQDGKTIKLQIWDTAGQERFRTITSSYYRGAHGIIVVYDVTDQDSFNNVKQWLNE
Subjt:  DYLFKLLLIGDSGVGKSCLLLRFADDSYLDSYISTIGVDFKIRTVEQDGKTIKLQIWDTAGQERFRTITSSYYRGAHGIIVVYDVTDQDSFNNVKQWLNE

Query:  IDRYASENVNKLLVGNKCDLTANKVVSYETAKAFADEIGIPFMETSAKSATNVEEAFMAMAAEIKNRMATQPMNNARPPTVNIRGQPVNQKAGCCSS
        IDRYASENVNKLLVGNKCDLTANKVVSYETAKAFADEIGIPFMETSAKSATNVEEAFMAMAAEIKNRMATQPMNNARPPTVNIRGQPVNQK GCCSS
Subjt:  IDRYASENVNKLLVGNKCDLTANKVVSYETAKAFADEIGIPFMETSAKSATNVEEAFMAMAAEIKNRMATQPMNNARPPTVNIRGQPVNQKAGCCSS

SwissProt top hitse value%identityAlignment
P28188 Ras-related protein RABD2a1.1e-9486.87Show/hide
Query:  DYLFKLLLIGDSGVGKSCLLLRFADDSYLDSYISTIGVDFKIRTVEQDGKTIKLQIWDTAGQERFRTITSSYYRGAHGIIVVYDVTDQDSFNNVKQWLNE
        DYLFKLLLIGDSGVGKSCLLLRF+DDSY++SYISTIGVDFKIRTVEQDGKTIKLQIWDTAGQERFRTITSSYYRGAHGII+VYDVTD++SFNNVKQWL+E
Subjt:  DYLFKLLLIGDSGVGKSCLLLRFADDSYLDSYISTIGVDFKIRTVEQDGKTIKLQIWDTAGQERFRTITSSYYRGAHGIIVVYDVTDQDSFNNVKQWLNE

Query:  IDRYASENVNKLLVGNKCDLTANKVVSYETAKAFADEIGIPFMETSAKSATNVEEAFMAMAAEIKNRMATQPM-NNARPPTVNIRGQPVNQKAGCCSS
        IDRYAS+NVNKLLVGNK DLT N+ + YETAKAFADEIGIPFMETSAK ATNVE+AFMAM+A IK RMA+QP  NNARPPTV IRGQPV QK GCCS+
Subjt:  IDRYASENVNKLLVGNKCDLTANKVVSYETAKAFADEIGIPFMETSAKSATNVEEAFMAMAAEIKNRMATQPM-NNARPPTVNIRGQPVNQKAGCCSS

P40392 Ras-related protein RIC19.1e-9487.31Show/hide
Query:  DYLFKLLLIGDSGVGKSCLLLRFADDSYLDSYISTIGVDFKIRTVEQDGKTIKLQIWDTAGQERFRTITSSYYRGAHGIIVVYDVTDQDSFNNVKQWLNE
        DYLFKLLLIGDSGVGKSCLLLRFADDSYL+SYISTIGVDFKIRTVEQDGKTIKLQIWDTAGQERFRTITSSYYRGAHGIIVVYDVTDQ+SFNNVKQWLNE
Subjt:  DYLFKLLLIGDSGVGKSCLLLRFADDSYLDSYISTIGVDFKIRTVEQDGKTIKLQIWDTAGQERFRTITSSYYRGAHGIIVVYDVTDQDSFNNVKQWLNE

Query:  IDRYASENVNKLLVGNKCDLTANKVVSYETAKAFADEIGIPFMETSAKSATNVEEAFMAMAAEIKNRMATQPMNNA-RPPTVNIRGQPVNQKAGCCS
        IDRYASENVNKLLVGNKCDL  N+VVSYE  KA ADEIGIPF+ETSAK ATNVE+AFM MA EIKNRMA+QP  NA +P TV +RGQPV Q++ CCS
Subjt:  IDRYASENVNKLLVGNKCDLTANKVVSYETAKAFADEIGIPFMETSAKSATNVEEAFMAMAAEIKNRMATQPMNNA-RPPTVNIRGQPVNQKAGCCS

Q05737 GTP-binding protein YPTM22.6e-9689.9Show/hide
Query:  DYLFKLLLIGDSGVGKSCLLLRFADDSYLDSYISTIGVDFKIRTVEQDGKTIKLQIWDTAGQERFRTITSSYYRGAHGIIVVYDVTDQDSFNNVKQWLNE
        DYLFKLLLIGDSGVGKSCLLLRFADDSYLDSYISTIGVDFKIRTVEQDGKTIKLQIWDTAGQERFRTITSSYYRGAHGII+VYDVTDQ+SFNNVKQWLNE
Subjt:  DYLFKLLLIGDSGVGKSCLLLRFADDSYLDSYISTIGVDFKIRTVEQDGKTIKLQIWDTAGQERFRTITSSYYRGAHGIIVVYDVTDQDSFNNVKQWLNE

Query:  IDRYASENVNKLLVGNKCDLTANKVVSYETAKAFADEIGIPFMETSAKSATNVEEAFMAMAAEIKNRMATQP-MNNARPPTVNIRGQPVNQKAGCCSS
        IDRYAS+NVNKLLVGNK DLTANKVV+ ETAKAFADE+GIPFMETSAK+ATNV++AFMAMAA IK+RMA+QP   NARP TV IRGQPVNQK  CCSS
Subjt:  IDRYASENVNKLLVGNKCDLTANKVVSYETAKAFADEIGIPFMETSAKSATNVEEAFMAMAAEIKNRMATQP-MNNARPPTVNIRGQPVNQKAGCCSS

Q9FPJ4 Ras-related protein RABD2b3.3e-9689.34Show/hide
Query:  DYLFKLLLIGDSGVGKSCLLLRFADDSYLDSYISTIGVDFKIRTVEQDGKTIKLQIWDTAGQERFRTITSSYYRGAHGIIVVYDVTDQDSFNNVKQWLNE
        DYLFKLLLIGDSGVGKSCLLLRFADDSYLDSYISTIGVDFKIRTVEQDGKTIKLQIWDTAGQERFRTITSSYYRGAHGIIV YDVTD +SFNNVKQWLNE
Subjt:  DYLFKLLLIGDSGVGKSCLLLRFADDSYLDSYISTIGVDFKIRTVEQDGKTIKLQIWDTAGQERFRTITSSYYRGAHGIIVVYDVTDQDSFNNVKQWLNE

Query:  IDRYASENVNKLLVGNKCDLTANKVVSYETAKAFADEIGIPFMETSAKSATNVEEAFMAMAAEIKNRMATQPMNNARPPTVNIRGQPVNQKAGCCSS
        IDRYASENVNKLLVGNK DLT+ KVVS ETAKAFADE+GIPF+ETSAK+ATNVEEAFMAM A IK RMA+QP   A+PPTV IRGQPVNQ++GCCSS
Subjt:  IDRYASENVNKLLVGNKCDLTANKVVSYETAKAFADEIGIPFMETSAKSATNVEEAFMAMAAEIKNRMATQPMNNARPPTVNIRGQPVNQKAGCCSS

Q9SEH3 Ras-related protein RABD2c3.0e-9789.34Show/hide
Query:  DYLFKLLLIGDSGVGKSCLLLRFADDSYLDSYISTIGVDFKIRTVEQDGKTIKLQIWDTAGQERFRTITSSYYRGAHGIIVVYDVTDQDSFNNVKQWLNE
        DYLFKLLLIGDSGVGKSCLLLRFADDSYLDSYISTIGVDFKIRTVEQDGKTIKLQIWDTAGQERFRTITSSYYRGAHGIIV YDVTD +SFNNVKQWLNE
Subjt:  DYLFKLLLIGDSGVGKSCLLLRFADDSYLDSYISTIGVDFKIRTVEQDGKTIKLQIWDTAGQERFRTITSSYYRGAHGIIVVYDVTDQDSFNNVKQWLNE

Query:  IDRYASENVNKLLVGNKCDLTANKVVSYETAKAFADEIGIPFMETSAKSATNVEEAFMAMAAEIKNRMATQPMNNARPPTVNIRGQPVNQKAGCCSS
        IDRYASENVNKLLVGNKCDLT+ KVVS ETAKAFADE+GIPF+ETSAK+ATNVEEAFMAM A IK RMA+QP   ++PPTV IRGQPVNQ++GCCSS
Subjt:  IDRYASENVNKLLVGNKCDLTANKVVSYETAKAFADEIGIPFMETSAKSATNVEEAFMAMAAEIKNRMATQPMNNARPPTVNIRGQPVNQKAGCCSS

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G02130.1 RAS 57.7e-9686.87Show/hide
Query:  DYLFKLLLIGDSGVGKSCLLLRFADDSYLDSYISTIGVDFKIRTVEQDGKTIKLQIWDTAGQERFRTITSSYYRGAHGIIVVYDVTDQDSFNNVKQWLNE
        DYLFKLLLIGDSGVGKSCLLLRF+DDSY++SYISTIGVDFKIRTVEQDGKTIKLQIWDTAGQERFRTITSSYYRGAHGII+VYDVTD++SFNNVKQWL+E
Subjt:  DYLFKLLLIGDSGVGKSCLLLRFADDSYLDSYISTIGVDFKIRTVEQDGKTIKLQIWDTAGQERFRTITSSYYRGAHGIIVVYDVTDQDSFNNVKQWLNE

Query:  IDRYASENVNKLLVGNKCDLTANKVVSYETAKAFADEIGIPFMETSAKSATNVEEAFMAMAAEIKNRMATQPM-NNARPPTVNIRGQPVNQKAGCCSS
        IDRYAS+NVNKLLVGNK DLT N+ + YETAKAFADEIGIPFMETSAK ATNVE+AFMAM+A IK RMA+QP  NNARPPTV IRGQPV QK GCCS+
Subjt:  IDRYASENVNKLLVGNKCDLTANKVVSYETAKAFADEIGIPFMETSAKSATNVEEAFMAMAAEIKNRMATQPM-NNARPPTVNIRGQPVNQKAGCCSS

AT3G11730.1 Ras-related small GTP-binding family protein1.7e-7973.23Show/hide
Query:  DYLFKLLLIGDSGVGKSCLLLRFADDSYLDSYISTIGVDFKIRTVEQDGKTIKLQIWDTAGQERFRTITSSYYRGAHGIIVVYDVTDQDSFNNVKQWLNE
        DYLFKLLLIGDS VGKSCLLLRFADD+Y+DSYISTIGVDFKIRT+EQDGKTIKLQIWDTAGQERFRTITSSYYRGAHGII+VYD T+ +SFNNVKQWL+E
Subjt:  DYLFKLLLIGDSGVGKSCLLLRFADDSYLDSYISTIGVDFKIRTVEQDGKTIKLQIWDTAGQERFRTITSSYYRGAHGIIVVYDVTDQDSFNNVKQWLNE

Query:  IDRYASENVNKLLVGNKCDLTANKVVSYETAKAFADEIGIPFMETSAKSATNVEEAFMAMAAEIKNRMATQPMNN--ARPPTVNIRGQPVNQ-KAGCC
        IDRYA+E+V KLL+GNK D+  +KVVS ET +A ADE+GIPF+ETSAK + NVE+AF+ +A EIK +M +Q   N  + P TV ++GQP+ Q   GCC
Subjt:  IDRYASENVNKLLVGNKCDLTANKVVSYETAKAFADEIGIPFMETSAKSATNVEEAFMAMAAEIKNRMATQPMNN--ARPPTVNIRGQPVNQ-KAGCC

AT4G17530.1 RAB GTPase homolog 1C2.2e-9889.34Show/hide
Query:  DYLFKLLLIGDSGVGKSCLLLRFADDSYLDSYISTIGVDFKIRTVEQDGKTIKLQIWDTAGQERFRTITSSYYRGAHGIIVVYDVTDQDSFNNVKQWLNE
        DYLFKLLLIGDSGVGKSCLLLRFADDSYLDSYISTIGVDFKIRTVEQDGKTIKLQIWDTAGQERFRTITSSYYRGAHGIIV YDVTD +SFNNVKQWLNE
Subjt:  DYLFKLLLIGDSGVGKSCLLLRFADDSYLDSYISTIGVDFKIRTVEQDGKTIKLQIWDTAGQERFRTITSSYYRGAHGIIVVYDVTDQDSFNNVKQWLNE

Query:  IDRYASENVNKLLVGNKCDLTANKVVSYETAKAFADEIGIPFMETSAKSATNVEEAFMAMAAEIKNRMATQPMNNARPPTVNIRGQPVNQKAGCCSS
        IDRYASENVNKLLVGNKCDLT+ KVVS ETAKAFADE+GIPF+ETSAK+ATNVEEAFMAM A IK RMA+QP   ++PPTV IRGQPVNQ++GCCSS
Subjt:  IDRYASENVNKLLVGNKCDLTANKVVSYETAKAFADEIGIPFMETSAKSATNVEEAFMAMAAEIKNRMATQPMNNARPPTVNIRGQPVNQKAGCCSS

AT5G47200.1 RAB GTPase homolog 1A2.4e-9789.34Show/hide
Query:  DYLFKLLLIGDSGVGKSCLLLRFADDSYLDSYISTIGVDFKIRTVEQDGKTIKLQIWDTAGQERFRTITSSYYRGAHGIIVVYDVTDQDSFNNVKQWLNE
        DYLFKLLLIGDSGVGKSCLLLRFADDSYLDSYISTIGVDFKIRTVEQDGKTIKLQIWDTAGQERFRTITSSYYRGAHGIIV YDVTD +SFNNVKQWLNE
Subjt:  DYLFKLLLIGDSGVGKSCLLLRFADDSYLDSYISTIGVDFKIRTVEQDGKTIKLQIWDTAGQERFRTITSSYYRGAHGIIVVYDVTDQDSFNNVKQWLNE

Query:  IDRYASENVNKLLVGNKCDLTANKVVSYETAKAFADEIGIPFMETSAKSATNVEEAFMAMAAEIKNRMATQPMNNARPPTVNIRGQPVNQKAGCCSS
        IDRYASENVNKLLVGNK DLT+ KVVS ETAKAFADE+GIPF+ETSAK+ATNVEEAFMAM A IK RMA+QP   A+PPTV IRGQPVNQ++GCCSS
Subjt:  IDRYASENVNKLLVGNKCDLTANKVVSYETAKAFADEIGIPFMETSAKSATNVEEAFMAMAAEIKNRMATQPMNNARPPTVNIRGQPVNQKAGCCSS

AT5G59840.1 Ras-related small GTP-binding family protein1.1e-6259.71Show/hide
Query:  DYLFKLLLIGDSGVGKSCLLLRFADDSYLDSYISTIGVDFKIRTVEQDGKTIKLQIWDTAGQERFRTITSSYYRGAHGIIVVYDVTDQDSFNNVKQWLNE
        DYL KLLLIGDSGVGKSCLLLRF+D S+  S+I+TIG+DFKIRT+E DGK IKLQIWDTAGQERFRTIT++YYRGA GI++VYDVTD+ SFNN++ W+  
Subjt:  DYLFKLLLIGDSGVGKSCLLLRFADDSYLDSYISTIGVDFKIRTVEQDGKTIKLQIWDTAGQERFRTITSSYYRGAHGIIVVYDVTDQDSFNNVKQWLNE

Query:  IDRYASENVNKLLVGNKCDLTANK-VVSYETAKAFADEIGIPFMETSAKSATNVEEAFMAMAAEIKNRMATQPMNNARPPTVNI--------RGQPVNQK
        I+++AS+NVNK+LVGNK D+  +K  V     +A ADE GI F ETSAK+  NVEE F ++A +IK R+A    + A P T+ I         GQ   QK
Subjt:  IDRYASENVNKLLVGNKCDLTANK-VVSYETAKAFADEIGIPFMETSAKSATNVEEAFMAMAAEIKNRMATQPMNNARPPTVNI--------RGQPVNQK

Query:  AGCCSS
        + CC S
Subjt:  AGCCSS


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
CTCCTTCATTCTCGTATTTGCAGTGACTATTTGTTTAAGCTTTTGCTTATCGGAGATTCAGGCGTTGGAAAATCATGTCTTCTACTGAGGTTTGCTGATGATTCATATCT
GGATAGCTACATTAGCACCATTGGAGTCGACTTTAAAATCCGTACTGTGGAACAGGATGGAAAGACCATTAAACTTCAAATTTGGGATACTGCCGGTCAAGAACGTTTTA
GAACAATTACTAGCAGCTACTACCGTGGAGCTCATGGCATAATTGTTGTGTATGATGTTACGGACCAGGATAGCTTCAATAATGTTAAGCAATGGTTGAATGAAATAGAT
CGATATGCAAGCGAAAACGTGAACAAGCTTTTGGTTGGTAATAAATGTGACCTCACTGCAAATAAGGTCGTTTCTTATGAGACAGCTAAGGCTTTTGCGGATGAAATTGG
GATTCCTTTCATGGAAACTAGTGCTAAAAGCGCTACTAATGTGGAAGAGGCTTTCATGGCCATGGCTGCTGAAATAAAGAACAGGATGGCGACACAGCCGATGAACAACG
CGAGGCCACCGACAGTGAATATTCGAGGACAACCTGTGAATCAGAAAGCTGGTTGCTGCTCTTCC
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
CTCCTTCATTCTCGTATTTGCAGTGACTATTTGTTTAAGCTTTTGCTTATCGGAGATTCAGGCGTTGGAAAATCATGTCTTCTACTGAGGTTTGCTGATGATTCATATCT
GGATAGCTACATTAGCACCATTGGAGTCGACTTTAAAATCCGTACTGTGGAACAGGATGGAAAGACCATTAAACTTCAAATTTGGGATACTGCCGGTCAAGAACGTTTTA
GAACAATTACTAGCAGCTACTACCGTGGAGCTCATGGCATAATTGTTGTGTATGATGTTACGGACCAGGATAGCTTCAATAATGTTAAGCAATGGTTGAATGAAATAGAT
CGATATGCAAGCGAAAACGTGAACAAGCTTTTGGTTGGTAATAAATGTGACCTCACTGCAAATAAGGTCGTTTCTTATGAGACAGCTAAGGCTTTTGCGGATGAAATTGG
GATTCCTTTCATGGAAACTAGTGCTAAAAGCGCTACTAATGTGGAAGAGGCTTTCATGGCCATGGCTGCTGAAATAAAGAACAGGATGGCGACACAGCCGATGAACAACG
CGAGGCCACCGACAGTGAATATTCGAGGACAACCTGTGAATCAGAAAGCTGGTTGCTGCTCTTCC
Protein sequenceShow/hide protein sequence
LLHSRICSDYLFKLLLIGDSGVGKSCLLLRFADDSYLDSYISTIGVDFKIRTVEQDGKTIKLQIWDTAGQERFRTITSSYYRGAHGIIVVYDVTDQDSFNNVKQWLNEID
RYASENVNKLLVGNKCDLTANKVVSYETAKAFADEIGIPFMETSAKSATNVEEAFMAMAAEIKNRMATQPMNNARPPTVNIRGQPVNQKAGCCSS