; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

MS012341 (gene) of Bitter gourd (TR) v1 genome

Gene IDMS012341
OrganismMomordica charantia cv. TR (Bitter gourd (TR) v1)
Descriptioncostars family protein
Genome locationscaffold63:66176..67340
RNA-Seq ExpressionMS012341
SyntenyMS012341
Gene Ontology termsGO:0032970 - regulation of actin filament-based process (biological process)
InterPro domainsIPR027817 - Costars domain
IPR038095 - Costars domain superfamily
IPR044302 - Costars family


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
XP_008454461.1 PREDICTED: costars family protein [Cucumis melo]1.3e-3689.25Show/hide
Query:  MNVDEEVERLKEEIQRLGKIQDDGSYKVTFGVLFNDDRCANIFEALVGTLRAAKKRKIVTYDGELLLQGVHDNVEIILKAAPAAEAATTAAAK
        MNV+EEV+RLKEEI+RLGK+QDDGSYKVTFGVLFNDDRCANIFEALVGTLRAAKKRKIVTYDGELLLQGVHD VEIILKA P  E ATTAA K
Subjt:  MNVDEEVERLKEEIQRLGKIQDDGSYKVTFGVLFNDDRCANIFEALVGTLRAAKKRKIVTYDGELLLQGVHDNVEIILKAAPAAEAATTAAAK

XP_011653450.1 costars family protein isoform X1 [Cucumis sativus]1.0e-3689.25Show/hide
Query:  MNVDEEVERLKEEIQRLGKIQDDGSYKVTFGVLFNDDRCANIFEALVGTLRAAKKRKIVTYDGELLLQGVHDNVEIILKAAPAAEAATTAAAK
        MNV+EEVERLKEEI+RLGK+QDDGSYKVTFGVLFNDDRCANIFEALVGTLRAAKKRKIV+YDGELLLQGVHDNVEIILKA P  E A+TAA K
Subjt:  MNVDEEVERLKEEIQRLGKIQDDGSYKVTFGVLFNDDRCANIFEALVGTLRAAKKRKIVTYDGELLLQGVHDNVEIILKAAPAAEAATTAAAK

XP_022149133.1 costars family protein [Momordica charantia]1.8e-41100Show/hide
Query:  MNVDEEVERLKEEIQRLGKIQDDGSYKVTFGVLFNDDRCANIFEALVGTLRAAKKRKIVTYDGELLLQGVHDNVEIILKAAPAAEAATTAAAKA
        MNVDEEVERLKEEIQRLGKIQDDGSYKVTFGVLFNDDRCANIFEALVGTLRAAKKRKIVTYDGELLLQGVHDNVEIILKAAPAAEAATTAAAKA
Subjt:  MNVDEEVERLKEEIQRLGKIQDDGSYKVTFGVLFNDDRCANIFEALVGTLRAAKKRKIVTYDGELLLQGVHDNVEIILKAAPAAEAATTAAAKA

XP_022922531.1 costars family protein [Cucurbita moschata]2.6e-4095.74Show/hide
Query:  MNVDEEVERLKEEIQRLGKIQDDGSYKVTFGVLFNDDRCANIFEALVGTLRAAKKRKIVTYDGELLLQGVHDNVEIILKAAPAAEAATTAAAKA
        MNVDEEVERLKEEIQRLGK+QDDGSYKVTFGVLFNDDRCANIFEALVGTLRAAKKRKIVTYDGELLLQGVHDNVEI+LKA PAAE ATTAAAKA
Subjt:  MNVDEEVERLKEEIQRLGKIQDDGSYKVTFGVLFNDDRCANIFEALVGTLRAAKKRKIVTYDGELLLQGVHDNVEIILKAAPAAEAATTAAAKA

XP_038905392.1 costars family protein [Benincasa hispida]1.7e-3689.36Show/hide
Query:  MNVDEEVERLKEEIQRLGKIQDDGSYKVTFGVLFNDDRCANIFEALVGTLRAAKKRKIVTYDGELLLQGVHDNVEIILKAAPAAEAATTAAAKA
        MNV+EEVERLKEEI RLGK+Q DGSYKVTFGVLFNDDRCANIFEALVGTLRAAKKRKIVTYDGELLLQGVHDNVEI+LKA P  E ATTAA KA
Subjt:  MNVDEEVERLKEEIQRLGKIQDDGSYKVTFGVLFNDDRCANIFEALVGTLRAAKKRKIVTYDGELLLQGVHDNVEIILKAAPAAEAATTAAAKA

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A1S3BZW5 costars family protein6.4e-3789.25Show/hide
Query:  MNVDEEVERLKEEIQRLGKIQDDGSYKVTFGVLFNDDRCANIFEALVGTLRAAKKRKIVTYDGELLLQGVHDNVEIILKAAPAAEAATTAAAK
        MNV+EEV+RLKEEI+RLGK+QDDGSYKVTFGVLFNDDRCANIFEALVGTLRAAKKRKIVTYDGELLLQGVHD VEIILKA P  E ATTAA K
Subjt:  MNVDEEVERLKEEIQRLGKIQDDGSYKVTFGVLFNDDRCANIFEALVGTLRAAKKRKIVTYDGELLLQGVHDNVEIILKAAPAAEAATTAAAK

A0A5D3DZW0 Costars family protein6.4e-3789.25Show/hide
Query:  MNVDEEVERLKEEIQRLGKIQDDGSYKVTFGVLFNDDRCANIFEALVGTLRAAKKRKIVTYDGELLLQGVHDNVEIILKAAPAAEAATTAAAK
        MNV+EEV+RLKEEI+RLGK+QDDGSYKVTFGVLFNDDRCANIFEALVGTLRAAKKRKIVTYDGELLLQGVHD VEIILKA P  E ATTAA K
Subjt:  MNVDEEVERLKEEIQRLGKIQDDGSYKVTFGVLFNDDRCANIFEALVGTLRAAKKRKIVTYDGELLLQGVHDNVEIILKAAPAAEAATTAAAK

A0A6J1D600 costars family protein8.6e-42100Show/hide
Query:  MNVDEEVERLKEEIQRLGKIQDDGSYKVTFGVLFNDDRCANIFEALVGTLRAAKKRKIVTYDGELLLQGVHDNVEIILKAAPAAEAATTAAAKA
        MNVDEEVERLKEEIQRLGKIQDDGSYKVTFGVLFNDDRCANIFEALVGTLRAAKKRKIVTYDGELLLQGVHDNVEIILKAAPAAEAATTAAAKA
Subjt:  MNVDEEVERLKEEIQRLGKIQDDGSYKVTFGVLFNDDRCANIFEALVGTLRAAKKRKIVTYDGELLLQGVHDNVEIILKAAPAAEAATTAAAKA

A0A6J1E4D6 costars family protein1.2e-4095.74Show/hide
Query:  MNVDEEVERLKEEIQRLGKIQDDGSYKVTFGVLFNDDRCANIFEALVGTLRAAKKRKIVTYDGELLLQGVHDNVEIILKAAPAAEAATTAAAKA
        MNVDEEVERLKEEIQRLGK+QDDGSYKVTFGVLFNDDRCANIFEALVGTLRAAKKRKIVTYDGELLLQGVHDNVEI+LKA PAAE ATTAAAKA
Subjt:  MNVDEEVERLKEEIQRLGKIQDDGSYKVTFGVLFNDDRCANIFEALVGTLRAAKKRKIVTYDGELLLQGVHDNVEIILKAAPAAEAATTAAAKA

A0A6J1J9Z5 costars family protein1.2e-4095.74Show/hide
Query:  MNVDEEVERLKEEIQRLGKIQDDGSYKVTFGVLFNDDRCANIFEALVGTLRAAKKRKIVTYDGELLLQGVHDNVEIILKAAPAAEAATTAAAKA
        MNVDEEVERLKEEIQRLGK+QDDGSYKVTFGVLFNDDRCANIFEALVGTLRAAKKRKIVTYDGELLLQGVHDNVEI+LKA PAAE ATTAAAKA
Subjt:  MNVDEEVERLKEEIQRLGKIQDDGSYKVTFGVLFNDDRCANIFEALVGTLRAAKKRKIVTYDGELLLQGVHDNVEIILKAAPAAEAATTAAAKA

SwissProt top hitse value%identityAlignment
A2XKU9 Costars family protein9.2e-3382.76Show/hide
Query:  MNVDEEVERLKEEIQRLGKIQDDGSYKVTFGVLFNDDRCANIFEALVGTLRAAKKRKIVTYDGELLLQGVHDNVEIILKAAPAAEAA
        MNV+EEV +LKEEIQRLG+ Q DGSYKVTFGV+FNDDRCANIFEALVGTLRAAKKRKIV YDGELLLQG HDNVEI L   PA  AA
Subjt:  MNVDEEVERLKEEIQRLGKIQDDGSYKVTFGVLFNDDRCANIFEALVGTLRAAKKRKIVTYDGELLLQGVHDNVEIILKAAPAAEAA

A9NK39 Costars family protein WS02710_H033.0e-3181.71Show/hide
Query:  MNVDEEVERLKEEIQRLGKIQDDGSYKVTFGVLFNDDRCANIFEALVGTLRAAKKRKIVTYDGELLLQGVHDNVEIILKAAP
        +NVDEEVERLKEEI+RL + + DGSY V FGVLF+DDRCANIFEALVGTLRAAKKRK+VTYDGELLLQGVHDNVEI+L   P
Subjt:  MNVDEEVERLKEEIQRLGKIQDDGSYKVTFGVLFNDDRCANIFEALVGTLRAAKKRKIVTYDGELLLQGVHDNVEIILKAAP

B4YYA9 Costars family protein ST45-21.1e-3072.83Show/hide
Query:  MNVDEEVERLKEEIQRLGKIQDDGSYKVTFGVLFNDDRCANIFEALVGTLRAAKKRKIVTYDGELLLQGVHDNVEIILKAAPAAEAATTAAA
        MNV+EE+++L+EEI RLG +Q DGSYKVTFGVLFNDDRCANIFEALVGTLRAAKKRKIV + GELLLQGVHD VEI L+  P    A  A +
Subjt:  MNVDEEVERLKEEIQRLGKIQDDGSYKVTFGVLFNDDRCANIFEALVGTLRAAKKRKIVTYDGELLLQGVHDNVEIILKAAPAAEAATTAAA

Q6AVK1 Costars family protein9.2e-3382.76Show/hide
Query:  MNVDEEVERLKEEIQRLGKIQDDGSYKVTFGVLFNDDRCANIFEALVGTLRAAKKRKIVTYDGELLLQGVHDNVEIILKAAPAAEAA
        MNV+EEV +LKEEIQRLG+ Q DGSYKVTFGV+FNDDRCANIFEALVGTLRAAKKRKIV YDGELLLQG HDNVEI L   PA  AA
Subjt:  MNVDEEVERLKEEIQRLGKIQDDGSYKVTFGVLFNDDRCANIFEALVGTLRAAKKRKIVTYDGELLLQGVHDNVEIILKAAPAAEAA

Q8LBN7 Costars family protein At4g336403.0e-3175Show/hide
Query:  MNVDEEVERLKEEIQRLGKIQDDGSYKVTFGVLFNDDRCANIFEALVGTLRAAKKRKIVTYDGELLLQGVHDNVEIILKAAPAAEAATTAAA
        MNVDEE+++L+EEI RLG  Q DGSYKVTFGVLFNDDRCANIFEALVGTLRAAKKRKIV ++GELLLQGVHD VEI L+  P    A  A A
Subjt:  MNVDEEVERLKEEIQRLGKIQDDGSYKVTFGVLFNDDRCANIFEALVGTLRAAKKRKIVTYDGELLLQGVHDNVEIILKAAPAAEAATTAAA

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT4G33640.1 unknown protein2.1e-3275Show/hide
Query:  MNVDEEVERLKEEIQRLGKIQDDGSYKVTFGVLFNDDRCANIFEALVGTLRAAKKRKIVTYDGELLLQGVHDNVEIILKAAPAAEAATTAAA
        MNVDEE+++L+EEI RLG  Q DGSYKVTFGVLFNDDRCANIFEALVGTLRAAKKRKIV ++GELLLQGVHD VEI L+  P    A  A A
Subjt:  MNVDEEVERLKEEIQRLGKIQDDGSYKVTFGVLFNDDRCANIFEALVGTLRAAKKRKIVTYDGELLLQGVHDNVEIILKAAPAAEAATTAAA


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGAATGTAGATGAGGAAGTTGAGCGACTCAAGGAGGAAATTCAAAGGCTCGGCAAGATCCAAGATGATGGTTCTTACAAGGTGACATTTGGGGTGCTGTTCAATGATGA
CAGATGTGCTAACATATTCGAGGCGTTGGTCGGGACGCTAAGAGCAGCAAAGAAGAGAAAAATCGTGACTTATGATGGTGAGCTGCTGCTGCAAGGAGTTCATGATAATG
TTGAGATCATTCTCAAAGCCGCTCCAGCTGCAGAAGCTGCAACCACTGCAGCTGCGAAAGCT
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGAATGTAGATGAGGAAGTTGAGCGACTCAAGGAGGAAATTCAAAGGCTCGGCAAGATCCAAGATGATGGTTCTTACAAGGTGACATTTGGGGTGCTGTTCAATGATGA
CAGATGTGCTAACATATTCGAGGCGTTGGTCGGGACGCTAAGAGCAGCAAAGAAGAGAAAAATCGTGACTTATGATGGTGAGCTGCTGCTGCAAGGAGTTCATGATAATG
TTGAGATCATTCTCAAAGCCGCTCCAGCTGCAGAAGCTGCAACCACTGCAGCTGCGAAAGCT
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MNVDEEVERLKEEIQRLGKIQDDGSYKVTFGVLFNDDRCANIFEALVGTLRAAKKRKIVTYDGELLLQGVHDNVEIILKAAPAAEAATTAAAKA