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MS012349 (gene) of Bitter gourd (TR) v1 genome

Gene IDMS012349
OrganismMomordica charantia cv. TR (Bitter gourd (TR) v1)
DescriptionMADS-box transcription factor ANR1
Genome locationscaffold63:108277..108498
RNA-Seq ExpressionMS012349
SyntenyMS012349
Gene Ontology termsGO:0045944 - positive regulation of transcription by RNA polymerase II (biological process)
GO:0005634 - nucleus (cellular component)
GO:0000978 - RNA polymerase II proximal promoter sequence-specific DNA binding (molecular function)
GO:0000981 - DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific (molecular function)
GO:0046983 - protein dimerization activity (molecular function)
InterPro domainsIPR002100 - Transcription factor, MADS-box
IPR033896 - MADS MEF2-like
IPR036879 - Transcription factor, MADS-box superfamily


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
EOX98615.1 AGAMOUS-like 16 [Theobroma cacao]6.5e-2392.31Show/hide
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KAB2091482.1 hypothetical protein ES319_A03G194100v1, partial [Gossypium barbadense]6.5e-2395.16Show/hide
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KDP35959.1 hypothetical protein JCGZ_09931 [Jatropha curcas]1.3e-2390.91Show/hide
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PRQ24221.1 putative transcription factor MADS-type1 family [Rosa chinensis]2.9e-2385.71Show/hide
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XP_022149185.1 MADS-box transcription factor 23 isoform X2 [Momordica charantia]8.5e-23100Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A061E0X6 AGAMOUS-like 163.2e-2392.31Show/hide
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A0A067KVR8 MADS-box domain-containing protein6.4e-2490.91Show/hide
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A0A2P6PQN2 Putative transcription factor MADS-type1 family1.4e-2385.71Show/hide
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A0A5D3A2E4 MADS-box domain-containing protein (Fragment)3.2e-2395.16Show/hide
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A0A5J5WHT0 MADS-box domain-containing protein (Fragment)3.2e-2395.16Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
Q40702 MADS-box transcription factor 29.8e-2276.56Show/hide
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Q6EP49 MADS-box transcription factor 278.8e-2386.67Show/hide
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Q6Z6W2 MADS-box transcription factor 571.4e-2379.41Show/hide
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Q9SI38 MADS-box transcription factor ANR12.1e-2491.94Show/hide
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Q9SZJ6 Agamous-like MADS-box protein AGL215.7e-2285Show/hide
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT2G14210.1 AGAMOUS-like 441.5e-2591.94Show/hide
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AT3G57230.1 AGAMOUS-like 169.1e-2383.33Show/hide
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AT3G57230.2 AGAMOUS-like 169.1e-2383.33Show/hide
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AT4G37940.1 AGAMOUS-like 214.1e-2385Show/hide
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AT5G13790.1 AGAMOUS-like 152.9e-2178.33Show/hide
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
GTAGAGAGAGAAATGGGAAGAGGGAAAATAGTGATTCGAAGAATAGACAATTCAACGAGCAGACAAGTGACTTTCTCAAAGAGAAGAAGTGGGTTACTCAAAAAAGCTCG
AGAACTTTCAATCTTGTGTGATGCTGAAGTTGGATTGATCATTTTTTCAAGCACTGGCAAGCTCTATGATTATTCCAGCACCAGGTCAGAATTATTATTCATCAGATCCC
TC
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
GTAGAGAGAGAAATGGGAAGAGGGAAAATAGTGATTCGAAGAATAGACAATTCAACGAGCAGACAAGTGACTTTCTCAAAGAGAAGAAGTGGGTTACTCAAAAAAGCTCG
AGAACTTTCAATCTTGTGTGATGCTGAAGTTGGATTGATCATTTTTTCAAGCACTGGCAAGCTCTATGATTATTCCAGCACCAGGTCAGAATTATTATTCATCAGATCCC
TC
Protein sequenceShow/hide protein sequence
VEREMGRGKIVIRRIDNSTSRQVTFSKRRSGLLKKARELSILCDAEVGLIIFSSTGKLYDYSSTRSELLFIRSL