; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

MS012429 (gene) of Bitter gourd (TR) v1 genome

Gene IDMS012429
OrganismMomordica charantia cv. TR (Bitter gourd (TR) v1)
DescriptionGibberellin-regulated protein
Genome locationscaffold63:629046..629446
RNA-Seq ExpressionMS012429
SyntenyMS012429
Gene Ontology termsNA
InterPro domainsIPR003854 - Gibberellin regulated protein


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAA0044354.1 peamaclein-like [Cucumis melo var. makuwa]3.5e-3987.64Show/hide
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KAE8649034.1 hypothetical protein Csa_014887 [Cucumis sativus]9.2e-4089.89Show/hide
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XP_038906246.1 peamaclein-like [Benincasa hispida]6.0e-3989.89Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0KV42 Uncharacterized protein2.4e-3889.66Show/hide
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A0A4U5QA14 Uncharacterized protein2.4e-3376.4Show/hide
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A0A5D3E0A6 Peamaclein-like1.7e-3987.64Show/hide
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A0A6J1D7V8 peamaclein-like2.1e-45100Show/hide
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B9HS89 Uncharacterized protein1.4e-3376.4Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
C0HLQ1 Cypmaclein6.5e-2064.41Show/hide
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O82328 Gibberellin-regulated protein 75.3e-2270Show/hide
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        +C ++C+ RC +AG+ DRC+KYCGICC  C+CVPSGTYGNKHEC CYRD  SSKG PKCP
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P86888 Peamaclein7.4e-2472.58Show/hide
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        S FCD +C  RCSKAG  +RC+KYCGICC  C CVPSGTYGNK ECPCYRD+++SKG PKCP
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Q8LFM2 Gibberellin-regulated protein 105.8e-2160.98Show/hide
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        +L+  LL TSS   +  A S  C  +C  RCSKAG  DRC+KYC ICC  C  CVPSGTYGNK ECPCYRDM++SKG  KCP
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Q948Z4 Snakin-15.3e-3070.11Show/hide
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        KLF  TLLL  L+ T S I   +A S FCD +CK RCSKAG+ DRC+KYCGICC  CKCVPSGTYGNKHECPCYRD ++SKGK KCP
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G10588.1 Gibberellin-regulated family protein1.5e-1958.44Show/hide
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AT1G10588.2 Gibberellin-regulated family protein2.1e-1858.44Show/hide
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        LL TSSF  +  A S  C  +C  RCSKA    + C++ C ICC  C CVPSGTYGNK ECPCYRDM++SKG  KCP
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AT2G14900.1 Gibberellin-regulated family protein3.8e-2370Show/hide
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AT2G39540.1 Gibberellin-regulated family protein2.3e-2052.87Show/hide
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        KL      +  LL TSSF +++ +    C  +C  RCSKAG  + C+KYC ICC  C CVPSGT+G+K ECPCYRDM++SKG  KCP
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AT5G59845.1 Gibberellin-regulated family protein4.1e-2260.98Show/hide
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        +L+  LL TSS   +  A S  C  +C  RCSKAG  DRC+KYC ICC  C  CVPSGTYGNK ECPCYRDM++SKG  KCP
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
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GAGATGCTCAAAAGCAGGAGTGATGGACAGATGCATAAAGTATTGTGGAATTTGCTGTGGCTATTGCAAGTGTGTTCCTTCTGGGACTTATGGGAACAAGCATGAGTGCC
CTTGCTATAGGGACATGAGGAGTTCTAAGGGTAAGCCCAAGTGCCCT
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGAAGAAGCTTTTCTTTTCGACGCTCTTGCTTTGCTTCCTGCTCTTCACTTCTTCCTTCATAAACATTGTCATCGCCAAGTCTGTGTTTTGTGACAAACAGTGCAAGAA
GAGATGCTCAAAAGCAGGAGTGATGGACAGATGCATAAAGTATTGTGGAATTTGCTGTGGCTATTGCAAGTGTGTTCCTTCTGGGACTTATGGGAACAAGCATGAGTGCC
CTTGCTATAGGGACATGAGGAGTTCTAAGGGTAAGCCCAAGTGCCCT
Protein sequenceShow/hide protein sequence
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