; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

MS012544 (gene) of Bitter gourd (TR) v1 genome

Gene IDMS012544
OrganismMomordica charantia cv. TR (Bitter gourd (TR) v1)
DescriptionRAB GTPase 11C
Genome locationscaffold63:1458301..1460153
RNA-Seq ExpressionMS012544
SyntenyMS012544
Gene Ontology termsGO:0005768 - endosome (cellular component)
GO:0005794 - Golgi apparatus (cellular component)
GO:0003924 - GTPase activity (molecular function)
GO:0005525 - GTP binding (molecular function)
InterPro domainsIPR001806 - Small GTPase
IPR005225 - Small GTP-binding protein domain
IPR027417 - P-loop containing nucleoside triphosphate hydrolase


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
XP_004133721.1 ras-related protein RABA2a [Cucumis sativus]1.2e-10996.76Show/hide
Query:  MARRPDDDYDYLFKVVLIGDSGVGKSNLLSRFTRNEFCLESKSTIGVEFATRTLQVEGRTVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGALGALLVYDTTKAMTF
        MARRPDDDYDYLFKVVLIGDSGVGKSNLLSRFTRNEFCLESKSTIGVEFATRTLQVEGRTVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGALGALLVYD TK MTF
Subjt:  MARRPDDDYDYLFKVVLIGDSGVGKSNLLSRFTRNEFCLESKSTIGVEFATRTLQVEGRTVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGALGALLVYDTTKAMTF

Query:  DNVSRWLKELRDHADSNIVIMLIGNKTDLKHLRAVATEDAQSYAEKEGLSFLETSALEATNVEKAFQTILSEIYRIISKKSLNSNEPAAASSIKEGKTIV
        DNVSRWLKELRDHADSNIVIMLIGNKTDLKHLRAVATEDAQSYAEKEGLSF+ETSALEATNVEKAFQTILSEIYRIISKKSLNS EPAAA++IKEGKTIV
Subjt:  DNVSRWLKELRDHADSNIVIMLIGNKTDLKHLRAVATEDAQSYAEKEGLSFLETSALEATNVEKAFQTILSEIYRIISKKSLNSNEPAAASSIKEGKTIV

Query:  VGESEANTKKSCCSSS
        VGESEANTKK+CCSSS
Subjt:  VGESEANTKKSCCSSS

XP_008452243.1 PREDICTED: ras-related protein RABA2a [Cucumis melo]2.7e-10996.3Show/hide
Query:  MARRPDDDYDYLFKVVLIGDSGVGKSNLLSRFTRNEFCLESKSTIGVEFATRTLQVEGRTVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGALGALLVYDTTKAMTF
        MARRPDDDYDYLFKVVLIGDSGVGKSNLLSRFTRNEFCLESKSTIGVEFATRTLQVEGRTVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGALGALLVYD TK MTF
Subjt:  MARRPDDDYDYLFKVVLIGDSGVGKSNLLSRFTRNEFCLESKSTIGVEFATRTLQVEGRTVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGALGALLVYDTTKAMTF

Query:  DNVSRWLKELRDHADSNIVIMLIGNKTDLKHLRAVATEDAQSYAEKEGLSFLETSALEATNVEKAFQTILSEIYRIISKKSLNSNEPAAASSIKEGKTIV
        DNVSRWLKELRDHADSNIVIMLIGNKTDLKHLRAVATEDAQSYAEKEGLSF+ETSALEATNVEKAFQTILSEIYRIISKKSLNS EP+AA++IKEGKTIV
Subjt:  DNVSRWLKELRDHADSNIVIMLIGNKTDLKHLRAVATEDAQSYAEKEGLSFLETSALEATNVEKAFQTILSEIYRIISKKSLNSNEPAAASSIKEGKTIV

Query:  VGESEANTKKSCCSSS
        VGESEANTKK+CCSSS
Subjt:  VGESEANTKKSCCSSS

XP_022136956.1 ras-related protein RABA2a [Momordica charantia]8.9e-113100Show/hide
Query:  MARRPDDDYDYLFKVVLIGDSGVGKSNLLSRFTRNEFCLESKSTIGVEFATRTLQVEGRTVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGALGALLVYDTTKAMTF
        MARRPDDDYDYLFKVVLIGDSGVGKSNLLSRFTRNEFCLESKSTIGVEFATRTLQVEGRTVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGALGALLVYDTTKAMTF
Subjt:  MARRPDDDYDYLFKVVLIGDSGVGKSNLLSRFTRNEFCLESKSTIGVEFATRTLQVEGRTVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGALGALLVYDTTKAMTF

Query:  DNVSRWLKELRDHADSNIVIMLIGNKTDLKHLRAVATEDAQSYAEKEGLSFLETSALEATNVEKAFQTILSEIYRIISKKSLNSNEPAAASSIKEGKTIV
        DNVSRWLKELRDHADSNIVIMLIGNKTDLKHLRAVATEDAQSYAEKEGLSFLETSALEATNVEKAFQTILSEIYRIISKKSLNSNEPAAASSIKEGKTIV
Subjt:  DNVSRWLKELRDHADSNIVIMLIGNKTDLKHLRAVATEDAQSYAEKEGLSFLETSALEATNVEKAFQTILSEIYRIISKKSLNSNEPAAASSIKEGKTIV

Query:  VGESEANTKKSCCSSS
        VGESEANTKKSCCSSS
Subjt:  VGESEANTKKSCCSSS

XP_023517501.1 ras-related protein RABA2a-like [Cucurbita pepo subsp. pepo]8.6e-10894.91Show/hide
Query:  MARRPDDDYDYLFKVVLIGDSGVGKSNLLSRFTRNEFCLESKSTIGVEFATRTLQVEGRTVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGALGALLVYDTTKAMTF
        MARRPDDDYDYLFKVVLIGDSGVGKSNLLSRFTRNEFCLESKSTIGVEFATRTLQVEGRTVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGALGALLVYD TK MTF
Subjt:  MARRPDDDYDYLFKVVLIGDSGVGKSNLLSRFTRNEFCLESKSTIGVEFATRTLQVEGRTVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGALGALLVYDTTKAMTF

Query:  DNVSRWLKELRDHADSNIVIMLIGNKTDLKHLRAVATEDAQSYAEKEGLSFLETSALEATNVEKAFQTILSEIYRIISKKSLNSNEPAAASSIKEGKTIV
        DNV+RWLKELRDHADSNIVIMLIGNKTDLKHLRAVATEDAQSYAEKEGLS +ETSALEATNVEKAFQTILSEIYRIISKKSLNS+EPAAA++IKEGK+IV
Subjt:  DNVSRWLKELRDHADSNIVIMLIGNKTDLKHLRAVATEDAQSYAEKEGLSFLETSALEATNVEKAFQTILSEIYRIISKKSLNSNEPAAASSIKEGKTIV

Query:  VGESEANTKKSCCSSS
        VGESEAN+KK+CCSSS
Subjt:  VGESEANTKKSCCSSS

XP_038905598.1 ras-related protein RABA2a [Benincasa hispida]5.1e-10896.3Show/hide
Query:  MARRPDDDYDYLFKVVLIGDSGVGKSNLLSRFTRNEFCLESKSTIGVEFATRTLQVEGRTVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGALGALLVYDTTKAMTF
        MARRPDDDYDYLFKVVLIGDSGVGKSNLLSRFTRNEFCLESKSTIGVEFATRTLQVEGRT+KAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGALGALLVYD TK MTF
Subjt:  MARRPDDDYDYLFKVVLIGDSGVGKSNLLSRFTRNEFCLESKSTIGVEFATRTLQVEGRTVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGALGALLVYDTTKAMTF

Query:  DNVSRWLKELRDHADSNIVIMLIGNKTDLKHLRAVATEDAQSYAEKEGLSFLETSALEATNVEKAFQTILSEIYRIISKKSLNSNEPAAASSIKEGKTIV
        DNVSRWLKELRDHADSNIVIMLIGNKTDLKHLRAVATEDAQSYAEKEGLSF+ETSALEATNVEKAFQTILSEIYRIISKKSLNS EPAAA +IKEGKTIV
Subjt:  DNVSRWLKELRDHADSNIVIMLIGNKTDLKHLRAVATEDAQSYAEKEGLSFLETSALEATNVEKAFQTILSEIYRIISKKSLNSNEPAAASSIKEGKTIV

Query:  VGESEANTKKSCCSSS
        VGESEANTKK+CCSSS
Subjt:  VGESEANTKKSCCSSS

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0L6P8 Uncharacterized protein5.8e-11096.76Show/hide
Query:  MARRPDDDYDYLFKVVLIGDSGVGKSNLLSRFTRNEFCLESKSTIGVEFATRTLQVEGRTVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGALGALLVYDTTKAMTF
        MARRPDDDYDYLFKVVLIGDSGVGKSNLLSRFTRNEFCLESKSTIGVEFATRTLQVEGRTVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGALGALLVYD TK MTF
Subjt:  MARRPDDDYDYLFKVVLIGDSGVGKSNLLSRFTRNEFCLESKSTIGVEFATRTLQVEGRTVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGALGALLVYDTTKAMTF

Query:  DNVSRWLKELRDHADSNIVIMLIGNKTDLKHLRAVATEDAQSYAEKEGLSFLETSALEATNVEKAFQTILSEIYRIISKKSLNSNEPAAASSIKEGKTIV
        DNVSRWLKELRDHADSNIVIMLIGNKTDLKHLRAVATEDAQSYAEKEGLSF+ETSALEATNVEKAFQTILSEIYRIISKKSLNS EPAAA++IKEGKTIV
Subjt:  DNVSRWLKELRDHADSNIVIMLIGNKTDLKHLRAVATEDAQSYAEKEGLSFLETSALEATNVEKAFQTILSEIYRIISKKSLNSNEPAAASSIKEGKTIV

Query:  VGESEANTKKSCCSSS
        VGESEANTKK+CCSSS
Subjt:  VGESEANTKKSCCSSS

A0A1S3BTD1 ras-related protein RABA2a1.3e-10996.3Show/hide
Query:  MARRPDDDYDYLFKVVLIGDSGVGKSNLLSRFTRNEFCLESKSTIGVEFATRTLQVEGRTVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGALGALLVYDTTKAMTF
        MARRPDDDYDYLFKVVLIGDSGVGKSNLLSRFTRNEFCLESKSTIGVEFATRTLQVEGRTVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGALGALLVYD TK MTF
Subjt:  MARRPDDDYDYLFKVVLIGDSGVGKSNLLSRFTRNEFCLESKSTIGVEFATRTLQVEGRTVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGALGALLVYDTTKAMTF

Query:  DNVSRWLKELRDHADSNIVIMLIGNKTDLKHLRAVATEDAQSYAEKEGLSFLETSALEATNVEKAFQTILSEIYRIISKKSLNSNEPAAASSIKEGKTIV
        DNVSRWLKELRDHADSNIVIMLIGNKTDLKHLRAVATEDAQSYAEKEGLSF+ETSALEATNVEKAFQTILSEIYRIISKKSLNS EP+AA++IKEGKTIV
Subjt:  DNVSRWLKELRDHADSNIVIMLIGNKTDLKHLRAVATEDAQSYAEKEGLSFLETSALEATNVEKAFQTILSEIYRIISKKSLNSNEPAAASSIKEGKTIV

Query:  VGESEANTKKSCCSSS
        VGESEANTKK+CCSSS
Subjt:  VGESEANTKKSCCSSS

A0A6J1C4Z3 ras-related protein RABA2a4.3e-113100Show/hide
Query:  MARRPDDDYDYLFKVVLIGDSGVGKSNLLSRFTRNEFCLESKSTIGVEFATRTLQVEGRTVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGALGALLVYDTTKAMTF
        MARRPDDDYDYLFKVVLIGDSGVGKSNLLSRFTRNEFCLESKSTIGVEFATRTLQVEGRTVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGALGALLVYDTTKAMTF
Subjt:  MARRPDDDYDYLFKVVLIGDSGVGKSNLLSRFTRNEFCLESKSTIGVEFATRTLQVEGRTVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGALGALLVYDTTKAMTF

Query:  DNVSRWLKELRDHADSNIVIMLIGNKTDLKHLRAVATEDAQSYAEKEGLSFLETSALEATNVEKAFQTILSEIYRIISKKSLNSNEPAAASSIKEGKTIV
        DNVSRWLKELRDHADSNIVIMLIGNKTDLKHLRAVATEDAQSYAEKEGLSFLETSALEATNVEKAFQTILSEIYRIISKKSLNSNEPAAASSIKEGKTIV
Subjt:  DNVSRWLKELRDHADSNIVIMLIGNKTDLKHLRAVATEDAQSYAEKEGLSFLETSALEATNVEKAFQTILSEIYRIISKKSLNSNEPAAASSIKEGKTIV

Query:  VGESEANTKKSCCSSS
        VGESEANTKKSCCSSS
Subjt:  VGESEANTKKSCCSSS

A0A6J1EU78 ras-related protein RABA2a7.1e-10895.85Show/hide
Query:  MARRPDDDYDYLFKVVLIGDSGVGKSNLLSRFTRNEFCLESKSTIGVEFATRTLQVEGRTVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGALGALLVYDTTKAMTF
        MARRPDDDYDYLFKVVLIGDSGVGKSNLLSRFTRNEFCLESKSTIGVEFATRTLQVEGRTVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGALGALLVYD TK MTF
Subjt:  MARRPDDDYDYLFKVVLIGDSGVGKSNLLSRFTRNEFCLESKSTIGVEFATRTLQVEGRTVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGALGALLVYDTTKAMTF

Query:  DNVSRWLKELRDHADSNIVIMLIGNKTDLKHLRAVATEDAQSYAEKEGLSFLETSALEATNVEKAFQTILSEIYRIISKKSLNSNEP-AAASSIKEGKTI
        DNVSRWLKELRDHADSNIVIMLIGNKTDLKHLRAVATEDAQSYAEKEGLSF+ETSALEATNVEKAFQTILSEIYRIISKKSLNS EP AAA++IKEGKTI
Subjt:  DNVSRWLKELRDHADSNIVIMLIGNKTDLKHLRAVATEDAQSYAEKEGLSFLETSALEATNVEKAFQTILSEIYRIISKKSLNSNEP-AAASSIKEGKTI

Query:  VVGESEANTKKSCCSSS
        VVGESEAN+KK CCSSS
Subjt:  VVGESEANTKKSCCSSS

A0A6J1J221 ras-related protein RABA2a2.7e-10795.39Show/hide
Query:  MARRPDDDYDYLFKVVLIGDSGVGKSNLLSRFTRNEFCLESKSTIGVEFATRTLQVEGRTVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGALGALLVYDTTKAMTF
        MARRPDDDYDYLFKVVLIGDSGVGKSNLLSRFTRNEFCLESKSTIGVEFATRTLQVEGRTVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGALGALLVYD TK MTF
Subjt:  MARRPDDDYDYLFKVVLIGDSGVGKSNLLSRFTRNEFCLESKSTIGVEFATRTLQVEGRTVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGALGALLVYDTTKAMTF

Query:  DNVSRWLKELRDHADSNIVIMLIGNKTDLKHLRAVATEDAQSYAEKEGLSFLETSALEATNVEKAFQTILSEIYRIISKKSLNSNEP-AAASSIKEGKTI
        DNVSRWLKELRDHADSNIVIMLIGNKTDLKHLRAVATEDAQSYAEKEGLSF+ETSALEATNVEKAFQTILSEIYRIISKKSLNS EP AAA++IKEGK I
Subjt:  DNVSRWLKELRDHADSNIVIMLIGNKTDLKHLRAVATEDAQSYAEKEGLSFLETSALEATNVEKAFQTILSEIYRIISKKSLNSNEP-AAASSIKEGKTI

Query:  VVGESEANTKKSCCSSS
        VVGESEAN+KK CCSSS
Subjt:  VVGESEANTKKSCCSSS

SwissProt top hitse value%identityAlignment
O04486 Ras-related protein RABA2a1.3e-10188.02Show/hide
Query:  MARRPDDDYDYLFKVVLIGDSGVGKSNLLSRFTRNEFCLESKSTIGVEFATRTLQVEGRTVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGALGALLVYDTTKAMTF
        MARRPD++YDYLFKVVLIGDSGVGKSNLLSRFTRNEFCLESKSTIGVEFATRTLQVEGRTVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGALGALLVYD TK  TF
Subjt:  MARRPDDDYDYLFKVVLIGDSGVGKSNLLSRFTRNEFCLESKSTIGVEFATRTLQVEGRTVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGALGALLVYDTTKAMTF

Query:  DNVSRWLKELRDHADSNIVIMLIGNKTDLKHLRAVATEDAQSYAEKEGLSFLETSALEATNVEKAFQTILSEIYRIISKKSLNSNEPAAASSIKEGKTI-
        +NVSRWLKELRDHADSNIVIMLIGNKTDLKHLRAVATEDAQSYAEKEGLSF+ETSALEA NVEKAFQTILSE+YRIISKKS++S++  A ++IKEG+TI 
Subjt:  DNVSRWLKELRDHADSNIVIMLIGNKTDLKHLRAVATEDAQSYAEKEGLSFLETSALEATNVEKAFQTILSEIYRIISKKSLNSNEPAAASSIKEGKTI-

Query:  VVGESEANTKKSCCSSS
        V   SE+N KK CCSSS
Subjt:  VVGESEANTKKSCCSSS

Q39434 Ras-related protein Rab2BV1.9e-8978.14Show/hide
Query:  MARRPDDDYDYLFKVVLIGDSGVGKSNLLSRFTRNEFCLESKSTIGVEFATRTLQVEGRTVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGALGALLVYDTTKAMTF
        MA R D +YDYLFK+VLIGDSGVGKSN+LSRFTRNEFCLESKSTIGVEFATRTLQVEG+TVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGA+GALLVYD TK  TF
Subjt:  MARRPDDDYDYLFKVVLIGDSGVGKSNLLSRFTRNEFCLESKSTIGVEFATRTLQVEGRTVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGALGALLVYDTTKAMTF

Query:  DNVSRWLKELRDHADSNIVIMLIGNKTDLKHLRAVATEDAQSYAEKEGLSFLETSALEATNVEKAFQTILSEIYRIISKKSLNSNEPAAASSIKEGKTIV
        DNV RWL+ELRDHADSNIVIM+ GNK+DLKHLRAV+ ED Q+ AEKEGLSFLETSALEA N+EKAFQTIL+EIY IISKK+L + E A+++   +G TI 
Subjt:  DNVSRWLKELRDHADSNIVIMLIGNKTDLKHLRAVATEDAQSYAEKEGLSFLETSALEATNVEKAFQTILSEIYRIISKKSLNSNEPAAASSIKEGKTIV

Query:  VGESEANTKKSCCSS
        V ++ AN ++SCCS+
Subjt:  VGESEANTKKSCCSS

Q40193 Ras-related protein Rab11C1.9e-8976.85Show/hide
Query:  MARRPDDDYDYLFKVVLIGDSGVGKSNLLSRFTRNEFCLESKSTIGVEFATRTLQVEGRTVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGALGALLVYDTTKAMTF
        MA R D +YDYLFK+VLIGDSGVGKSN+LSRFTRNEFCLESKSTIGVEFATRTLQVEG+TVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGA+GALLVYD TK  TF
Subjt:  MARRPDDDYDYLFKVVLIGDSGVGKSNLLSRFTRNEFCLESKSTIGVEFATRTLQVEGRTVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGALGALLVYDTTKAMTF

Query:  DNVSRWLKELRDHADSNIVIMLIGNKTDLKHLRAVATEDAQSYAEKEGLSFLETSALEATNVEKAFQTILSEIYRIISKKSLNSNEPAAASSIK-EGKTI
        DNV RWL+ELRDHADSNIVIM+ GNK+DL HLRAV+ +D  + +EKEGLSFLETSALEATN+EKAFQTIL+EIY I+SKK+L + E  A +S+  +G TI
Subjt:  DNVSRWLKELRDHADSNIVIMLIGNKTDLKHLRAVATEDAQSYAEKEGLSFLETSALEATNVEKAFQTILSEIYRIISKKSLNSNEPAAASSIK-EGKTI

Query:  VVGESEANTKKSCCSS
         V ++  NTKK CCS+
Subjt:  VVGESEANTKKSCCSS

Q96283 Ras-related protein RABA2c4.2e-8977.88Show/hide
Query:  MARRPDDDYDYLFKVVLIGDSGVGKSNLLSRFTRNEFCLESKSTIGVEFATRTLQVEGRTVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGALGALLVYDTTKAMTF
        M  R D +YDYLFK+VLIGDSGVGKSN+LSRFTRNEFCLESKSTIGVEFATRT QVEG+T+KAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGA+GALLVYD TK  TF
Subjt:  MARRPDDDYDYLFKVVLIGDSGVGKSNLLSRFTRNEFCLESKSTIGVEFATRTLQVEGRTVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGALGALLVYDTTKAMTF

Query:  DNVSRWLKELRDHADSNIVIMLIGNKTDLKHLRAVATEDAQSYAEKEGLSFLETSALEATNVEKAFQTILSEIYRIISKKSLNSNEPAAASSI--KEGKT
        DNV RWL+ELRDHADSNIVIM+ GNK+DL HLR+VA ED QS AEKEGLSFLETSALEATNVEKAFQTIL EIY IISKK+L + E AAA+S    +G T
Subjt:  DNVSRWLKELRDHADSNIVIMLIGNKTDLKHLRAVATEDAQSYAEKEGLSFLETSALEATNVEKAFQTILSEIYRIISKKSLNSNEPAAASSI--KEGKT

Query:  IVVGESEANTKKSCCSS
        I V ++    K++CCSS
Subjt:  IVVGESEANTKKSCCSS

Q9LNW1 Ras-related protein RABA2b4.6e-8877.67Show/hide
Query:  MARRPDDDYDYLFKVVLIGDSGVGKSNLLSRFTRNEFCLESKSTIGVEFATRTLQVEGRTVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGALGALLVYDTTKAMTF
        MA R D +YDYLFK+VLIGDSGVGKSN+LSRFTRNEFCLESKSTIGVEFATRTLQVEG+TVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGA+GALLVYD TK  TF
Subjt:  MARRPDDDYDYLFKVVLIGDSGVGKSNLLSRFTRNEFCLESKSTIGVEFATRTLQVEGRTVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGALGALLVYDTTKAMTF

Query:  DNVSRWLKELRDHADSNIVIMLIGNKTDLKHLRAVATEDAQSYAEKEGLSFLETSALEATNVEKAFQTILSEIYRIISKKSLNSNEPAAASSIKEGKTIV
        +NV RWL+ELRDHADSNIVIM+ GNK+DL HLR+VA ED +S AEKEGLSFLETSALEATN+EKAFQTILSEIY IISKK+L + E AA +   +G  I 
Subjt:  DNVSRWLKELRDHADSNIVIMLIGNKTDLKHLRAVATEDAQSYAEKEGLSFLETSALEATNVEKAFQTILSEIYRIISKKSLNSNEPAAASSIKEGKTIV

Query:  VGESEANTKKSCCSS
        + +S A  +K CCS+
Subjt:  VGESEANTKKSCCSS

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G07410.1 RAB GTPase homolog A2B3.3e-8977.67Show/hide
Query:  MARRPDDDYDYLFKVVLIGDSGVGKSNLLSRFTRNEFCLESKSTIGVEFATRTLQVEGRTVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGALGALLVYDTTKAMTF
        MA R D +YDYLFK+VLIGDSGVGKSN+LSRFTRNEFCLESKSTIGVEFATRTLQVEG+TVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGA+GALLVYD TK  TF
Subjt:  MARRPDDDYDYLFKVVLIGDSGVGKSNLLSRFTRNEFCLESKSTIGVEFATRTLQVEGRTVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGALGALLVYDTTKAMTF

Query:  DNVSRWLKELRDHADSNIVIMLIGNKTDLKHLRAVATEDAQSYAEKEGLSFLETSALEATNVEKAFQTILSEIYRIISKKSLNSNEPAAASSIKEGKTIV
        +NV RWL+ELRDHADSNIVIM+ GNK+DL HLR+VA ED +S AEKEGLSFLETSALEATN+EKAFQTILSEIY IISKK+L + E AA +   +G  I 
Subjt:  DNVSRWLKELRDHADSNIVIMLIGNKTDLKHLRAVATEDAQSYAEKEGLSFLETSALEATNVEKAFQTILSEIYRIISKKSLNSNEPAAASSIKEGKTIV

Query:  VGESEANTKKSCCSS
        + +S A  +K CCS+
Subjt:  VGESEANTKKSCCSS

AT1G09630.1 RAB GTPase 11C8.9e-10388.02Show/hide
Query:  MARRPDDDYDYLFKVVLIGDSGVGKSNLLSRFTRNEFCLESKSTIGVEFATRTLQVEGRTVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGALGALLVYDTTKAMTF
        MARRPD++YDYLFKVVLIGDSGVGKSNLLSRFTRNEFCLESKSTIGVEFATRTLQVEGRTVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGALGALLVYD TK  TF
Subjt:  MARRPDDDYDYLFKVVLIGDSGVGKSNLLSRFTRNEFCLESKSTIGVEFATRTLQVEGRTVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGALGALLVYDTTKAMTF

Query:  DNVSRWLKELRDHADSNIVIMLIGNKTDLKHLRAVATEDAQSYAEKEGLSFLETSALEATNVEKAFQTILSEIYRIISKKSLNSNEPAAASSIKEGKTI-
        +NVSRWLKELRDHADSNIVIMLIGNKTDLKHLRAVATEDAQSYAEKEGLSF+ETSALEA NVEKAFQTILSE+YRIISKKS++S++  A ++IKEG+TI 
Subjt:  DNVSRWLKELRDHADSNIVIMLIGNKTDLKHLRAVATEDAQSYAEKEGLSFLETSALEATNVEKAFQTILSEIYRIISKKSLNSNEPAAASSIKEGKTI-

Query:  VVGESEANTKKSCCSSS
        V   SE+N KK CCSSS
Subjt:  VVGESEANTKKSCCSSS

AT1G16920.1 RAB GTPase homolog A1B1.4e-7970.75Show/hide
Query:  RPDDDYDYLFKVVLIGDSGVGKSNLLSRFTRNEFCLESKSTIGVEFATRTLQVEGRTVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGALGALLVYDTTKAMTFDNV
        R +DDYDYLFKVVLIGDSGVGKSNLLSRFT+NEF LESKSTIGVEFATRTL+V+G+ VKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGA+GALLVYD T+  TF+NV
Subjt:  RPDDDYDYLFKVVLIGDSGVGKSNLLSRFTRNEFCLESKSTIGVEFATRTLQVEGRTVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGALGALLVYDTTKAMTFDNV

Query:  SRWLKELRDHADSNIVIMLIGNKTDLKHLRAVATEDAQSYAEKEGLSFLETSALEATNVEKAFQTILSEIYRIISKKSLNSNEPAAASSIKEGKTIVVGE
         RWLKEL++H D NIV+ML+GNK+DL+HL AV TED +SYAE+E L F+ETSALEATNVE AF  +L++IYRI SKK + + E   AS  K  K  V  +
Subjt:  SRWLKELRDHADSNIVIMLIGNKTDLKHLRAVATEDAQSYAEKEGLSFLETSALEATNVEKAFQTILSEIYRIISKKSLNSNEPAAASSIKEGKTIVVGE

Query:  SEANTKKSCCSS
          A  K  CCS+
Subjt:  SEANTKKSCCSS

AT3G46830.1 RAB GTPase homolog A2C3.0e-9077.88Show/hide
Query:  MARRPDDDYDYLFKVVLIGDSGVGKSNLLSRFTRNEFCLESKSTIGVEFATRTLQVEGRTVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGALGALLVYDTTKAMTF
        M  R D +YDYLFK+VLIGDSGVGKSN+LSRFTRNEFCLESKSTIGVEFATRT QVEG+T+KAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGA+GALLVYD TK  TF
Subjt:  MARRPDDDYDYLFKVVLIGDSGVGKSNLLSRFTRNEFCLESKSTIGVEFATRTLQVEGRTVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGALGALLVYDTTKAMTF

Query:  DNVSRWLKELRDHADSNIVIMLIGNKTDLKHLRAVATEDAQSYAEKEGLSFLETSALEATNVEKAFQTILSEIYRIISKKSLNSNEPAAASSI--KEGKT
        DNV RWL+ELRDHADSNIVIM+ GNK+DL HLR+VA ED QS AEKEGLSFLETSALEATNVEKAFQTIL EIY IISKK+L + E AAA+S    +G T
Subjt:  DNVSRWLKELRDHADSNIVIMLIGNKTDLKHLRAVATEDAQSYAEKEGLSFLETSALEATNVEKAFQTILSEIYRIISKKSLNSNEPAAASSI--KEGKT

Query:  IVVGESEANTKKSCCSS
        I V ++    K++CCSS
Subjt:  IVVGESEANTKKSCCSS

AT5G59150.1 RAB GTPase homolog A2D7.3e-8976.96Show/hide
Query:  MARRPDDDYDYLFKVVLIGDSGVGKSNLLSRFTRNEFCLESKSTIGVEFATRTLQVEGRTVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGALGALLVYDTTKAMTF
        MA R + DYDYLFK+VLIGDSGVGK+N+LSRFTRNEFCLESKSTIGVEFATRTLQVEG+TVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGA+GALLVYD TK  TF
Subjt:  MARRPDDDYDYLFKVVLIGDSGVGKSNLLSRFTRNEFCLESKSTIGVEFATRTLQVEGRTVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGALGALLVYDTTKAMTF

Query:  DNVSRWLKELRDHADSNIVIMLIGNKTDLKHLRAVATEDAQSYAEKEGLSFLETSALEATNVEKAFQTILSEIYRIISKKSLNSNEPAAASSI--KEGKT
        DNV RWL+ELRDHADSNIVIM+ GNK DL HLR+VA ED Q+ AE EGLSFLETSALEATNVEKAFQT+L+EIY IISKK+L + E AAA+S    +G T
Subjt:  DNVSRWLKELRDHADSNIVIMLIGNKTDLKHLRAVATEDAQSYAEKEGLSFLETSALEATNVEKAFQTILSEIYRIISKKSLNSNEPAAASSI--KEGKT

Query:  IVVGESEANTKKSCCSS
        I V ++    K+ CCS+
Subjt:  IVVGESEANTKKSCCSS


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGCCCGGAGACCCGACGACGACTACGATTACCTCTTCAAAGTTGTGTTAATCGGCGATTCCGGCGTTGGGAAATCCAACTTGCTTTCCCGATTCACTCGGAATGAGTT
TTGTTTGGAGTCCAAGTCCACCATTGGCGTCGAATTCGCCACTCGTACTCTTCAGGTCGAGGGAAGAACCGTGAAAGCACAGATATGGGACACGGCTGGTCAAGAGCGAT
ACAGAGCAATCACCAGTGCTTACTACAGGGGCGCCCTTGGAGCTCTTCTAGTTTACGACACAACGAAAGCAATGACTTTCGACAATGTAAGCCGTTGGTTGAAGGAACTT
AGGGACCATGCAGATTCCAACATAGTCATCATGTTAATCGGAAACAAGACTGATCTAAAACACCTCCGAGCGGTTGCGACAGAGGATGCTCAGAGCTACGCCGAGAAAGA
AGGGCTATCTTTCCTTGAAACTTCTGCTCTTGAAGCAACAAACGTGGAGAAGGCTTTCCAAACTATTCTCTCAGAGATATATAGGATAATCAGTAAGAAGTCCCTCAATT
CGAATGAGCCAGCTGCTGCTAGCAGCATTAAAGAAGGAAAAACCATTGTGGTTGGGGAATCTGAGGCCAATACAAAGAAATCTTGCTGCTCCTCTTCT
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGGCCCGGAGACCCGACGACGACTACGATTACCTCTTCAAAGTTGTGTTAATCGGCGATTCCGGCGTTGGGAAATCCAACTTGCTTTCCCGATTCACTCGGAATGAGTT
TTGTTTGGAGTCCAAGTCCACCATTGGCGTCGAATTCGCCACTCGTACTCTTCAGGTCGAGGGAAGAACCGTGAAAGCACAGATATGGGACACGGCTGGTCAAGAGCGAT
ACAGAGCAATCACCAGTGCTTACTACAGGGGCGCCCTTGGAGCTCTTCTAGTTTACGACACAACGAAAGCAATGACTTTCGACAATGTAAGCCGTTGGTTGAAGGAACTT
AGGGACCATGCAGATTCCAACATAGTCATCATGTTAATCGGAAACAAGACTGATCTAAAACACCTCCGAGCGGTTGCGACAGAGGATGCTCAGAGCTACGCCGAGAAAGA
AGGGCTATCTTTCCTTGAAACTTCTGCTCTTGAAGCAACAAACGTGGAGAAGGCTTTCCAAACTATTCTCTCAGAGATATATAGGATAATCAGTAAGAAGTCCCTCAATT
CGAATGAGCCAGCTGCTGCTAGCAGCATTAAAGAAGGAAAAACCATTGTGGTTGGGGAATCTGAGGCCAATACAAAGAAATCTTGCTGCTCCTCTTCT
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MARRPDDDYDYLFKVVLIGDSGVGKSNLLSRFTRNEFCLESKSTIGVEFATRTLQVEGRTVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGALGALLVYDTTKAMTFDNVSRWLKEL
RDHADSNIVIMLIGNKTDLKHLRAVATEDAQSYAEKEGLSFLETSALEATNVEKAFQTILSEIYRIISKKSLNSNEPAAASSIKEGKTIVVGESEANTKKSCCSSS