; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

MS012548 (gene) of Bitter gourd (TR) v1 genome

Gene IDMS012548
OrganismMomordica charantia cv. TR (Bitter gourd (TR) v1)
DescriptionRas-related protein Rab-1A
Genome locationscaffold63:1478547..1481286
RNA-Seq ExpressionMS012548
SyntenyMS012548
Gene Ontology termsGO:0006886 - intracellular protein transport (biological process)
GO:0012505 - endomembrane system (cellular component)
GO:0003924 - GTPase activity (molecular function)
GO:0005525 - GTP binding (molecular function)
InterPro domainsIPR001806 - Small GTPase
IPR005225 - Small GTP-binding protein domain
IPR027417 - P-loop containing nucleoside triphosphate hydrolase


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
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XP_008452238.1 PREDICTED: ras-related protein RABD1 isoform X1 [Cucumis melo]1.6e-10096.43Show/hide
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XP_022762717.1 ras-related protein RABD1 [Durio zibethinus]1.0e-9995.9Show/hide
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XP_022929522.1 ras-related protein RABD1-like [Cucurbita moschata]1.2e-10096.94Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0L6Q4 Uncharacterized protein7.8e-10196.94Show/hide
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A0A1S3BTF1 ras-related protein RABD1 isoform X17.8e-10196.43Show/hide
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A0A6J1C4U5 ras-related protein RABD11.3e-103100Show/hide
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A0A6J1EMZ9 ras-related protein RABD1-like6.0e-10196.94Show/hide
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A0A6J1JCC5 ras-related protein RABD1-like6.0e-10196.94Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
P16976 GTP-binding protein YPTM14.9e-8480.2Show/hide
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P40392 Ras-related protein RIC11.4e-8680.71Show/hide
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        IDRYA+++V KLLVGNKCDL EN+VV  +  KALADE+GIPFLETSAKD+ NVE+AF+TMA EIK +M SQP++  S   TVQM+GQP+ Q+SSCCS
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Q05737 GTP-binding protein YPTM23.4e-8580.2Show/hide
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        IDRYA+D+V KLLVGNK DL  NKVV T+TAKA ADE+GIPF+ETSAK++ NV+QAF+ MAA IK +M SQP++  +   TVQ++GQP+ QK+SCCS
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Q9SEH3 Ras-related protein RABD2c3.4e-8579.08Show/hide
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Q9ZRE2 Ras-related protein RABD11.2e-9085.28Show/hide
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G02130.1 RAS 55.0e-8477.66Show/hide
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        IDRYA+D+V KLLVGNK DL EN+ +  +TAKA ADE+GIPF+ETSAKD+ NVEQAF+ M+A IK++M SQP+   +   TVQ++GQP+ QK+ CCS
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AT3G09900.1 RAB GTPase homolog E1E7.1e-6258.82Show/hide
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AT3G11730.1 Ras-related small GTP-binding family protein8.6e-9285.28Show/hide
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        IDRYAN+SVCKLL+GNK D+VE+KVV T+T +ALADELGIPFLETSAKDSINVEQAFLT+A EIKKKMGSQ ++ K+S  GTVQMKGQPI+Q +  C
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AT4G17530.1 RAB GTPase homolog 1C2.4e-8679.08Show/hide
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AT5G47200.1 RAB GTPase homolog 1A7.8e-8578.57Show/hide
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
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mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
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Protein sequenceShow/hide protein sequence
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