; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

MS012702 (gene) of Bitter gourd (TR) v1 genome

Gene IDMS012702
OrganismMomordica charantia cv. TR (Bitter gourd (TR) v1)
Descriptionhomeobox-leucine zipper protein ATHB-40-like
Genome locationscaffold63:2763673..2765481
RNA-Seq ExpressionMS012702
SyntenyMS012702
Gene Ontology termsGO:0006357 - regulation of transcription by RNA polymerase II (biological process)
GO:0045893 - positive regulation of transcription, DNA-templated (biological process)
GO:0005634 - nucleus (cellular component)
GO:0000981 - DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific (molecular function)
GO:0043565 - sequence-specific DNA binding (molecular function)
InterPro domainsIPR000047 - Helix-turn-helix motif
IPR001356 - Homeobox domain
IPR009057 - Homeobox-like domain superfamily
IPR017970 - Homeobox, conserved site


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG7031239.1 Homeobox-leucine zipper protein ATHB-40 [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]7.8e-8078.95Show/hide
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XP_022943109.1 homeobox-leucine zipper protein ATHB-40-like [Cucurbita moschata]2.3e-7978.95Show/hide
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XP_038877287.1 homeobox-leucine zipper protein ATHB-40-like [Benincasa hispida]8.9e-8483.19Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0KWL3 Homeobox domain-containing protein4.3e-7676.21Show/hide
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A0A1S3BY52 homeobox-leucine zipper protein ATHB-405.8e-8179.2Show/hide
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A0A6J1C5L6 homeobox-leucine zipper protein ATHB-40-like3.9e-117100Show/hide
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A0A6J1FTB2 homeobox-leucine zipper protein ATHB-40-like1.1e-7978.95Show/hide
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A0A6J1J034 homeobox-leucine zipper protein ATHB-40-like1.0e-7777.63Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
A2YN17 Homeobox-leucine zipper protein HOX141.2e-2738.68Show/hide
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        S+   G  G +  +D   Y+PE    +DN+ +     EW + Y
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O23208 Homeobox-leucine zipper protein ATHB-401.9e-4451.5Show/hide
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Q7XI85 Homeobox-leucine zipper protein HOX143.0e-2638.27Show/hide
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        E+ Q  Q+   Y    +  A   G     +PR RR++ RG+          E      KKR+L+ +QV +LE +F  E KLE+ RK  LASELGLDP+QV
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        S+      G +  +D   Y+PE    +DN+ +     EW + Y
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Q9LVR0 Homeobox-leucine zipper protein ATHB-536.1e-3548.99Show/hide
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        ++VV+ +C+LE++IL L EQLSEA+ E  +L  R +   ++S S S+S+EA + PT +    E          Y +P    DN  +  ME  W   Y+
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Q9ZU70 Homeobox-leucine zipper protein ATHB-211.9e-4448.5Show/hide
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        PRQVAVWFQNRRARWKNK++E+EY+ LK  +E+ VVEKCRL++E+++LKEQL EAE+E +RL  R +G LS+SP S S+++EA   T +     FG Y++
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                + E+D   +Y  +    ++W + ++
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT2G18550.1 homeobox protein 211.3e-4548.5Show/hide
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AT3G01470.1 homeobox 13.9e-2141.72Show/hide
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        KKR+LT +QVHLLE +F +E+KLE ERK +LA +LGL PRQVAVWFQNRRARWK K+LE +Y  LK         ++S+V++  +L +E+ +L E+L   
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        ++       A+ P    P P+      ++  A+        G  GS  L+D
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AT4G36740.1 homeobox protein 401.3e-4551.5Show/hide
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        MN+ + +++ A  ISQLY  +Y Q+       GE K P+RRRKK +GS + ++      +KRKLT +QV++LE +FG EHKLESERKDRLA+ELGLDPRQ
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        ++VV+ +C+LE++IL L EQLSEA+ E  +L  R +   ++S S S+S+EA + PT +    E          Y +P    DN  +  ME  W   Y+
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Sequences Show/hide sequences
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YI