; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

MS012722 (gene) of Bitter gourd (TR) v1 genome

Gene IDMS012722
OrganismMomordica charantia cv. TR (Bitter gourd (TR) v1)
DescriptionbZIP transcription factor 44-like
Genome locationscaffold63:2947885..2948340
RNA-Seq ExpressionMS012722
SyntenyMS012722
Gene Ontology termsGO:0045893 - positive regulation of transcription, DNA-templated (biological process)
GO:0005634 - nucleus (cellular component)
GO:0000976 - transcription regulatory region sequence-specific DNA binding (molecular function)
GO:0003700 - DNA-binding transcription factor activity (molecular function)
InterPro domainsIPR004827 - Basic-leucine zipper domain


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
AOZ56991.1 bZIP2 [Citrullus lanatus]7.8e-6388.82Show/hide
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KAA0044785.1 bZIP transcription factor 53 [Cucumis melo var. makuwa]2.7e-6386.18Show/hide
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XP_008452107.1 PREDICTED: bZIP transcription factor 53 [Cucumis melo]3.5e-6386.18Show/hide
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XP_038897679.1 bZIP transcription factor 44-like [Benincasa hispida]2.4e-6489.47Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A1I9RYK7 BZIP23.8e-6388.82Show/hide
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A0A1S3BT51 bZIP transcription factor 531.7e-6386.18Show/hide
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A0A5A7TTR6 BZIP transcription factor 531.3e-6386.18Show/hide
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A0A5D3CZ93 BZIP transcription factor 531.7e-6386.18Show/hide
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A0A6J1C522 bZIP transcription factor 44-like1.6e-7499.34Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
C0Z2L5 bZIP transcription factor 441.5e-2953.59Show/hide
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        + L +  S+ DLRQ  ++D+RKRKR  SNRESARRSRMRKQK LDDLT QV  +R EN QI   I  TTQ Y  +EAEN +LRAQ+ EL HRL SLNEI 
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         F+ SS+     ET Q   +    DG ++     F NQPIMA    AGD+F C
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O65683 bZIP transcription factor 112.3e-2547.74Show/hide
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        +S + +S GS  S      +++QRKRKRM+SNRESARRSRM+KQK LDDLT QV  ++ EN +I  +++ TTQ Y  +EAENSVLRAQ+ EL HRL SLN
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        +I  F++SS  N         + + G+   D FV+     + +NQP+MA+ D  M
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P24068 Ocs element-binding factor 13.2e-1132.85Show/hide
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        +S +  + G  S  +        R+ KR +SNRESARRSR+RKQ+ LD+L  +VA+++++N ++          Y  +E EN+VLRA+ AEL  RL S+N
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        E+   +   +    + +   +E+   D  +  W  P+
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Q9LZP8 bZIP transcription factor 532.2e-2043.06Show/hide
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        SP SD D R   + D+RKRKRMISNRESARRSRMRKQKQL DL  +V  ++++N +IT  ++  ++ Y  +E++N+VLRAQ +EL  RL SLN +   + 
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          +    +  +  + +       + W  P   QPI A+ DMF C
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Q9SI15 bZIP transcription factor 21.5e-2448.37Show/hide
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        SS G  ++  D    VD+RKRKRM+SNRESARRSRMRKQK +DDLT Q+ Q+ ++N QI  ++  T+QLY  ++AENSVL AQM EL  RL SLNEI   
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Query:  INSSTRNLFETEQD----HDEICGIDGFVDS---------W-GFPFLNQPIMA
        + S+       + D     D   GIDG+ D          W G  + NQPIMA
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G75390.1 basic leucine-zipper 441.1e-3053.59Show/hide
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        + L +  S+ DLRQ  ++D+RKRKR  SNRESARRSRMRKQK LDDLT QV  +R EN QI   I  TTQ Y  +EAEN +LRAQ+ EL HRL SLNEI 
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         F+ SS+     ET Q   +    DG ++     F NQPIMA    AGD+F C
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AT1G75390.2 basic leucine-zipper 448.1e-1861.18Show/hide
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AT2G18160.1 basic leucine-zipper 21.1e-2548.37Show/hide
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        SS G  ++  D    VD+RKRKRM+SNRESARRSRMRKQK +DDLT Q+ Q+ ++N QI  ++  T+QLY  ++AENSVL AQM EL  RL SLNEI   
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Query:  INSSTRNLFETEQD----HDEICGIDGFVDS---------W-GFPFLNQPIMA
        + S+       + D     D   GIDG+ D          W G  + NQPIMA
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AT3G62420.1 basic region/leucine zipper motif 531.6e-2143.06Show/hide
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        SP SD D R   + D+RKRKRMISNRESARRSRMRKQKQL DL  +V  ++++N +IT  ++  ++ Y  +E++N+VLRAQ +EL  RL SLN +   + 
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          +    +  +  + +       + W  P   QPI A+ DMF C
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AT4G34590.1 G-box binding factor 61.6e-2647.74Show/hide
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGCTTCTCCGGTAGGAAGTTCATTGGGATCTCCGAGCTCTGACGAAGATCTGCGGCAAATCGTGGATCAGAGGAAGAGGAAGAGAATGATATCGAATCGGGAATCGGC
CCGCCGGTCGAGGATGCGGAAGCAGAAACAGCTGGACGATCTGACGGTTCAGGTGGCCCAAATCAGATCGGAGAATGAGCAAATCACCGTCAACATCAATTTCACCACCC
AGCTTTACCGGAATCTGGAGGCGGAGAACTCGGTTCTCCGGGCCCAGATGGCGGAGCTCCGCCACAGATTGGACTCGCTAAACGAAATCACGAGCTTCATAAACTCCAGC
ACCAGAAATCTGTTTGAAACTGAACAAGATCATGATGAAATTTGTGGCATTGATGGGTTTGTTGATTCGTGGGGATTCCCCTTTCTCAACCAGCCAATCATGGCGGCTGG
TGACATGTTTATGTGC
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
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CCGCCGGTCGAGGATGCGGAAGCAGAAACAGCTGGACGATCTGACGGTTCAGGTGGCCCAAATCAGATCGGAGAATGAGCAAATCACCGTCAACATCAATTTCACCACCC
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TGACATGTTTATGTGC
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MASPVGSSLGSPSSDEDLRQIVDQRKRKRMISNRESARRSRMRKQKQLDDLTVQVAQIRSENEQITVNINFTTQLYRNLEAENSVLRAQMAELRHRLDSLNEITSFINSS
TRNLFETEQDHDEICGIDGFVDSWGFPFLNQPIMAAGDMFMC